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SCNpilot_expt_500_bf_scaffold_4921_4

Organism: SCNPILOT_EXPT_750_P_Alphaproteobacteria_novel_39_47

near complete RP 46 / 55 MC: 1 BSCG 47 / 51 MC: 4 ASCG 10 / 38 MC: 2
Location: 1968..4460

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Acriflavin resistance protein n=1 Tax=Caenispirillum salinarum AK4 RepID=K9GX52_9PROT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 60.1
  • Coverage: 827.0
  • Bit_score: 974
  • Evalue 7.70e-281
Multidrug transporter AcrB {ECO:0000313|EMBL:AIL13361.1}; TaxID=244581 species="Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rickettsiales; Caedibacter.;" source="Candidatus Caedibacter acanthamoebae.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 94.3
  • Coverage: 830.0
  • Bit_score: 1523
  • Evalue 0.0
multidrug efflux transporter similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 57.6
  • Coverage: 835.0
  • Bit_score: 934
  • Evalue 2.10e-269

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Candidatus Caedibacter acanthamoebae → Caedibacter → Rickettsiales → Alphaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2493
ATGCGAATTTGGCTTGATCCCCTAAAACTAGCCGCCCTCAAATTAACGCCTGATGATGTGATTTCATCATTAAGTAATCAAAATCTCGAAGTACCTGCCGGGCGAATTGAAAATACGAAAAGAGAATTCACAGTTCTTGTGAATAGTGACCTTGCAACGCCAGATCAGTTTAATAAATTAGTCCTAAAGAATGTCAACGGGTTTGCTGTAACCTTAAAAGATGTTGGCTATGCACAATTAGGGCCAGAAGACGAACGTATTATCGCGCGTTTTAATGGAAATAAAGCTATTGCGATTGGTATCGTCAAACAAGCAACAGCCAATCCTCTCACTATTTCCCAAGAAGTGCAAAATGCGCTTCATACTTTAAGAACTCTTCTTCCAGAAGGTATGCATGTCGATGTGGCTTATGATTCATCAGTCTTTATTGATCGTTCAATTAAAGAAGTTTACAAAACAATTCTAGAAGCTGTTGTCCTTGTCGTTCTTGTTATTTTTCTTTTCTTGAGAAACTTTCGATCTATTTTAATCCCTCTTGTGACAATTCCCATCTCTCTTATTGGAGCGCTTACGTTAATGTATATCTTTGGATTCACAATTAACACCCTAACGCTTTTGGCAATTGTCCTTGCGATAGGACTTGTTGTCGATGATGCCATTGTTATGCTTGAGAATATTTATCACCATATTGAAAAAGGGACCCCTCCTATTAAAGCTGCCATTATTGGAAGTCGTGAAATTACTTATGCTATTATTGCGATGACAATCACGCTTGCGGCTGTTTATACCCCCATGGTCTTTTCCCAAGGGCGCACAGGAAAACTGTTTATTGAATTTGCCTTAACACTTGCAGGTTCCGTGCTTGTCTCTGGTTTTGTAGCTTTAACACTTTCGCCTATGATGTGCTCACGCTTACTTCGTGAGGTAAAAAATGAGGGTAATTTTTCCCTTTGGATTGAAAAAAAGCTTGAACAATTAAGAAATTCCTATGAAAAATGGCTCTCCATTTCCATTCATAATCGTTCCTTTGTGTTAGGTGCGGCTGGGGCCATTCTTATTGGATGTGGTGTATTATTCCATATGACGCCTTCTGAACTAGCTCCTATTGAAGACCGTGGAACAATTATTGGCATCGGGGTTTCTCCTGAAGGTTCGACCATTGGATATACTTCAACTGCAGCTCAGAGCCTTGAAAACATTTACCAAAAAATTCCTGAAATAGACCGTTATTTCGTTGTCGCTGGCTATCCTGTCGTTTCTCAAGTGATCACTTTTTCTCGCTTAAAACCTTGGGAAGAACGCTCAAGAAAACAGCAAGATATTGTTCAAGCCTTATTCCCTCAGTTTTTTTCGATTCCAAGTATTCTTGCCTTTCCTATTAATCCTGCTTCTTTGGGACAAAGCGCCATAGAACGTCCTGTACAGTTCGTTATTAAATCACTTTCTTCTTATGAGCACCTTGATAAAGTTGTTACACAAGTTCTCCAAAAAGTACGTACCTCTCCTGCTCTCGTTAATATCGACTGCGACTTGAAATTAAATCAGCCACAATTGAACATTCTTCTTGATCGAGAAAAAATTAACAATGTTGGTGCTGATGTTGCTGCTATCGGCAGAACTTTAGAAACTCTTTTAGGTGGGAAAAAAGCAACTCGCTTCAAGCAAGATGGGAAACAATATGATGTTATTGTCCAAGTTTCCGATAATGAACGCCTAACACCACAACAAATTAATAATATTTTTATCAAAGGCAAAAACGACGTTATGATTCAACTCTCAAACCTTGTGAGAATAGAAGAAACTGTTGCACCTAAAGATTTAAATCGCTTTGATCAATTACGTTCTGCAACAATTTCGGCCACTGTTGGGGAAGGCCATTCTCTAGAGCAAGCCCTTAAAATTCTTGAAGAGGCAACCTTAAGCTTAGGAGACAAAGAGATTCAAATCGATCATGCGGGAGAATCTCGAGAATTTAAAGAATCGAGCAAAGAAATATATTTTATTTTCTTGTTAGCCCTTATCTTTATCTATCTTGTCTTAGCCGCACAATACGAGAGTTTTCGCGATCCATTAATTATTATCTTCTCAGTGCCTCTTTCAACGTTTGGGGCTCTTTTAGCCATGAAATTAAATAATATTACCCTTAATATTTATTCCCAGGTTGGCCTTGTAACATTGATTGGGCTGGTAACAAAACACGGTATTCTTATTGTTGAGTATGCTAATCACATTCGTTTACAAGGAAAAAATAGAATTGATGCCGTTTGTGAGGCGGCGAGCCTCCGTTTAAGGCCTATTTTAATGACAACGGGAGCTATGGTTCTAGGAGCTGTCCCCTTAGCATTTGCTTCTGGCGCCGGAGGCGAAAGTCGCAACGCTATTGGCTGGGTTATTGTTGGAGGGTTGACGATCGGTACGCTATTTACCCTTTTTATTGTCCCCATTGTTTATACTTTTCTTGCAGCACCTCACCTCAAAAAAGAAATAGATTAA
PROTEIN sequence
Length: 831
MRIWLDPLKLAALKLTPDDVISSLSNQNLEVPAGRIENTKREFTVLVNSDLATPDQFNKLVLKNVNGFAVTLKDVGYAQLGPEDERIIARFNGNKAIAIGIVKQATANPLTISQEVQNALHTLRTLLPEGMHVDVAYDSSVFIDRSIKEVYKTILEAVVLVVLVIFLFLRNFRSILIPLVTIPISLIGALTLMYIFGFTINTLTLLAIVLAIGLVVDDAIVMLENIYHHIEKGTPPIKAAIIGSREITYAIIAMTITLAAVYTPMVFSQGRTGKLFIEFALTLAGSVLVSGFVALTLSPMMCSRLLREVKNEGNFSLWIEKKLEQLRNSYEKWLSISIHNRSFVLGAAGAILIGCGVLFHMTPSELAPIEDRGTIIGIGVSPEGSTIGYTSTAAQSLENIYQKIPEIDRYFVVAGYPVVSQVITFSRLKPWEERSRKQQDIVQALFPQFFSIPSILAFPINPASLGQSAIERPVQFVIKSLSSYEHLDKVVTQVLQKVRTSPALVNIDCDLKLNQPQLNILLDREKINNVGADVAAIGRTLETLLGGKKATRFKQDGKQYDVIVQVSDNERLTPQQINNIFIKGKNDVMIQLSNLVRIEETVAPKDLNRFDQLRSATISATVGEGHSLEQALKILEEATLSLGDKEIQIDHAGESREFKESSKEIYFIFLLALIFIYLVLAAQYESFRDPLIIIFSVPLSTFGALLAMKLNNITLNIYSQVGLVTLIGLVTKHGILIVEYANHIRLQGKNRIDAVCEAASLRLRPILMTTGAMVLGAVPLAFASGAGGESRNAIGWVIVGGLTIGTLFTLFIVPIVYTFLAAPHLKKEID*