ggKbase home page

rifcsplowo2_02_scaffold_11988_12

Organism: RIFCSPLOWO2_02_FULL_Archaea_Woesearchaeota_30_14

partial RP 37 / 55 MC: 3 BSCG 16 / 51 ASCG 30 / 38 MC: 3
Location: 6078..8651

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Cell surface protein Tax=RBG_13_Bacteroidetes_42_15_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 28.8
  • Coverage: 657.0
  • Bit_score: 250
  • Evalue 1.10e-62
lipoprotein id=5045997 bin=GW2011_AR4 species=GW2011_AR4 genus=GW2011_AR4 taxon_order=GW2011_AR4 taxon_class=GW2011_AR4 phylum=Archaeon tax=GW2011_AR4 organism_group=Woesearchaeota organism_desc=gwa2_.45_18 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 33.5
  • Coverage: 493.0
  • Bit_score: 230
  • Evalue 6.50e-57

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RBG_13_Bacteroidetes_42_15_curated → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2574
ATGATTAAACTCAAATATTTCTTAATGGTCTTTTTAGGTATCTTATTTATTAGTTTAAATGCTATCGGAAGTGCTGAAAATTCTTTTACTTTTACTCAGGAAGATTTTAATTTATTTAAAAATAAATATGGAGATTGGCAGTTAACAGATGATTTTAATAGTGTAAACTTGCAAGGACAAAATATTCCTTTGAGCTTGAACAAGGAAATAAATAAAGAAATAATTGAAAGTAGTGTAAGAAATTTTATAGATGATAATGGAAATTTACTGAAGATAAATGAAAATGAATTGAAAACTACTAGAGTTGTAAATAATAATGATGAATGGAATTTAAAATTTGAACAGGAACATAATGGAGTAAAGGTATATAATAGTAAAGTAATTATAAGTATTAAAAACAACAATATTGTAAAAATAAAATCAAGTTTCTATAATAATATCAATATTGATACTAAGCCTAGTATTTCTAAAAAAGAAGTAAAAAATTTAGCTTTAAATTACCTAGGAAAGAAAGCACAAGTTGAAGATATACAATTATTTGTTTATCCAATAACTGAAAAGGGAAATAATTTTTTCAGACTTGCTTATAGGGTTGTTTTTTCAGATATGTTTGAAGAAAAACCTGTAAAATATGTTTATTTTATTGATGCAAAATCCAAAGAATTGTTTAAAATAGAGAATGCTATTAGAGAGGCTGCAATTCAGGGATCTGTAACAGGCCCTTATATTCGCGAATATCCAAGCCAAGGATATACTACTACTGGATTTGAAGATGAGGAAGTTAGAGTAAATACTTTTTCTGTATTTACAAATGAAACTGGAGCTTATTACAGAGATGGATTAAGTGGTACAGTAAATTTGTTGTTTAAGCTAAAAGGAAGATATGTAGATGTAAATAATTTAGAAAGGACTGAATCAAGTCATAGTAGAAGTATAACTGTTCCAAATACATATAATGTAAATTGGAATAACTATGACATAAGCTATCAAAAGGAAGAAAGCAATGTTTATTATCATGTAAATAAATTAAGAGATTATTTTAATAGTGGCGGTGCTCTTAATTTTAATGAATTAGATTTTGTGAGTACTGCAAATGTTGGTTTTGGACCAAGTTATTGTGGGGCATTTTCAAATGGAATAACTATAACTTTTTCAAGATTATATCCTGGAGTTTGTAATAGTCTAGCATTATCAAGTGATATTATATATCATGAATACACTCATAATTTGGTTTACGGTGTATATGGGATTTTTAATATTCCTGGCCCAGAAGGAGGTTCATTAAATGAAGCTCTTGCAGATTATTTTGCAGCTTCGGTAAATGGAAATCCAATAATTGCTGAAGAAGTATATTATGGACTTCCGGGAGGAAGAACTATTGATACTGATTTATTTTATCCAATTGATCTAATGGGAGAAGCACATCAAGATGGTTATATAATAAGTGGAGCTTGGTGGGATCTAAGACAAACATTAGGAATGACATTAACTGATAATTTAATGGGAGAAGCCTTAAGATTAGAACCTAGTACATACGAACAATTTTTAATAGATGTGCTAATTGCTGATGACAATAATGGGAATTTAAATGATGGAACACCTAATATTAATGCAATATGTAATGCATTTTATGATAGACATACAATTTACAGTGAATATTGCAGAGGTAGAACTAATGGCCCAATTGCTCATTTAACATATCCATTGCATGATCAACGAGTATTCCTTGGACAAAATGAGTTGTATATTGCTGGAACAGTTTGGGGAAGCAGGACAAGTCCATTAAATTATTATAAGATTGAATATCAATTTTACAATGATCCTCCAGTTTTAATTGCTGAAGGCAATACACCACTTATAAATGGGATTTTAACAAACTGGAATATTTCAAATTTACCACAAGGTGAATATAAATTAATTTTAACAACTAGAACACAGAATAATGTTGTTCAAACTTATAGAATAATGGTAAATCTGTTTGATGTGAATTTAGATGATGCCGCTATTACATGTGATTCACATCCCTGTATTGCTTCTTCTGATTTAATAAGGAGCAGGGGATTTATAGATATTCCTGAATACAGATATCCTAATACTGTTGATGAATGTACTGATGGAAATTTTGGTCAATACTTGGTAGAGCAATCTGTTGAAGAGATAAAAGTAGAGAACTTAGATAATTCACAAATTGGAGGCGTTCCTGTATTTCTAAAGGGAGACCTTGTTCAGGTAACTATGAGAATTTGGTGTGGTCAGTTAAGCGATCAACTGGTAATAGCTTATATGGCTGATCCTAATAACCCAACTTGGGTACAAGAGGCAAGAACTTATTGTTATGGAGTTCAAAATCAATTCTATAACTATAGTACTACATTTAATTTAGATGACAGAGAGGGATATCATGTAATTAGGGCACTTGTTGGAGATTATACTGATTTAGGAACTTTTTGTGGTGATTGGCTATATGATGATAATGATGATGTTGTAATTAATGTGGTTAGTGAACCAAGGGGTGGAAGTGGAAGTCCTATGTTTTTAAAGGCGATACCAAGAAACATTGATAGAGAAAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 858
MIKLKYFLMVFLGILFISLNAIGSAENSFTFTQEDFNLFKNKYGDWQLTDDFNSVNLQGQNIPLSLNKEINKEIIESSVRNFIDDNGNLLKINENELKTTRVVNNNDEWNLKFEQEHNGVKVYNSKVIISIKNNNIVKIKSSFYNNINIDTKPSISKKEVKNLALNYLGKKAQVEDIQLFVYPITEKGNNFFRLAYRVVFSDMFEEKPVKYVYFIDAKSKELFKIENAIREAAIQGSVTGPYIREYPSQGYTTTGFEDEEVRVNTFSVFTNETGAYYRDGLSGTVNLLFKLKGRYVDVNNLERTESSHSRSITVPNTYNVNWNNYDISYQKEESNVYYHVNKLRDYFNSGGALNFNELDFVSTANVGFGPSYCGAFSNGITITFSRLYPGVCNSLALSSDIIYHEYTHNLVYGVYGIFNIPGPEGGSLNEALADYFAASVNGNPIIAEEVYYGLPGGRTIDTDLFYPIDLMGEAHQDGYIISGAWWDLRQTLGMTLTDNLMGEALRLEPSTYEQFLIDVLIADDNNGNLNDGTPNINAICNAFYDRHTIYSEYCRGRTNGPIAHLTYPLHDQRVFLGQNELYIAGTVWGSRTSPLNYYKIEYQFYNDPPVLIAEGNTPLINGILTNWNISNLPQGEYKLILTTRTQNNVVQTYRIMVNLFDVNLDDAAITCDSHPCIASSDLIRSRGFIDIPEYRYPNTVDECTDGNFGQYLVEQSVEEIKVENLDNSQIGGVPVFLKGDLVQVTMRIWCGQLSDQLVIAYMADPNNPTWVQEARTYCYGVQNQFYNYSTTFNLDDREGYHVIRALVGDYTDLGTFCGDWLYDDNDDVVINVVSEPRGGSGSPMFLKAIPRNIDREN*