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MEL_C3_68_11

Organism: MEL.C3

partial RP 36 / 55 MC: 3 BSCG 39 / 51 ASCG 0 / 38
Location: 9501..10553

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
transmembrane_regions (db=TMHMM db_id=tmhmm from=93 to=115) iprscan interpro
DB: TMHMM
  • Identity: null
  • Coverage: null
  • Bit_score: null
seg (db=Seg db_id=seg from=230 to=242) iprscan interpro
DB: Seg
  • Identity: null
  • Coverage: null
  • Bit_score: null
S_layer_CsaB: polysaccharide pyruvyl tra (db=HMMTigr db_id=TIGR03609 from=8 to=307 evalue=3.5e-78 interpro_id=IPR019896 interpro_description=Polysaccharide pyruvyl transferase, CsaB) iprscan interpro
DB: HMMTigr
  • Identity: null
  • Coverage: null
  • Bit_score: null
  • Evalue 3.50e-78

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. CAG:306 → Melainabacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1053
ATGGATGTTGATTTAAAAAAAAATGTTCTTATATCCGGATATTACGGTGATAAAAATTTTGGTGATGAAGCTATTCTTTATGTTCTTGTACAGAAGTTGAAAAATATAACAAAAAACATCTGTATTCTATCATCAGACCCTGAATTTACAAGTGAGGTTTATCTTGTAAATAGTGTTTATAAGTTTAATTTATTTAAAATATTAAAACAGATTTTTAAATCAGATGTTTTAATTTCAGGCGGTGGAAGCCTGCTTCAGGATGTTACGAGTTTAAAAAGTCTGCTTTATTACTTATTTATTATTTTTGTTTCGCTTTTGTTTAGCAAAGAAGTTATAATTTTTGCGCAAGGTATTGGACCTATAAATAATAAACTTGGACAGTTTCTAACTAAAAAGTTATTAAAACAAGTAAAACTAATAACAGTGCGTGATGTAAAAAGTTATGAATTGTTGAGAAGTTGGGGAATTGATTCAAAAATTATTAATGATCCAATGTTTGGTTTATCTCTTCCTCAAAATACTCCAATGAACAGAGTAGGTATTCAATTGAGACAATGGAAAACACTTACTTCAAAAATGTTAAATGAACTTGCTTTTGCTGTAAATAAAAATTTTTCTCATAAAGAAATATATATTTATTCACTTCAGGATAGTATTGATATGCCGGTATGTCAGGAATTTGCGCAAATATTGTTGAATATAAATCCCAAAATAAAGTTAAAATTAGAACATAATTTAAATATTCCCGAGATAATTTCAAGTTTTCGCAATTTGGATTTTATGCTTTCTATGCGTTTTCATGGTTGTTTACTTGCTTTAAAATATGGTATAAGGACCTGTGCATTAAGTTATGACCAGAAAGTTGAAAAATTAGCAGAAGAATTTGATATCCCATGTTTTAATTTAAATGCCAAATCTGAATATAATTTTGAAGATATTTTTAATAAACTTATAAGTATTGATAAACGACAATTATTTAATAAAGTTAATTCAATTAATTTTAATTTCCATCCAATTGAAGATTATTTAACAAAAATTAATAAAAACAGATAA
PROTEIN sequence
Length: 351
MDVDLKKNVLISGYYGDKNFGDEAILYVLVQKLKNITKNICILSSDPEFTSEVYLVNSVYKFNLFKILKQIFKSDVLISGGGSLLQDVTSLKSLLYYLFIIFVSLLFSKEVIIFAQGIGPINNKLGQFLTKKLLKQVKLITVRDVKSYELLRSWGIDSKIINDPMFGLSLPQNTPMNRVGIQLRQWKTLTSKMLNELAFAVNKNFSHKEIYIYSLQDSIDMPVCQEFAQILLNINPKIKLKLEHNLNIPEIISSFRNLDFMLSMRFHGCLLALKYGIRTCALSYDQKVEKLAEEFDIPCFNLNAKSEYNFEDIFNKLISIDKRQLFNKVNSINFNFHPIEDYLTKINKNR*