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MPI_scaffold_272_26

Organism: MPI_Nov_34_27_partial

partial RP 3 / 55 BSCG 3 / 51 ASCG 3 / 38
Location: comp(20917..22938)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Marine sediment metagenome DNA, contig: S01H1_L01978 {ECO:0000313|EMBL:GAF68582.1}; Flags: Fragment;; TaxID=412755 species="unclassified sequences; metagenomes; ecological metagenomes.;" source="marin UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 59.8
  • Coverage: 423.0
  • Bit_score: 494
  • Evalue 2.70e-136
O-antigen polymerase KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 23.9
  • Coverage: 711.0
  • Bit_score: 177
  • Evalue 1.40e-41
O-antigen ligase-related protein similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 215
  • Evalue 4.10e-53

Lists

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Notes

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Taxonomy

marine sediment metagenome

Sequences

DNA sequence
Length: 2022
TTGGAAAAGTACTGGATAGAAAAGGATAATAGTTATCAGAAACTGTTAACCATATTATTAAAATTAACATTATTATCCGTCCCCTTGTATGTAAATAAATATATCTATAATTTTAGGGTAAATCAGGAAGCCGTGCTTAAACTGTTTGCTGTATTTTTAATTGCGATTTGGCTAGTAAAAATAATAAATACCGAAAAATATTCTTTACAAAAGACCAAATTGGACCTGCCCATTATTCTATTTTCTTTGGCATTAATCCTTTCTCTTTTTATCAGCAAGACAAAGACGGTAAGTTTTCAGGAATTTATAATATTTTTATCTTATATTCTAATATTTTTTTTAATTACCAATAATTTAGATAATAAGGCAAATTTTAATTCATTTATTCATCTATTCTTTATAATCTCCTTAGTTGTTTCTATATACACCCTTATGCAGTATTATGGCATAGACCCCTATCTAAGTGATTTACACTCTTTAACTTCCACTATCGGCCAGAAAAACTGGATTTCCAATTACCTGGCGATGATTTTTCCGGGAGCGTTTTCTTATTTTTTATTAGAACAATCCCAAAAAAGAATACTCTATTTCTTACTACTATCTATCCTTTATACGACTTTAATGATCTGCCAGAGCCGGGGGATATGGATTAGCATCGGTCTTACTCTAATATTTGCCATTTATATTATTATTAAATTCAAACTTTATGAAATATTTCATAAAAATAAAAAATGGCTAACCTTGCTTTTAATAACACTTCTATTAATAACCATTATTTATTCTACCGACAATCCTCTAAACAAAAGCGCCATAACCGTTCCCCAGAGGGCAATGACCACCTTTGACGAGCAGGATCCTTCCATCAATACTCGTTTTTTAATTTGGAAGACTACTCTTGAGATGATTAAAGAACGACCCATATTGGGCTCAGGAATTGGCACTTTTAAAATGAATTATTTAGTCTACCAAGCAGAGTTTTTAAAAAATAATCCTTATTATATACAATATTCTGGAAAAGCCCGGGATGCTCATAATGAATATCTGCAGATGTGGGCTGAATTGGGGATAATCGGTTTGGGGATATTTATCGGAATTATTCTGATGTTTTATAGTTCAATAATAAATTATTTAAAAAAAGTTAATAAAGATAATGAGAAAGATAAAATAATTGTCTTTGGATTGATTTTGGGTATTACCTGTTTTTTAATTCATTCGATTTTTACCTTTCCTTTGCGTGTACCGGCATTAGGAGTAACCTTTTTTGCCTTATTGGGATTAACTGTAATATATATCAGAAAGATAAATTTAGATAAAACTTGTTCTGATAATAAACCAAAAGAATTAAAATTGAAAAATAAAGGGATAAAAATTGCCTTAACTGTTCTTGTATTATTTTTTATGATATGGACCATTAATTTAGTAGCAGTAAAACCATATATTGCCGAAATAAAATATTTTAATGGTATGAGACATAATGTGGACGGTAATTATAAAGAAGCTTTAACTTATTTTGAACAGGCCGCATTATTATATCCTTATAATGGAAGAATATTACATGCCCTGGGCACAACTTATTATAATTTGGGAAATCTCAGTAAGGCTGAAGAAGTTTTACAGAAAGCAATCAGGTATATGATTGATGCCAATACCTTTTATAATTTAGGTTTAGTTTATCGCCAGGCAGGATTATTTTCAAAAGCAGAAGAAGAATTTCGGTATGCCGCTTATCTTATCCCAAAATTTACTAAAGCATATTATGATTTAGGGTATCTGTATTTTATACAGGAAAAATACGATGATACTATCGAGCAGTGGAGTAAGATTTTAGAAATTGAGCCCCTTTTTGACAATAAGTATATTGTATTAAATAATTTAGGAATAGTGTATAAGAAAAAACAAATGCCAGATAAAGCTTTAGAATATTTTTTGGAAGCTTTAGTATTAGCTCCAGAAGATAGCCCTGTTATTGAAGAAATAGAAAAAGAAATATATAATATTTATAAAAGTAATTTGGATAACTAA
PROTEIN sequence
Length: 674
LEKYWIEKDNSYQKLLTILLKLTLLSVPLYVNKYIYNFRVNQEAVLKLFAVFLIAIWLVKIINTEKYSLQKTKLDLPIILFSLALILSLFISKTKTVSFQEFIIFLSYILIFFLITNNLDNKANFNSFIHLFFIISLVVSIYTLMQYYGIDPYLSDLHSLTSTIGQKNWISNYLAMIFPGAFSYFLLEQSQKRILYFLLLSILYTTLMICQSRGIWISIGLTLIFAIYIIIKFKLYEIFHKNKKWLTLLLITLLLITIIYSTDNPLNKSAITVPQRAMTTFDEQDPSINTRFLIWKTTLEMIKERPILGSGIGTFKMNYLVYQAEFLKNNPYYIQYSGKARDAHNEYLQMWAELGIIGLGIFIGIILMFYSSIINYLKKVNKDNEKDKIIVFGLILGITCFLIHSIFTFPLRVPALGVTFFALLGLTVIYIRKINLDKTCSDNKPKELKLKNKGIKIALTVLVLFFMIWTINLVAVKPYIAEIKYFNGMRHNVDGNYKEALTYFEQAALLYPYNGRILHALGTTYYNLGNLSKAEEVLQKAIRYMIDANTFYNLGLVYRQAGLFSKAEEEFRYAAYLIPKFTKAYYDLGYLYFIQEKYDDTIEQWSKILEIEPLFDNKYIVLNNLGIVYKKKQMPDKALEYFLEALVLAPEDSPVIEEIEKEIYNIYKSNLDN*