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RTP_09252017_15_scaffold_24_10

Organism: RTP_09252017_15_Sphingobacteria_36_17

near complete RP 50 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 12 / 38
Location: 16521..20045

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
hypothetical protein n=1 Tax=Gracilimonas tropica RepID=UPI00038295DD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 52.6
  • Coverage: 1161.0
  • Bit_score: 1228
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug {ECO:0000313|EMBL:ACY48963.1}; Flags: Precursor;; TaxID=518766 species="Bacteria; Bacteroidetes; Bacteroidetes Order II. Incertae sedis; Rhodothermaceae; Rhodothermus.;" source="Rhodothermus marinus (strain ATCC 43812 / DSM 4252 / R-10); (Rhodothermus obamensis).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 50.4
  • Coverage: 1149.0
  • Bit_score: 1149
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 50.4
  • Coverage: 1149.0
  • Bit_score: 1149
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Rhodothermus marinus → Rhodothermus → Bacteroidetes Order II. Incertae sedis → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3525
ATGGGAAAAAAAGAATCTTTTCCAATTAAAAATCTTCTTTTCTCTGTCACAAGAGGAATTAAAATTGGATTTTTATTAATTATCATTTCAATTCAGCTTTCGGCAAAAAACTTTGCTCAGCAAAAAATTTCGTTGGATTCAGAAAAAACTGATATTCAAACTGTTTTTAAAATGATTGAAAAACAGTCCACTTATCGCTTTTTTTACAGTAACGATGTATTGCCTGCAAATAAAGAAGTTACAGCGCAGTTCAAAGATGCTTATGTCGAAGTGATCTTGAATAAAATATTAGACGGACTCCCAGTTACATGGAAATTTATGGATGATAAAAACATTGTCATCTCTAATAAATCAAGTAATACTATTTCAGCCTCATTTAGTGTAATAGCTGATACTGTTGTTTCTGGTGTTGTTAGAGCTTCTGAAGATGGTGAACCACTAAAAGGAGTAAGTGTGACTGTGAAGGGCAGTTCACTTAAAACAATCACGGATGACAATGGAAAGTATCAAATTAAGTTAGCTTCAGTGAATAACACTTTAGTTTTTAGCTATGTTGGCTATCTTAATAAAGAAGTTGTAGCAAGTAAGTCTAGTGATTTAAATGTGGCATTAAAAGTCAATTCAAAGGCATTAGATGAAGTGGTCGTGGTAGGTTATGGTAAGCAAAAAAGAAAAGAAATTACAGGTGCGATTGCCAGTATCAATGAATCTCAGCTTAAAGAGATTGCGGTTAGTAGTTTTGAGAATGCCATTCAAGGTCGAGTAGCAGGTTTAGAGGTGTCAGTACCTTCTGGAGAGCCTGGTTCGGCGCCAGTGATTAGAATTAGAGGTTCTGCATCTATTTCAGCAGGAAATGATCCTTTATATGTAATAGATGGTTTACCAATCTCAAGCAACACTGGTTTACAACAAAATATAGGACAAAGAACAGAGGCGTATACAGTGCCTAAAATCAATCCTTTTACAACAATCAATCCAAATGATATACAATCTATTGAAGTATTAAAAGATGCTTCTGCAGCTGGTATTTATGGATCAAGAGGTTCGAATGGGGTGATTATGGTAACGACTAAAAAAGGATTAAAAAATAGAAAACAAGTTTCATTCAATGCTTATACAGGTATGAATGAAGCAATGAATTTGCCTGATTTAATGGGTTCAGAAGAATTAATCCAGTATACCAAAGAAACTAGAAACAATAACTATTTACAAACCAACGATCCAACAAATCCTGCTAGTAAAACATACAACGCATTATACAATCCTAATACAAATGCAGGAAGAGGAACACAAGCCAATTTCTTAATTCCAGAAAAATATGTAAACTGGGATGGTACCAATACTGATTGGTTAAGCTTAGTGCTTTCAAGAGGCATGGTGTCTAATTACAATTTATCTGTGAGTGGTGGAAAAGATAATATGACCTATTATACTTCAGCTGGCTACTATACAGAAGAGGGAACAATTAAGGGTTCTAAATTTGATCGTTATACATTTAGAGCAAATGTGGTAGATGATATTTCTTCTAAATTTCAAATTGGTTCTAGTGTAAATATTGCTTTTACAGATAACAATCGTTTACCTGCGAATGGACCTTATTTTGCATTACCTCCAGGAATTATTTATGATGCCATGGTGCACTCGCCAGTGATTAAGCCTTATTTGCCTGATGGAAGCATCAATCAGTCTGATAACCAAAATCAACTGGGTGCTTATATGACAACTGCTAATAATCCTTTGGCAACAATGGAAGCAATTAAGGAAAATATCCGTAACCTTAGAATATTTGGAAATAGTTATCTTAAGTATAGTATCTTACCAAATTTAGCATTCAAGACTTATATTGGAATTGACCTGGATAATTATCAACAGTCTTATTATAAAGGGGTTACCTTATTATATAGAGGTGCAACTAAACCTGATCCATTTGCAAAATCTAGTACTTCACAAGGTTTAAATTGGATTTGGGAAAATACTTTAGATTATTCTAAAACATTTAACGACCACACATTGACATTGCTTGGAGGCTATACTGCACAAAAGCAAAACAACGATTTACAATTTATACAAGCAAATAGTTTCCCAGATGATCAGGTAACCACAATTAGTGGCGGTATAGTGACTGGCGGATCTGCTGTGAAAGAACAATGGACTTTGGTTTCTGCTTTAGCAAGAGCGAACTATTCTTATAAAGACAAGTATTTATTGTCTGCATTAATTCGTTCAGATAAATCATCAAGATTTGGAACAGGCAATCAGACTGGTATCTTCCCATCCGTTTCTGCTGGTTGGAGAATTGACCAAGAATCATTTATGACAAATGTTGAATTTGTGAATGAATTGAAGCTTAGAGCAAGTTATGGTTTCACTGGTAACTTCCAGATTCCTAACTATGGCTCTATTGGTTTATTAAATAACGCAAATTATGTATTTGGCAATGCTTTGGTGAATGGTATTGGAAGATCCACATTAAATAATGACAAATTAAGCTGGGAGTCTAAAAAGCAATTGGATATTGGATTGGACTTTGGTTTATTCAATGATCGTATTTATGGTGGATTTGACTATTATAATAGTGTAACATCAGATTTATTGTTGAATGTTAATATTGCTTCCTCTGCTGGTTTTACAACTGCATTAACGAATGTTGGTGAGGTAGAAAATAAAGGTCTTGAGTTTACTTTAAATACAAGAAATACAGTAGGCAAATTTCAATGGTCTACAGATTTTAATATCAGTGCGAATAAAAACAAGGTGTTAAAACTTGGACCAACTGGAGATCCTATTTTGAGTGTTGGTAGTGCCGGTGATATCAGACACATCACTAGAATTGGAAACCCTGTAGGTAGTTATTATGGCTATCAAGTGGTTGGTGTATATCAAACAATGGAACAAATTGCAGCTGCACCAAAAGATTTACTAGTTGGCGCAGGAGGTGCAAGACCTGGTGATTTACAGTTCAAAGATGTAAATGGGGATGGTCAAATTACTCCATTAGACAGAACAACACTTGGAAACTACATGCCTGATTTTACTTATGGTATTACGAATAAATTTAGGTATGCCAATTTTGATTTAAGCATTTTCGTTCAAGGCGTAGAGGGTAGAGAAATTTTGAACTTGACACAAAGACACCTTTTGAATGGGGAAGCCAATTTTAACTCTTATGCTGCGTTTAAAGACAGATGGGTATCTGCTGAACAACCAGGCAATGGTAAATTTCCAAGAGGGGATAGTAATTCTGGATTACACGGTTTTAATATGAGACCATCTTCTTTTCAGGTGGAAGACGGATCTTATGTAAGATTAAGAAATGTAACCCTAGGGTATGAATTTCCTATTAAAGGCGTATCTAAAAAAGCAAGAGTATATGTAACTGGTACAAACTTATTCATATGGTCTAACTATTTAGGTTTTAATCCAGAAGTACAACAACAAGCAACAAACAATCTTGTTCCTGGAGAAGATTATGGAGCATATCCAATTTCTAGAACATTTTTAGTTGGATTTAATCTTACATTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1175
MGKKESFPIKNLLFSVTRGIKIGFLLIIISIQLSAKNFAQQKISLDSEKTDIQTVFKMIEKQSTYRFFYSNDVLPANKEVTAQFKDAYVEVILNKILDGLPVTWKFMDDKNIVISNKSSNTISASFSVIADTVVSGVVRASEDGEPLKGVSVTVKGSSLKTITDDNGKYQIKLASVNNTLVFSYVGYLNKEVVASKSSDLNVALKVNSKALDEVVVVGYGKQKRKEITGAIASINESQLKEIAVSSFENAIQGRVAGLEVSVPSGEPGSAPVIRIRGSASISAGNDPLYVIDGLPISSNTGLQQNIGQRTEAYTVPKINPFTTINPNDIQSIEVLKDASAAGIYGSRGSNGVIMVTTKKGLKNRKQVSFNAYTGMNEAMNLPDLMGSEELIQYTKETRNNNYLQTNDPTNPASKTYNALYNPNTNAGRGTQANFLIPEKYVNWDGTNTDWLSLVLSRGMVSNYNLSVSGGKDNMTYYTSAGYYTEEGTIKGSKFDRYTFRANVVDDISSKFQIGSSVNIAFTDNNRLPANGPYFALPPGIIYDAMVHSPVIKPYLPDGSINQSDNQNQLGAYMTTANNPLATMEAIKENIRNLRIFGNSYLKYSILPNLAFKTYIGIDLDNYQQSYYKGVTLLYRGATKPDPFAKSSTSQGLNWIWENTLDYSKTFNDHTLTLLGGYTAQKQNNDLQFIQANSFPDDQVTTISGGIVTGGSAVKEQWTLVSALARANYSYKDKYLLSALIRSDKSSRFGTGNQTGIFPSVSAGWRIDQESFMTNVEFVNELKLRASYGFTGNFQIPNYGSIGLLNNANYVFGNALVNGIGRSTLNNDKLSWESKKQLDIGLDFGLFNDRIYGGFDYYNSVTSDLLLNVNIASSAGFTTALTNVGEVENKGLEFTLNTRNTVGKFQWSTDFNISANKNKVLKLGPTGDPILSVGSAGDIRHITRIGNPVGSYYGYQVVGVYQTMEQIAAAPKDLLVGAGGARPGDLQFKDVNGDGQITPLDRTTLGNYMPDFTYGITNKFRYANFDLSIFVQGVEGREILNLTQRHLLNGEANFNSYAAFKDRWVSAEQPGNGKFPRGDSNSGLHGFNMRPSSFQVEDGSYVRLRNVTLGYEFPIKGVSKKARVYVTGTNLFIWSNYLGFNPEVQQQATNNLVPGEDYGAYPISRTFLVGFNLTF*