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08E140C01_z5_2013_Ig3399_v2_scaffold_1063_5

Organism: 08E140C01_Z5_2013_Ig3399_Hor_167_2013_Bacteroidetes_36_8

near complete RP 46 / 55 MC: 1 BSCG 48 / 51 ASCG 13 / 38
Location: 5757..8876

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family n=1 Tax=Echinicola vietnamensis (strain DSM 17526 / LMG 23754 / KMM 6221) RepID=L0FW15_ECHVK similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 47.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 998
  • Evalue 3.60e-288
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:AKD03402.1}; TaxID=400092 species="Bacteria; Bacteroidetes; Cytophagia; Cytophagales; Cytophagaceae; Pontibacter.;" source="Pontibacter korlensis.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 50.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1092
  • Evalue 0.0
SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 47.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 998
  • Evalue 1.10e-288

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Pontibacter korlensis → Pontibacter → Cytophagales → Cytophagia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3120
ATGAAACGAACACTATCTATTTTATTGTTATTCTTCCTTGGAATGCAAATTATATTTGCACAGGGAAAGGCTATTACCGGTAAAGTGACCAGTGCATCCGACGGTTCCACAATTCCTGGCGTTCAGGTTATTGTAAAAGGAACTATTACTGGTACTACGACGAACACAGATGGAACTTATAGTTTGACTGTTCCAGCATCAGCCACAATTCTACAATTTTCATTCATTGGGATGAAAACAGTGGATGTAGAAATAGGCAATCAAACTGTCATAAATTTGGCAATGGAAGAAGACCTACTGCAACTTGACGAAGTAATTGTTGTTGCTTATGGTTCTGCTAAAAAAGGAGCATTTACAGGTTCTGCCACTCAAATCAATGCCGAAAAAATTGAATCCCGACCTATCACCAATATATCAAGGGCTATCGAAGGCCAGTCTGCCGGTGTTGAGGTTACTGCAGGTAGCGGGCAACCGGGCGCAAGTCAGGATATTCGCGTACGTGGTTTTGGCTCTGTCAGTGCTGAGCAAGCACCATTATATGTTGTTGACGGAGTTCCATTTGAAGGCTCACTTAATTCACTTAACCCTAACGACATTGAAAGCTTAACAATTCTTAAAGATGCTGCTTCTACTTCACTTTATGGTAACAGAGCTGCCAATGGTGTGGTTATGATCACAACCAAAAAAGGACGACAGGGTGAAGGTCAACTAACAATTGATGTATCACATGGTTTTGTTAATCGATCTCAACCTGAATATGAGATGATGGGACCTCAGGATTATGTTGAAACGATGTTTGAAGCATATAGAAATGGGTTGTTATCTAGCGGCAAATCATTGGAAGTAGCCAACCAAACTGCCAGTACTGGATTATTTAACGGCAATCATTTAAGGGTTAATCCTTATACTACTCCTGCTGATCAAACAGTTGGACTTGATGGAAAATTAAATTCGAGTGCACGATTATTATGGCCAGACGATTTAGATTGGCTGGGTGCAATCGAAAAACCCGGAACTCGTGACAATTATGATATATCTTATTCAGGTGGAACAAAAAAGACTGACTATTTTGTTTCATTGAGCTATTTGAACGAACAGGGATGGATTCTCGAATCAGATTTCAAACGATTTTCTGGCCGTGCAAATATTAACTTTCAGGCCACTAACTGGCTAAAAACAGGATTTAATGTTTCTGCATCTAACACAAAAACTAATTTTGCACAAACTGGTAGCTCAACTACCTATGTAAATCCTATCCGTTTTACAAGGCAAATGGGCCCTATTTACCCCATTCATCAGCACGACTATACAACTGGAGCTTACATTTTGGATGACAATGGTGACCCAATTTTTGATATTCAAGATAATCGTCCATCAGGGGCAAGTACAGGAAGACATATTGTAGCAGAAATTTTATGGGATTCTGATTTAGACGAAATTACTTCTATTAATGGGAAGACATATGCAGAAGTTAAAATAATGAAAGATTTAACATTCAGCACCAATGTCAGTTGGGATCAGCGACAATACTTCAATGCTTTTTTCAATAATCCATTTGTTGGTGATGGTGCTCCCGGTGGCAGATCTTATCGTACTTATACCAATTCTACAACCGTTAACTTTAACCAATTACTTAATTATAATAAAACGATTGGCAAACACAACTTCAGCGTATTGGCAGGTCACGAATCTTACGACTATCATTACAAGCGTTTGACCGGATCAATGACCACTCAGGTTATGGAAGGAAATATTGAACTTGATAACTTTGTTAATATCAATGGTGTTGGCGGGCGAACCGATGATTATAGGCTCGAGAGTTACTTTAGTCGTGTGAATTATGACTATGATGATAAATATTATTTATCAGCTTCAATTCGACGTGATGGATCTTCACGGTTTTACGAAGAAAATCGTTGGGGTGATTTCTGGTCAGTCGGGGGAAGTTGGAGAATAGACCAGGAACCATTTGTTAAAGATATAAATTGGATCCAGATGTTAAAATTAAGAGGATCCTACGGACAAACCGGTACTGATAGGGGTATAGGTTACTATGCTTATCAGGCCTTGTACGACTTAGGTTGGAACAACCAGACAGCTGCCGGAATTTATCAGGCATCCTTGCCTGCTTACGATCTGGTTTGGGAATCGAATAATGCATTTGACCTTGCTCTTGAATTTGGTATTTACAACAAATTATTTGGTACCATTGAATATTATAACAAGGCTTCCGAAGATTTGATTTTTGAAGTACCATTGCCTTATTCATTAGGCATGGATAGCAAAGATGCTAATATTGGGAAACTTGTAAACAAAGGAGTGGAACTTTCATTGAACTATGAAGTAATGAGAACCAATGATTTTTCATGGAATGTAAACTTCAATTTATCAACCAATGTGAACAAATTCACCAAGTTACCTCAGGAAGAAATTATTGACGGAACTAAAAAATATATGGTAGGTAAAGGGCTATTTGATTTCTGGTTAAAAGAATGGCTAGGGGTTAATCCCGATAACGGCGATGCAATGTATCGTGCTGATGATGTAAACGGTCCGGATGTTTATGTCAAAGGCGGAGATACCATTACTCCTCATAATAACAATGCAAGGTACCATTATGCTGGTACAGCACGGCCTGATTTTTGGGGTGCTATTAGCAACACCTTTAAATATAAAAATTTCGAAGTTGGATTTATGTTCACCTACCAGGTAGGAGGACTTATCAACGACGGGAATTATGCCAGTACTTTAAATGTTGATTCATATGGTAGCGGTTTATCTTTAGATATGCTCAACCGTTGGAAAAACACAGGTGACGTGACCGATATCCCAAGGATTGATGATACCAAAGGAACGGATTTGGAAGGTGGATCTTCTGATCGGTATTTAACCGATGCTTCATTCCTGGCTTTAAAACAATTTACCATATCTTATAATTTACCAAAAAGTTTCCTGAATAAATATGGTATTGCTGCGGCAAGGGCCTATTGCAGTGGAGAAAACCTTTTTTATATCAATGCCCGTAAAGGCATGAATATGCAACAAGCATTCTCTGGTAATACATCAAATGCTTTTACCCCTTCAAGGGTAATTACATTAGGTCTTAATGTTAAATTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1040
MKRTLSILLLFFLGMQIIFAQGKAITGKVTSASDGSTIPGVQVIVKGTITGTTTNTDGTYSLTVPASATILQFSFIGMKTVDVEIGNQTVINLAMEEDLLQLDEVIVVAYGSAKKGAFTGSATQINAEKIESRPITNISRAIEGQSAGVEVTAGSGQPGASQDIRVRGFGSVSAEQAPLYVVDGVPFEGSLNSLNPNDIESLTILKDAASTSLYGNRAANGVVMITTKKGRQGEGQLTIDVSHGFVNRSQPEYEMMGPQDYVETMFEAYRNGLLSSGKSLEVANQTASTGLFNGNHLRVNPYTTPADQTVGLDGKLNSSARLLWPDDLDWLGAIEKPGTRDNYDISYSGGTKKTDYFVSLSYLNEQGWILESDFKRFSGRANINFQATNWLKTGFNVSASNTKTNFAQTGSSTTYVNPIRFTRQMGPIYPIHQHDYTTGAYILDDNGDPIFDIQDNRPSGASTGRHIVAEILWDSDLDEITSINGKTYAEVKIMKDLTFSTNVSWDQRQYFNAFFNNPFVGDGAPGGRSYRTYTNSTTVNFNQLLNYNKTIGKHNFSVLAGHESYDYHYKRLTGSMTTQVMEGNIELDNFVNINGVGGRTDDYRLESYFSRVNYDYDDKYYLSASIRRDGSSRFYEENRWGDFWSVGGSWRIDQEPFVKDINWIQMLKLRGSYGQTGTDRGIGYYAYQALYDLGWNNQTAAGIYQASLPAYDLVWESNNAFDLALEFGIYNKLFGTIEYYNKASEDLIFEVPLPYSLGMDSKDANIGKLVNKGVELSLNYEVMRTNDFSWNVNFNLSTNVNKFTKLPQEEIIDGTKKYMVGKGLFDFWLKEWLGVNPDNGDAMYRADDVNGPDVYVKGGDTITPHNNNARYHYAGTARPDFWGAISNTFKYKNFEVGFMFTYQVGGLINDGNYASTLNVDSYGSGLSLDMLNRWKNTGDVTDIPRIDDTKGTDLEGGSSDRYLTDASFLALKQFTISYNLPKSFLNKYGIAAARAYCSGENLFYINARKGMNMQQAFSGNTSNAFTPSRVITLGLNVKF*