ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

SCNpilot_expt_500_p_scaffold_1147_curated_14

Organism: scnpilot_dereplicated_Caedibacter_1

near complete RP 52 / 55 BSCG 51 / 51 MC: 1 ASCG 11 / 38 MC: 2
Location: 13340..21325

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
Outer membrane autotransporter barrel domain protein n=1 Tax=Hafnia alvei ATCC 51873 RepID=G9Y7Z3_HAFAL similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 29.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 399
  • Evalue 2.50e-107
Outer membrane autotransporter barrel domain protein n=1 Tax=Hafnia alvei ATCC 51873 RepID=G9Y7Z3_HAFAL similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 29.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 399
  • Evalue 2.50e-107
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:KDF04682.1}; TaxID=1439319 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Citrobacter.;" source="Citrobacter sp. MGH 55.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 26.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 405
  • Evalue 4.90e-109

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Citrobacter sp. MGH 55 → Citrobacter → Enterobacteriales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 7986
ATGAAGCAATTTTTGACGAAAAAAATTTATGAAATTGTAAATTGTTTGTTGGGTTTATGCTTCATAAGTTGCTCCGGCTTAAGTTCACCCATGCACGTTTATTCATTTCCAACAAATAGCATTTTTCAATCGGTGAATGCATTGGCGGTAGATCAAAATAGCGGGGTAGTACATGTTTCTGATAATTTAGGAAATAAAGTATATTCTTTGACCGATACAGGAATTAATCCTATTCTTTTATGTAATGCTTTAAGCCCATTAGGAATACATGTCGCTAGAAAGCCTGATGGTGCCCCTAACATTTGGATTATGGCTTTTAAAGATCCAAGCCCGGCTATTTACAGGTTGGGAAGCCAAGATCTTTTAGGAGGTACAATTTCTTTTCCTTATCCTGCTATAACTTATTCTTCCACTAATAATATAGTAGCGAGCCTAGATGATGGAAATACGAAAAAGATATTTATAACAACTCCAGCGCCGGCATTAAATTTTAATGGAGAAATTAAAGTGTTTGATGCCGAAAATGAAGCACCTGGTGTTTCCATTCCTCTTAATTCAAATGAATATGCGACGGGCCTAAGTTTTAATGGAAATCGTGTTTATGCTGCAATTACAAAAACAACTACTGGACAAGGTAGTATTAGAATTATAAATGAGGGAGATTTTTTAGATTATATTGATATTCCTCATTTGAATGGACAATTAGAACGCCCATATGGAGTTTCAGTAATAGAGTCTAATGATACTTTTGCGCCCTTATTTATTATTGATTCTACCATGCAGAATATTCAATATTATGAATACGATAATGAACTTATTCCTCCTAGATATGATATGAAAAGTTCTAGTGATCCGAATAGTCTAAATGCTCCTGTTAGTTTAGCACTAAATGAATTTCTAGGCAAAATTTATGTATTGGATAATGGCAATGGAGGAATGTTGCATGTATATCTTTCAAAACAGGCATGGAAGAAAGATGGGATTTCTAATGTACAACAGGTAAAAATTGACCAACCCTTTCCTTTAACTCTAGGGAAAAAATTGATGTCATCAAAAATTCCGGACACAATTGATCCTTCTGTTCTCAGTACAGGTTTTATAACATTAGCTGCTGGTTCTAACTTACAATTACAAGGAGGAGAATTTGCTCCTTATAAGTTGATATTTGATAGTGGTTTGATTAGTGCTTCGACTAATTCCATTGTAGATACAACCCAACCTGTAGAAGTTACCGAAAATCATGGCACAATCGATGTTGATCAAAACATTATTCTTCAAATTCTAACACCCATTGTAAAAACAGGCACAAATTTAGGAAAATTGATCAAGCAAGGCCTCGGGGAACTTCAACTTACAAAGTTTTATAATGGTTCGATGGACATAGAATCCGGCATTGTTAGTGTTTCTGAAGGAAATGATATTGGTGAGATTAACACTAATGTAGACAAAATTACCTTAGGAACAAATGCTTCTTCAGCAACGTTAAAATTTCTTCCGTCTGTTAATAACATAGGGGTATTTCATAAAACGATTCTTAATGCAGGAGGAGGTATTTTTGATGTTTCAGCGAATTCTGTGGCTGCTCCAGGTGATATAAGTGGAGATGGTAGTCTCACAAAAATTGGCTCAGGTGTACTCTCTCTTGTTTATAATACGTCCTATAAAAATGGAACTTATCTCAATGAGGGGATATTGCAAATAGGCACAAATAACGCTCTTCCAACACCTTTAGCTCTAGTTGATCCTCTTTTTCCTAACCAAGGAGATTTTGCGATAGGAACAAACGGAACTCTGGATCTGAGTATTTATAGTCAAACAATTAAAAGATTAACGGGACCAGGTATCGTCACAAGTAGTTCTGGTAACTTAAACATACTCTCCACGATCACTTTAACTCCAGATCTTCCTACCACATTTGGAGGAAAGATTCAGGATGGAACAGGGAAGGTTGCTGTTGTTATTAATAGTCCTGGCGTGACTCAAACTTTCTCAGGCGTTAATCCATTTAGTGGCGGGTTAACCATGACTGCAGGCATGGTAGCCATAGCTCCAACGAGTTTAGATCCTTCAGATCCTATTTTAGGAACGGGCAATATTATAATGCAAGATAATACAGCCCTTTATTGGAATTTGAATGCAACCCTCAATAATAATTTTACCCTGAATCCTGGCAATCCTAACAACCAAGGTATTACGATGGATACTGGTGGTAATACTGGAATATTGGGACAAGCTATAACTGTTCTTGGAAAACTGATTAAGAAAGGAATTGGAGAGTTAAAGCTTCTCGCGGGTGGACAGAATTCAGGAACTCTTGAAATTCAAGAAGGTATTTTTACAACTGAAGGCGATCTAACCAATAATGTGGGAGCTACAATTGCTAATAGTGGGACTTTTAAAAATGTAAATCATCTATTCACTAATCGAGGATCATTAACAGGGAATGGAAGTTTTCTACTAAAAGGAAGCATTTTTCAGGATCTAAATAGTGCTATAGTTAATTGGTCAATTTTAATTGACAGTCTAGGTAGTACAATAAAATCTGGGGACCAAACTCACCCTAATAATGTGCTTACTTTTAATAATACCATCACAGATAATGATCCTCTCAATCCTGGATTACTTACTTTGTCTGAGCCTGGGACTATCATTCTTAATGGCGCGAATGATTATAAAGGAGGAACTTCAATTGCGAACTCAGCGATTGTTCAGATTGGAAGTAATACAGCCCTTGGATCAGGAGCAATTAGTTTAGAAGGAACTCTCCAAGCAGGGCAAGATGCTCTCACGCTCGACAATGATATCTCTCTTGGTAGTTCAAGCATCATCGATAATAAGGGATATACGTTAAATTTCTCAGGGGAATTTTCAAGTCCTGTAGAAGGTTCGCTTAATTTTATTGATTCTTCAGTTGCGCAAAATGGCACAACTATTCTTTCTGGGCAGAGTACATTTACAAAAAAATTGATCGCTCAAAGTACTCGATTTACTAATGCTGGTACCATAATTTTAAATAACTCAACCATATTAGAAAATGACAATCCATTTACTAACACAGGTACTATAAAAATAGATGAAAGTTCAATTTCAAACAAAAGTACGTTCATAAATTCTGGAGAAATTACGAACAATGATCGCTTTTACAACTTTGAGACACTTCGTTTAGAGGCTAATAGTAAATTTACAGGAACTGGTTCTCTAAACTTATCGGGTTCAACGGTGATATTTAATGGTCCTGGAATTCAATTTAACAATAATATTGCTATCAATCCTGACTTTGTAAACTCTCTTGGAGTTACTCTTTTTGTCGCTGATGGCGTAACTCAAAACATCGATAACGTGATCTCATCTCCTAATGGAAGTGCTCCTCTTACCAAAGATGGATTAGGTAAATTGATACTCAATGGGGCTAATACAACATTTAGTGGACAAACAACCCTTTCTTTGGGCGCGCTTCAGGTGGGACATAACGCCGCTCTTGGAACGAATTCCTTAAAGATGCTTAATAATACGACACTCCAGTTTGGAATAGGTGGTCTCGTTATTAATAATCCTGTAGTCCTTGATTCAGGAAACTCGGTTAATCCTGGCATTGCTACAATTGATACAGGGAATTTTATGAGCACCTTATCTAATGCTATCACCCAGATAGGTAATAGTGTGATGAAACTCATTATTCAAGGCGGAAATATTCTAACTTTGAACGGTTTAATCTCGCATCAAGGAGGCAGTGAAGTTGGAGCTGGGACAACTTTTAAGGCAGGTATCTCAAATATCTTTGCGGGCGTGAATAAATCTCTTAAACTTGCAGGCGTGGCCTCTACCTTTGATATGACAGCTGCTGATCAAATTCTAGGAGAATTACAAAGTAGTATTAGCACCAGTCAAGTTCTTTTAAATAATCGTACCTTAACTATTAATCAACCTTCTACTTTTGATGGGGTCTTTTCAGGGGTTGGAGGGAGTATTATCGCCAAAGCTGATCTGACACTCGGTGGACAAAGCACAAATACAGGTTTATTCACGATTGATGCCAGCGTAAATCCTGTGACAATGACCATGAAAGTCAATAGTTCTTTAGCTGCAGGGAGTTCCTTTTCTCTTATTGGTTTAGGTGCTAATAATGCTGTTTTTGACATGAAATTAGCATCCCAAACAATTAGTGAACTGAACGGTAACGCGCATAGCCTTATTGAATTAGGTAATCAAAAGCTTACTTTTGGCACCAACAATGATTCTGTTTTCAAGGGTGAAATTCAAGGAACAAACGTCAGTTCTCTTGTAAAAAAAGGTAATGGTACTGCAAATTTTGAAGGAATAAGCCCAAATTTTCATGGGGTAACATCGGTTGTTACAGGTGGGTTAGTTCTTAGAAATCCTCTTTCGATTGGAACAGGAGTTTTAGAAATTGAAACTGTTGATTCTCCTTCTGTCGGTAACTCTGGGCTTGTTGCTTTAGAGTTTTCTGGTCAAGCGAACCAACATGCTACTTTTAGTAATTCAGTTAAAGGGACAGGTGAATTGAATGTAGTAGGATCTTATATTGATATTACAGGTGACAACTCTGATTTTGAAGGATCTCTCCATATAGGAGGATCTGCTTATGTAACAGAGCAAAAAAATATAGGGCAAAGCACAATTAATTTAACTGGTCTACTTGGATTAAATCCTCAAGGTGATTTTACTTTCAATAACCGTCTTATAGCACCATCAAGTGGTTCTTTGGTTGTTTCTATGGAAACTCCACAAAACATCTTTAAATTTGATGATATTTATCATGGATTTCCTTCTCAGTTTGAGGGTGAGATTGTTTTAGAACAAGGGGCTTTTGATATTTCAGGAAGGAATACAGAAGCTTTAACCTCTGCAACTTTAAAATTATCTCCTTATGGTACTGCATTTCTTGGTGGAGATCCAGGTAACCCTATGACCCAAGCAATTGGAGGGCTTACTTTTTCTGGTGGGATGTTGTCTTTAAGACCTTCTGGAGACGATTTTACACCAGCAGATACCCTTGCTGTTAATATGTTAGACTTATCTTCAAGTTTAAATGGAACCATCCAAATTACAATTCCTGCTGGATTTGATCCCCCAGAAGAATGGGATGGACATAATAAACCTCTTCTTATGCAAGATGATGTGATTTTGACACAATTTGTTAAAGCCAATCAGGTTAATAGATCTAATGTGAACGACTCATTGAGACTTGTTGATCAGGATGGAAATATTGTTAGTGCAGAGAGAGAAATAGACATTGATGAAGGGACTCAACGCGTTGCTAAAGGTTTTTATGATTATGGGATTTTAGTGCAAGATGATGGTCTTTACCTGAGTTATGGTCTCCAACAATTAGAATTACAAGATCAACAGACCACTGTGCTTGGAGGAGATCATCAAGGTCAAGGAGCTGCGGAGTTCCACGCACGATTAACTGGACAAGGCAATATTGAGATTGATGCGACCAATAGTATTACGCTTAATAATCCAACAAATAATTATCAAGGAACGACGACGGTTAAAACAGGAGAGCTCATTTTAGGATCAGATCATTCTTTAGGAAATACGTCTGATTTAATTTTGAAAGAAGAGACAAAAGTAAACTTATCTGGGACGACGCAAACTGTTGGGACCCTTCATACAGAAGCAAGGAGTTCCTTAAACTTTAATGGTGGTAATTTAAGCGTTGAACAAGGTGGAGTTGTACAATCTGAAGCATTATCAGGAGCAGGCACTTTAACTATTGAAGGTGGCTCTTTTCAAGTAAATGGTCCTAACCAAGCATATTCCGCAACAACTAGAATTGAAAATGGTGCCGAGGTTGTTTTATCTGATTCCCATGGATTGGGTACTAGTACTGTTGAGAATAATGGTCATCTGACATTACAAGGAAATGGAAATTTAATTGATAATGCTTTTAATAATGATATTTCGGGAGTAGGTACTCTTATTGTACAAAATACTGATGTCGTTTTGGGTGGAAACAATCAGCATACTGGGTCCACAGAAATTAAGGATTCTACAGTTTCCATCTCTTCTGATAACAATTTAGGAGCTGCCACAGGAGAAGTTAAACTCGATAACTCCACCTTAAAGTTTGATAATTCTGTTACTTTGCCAGGCACAAGAATACTGACCCTCAATAATACATCTGTGATTGATACGCAAAATTATTCCTCATCAATTAATGGTGAAATAAATGGAGTGGGCATCTTAACTAAAAAAGGAGCAAATCGCCTTTCGCTTAATGGTGATAAGAATTTTGTCGGAGATATAAATGTTGTCTCTGGTGAGCTCAAGGTTAATGGAGATATTTCAAACGCAAATGTAAATCTTGAAGAAGGATCTACTTTTTCTGGCAACAATACTGTCTTAAATCTAATTAACCGTGGCATTGTTGCTCCTGGAAATTCTATTGGGCAAATTCAGGTTAGAAATATTTTCAATAACACAGGGGGCATTTATCAGTGTGAAGTCAATGATGCTGGTCAATCTGATTTAATAAGAGTTATTGGGGCAGCGAGCACAACTACTCTCCATGGAACATTGCAAGTTATTCCAATGGCTGGGAATTATCAATTAAATCAACCTTATATTTATACAATTTTGACAAGTGTCAATCCAATCAATACAACTTTTGATACGGTTAATGGAGTATCTCCTTTATTTGCTTACAATGTCATTTATAACCCTAACAATGTGCAATTAAGGATGATTCGCACTTCAACCCTTAATCAAGTGATTACGGAAGGAAATGCAGGGATTGTTAGTCAGAATTTGGAAAATATTGGGACCTTAACAGGAACGCTACAGACGGCGACTAATAGCTTAATGGGGTTCAATAAAAACCAAATTATAGATGCCCTTAATAGATTTAATACTGCAAGTAATACATTGTTAGCAGATAACTTAGCAGATAATTTTTTTGACTTAGGAAACACACTATCACACATGTTACATTCTCCCTTAGAGAGATCAGCTGCTCATTCTTCTTTTAAAGAGCTCGTAAAAAGTGTTTCTTCTAATTTTAAAGGGACTATGGCTCAATTGTTCTCCTCTTCTGTGAAGAGATCATCAATGAATCAAACAACAAAATCTAGTAGCCAACAGGTTCCTCATTCATTTCGTTCAAAGATAGGCCAGTCTACAGTCTGGAGTTATAGTGATGCCAAGGTTTTAAATCAAAAATCTTATACGAGCCCAGGAACTTATTTACCCGCTCTTAAATCAACAATGGGAGAGACTAAGCTTGGATTTGATCATCAGTTTACTGATCAAATATTGGTTGGTTTTATGGCAGGTTATGGAAATACGTCTTATAAATTGAGTGATCAGTATGGATCTGGAAAAATAAATTCTTATCATGTTGGATCTTATAGTTCTGTTCATATTACGCCAGAATTTTATATTGATACGTTAGTTTCTTATGGAATGAACAATCTTAAAGGCACTCGTAAGATCAATTTTTCTGGATTTGAAGCTGAAGCCTCACAAAAACATCATGCTCATCAGTTTGGTGGAATGATTGATACAGGATATGAGATATATCTTCCTTCAAACTTTAGTATTACGCCAATGGCAGGAATTGGGGTTCTTTCTTTGAAAGAAGAGGGTTATCGTGAAATAGGTGCAGATACTTTAGGTCTTAATGTTAGGAGACAACGTCGTACTTACATCCAACATAAATTCGGTGCTCAATTAGCCAAACACTTTATATTAGATGAAATGCAATTCTATGGTTTTATTAGAGGGGCTTATACATATAGAAAAGGTTTAAAGAATTCTCATAGAGTTACTTCATCTTTTATAGGTCAACTCCCAAGCTTTACTGTTTTTGGTGATAAAAAGAATCATAGTTTCTTTAGTCCAGGTGCAGGATTGACTGCCCTTTTTAAGAATGATGTCTATATATCCATAGGATACAATGGAGATCTTGGAAAAAAACAAAAATCTCATGAAGGGTTCTTCAAAATAGGGTATAAATTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 2662
MKQFLTKKIYEIVNCLLGLCFISCSGLSSPMHVYSFPTNSIFQSVNALAVDQNSGVVHVSDNLGNKVYSLTDTGINPILLCNALSPLGIHVARKPDGAPNIWIMAFKDPSPAIYRLGSQDLLGGTISFPYPAITYSSTNNIVASLDDGNTKKIFITTPAPALNFNGEIKVFDAENEAPGVSIPLNSNEYATGLSFNGNRVYAAITKTTTGQGSIRIINEGDFLDYIDIPHLNGQLERPYGVSVIESNDTFAPLFIIDSTMQNIQYYEYDNELIPPRYDMKSSSDPNSLNAPVSLALNEFLGKIYVLDNGNGGMLHVYLSKQAWKKDGISNVQQVKIDQPFPLTLGKKLMSSKIPDTIDPSVLSTGFITLAAGSNLQLQGGEFAPYKLIFDSGLISASTNSIVDTTQPVEVTENHGTIDVDQNIILQILTPIVKTGTNLGKLIKQGLGELQLTKFYNGSMDIESGIVSVSEGNDIGEINTNVDKITLGTNASSATLKFLPSVNNIGVFHKTILNAGGGIFDVSANSVAAPGDISGDGSLTKIGSGVLSLVYNTSYKNGTYLNEGILQIGTNNALPTPLALVDPLFPNQGDFAIGTNGTLDLSIYSQTIKRLTGPGIVTSSSGNLNILSTITLTPDLPTTFGGKIQDGTGKVAVVINSPGVTQTFSGVNPFSGGLTMTAGMVAIAPTSLDPSDPILGTGNIIMQDNTALYWNLNATLNNNFTLNPGNPNNQGITMDTGGNTGILGQAITVLGKLIKKGIGELKLLAGGQNSGTLEIQEGIFTTEGDLTNNVGATIANSGTFKNVNHLFTNRGSLTGNGSFLLKGSIFQDLNSAIVNWSILIDSLGSTIKSGDQTHPNNVLTFNNTITDNDPLNPGLLTLSEPGTIILNGANDYKGGTSIANSAIVQIGSNTALGSGAISLEGTLQAGQDALTLDNDISLGSSSIIDNKGYTLNFSGEFSSPVEGSLNFIDSSVAQNGTTILSGQSTFTKKLIAQSTRFTNAGTIILNNSTILENDNPFTNTGTIKIDESSISNKSTFINSGEITNNDRFYNFETLRLEANSKFTGTGSLNLSGSTVIFNGPGIQFNNNIAINPDFVNSLGVTLFVADGVTQNIDNVISSPNGSAPLTKDGLGKLILNGANTTFSGQTTLSLGALQVGHNAALGTNSLKMLNNTTLQFGIGGLVINNPVVLDSGNSVNPGIATIDTGNFMSTLSNAITQIGNSVMKLIIQGGNILTLNGLISHQGGSEVGAGTTFKAGISNIFAGVNKSLKLAGVASTFDMTAADQILGELQSSISTSQVLLNNRTLTINQPSTFDGVFSGVGGSIIAKADLTLGGQSTNTGLFTIDASVNPVTMTMKVNSSLAAGSSFSLIGLGANNAVFDMKLASQTISELNGNAHSLIELGNQKLTFGTNNDSVFKGEIQGTNVSSLVKKGNGTANFEGISPNFHGVTSVVTGGLVLRNPLSIGTGVLEIETVDSPSVGNSGLVALEFSGQANQHATFSNSVKGTGELNVVGSYIDITGDNSDFEGSLHIGGSAYVTEQKNIGQSTINLTGLLGLNPQGDFTFNNRLIAPSSGSLVVSMETPQNIFKFDDIYHGFPSQFEGEIVLEQGAFDISGRNTEALTSATLKLSPYGTAFLGGDPGNPMTQAIGGLTFSGGMLSLRPSGDDFTPADTLAVNMLDLSSSLNGTIQITIPAGFDPPEEWDGHNKPLLMQDDVILTQFVKANQVNRSNVNDSLRLVDQDGNIVSAEREIDIDEGTQRVAKGFYDYGILVQDDGLYLSYGLQQLELQDQQTTVLGGDHQGQGAAEFHARLTGQGNIEIDATNSITLNNPTNNYQGTTTVKTGELILGSDHSLGNTSDLILKEETKVNLSGTTQTVGTLHTEARSSLNFNGGNLSVEQGGVVQSEALSGAGTLTIEGGSFQVNGPNQAYSATTRIENGAEVVLSDSHGLGTSTVENNGHLTLQGNGNLIDNAFNNDISGVGTLIVQNTDVVLGGNNQHTGSTEIKDSTVSISSDNNLGAATGEVKLDNSTLKFDNSVTLPGTRILTLNNTSVIDTQNYSSSINGEINGVGILTKKGANRLSLNGDKNFVGDINVVSGELKVNGDISNANVNLEEGSTFSGNNTVLNLINRGIVAPGNSIGQIQVRNIFNNTGGIYQCEVNDAGQSDLIRVIGAASTTTLHGTLQVIPMAGNYQLNQPYIYTILTSVNPINTTFDTVNGVSPLFAYNVIYNPNNVQLRMIRTSTLNQVITEGNAGIVSQNLENIGTLTGTLQTATNSLMGFNKNQIIDALNRFNTASNTLLADNLADNFFDLGNTLSHMLHSPLERSAAHSSFKELVKSVSSNFKGTMAQLFSSSVKRSSMNQTTKSSSQQVPHSFRSKIGQSTVWSYSDAKVLNQKSYTSPGTYLPALKSTMGETKLGFDHQFTDQILVGFMAGYGNTSYKLSDQYGSGKINSYHVGSYSSVHITPEFYIDTLVSYGMNNLKGTRKINFSGFEAEASQKHHAHQFGGMIDTGYEIYLPSNFSITPMAGIGVLSLKEEGYREIGADTLGLNVRRQRRTYIQHKFGAQLAKHFILDEMQFYGFIRGAYTYRKGLKNSHRVTSSFIGQLPSFTVFGDKKNHSFFSPGAGLTALFKNDVYISIGYNGDLGKKQKSHEGFFKIGYKF*