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rifcsphigho2_01_scaffold_8224_21

Organism: RIFCSPHIGHO2_01_FULL_Archaea_Pacearchaeota_37_200

partial RP 35 / 55 MC: 5 BSCG 5 / 51 ASCG 28 / 38
Location: comp(16857..19739)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Na-Ca exchanger/integrin-beta4 Tax=RBG_13_RIF_OD1_08_40_8_curated UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 40.5
  • Coverage: 247.0
  • Bit_score: 178
  • Evalue 6.00e-41

Lists

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Notes

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Taxonomy

RBG_13_RIF_OD1_08_40_8_curated → RIF-OD1-8 → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2883
ATGAAGCTATATATGGTAAAGAAAGGGGTTGGTGTGAGGGTAAGGGGAAGAAATATGGTTATAATTTTATTAGCTATAATCTTTGTTTTCATTTTAAGCCCAATTACAGTTTCAGCTTTTAGTTTTGACAATCTTTTTAATAAACTATTTGGCAGACAATCTGATTCTAAAACCGATATAACTGGCTTTGCTCCGCAGGTTGGAACTGCATATAGTATTGGCCCAATATGCAATGATTCGGATTCAAATTCGACATATCCTAACGGTTTAAATTATTACAAGAAAGGGCTGGCAGATGGGCGCGTCAATGGAATTGGTTCATGGTATGAAGACATATGTCTTTATTTAAATCAGACAGGGCCAAGAAGCTGGCAGTACGTACGAGTTGATGGTTGTTCTGGAAGCAATTGTAATTTGCAAGAAGGTTACTGTTCTGGCACGAGTGTTACAAATATTGCTTATAAATGTCCTTATGGATGTACTGGGGCAGCTTGCGCCCCCCGATGTGTGGATAACGATAATGGGAAAAATTATAGCATAAAAGCAAGTACAATCGGCACATGGAATATGTATCGAAATTCAGAAATTTTCGTCCAAGCAAATCAAACAGATTTATGTGGTAAGGACGTTTATCCAGTGGGAAGTGAGCAATACATACGTTATAAAGATAGATTATATGAATATTTCTGCACTTCAGATGGATATTTTGATAGTGAGACTTATATCTGCCCAAGCGGGAAGTGTGATAATGGGGCATGCGCCTCTATTGAAATAATTCCCGTCTCTTCTATCCTACTGGCCGACTTAAAGATAAACAATTTAGATAGTAATTTGACCGTAGATTTTAATTCGCCTTTAATTTTAAGCTGGAATTTTACTGGCGCAGATTATTGCTCATTAAATACAACGGAAGTATATTTATCAGACGGGACACCTTTTGACTCAAAACACCTAACAGAAAATAGTGGAAATATCACTTTATATGCAAGACCATTAAATGAGCTAACAAATTTATTAGAATTTGGAATTTATTGTTTAAATAACTCTTTAAACACCTCTGCTAAGGATACAATTTTTGTTAATATAAACGCTTCAACTTGTACTGATTCTGACGCTAGTGAGATTTATCCGAATGGATTAAACTTTAATATGAGGGGCAATGTATTAGATTATTCCGGTTCAGTGCATTCTGATAGTTGCTTATTGTTAAATGCAACAAAACCTGGAAAAGAACAATTTGTAATAACGAGATATTGTTTCGGTCTTAATTGTACTTTACAAGAAAATTATTGTTCAAATGGGGTAAGGGCTAATTTATTGTTTAATTGTACGGGGGGATGTTTAGATGGGGTATGCAGTAATATAGATCAAACTTGTAAAGATGGCACCCTCTATGGGCAATGCATGCAGGCCAAACCTAACTATTGCTATTTTGGCAATAGTATAGCAAAATGCTCTGTTTGTGGATGTAATGAGGGAGAAAGGTGCATTAATTCTACTGAATTTTGTGAGCAAATATTTGATTCTGTAAATTTTGAATCGATTGAGACACCCCTCGATTTTGATTTAGTGTATCCTCGTGGGCAGTTAATCAATTTATATCCCTTAGGTAGTGGATTTGAATTAATGAAAGAGGCAATCTACGAGATTTCAATTAATAACTCAGTTATTTTTAGAAGAAACGCAGATTGTGAACAGGAGGAATGTTTAATTACCACTTGGGAAGCAAATCAAGGAATATTAATTGGAAGAAACAACTACTTAGTTAATATAACTTTAATAGACCAAGAGGGTCTTTCCTTCAACAAGGAAGAGGTTTTCTCAATAGAGTTTAAAGAAATTGATTCTACATTATGCAACGAGCTTATAACTGGCCATAACAATGCTTCCGCTGATAGGGCAAATGTGATATTTGTAGGCTTCTTCGATGAGGTCATGGGCGCTGAGTGGTTATGTGGGGATGCTTTGCAGACATTCTGTGCGGATACGTATTCAGTAGGGAAAATAGTAGCAAACTTAGTAAGTACTAATGCAACTACAAATTCAATCACATTTTATTGTGAAAATCCGGAGGATGGATTTAGGAGTTTGAATTATACCAAGTCCCTTACAGAATTAAGTAACTATGATTCTAGGTGTGAACAAATTCAGGATACCCGAGAAGAAGTTTTAAAAAAAATTTCAGAATATTTTTTAGATCTGGATGGGAACAACAAAGGGTTATTTTCTATTGAACCCTTTAAGAGCAATGTGAATAGATTTAATTTTTGGTATGTAAATAAAACTCAATCTTTAGATTATTGTTCTAAACCTGAAGGCGGGTGGGGAGAGGCTTCTTGTGAGGATCCCACCCTAGACGCAAATTGTTTATTGCCTAATAAATATGTTACATTCATTATAGATAACTCTTTTAGATCGAATGCCGGTCCCCCAATAATGCTTTCCTCACCCCTTGCCCAGAATACTAGTCCCTACTCTGTTCAAGCAACAACCTTTGTTCATGAATTTGGCCATCAATTTGGAGTTCTCAGAGATGAATACATAGAATACCCTGGAAGCCATCATTCATACGGAACTGAGGATAGATTCAAGAACTGTTATGCAGGTTTACAACAAACTCGTGATGAATGCCTACAAAATTCCCAATGGAAGTATTTTATTGGGCGCGGATGTGGAAACGAAAGTAGAATTGATTGTACTGAAGAAGATGCAAACTATTCTTTAGAGATCGGATGCTTTGAAGGGTGTAGTTATACAGAGTTTGGGATCTTTAGACCTTCGTTTAATAGCATCATGCGATGTCATGGATGTGAACCATTTTCATTTGGCCCATGGAACGAAAAATTAATTAATGACGTTTTACAACAATTTGGAGATAGATAA
PROTEIN sequence
Length: 961
MKLYMVKKGVGVRVRGRNMVIILLAIIFVFILSPITVSAFSFDNLFNKLFGRQSDSKTDITGFAPQVGTAYSIGPICNDSDSNSTYPNGLNYYKKGLADGRVNGIGSWYEDICLYLNQTGPRSWQYVRVDGCSGSNCNLQEGYCSGTSVTNIAYKCPYGCTGAACAPRCVDNDNGKNYSIKASTIGTWNMYRNSEIFVQANQTDLCGKDVYPVGSEQYIRYKDRLYEYFCTSDGYFDSETYICPSGKCDNGACASIEIIPVSSILLADLKINNLDSNLTVDFNSPLILSWNFTGADYCSLNTTEVYLSDGTPFDSKHLTENSGNITLYARPLNELTNLLEFGIYCLNNSLNTSAKDTIFVNINASTCTDSDASEIYPNGLNFNMRGNVLDYSGSVHSDSCLLLNATKPGKEQFVITRYCFGLNCTLQENYCSNGVRANLLFNCTGGCLDGVCSNIDQTCKDGTLYGQCMQAKPNYCYFGNSIAKCSVCGCNEGERCINSTEFCEQIFDSVNFESIETPLDFDLVYPRGQLINLYPLGSGFELMKEAIYEISINNSVIFRRNADCEQEECLITTWEANQGILIGRNNYLVNITLIDQEGLSFNKEEVFSIEFKEIDSTLCNELITGHNNASADRANVIFVGFFDEVMGAEWLCGDALQTFCADTYSVGKIVANLVSTNATTNSITFYCENPEDGFRSLNYTKSLTELSNYDSRCEQIQDTREEVLKKISEYFLDLDGNNKGLFSIEPFKSNVNRFNFWYVNKTQSLDYCSKPEGGWGEASCEDPTLDANCLLPNKYVTFIIDNSFRSNAGPPIMLSSPLAQNTSPYSVQATTFVHEFGHQFGVLRDEYIEYPGSHHSYGTEDRFKNCYAGLQQTRDECLQNSQWKYFIGRGCGNESRIDCTEEDANYSLEIGCFEGCSYTEFGIFRPSFNSIMRCHGCEPFSFGPWNEKLINDVLQQFGDR*