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SCNpilot_BF_INOC_scaffold_2252_1

Organism: SCNpilot_BF_INOC_Clostridium_42_5_partial

partial RP 46 / 55 MC: 1 BSCG 40 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38 MC: 3
Location: 321..6929

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
Putative cell wall associated protein/ RHS repeat family n=2 Tax=Clostridium botulinum RepID=F4A9I8_CLOBO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 32.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 930
  • Evalue 2.60e-267
putative cell wall associated protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 930
  • Evalue 7.30e-268
  • rbh
Putative cell wall associated protein/ RHS repeat family {ECO:0000313|EMBL:AEB75043.1}; TaxID=929506 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Cl similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 32.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 930
  • Evalue 3.60e-267

Lists

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Notes

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Taxonomy

Clostridium botulinum → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 6609
ATGAAACGAATTAAAATGTTCACACAGGTAACTGCAATTGTTCTATGTATGGCGCTATGCTTTTCCATTGTACCAATAGCAGCCTCTGCAAGCTCTCTCAAACAAACGAATAAAGAAACCATTCCTATTTCGGAAACAAAAAAGAATGAACCTTCTCCCTATATTATAGGAGAAGAAAAATCAAAAAGAGGCTTCAATACAAAGCATTTTAAGATGAGCGACGGAACTTATACTGCAGTAATGTATAAAGATCCTGTTCATAAAAAAGTAAATGAAAAATGGGTGGACATAGATAATACTTTACAGGAATCGATCGACAGTGCCGGAACGAAGAAGATTAACAATACAAATGGACTGTACGATGTTAATTTCAAAACTTCGGCTTCAAACAAAAACATGATCAACATTCAGGTTAATGGCTATTCAATTAGCTGGAGATTGAACGATTCAGAAAGTGTAAACGTAGAAGAAGCTGATTTATATAGTGATGTATATAATAATTTGAAAATAGCAAAAAGTGATGAAAAAATTAAGGCTGTTGAAAAAACACAGAGGAAGGTTACCTATAAAGATATCCTCAAGGATATTAACGTTGAATATACTTTGTTAGCTAACAAATTGAAAGAAGATATTGTAATCAAGAAGAGAAATGACATAAATTCGTTTTCTTTTACTTTGCAGTGTGATAAACTGACTCCAAAATTGAATAAAGACAAAAGTATTGGTTTGTATGATAATAAGGACAATCAAGTATTTGTTTTCGATAAACCATATATGTATGATGCAAAAGGCAATAACTCAATAGATATAGGCATCTCAATTGTAAAGAAAGCAAAGGATTTTATCTTAACAATTGCTCCAAATCGCGAATGGCTAAATGATAAATCCAGAATTTATCCTGTAACCGTTGATCCTTCTTTTCAGATAACTAGGAATTACGATTCCATGGATTGTGGTTATATTGATCTTGCAAATCCCGATAGCACTTTTGCTGGCGGTGCGACGAATAAGGTGGGCACACAATTTCTGGATGGTAGTTATCACATCAACAGATCATTTGTTAAGTTTACACGCCTTCCAGAGTTAACCCCGAATGATATGATTATTGATGCATCATTGGAAATGTATGGCGCTCCGAAAATTACTGTTGATGAGTATGGGAATCCAACATTCACTGATTGGGATCTATCTTCATACAATTATGCCATGACAGCTCATCAAGTAACTTCCAGCTGGGACGAATATTCACTGACCTGGAGCAATATGTCTGGTAATTTTGATACAACCGCATTGGATTACAGCAAAGTAACTAACAATAACACTATTTATAACTGGGATATTACCAAGGCTGTAAAAAATTGGTACAGACAAGATGATGCAAGCAACAACTATGGCATTATGTTAAGATACTCAGATGAAAGCTCGGGCAATGGCATAGCGGAATTGTGGGGATCCAATGGTCCTTATGACAGCCTGGTGCCACAACTTATCGTTACTTATGTTAACAATGTAGGACTGGAAAACTATTGGTCATACCACAGCCATTCGGCAGGAGAAGCCGGAACAGGGTGGGTGAATGATTATACAGGCAATCTGGTTTTTCAACATACTGACATTGCCATGAGCGGCAATCGGATGCCTATGGCAATCGCTCATGTATACAACAGCAAAAAATACTACAAAAACTTTTTCCCCAACGACAGCGACCCCTCCACACCGGCAGGATTGAATAGCGGGTATGGATGGCAGATGAACATAAGTCAGCGTATTGATGTTGTAACAGGTGATTTGGCATATTCATTTCCGTATAAATTAACGGACGCTGACGGAACCGAGCATTATTTTTCTTTAGAATCAACGGGCGTTTGGAAAGATGAGTTTGATCCGAGCACGAAGCTCACCCGGCCTATTGAAGGCGGTGTTGAAATATACCAAATTAAAGATAAAAATGATAATATTCTAAAATTTACATCTAACGGATACTTAAAAAATGTAATTGATGCGAATGGGAACACCATAACATATGTCTATGCCGGCGAATATGTAACGGCAATCATTGACGGTGCTGGAAGATATACATATATCAGCAGGAATGGAGATCATATCAGCGCAATAACAGACCCTGACAACCGAGTGACTACATTCAGTTATACAAATGGAAGATTGACATCCATTCAGGATTCAGATGGTTCTACATCTTATTTTGCATATGACAGCAACGGAATTTTAAACAAGGTAACATCGGCTGATTCTTATAAAATCAGATACACCTATACGCTTGATGACAACGCAAGCCCGCAGTTAACCCAAATTGACGAGTTGGGCGTTAATGATACCGATGAAAGTGATAATGGCAACAGCCTTCAATTTGATTATACAAACCCGGATGCAACGGTTGTCACCGATCCCGGTAATGATAGTAGCTATGCGACGGAGGATGATAATTATTATACATCCTACAATTTTGATAATTATGGAAGGACTATTGACGTTTCAGATAAGTTTGGCAACACCAATGTATATAAATATTTGAATACAGCTGACTCATCAAACAACAAACTAAGCGGGACCGCGTCTGCAAACAAGCCGGTATTTAACCTGTTGACCAACAGTGGGGCAGAAAATGGATCGACAGATTGGTACACACCACCAACATCAACAGACGCTAACGTTTACAACGGTACCCATTCTTTCATGTTAAGCGATGGGAATTATTTTGCTCGTGGCTATGATTATTCCGAACAGTTTGGCAGAGACCTGACAATGTCATGCTATATCAAAACGGATGGAGCAACGAGTGGAACAGGAGCTCGCTTCTCTGTGCAGGGTTACAATCAGTCCGGTCATAATTTATCAATTGAATCTACCCAGGTGTATGATTCGGATCCCAGCAGGGATGTGAACGGTTGGGTCAGAGTCAAGGTATCCTTTACTTTGCCGACAGATACGGTAGCATTTTGGTTTTTTTGCTTGTCTGCTACTGGCGGTACCACCTATTTTGATTGCTTCCAGTTGGAAAAAGGACTGGTAATGAATCGGTTCAGTCTGCTTGAAAATTCTAGCTTTGAGAATGAATCCAGCACCCTTCCTTCGGGCTGGACAGGCTCTAGTTTGAACGCTGCTTATGACTATCTGGTTTCAGATTCATCAGTGCTGGAAAACACGAAGATAGACGGTACGAAAGCGTTTAAAATTACCGGCGCAGTAAACACCGCCAAGAAACTATATCAGACAGTTTATGTGGGTGGAGCACAAGGCGATTTTTACACGCTAAGCGGAAGAGCAAAGGCAAATTCAGTCCCAACAGGCTTTGACAATCGTCTATTTGCCCTTGGTGCGGAGGTAGTATACAGTGATGGGTCAACCGGCCCCGATCCGATAATAATACCGTTTAACAGTGACAATGCAAACTGGCAGTATACATCGGGCACATTCAGTCTTAAACATCCGAGCAATACGTCGATAACACCAATCTACTTGCGTATCTACTGTATCTATAGCTACAACGCAAACACAGCGTATTTTGACGCCTTGCAACTTGTTAGGGATGAGTCAAACAGCTATACATATGATACGAACGGAAATGCAATATCAACGGCCGACAAAGCCAAGACGGAATCCAGCTTTAACTACACAAACAATAATCTGAACTCCATGATAAACCCTGACGGAACATCATTCACCTACAGCTATGATTCAAAGCACAATATGGTGGAAGCCAGAAGCTCTAATGATTTACGTTATGCTGTTACCTATGATAGTTATGGCAACCCGACAGCAGCCTCCACAAGTGCATTACAAACAGCCAGATCGATTGTGAACAATACAGAATATACCATAACAGCAGTCAATTCATCATGGAGGGTTGATATTGCCGGTACCGGCTCAGCTCAGGATACCAACGCAGCTAATACTGTTACAAATTCACAACAATCGACCAACACACAAAAGTGGAAAGCGGTGTATGTCTCTGGCGCCGGGGATGATTCACTTTACAAATTGGTTTCTGTTAACAGCGCCACCGGCAGAGTGTTGTCAGCGATGTTCAGTTCGGAAGGAACCATTGTTAAACTCTACAGTTATGTTGGCTTTTCTGGTCAATTATGGAAATTTGCCAAGAAAGCAGATGGTACATACAGAATCATTCCGTCTAATGCCCTCAATAAATGCCTCACCGAAGAAAAGACAATTGGCACCACGCCGGGGCAGTATATAAAGATACAAACATTTAGTGATGCAAAAACCGATGATTCAAACCAAAAATGGCGTATTGATCCGGTTTCTCAGAGCTATGCTAAATATTTTACCAATACCGCTGAATATACAACCGATGGAAATTATCCGTCCAAAACAGAAGATTCACTGGGCAATCAGACCTTTTACAATTATGATTCCTCTAATGGATTATTGAAAGGTGTAACCGATCCAAGATCGAACCAGAAAACATATCAATATGAGCAGTACAACGGCACCGATACTGGAAAATTGGATTCTGTTACTGCAGTCACTGATTCGAATACATATACAACCCGTTATGATTATACTGCGGAAGGCAGACTGTCAACTATAAAGCCCCACAGTGACAGTGATTCTTATCGGTATCAAATTAATTATGATACATTTGGCAATGTGACAAACACGCTGGTAGGTACACAAACTCTTATGACCAATACCTATAAGGCCAATAACAGAGGTCTTGACTACAACTCCTTTGGTAACAACTATAAGGTCAGGTATATCTACGACGAATACAACAGAGTAATAGAAAGTAAATACGGAACCGACCTAAGTAACATGACAAGCCGATACAAATATACCTATGATAATGAGGGGAATTTGTATCAACACCAGGATTTATCAAGCAACAGATCCTACACATATTCGTATGATCTTGCGAAACGCTTGACAAGAGTCAGCGGAACAAATCATGAGATGAGATTTAAATATGATGCATACAATCGTTTGGCGGATTATTTTAATATCTTCGGGTCAACATCCTA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PROTEIN sequence
Length: 2203
MKRIKMFTQVTAIVLCMALCFSIVPIAASASSLKQTNKETIPISETKKNEPSPYIIGEEKSKRGFNTKHFKMSDGTYTAVMYKDPVHKKVNEKWVDIDNTLQESIDSAGTKKINNTNGLYDVNFKTSASNKNMINIQVNGYSISWRLNDSESVNVEEADLYSDVYNNLKIAKSDEKIKAVEKTQRKVTYKDILKDINVEYTLLANKLKEDIVIKKRNDINSFSFTLQCDKLTPKLNKDKSIGLYDNKDNQVFVFDKPYMYDAKGNNSIDIGISIVKKAKDFILTIAPNREWLNDKSRIYPVTVDPSFQITRNYDSMDCGYIDLANPDSTFAGGATNKVGTQFLDGSYHINRSFVKFTRLPELTPNDMIIDASLEMYGAPKITVDEYGNPTFTDWDLSSYNYAMTAHQVTSSWDEYSLTWSNMSGNFDTTALDYSKVTNNNTIYNWDITKAVKNWYRQDDASNNYGIMLRYSDESSGNGIAELWGSNGPYDSLVPQLIVTYVNNVGLENYWSYHSHSAGEAGTGWVNDYTGNLVFQHTDIAMSGNRMPMAIAHVYNSKKYYKNFFPNDSDPSTPAGLNSGYGWQMNISQRIDVVTGDLAYSFPYKLTDADGTEHYFSLESTGVWKDEFDPSTKLTRPIEGGVEIYQIKDKNDNILKFTSNGYLKNVIDANGNTITYVYAGEYVTAIIDGAGRYTYISRNGDHISAITDPDNRVTTFSYTNGRLTSIQDSDGSTSYFAYDSNGILNKVTSADSYKIRYTYTLDDNASPQLTQIDELGVNDTDESDNGNSLQFDYTNPDATVVTDPGNDSSYATEDDNYYTSYNFDNYGRTIDVSDKFGNTNVYKYLNTADSSNNKLSGTASANKPVFNLLTNSGAENGSTDWYTPPTSTDANVYNGTHSFMLSDGNYFARGYDYSEQFGRDLTMSCYIKTDGATSGTGARFSVQGYNQSGHNLSIESTQVYDSDPSRDVNGWVRVKVSFTLPTDTVAFWFFCLSATGGTTYFDCFQLEKGLVMNRFSLLENSSFENESSTLPSGWTGSSLNAAYDYLVSDSSVLENTKIDGTKAFKITGAVNTAKKLYQTVYVGGAQGDFYTLSGRAKANSVPTGFDNRLFALGAEVVYSDGSTGPDPIIIPFNSDNANWQYTSGTFSLKHPSNTSITPIYLRIYCIYSYNANTAYFDALQLVRDESNSYTYDTNGNAISTADKAKTESSFNYTNNNLNSMINPDGTSFTYSYDSKHNMVEARSSNDLRYAVTYDSYGNPTAASTSALQTARSIVNNTEYTITAVNSSWRVDIAGTGSAQDTNAANTVTNSQQSTNTQKWKAVYVSGAGDDSLYKLVSVNSATGRVLSAMFSSEGTIVKLYSYVGFSGQLWKFAKKADGTYRIIPSNALNKCLTEEKTIGTTPGQYIKIQTFSDAKTDDSNQKWRIDPVSQSYAKYFTNTAEYTTDGNYPSKTEDSLGNQTFYNYDSSNGLLKGVTDPRSNQKTYQYEQYNGTDTGKLDSVTAVTDSNTYTTRYDYTAEGRLSTIKPHSDSDSYRYQINYDTFGNVTNTLVGTQTLMTNTYKANNRGLDYNSFGNNYKVRYIYDEYNRVIESKYGTDLSNMTSRYKYTYDNEGNLYQHQDLSSNRSYTYSYDLAKRLTRVSGTNHEMRFKYDAYNRLADYFNIFGSTSYKTSYVYGSGASSSSQSGLIYGVKVNDTQKLTYTYDGLSRSSTRTLNGANNYVSTYSYVDGASNKTSTLLSSITNSGSTLSYTYDANGNIETISENGVLKTRYYYDSLNQLTRENNQYTGKTIFYSYDTGGNLRIKYEWAYFEAQYPSGPTTATLYYSYSDANWKDKLTYYNGQAITYDEIGNPLTYEDKTLYWQGRQLRAIEGSWGVSYYQYNDSGIRTQKGISGNVTNYYLNGDQVVREVSPYDTLDYFYDDNNNLFSFKLNGTEYYYIDAAGNQVVSYVYDTWGNILSITGSLASTVGAMNPYRYRGYRYDWDTGLYYLNSRYYNPQWGRFINADAFVTGELLGTNLFAYCNNNPVNNVDPSGYHCYYNTTPEEYFAAEVRSREYVNYYNAHPDEYRTYWSYMKTIDVPAYDPREYEALGYLTGEESTFSKLIREGTDKIERADAWCGYKFVLYFNQTGTEQLKIAGQAYYYGMAALCAPIPVGGPIAAGVLSASGIIFSSYIDFLNADNSGVKLELYFSRDNVFLQPWLTDR*