ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

SCNpilot_bf_inoc_scaffold_50_curated_88

Organism: scnpilot_dereplicated_Clostridiales_1

near complete RP 49 / 55 MC: 5 BSCG 51 / 51 MC: 4 ASCG 14 / 38 MC: 4
Location: 110464..115785

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
Leucine-rich repeat domain protein (LPXTG motif) n=2 Tax=Listeria monocytogenes RepID=J7N717_LISMN similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 24.0
  • Coverage: 613.0
  • Bit_score: 100
  • Evalue 2.10e-17
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 24.0
  • Coverage: 613.0
  • Bit_score: 100
  • Evalue 6.60e-18
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:ERT64012.1}; Flags: Fragment;; TaxID=1111133 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Peptoniphilaceae; Peptoniphilus.;" source="Peptoniphilus sp. BV3AC2.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 23.0
  • Coverage: 805.0
  • Bit_score: 98
  • Evalue 8.50e-17

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Peptoniphilus sp. BV3AC2 → Peptoniphilus → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5322
ATGGACAAAAATCTAACTGTAGTAAATCCATTGGTTAAGAGAATATTTTCGATCCTCTTAACATTCGTATTGGTGCTAGGCATGATACCCGCACCTACATTTGCGTTACCAGATGGCGTAACGATTACCAATTCGGGTAGCGACCCGACAACTGCACTTCCAACTTCACTTCAAAATGGTGAATTATGGACTGACAAAAGTGTCAGTTATGCAGGGGATGGCATATTTAATATCACATTAAGTGCGATCGGGCAAGATTTTAAGGTAACAAATCCACCTAAAAAACTAGATGTAATTTTGGCACTAGATTTTTCTTACAGTATGAATTCAAACTCAAAGCTTACTAATGAAAAAAATGCAGCGAAAGCTATTGCAGGTAATCTTATCGATGCAGGGCATAGAGTTGCTATAGTGAAATACAACGACAGTGCATCGTTACAGTATAATTTTTCAACCAATAAAACCAATGTTCAAAACAAGATAGATGAGGGCTTTGGAGGTACTTACACTGATATTCAAAATGCATTTTTAGTATCAGAGCAAACCTTTAATAACAGACCATCTAAAACCAATCAGCCGGTATTAATTATCATAAGTGATGGTGAACCAACCATTTACCATGAGAATTTAGCTGATCATAGCATTAACAGCCAACGTCATCAGTCCGCTTCAAGTGGTAGTGACTATGTCTGGTGGACCATTCAACAAGGTATGAAATTAAAACTTGGTCAAGACGGCATTGAGTCAGACGATGACGTTAAGATATACACTATTGGATTTGATTTATTGGGTAATTCTCTAGCTGCATCGACATTGCAACCAACTGAATCGAATACCAGCAGCGTTAGACCTTCAGCTTATAACTTTGATGAAAGAAACAGACAAGAATCTGGACTTTATAGAGTTAAAAGCAATGGTAGTTTGTATACACCAATTGAATCAACTGGTACGATTACCACTGTACTAGGAAATTGGACTGCTAATACGGCTTCTTCAAGTCCATCTAATTATTTGGATGATCCTGTTTTATCTGGAAGTACACAAATTATAAATGGTACAAGATATAAACAAGGTGTCAGATCTGGAAAGGACTATCAAAATATTATCTTTAATCAAGAGGCATTTAATCAAAAGTATTGGGAAGATGGTTTTATAATCGGAAGTGATTACACATCACTTTACAATGCTCTCAATGCAATCACTCAGAGCTTTTCTGTTTCAAAACCGCTTCAATACATTTCAAATACTGGATATTCAAATCTAGTGATCGAGGATGTTTTGGGATCAGGGTTTGAATTGCTCGGTTTACTGCCAAGTGGTATGAGTCAATCAGGGAATACGCTTACTTGGACTGTAAATGGTGATGATTTTGTAACCATGCCAGTGGACAGCGTAGCAGTTGACCCTCTGAAGGTAAGTAAAGTTACCTTCCAGGTTAAGGTAAAGGATAATGCAGCAGTCAACACGCAATTGTTTACAAATGCTTCAGCAAAAGCGACGTTTACTGTAACAGATGAAAATCCATTTTATCCAAGTGCACCTTTAAACAGGGAACAAAATTTACCGAACAAGGGCTGGTTAACCTTAAGTGCACCTCCTGTGCATGCAAGTATAACCGTTACAAAACAAGTTATTGGTCCAGTTACCAACGTAGCTAGAGTTTTCAGCTTTACACTTTATGATGCTGCAAGCAATGGCAATGTAGTCAGTGGTCCAATCAATATCACTGTGACAGGTGCAAGTAGCAATACAGGCACATTTACCTTTGATATTCCTTACAATGGTTTTAGTAATAACCAAGTGACTTATTATATCCAAGAAAATGAATCCGCACCAAATAGCTTCTGGAGCTATGATAATACAGCTCGTAAAGCGATTACTTTGTCAAGAGCTGTACCAACAGGTTCTAAAACCTTTACAAACAGCTATGCACCAACGGGTACCTTAACTGTAGACAAAACTTGGACGGGAGACGGCCCAGATACGGCTGCAAGCTTCAAGCTCTATAAAAAGGTAGGCAATGATTGGGTTGCTGCTTCTCAAGGTAGCTATTCTATAGACACCAGCTCACCAGCTACTTCACAAGTAACCATCAGTAATTTAAGCTTAGATACTGAATATAAGGTAATTGAAGATCCAATGTTAGATTATGAGGTTTCTTATTCACCTCAAACGATAATGTTTAACTCAGCAGATCTAATAGCTGGTAATGGCGTTTTAACAAAGAACATTACCATTACAAATGAATATCATAAACCTATTGGAAAGATTACGATTAATAAGGTATGGTCAGATGCTGAGGACGTAGCTCAGGATAGACCAAGTGAACTGACCTTTAACATCGTTGGTCCTGAAGCGTATGATGGTCCTTCAACTATAACCTTAAAGGCATCGGAAGGCTGGACAAAGGATTTTGAAACAGAAGTCTTTGGTACTTATCAATTTACTGAAGTTCTTCCTTTAGACTATGTGATTACTGAAAATACACTTAACCCTCAATCACAAAGTGTTTCTATCTTACCAGTAGATGCTAGAGAAGCTAGCTTAACGTTCTCTAACACTTATGTTGAGCCTAAAGGTAGTTTAACCATTAAGAAGATTTGGGAAAATGAAGATGATTTATATGCTTCATATAGACCAGATTCAATCACAATTAAGCTATTTAAAGATGGTGTAGATACACAGCTTTCAGTTGTTTTACCTGAAGCGGATGATACACCTTGGGAACACACATTTACTGACTTGCCATTTGGTGAATATTCAGTTGAAGAAATTGATGTCCCAGATTACACGGTCACTTATTCAGACAATGTATTTTTGAATAAGTTTGATGACAATCACGGCATATCAGAAAGAACAGGCCAAATTAATATTACCAATACCTTTGATGAACCAAAGGGAAGTATTATAGTTTCAAAAACTTGGGTCGAAACAGATGTGGATGCATCCGTGGTTAGACCAAGTAGCATCGTCGTATCACTCCAAAAAGATGGCGCCCCATTTGATACAGCTGAGTTAAACGCAGCGAACAATTGGACGACAACCTTTGATGAGCTACTACTAGATAACGGCATATATACAGTTTCTGAATCCTCAACAGATTCTGATAAGCTCTCTATGTATGCTGAGCAAATTAGCTACAGTGCAAATGAAGCCTCTGAAAGTGATTTGCAATTAGGTCCAAGCTCTAGAAGTGGAACGATTGCAATTACAAACACCTATGCAAAAGGAACGATTACAGTGAACAAGGTTTGGGAAGATGGAAATAATCCTGTTGCTGAAAGACCATCAGGTGCATTTATTACGCTTCATAAGGTAACTATTTTACCGCCAATCGTAGTTGATCCGATACCAGATCCAGAGCATCCAGATCAATTTATAACACCACCACCTATCGTTCAACCACCAGTTGATGAAACTGTAGCTACCTTAGCGATAGTAAGACCAGTAAATGCGCCAGTAGTATTCTATAATCTAGAATTAGGCGATAATATTAGCTACTATATAACTGAGGGAGACATTCCTTTCTACAATTCATCAATTAATAAATCTTTAGTTGTATTAAATGAAAATAATCAAAATGATTCGTTTACAGTGACAAACACTTATACAGATCCTAAAGGCAGCTTAACTGTTAACAAGACTTGGGATCATGGCAATAATCCTAACCAGCCTACTGAAGTAACCGTTGAGCTTTATGAAGATGGTATCTACAAAACTCAAGCGACATTTAGCTCAAATTATACTTTTACAGGTCTTGATTTAGGAAAGACTTATACCATTCTTGAGGTATCAGTTGACAATTATAGTGCAGATTACAATGGTTTCGTAAGCTATAAACCTGTAAAAGGACAAAGTAGTGTGGCTGGAGGATCAGCGACAATTGAAAACACTTATATTCCTGAGCTGAATGACTTAACCGTCAACAAGGATTGGGTTGGATTAGTGGGCGCTCCAATTACCGTTACACTATATAGATCTGTAGGCGAAGGCTTATCCTTAGTTGGAACAACCGTACTCGATAACGAAAATGAATGGTCTCATACTTTCACAGGACTCGAAATCTATGGTCCAGGTGGCGTGAGATACACTTATTCAGTTTCTGAAAATGGTGCAGGACTATCGTTATATGACACAGATACCTCAGACACGGCACAATTAAATGTAGAGGTACCAAGTGAAATTACAATTACAAACACCTATTCACCAAATAAAGGTGAACTTACAATTACTAAAACTTGGTTAGGACTTGACGAAGAAGAGATAACACCACCAGTTGACTCGGTTGAAGTTAGATTAATCGTCAATGGCGAACCAGAAGAAACCAATATGGTTTTAAACGCTGAAAATAATTGGACTGTAGTAAGAACTGGTCTTAATGCAGAGGCGACCTATTCTGTAGAAGAAATGACAACCTTTGAAGAGTTTGATGTATCCTATAGTGCTTCAGAAATCACATTTGATGCTGAAAACCTCAAAAAATCCGTTGAAATCATTAATCTTAGAACAGAAGATCAACCTAGCATCGATGTTAATAAATCGATTTCAAATGCATTAGTACAGCTTTCATCAGGCACAGCAACCTTTAATTACAGTGTTGAATTAATTAACAATGGTAACAGAACTCTTAATGCACTTAGAGTGGTCGATCTCATGACAGGACCTCAAGGCTCAAATAGGGTTTACGCACCAGCTCCAAATAGTCAGGATGAAAATGGTGCAGTATTTGAATTAGAGGGCTCTTTGAAACCGGGTGATAAGGTTGTCTTTAACTATAGCGTAACTGTAAATCTAGCAGGAACTTATGTAAATACTGCAACTGGTTATGGTTATTATGTAGAAACTGAAGTTAGTGATGATGGCACTGCAACAGCAGTAGCAACAAATCCACCAACACCTACTCCAGATCCTGATCCAACACCAAACGGTTTGGTAAACGTTACATTTGTGGATACAAATGGCGTTACTTTATCAGCTGGCTATCAAATGGTTGGAGTGGTTGGCACTAACTATTCAACCACTGCTAGAGATATCCTTGGCTATGATTTAGTAGCAACACCAGCAAATGCAAATGGTACCTTTATCAATGGCACACTTTCAGTCGTATATGTTTACGATGTACCTGTTGAGATCACAACTGAAGAAACACCTTTGGGCGAAGCGACTACAGAATCAACAACTGAAGAAGAAGTGATTGTGGATGAAGGCACTCCTCTTGGTGAAGCTTTACCACAAACTGGTCAATTACCTCCAGAGCTCTTCTACGGCATCGGTAGTATCGTTACTGCAGCAGGTGTCTTCATGAAAAGAAAAAACAAATAG
PROTEIN sequence
Length: 1774
MDKNLTVVNPLVKRIFSILLTFVLVLGMIPAPTFALPDGVTITNSGSDPTTALPTSLQNGELWTDKSVSYAGDGIFNITLSAIGQDFKVTNPPKKLDVILALDFSYSMNSNSKLTNEKNAAKAIAGNLIDAGHRVAIVKYNDSASLQYNFSTNKTNVQNKIDEGFGGTYTDIQNAFLVSEQTFNNRPSKTNQPVLIIISDGEPTIYHENLADHSINSQRHQSASSGSDYVWWTIQQGMKLKLGQDGIESDDDVKIYTIGFDLLGNSLAASTLQPTESNTSSVRPSAYNFDERNRQESGLYRVKSNGSLYTPIESTGTITTVLGNWTANTASSSPSNYLDDPVLSGSTQIINGTRYKQGVRSGKDYQNIIFNQEAFNQKYWEDGFIIGSDYTSLYNALNAITQSFSVSKPLQYISNTGYSNLVIEDVLGSGFELLGLLPSGMSQSGNTLTWTVNGDDFVTMPVDSVAVDPLKVSKVTFQVKVKDNAAVNTQLFTNASAKATFTVTDENPFYPSAPLNREQNLPNKGWLTLSAPPVHASITVTKQVIGPVTNVARVFSFTLYDAASNGNVVSGPINITVTGASSNTGTFTFDIPYNGFSNNQVTYYIQENESAPNSFWSYDNTARKAITLSRAVPTGSKTFTNSYAPTGTLTVDKTWTGDGPDTAASFKLYKKVGNDWVAASQGSYSIDTSSPATSQVTISNLSLDTEYKVIEDPMLDYEVSYSPQTIMFNSADLIAGNGVLTKNITITNEYHKPIGKITINKVWSDAEDVAQDRPSELTFNIVGPEAYDGPSTITLKASEGWTKDFETEVFGTYQFTEVLPLDYVITENTLNPQSQSVSILPVDAREASLTFSNTYVEPKGSLTIKKIWENEDDLYASYRPDSITIKLFKDGVDTQLSVVLPEADDTPWEHTFTDLPFGEYSVEEIDVPDYTVTYSDNVFLNKFDDNHGISERTGQINITNTFDEPKGSIIVSKTWVETDVDASVVRPSSIVVSLQKDGAPFDTAELNAANNWTTTFDELLLDNGIYTVSESSTDSDKLSMYAEQISYSANEASESDLQLGPSSRSGTIAITNTYAKGTITVNKVWEDGNNPVAERPSGAFITLHKVTILPPIVVDPIPDPEHPDQFITPPPIVQPPVDETVATLAIVRPVNAPVVFYNLELGDNISYYITEGDIPFYNSSINKSLVVLNENNQNDSFTVTNTYTDPKGSLTVNKTWDHGNNPNQPTEVTVELYEDGIYKTQATFSSNYTFTGLDLGKTYTILEVSVDNYSADYNGFVSYKPVKGQSSVAGGSATIENTYIPELNDLTVNKDWVGLVGAPITVTLYRSVGEGLSLVGTTVLDNENEWSHTFTGLEIYGPGGVRYTYSVSENGAGLSLYDTDTSDTAQLNVEVPSEITITNTYSPNKGELTITKTWLGLDEEEITPPVDSVEVRLIVNGEPEETNMVLNAENNWTVVRTGLNAEATYSVEEMTTFEEFDVSYSASEITFDAENLKKSVEIINLRTEDQPSIDVNKSISNALVQLSSGTATFNYSVELINNGNRTLNALRVVDLMTGPQGSNRVYAPAPNSQDENGAVFELEGSLKPGDKVVFNYSVTVNLAGTYVNTATGYGYYVETEVSDDGTATAVATNPPTPTPDPDPTPNGLVNVTFVDTNGVTLSAGYQMVGVVGTNYSTTARDILGYDLVATPANANGTFINGTLSVVYVYDVPVEITTEETPLGEATTESTTEEEVIVDEGTPLGEALPQTGQLPPELFYGIGSIVTAAGVFMKRKNK*