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FFSP_09252017_12_scaffold_3117_5

Organism: FFSP_09252017_12_Sphingobacteria_36_66

partial RP 32 / 55 MC: 2 BSCG 35 / 51 MC: 3 ASCG 9 / 38
Location: comp(3032..6265)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
RND efflux system, inner membrane transporter CmeB n=1 Tax=Cyclobacterium qasimii M12-11B RepID=S7VN09_9BACT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 73.9
  • Coverage: 1079.0
  • Bit_score: 1620
  • Evalue 0.0
Efflux pump membrane transporter BepE {ECO:0000313|EMBL:KHJ36713.1}; TaxID=1122941 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Sphingobacteriaceae; Pedobacter.;" source="Pedobacter glucosidilyticus.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 89.2
  • Coverage: 1079.0
  • Bit_score: 1907
  • Evalue 0.0
hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family transporter similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 74.4
  • Coverage: 1068.0
  • Bit_score: 1618
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Pedobacter glucosidilyticus → Pedobacter → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3234
ATGTTTAATAAGTTTATTAAAAGGCCAGTGCTTGCTATTGCCTTGTCTGTAGTAATAGTATTTATGGGATTATTGGCAATTAAAACATCCCCTGTTGCCCAGTTTCCCGAAATAGCACCACCCCGTGTCAATATTTTTATTGAGTTTCCAGGGTCTAATGCTGATGTATTAGTAAAATCTACTTTGACCATATTGGAGCGTGCCATTAATGGAGTGCAGGGTATGCAATACATGATTTCAGATGCCACAAGTGCAAGTGAAGCAACCATTGAAGTGATTTTTGAACCTGGTACAGATCCCACATTGGCTGCAGTTAGAGTAAAGTCTAGAGTTGATCAAGTGATGACCAATTTACCACCACTTGTACAAAGAGAAGGGGTGATTATTTCGCCGCTTCAGCCGAGTATGTTGATGTACTTAAATCTTTTTAGTAAAGAGAATGATGTTGATGAAAAGTATTTATTCAACTATGCTAATACGTACATCTTACCAGAACTTCAACGGATCAATGGTATGGGATTTGCGCAAGCTATTGGTAGCCGTGCATTTGCTATTCGGGTATGGTTAGACCCTGAACGAATGAGGGCATACAATATTTCTGCAGAAGAAGTTTTAAAATCGATTGATGAACAAAGTGTATTAGCAAGACCTGGTAGAGTAGGATTAAGTTCGGGTAAAACAGCTCAGTCGCAAGAGTATGTTTTTACTTATAAAGGATGGTACAATAAACCTGAACAATATCAGGATATCATTATCAAAGCCAATTCAAAAGGTGAAATTTTAAAGTTAAAAGATATTGCAGAAGTTGAAGTAGGAAGTGAGTTCGTGGATATTTATTCTAACAAAGATGGACATCCCTCGGCTTCTTTGGTTCTTAAACAAAACCCTGGAAGTAATGCTAATACTGTTATTGCTGAAGTAAAAGCAAAGTTAGCGGAGCTGAAAAAAGATTTTCCTCCTGGTATTGATTATGAAATCAACTATGATGTTTCAAAATTTGTGGATGCTTCTATTGAGAAAGTATTGCATACATTAATAGAAGCATTTATTCTTGTAGCGATTGTTGTGTTCGTTTTTTTAGGCGATTGGCGCTCTACTTTTATTCCAATTTTAGCGGTACCAGTATCATTAATTGGTGCGTTTGCATTAATGAAGTTTTTTGGTTTGAGTATTAACCTAATTACGTTGTTTGCATTGGTTTTAGCAATTGGGGTAGTTGTTGATGATGCCATTGTTGTAGTAGAAGCAGTGCATGTAAAGATGGAAGAAGAAAACTTATCGCCCTTTGCTGCAGTTAAAAAAGTTATTAGAGAAATCAGTGGTGCAATTATTGCCATTACATTGGTTATGACATCTGTATTTGTTCCTGTTGCATTTATGACAGGACCTGTAGGCGTTTTATACAGACAATTTTCATTGACTATGGCAAGTGCCATAGTGATTTCCGGATTTGTAGCTTTAACACTTACACCAGTATTGTGTGCAATTCTGCTAAAAAACACACATGGTAAACCGAAACCAAAAACACCCATTAACCAATTCATCAATTGGTTTAATAAAACGTTTGAACGTATAACAGGAAAGTACACTAAATTTCTATCGCTAATTGTAAATCGAAAATTAATCACTTATGGGATACTATTGGTTTTTGCTTTCGGTATATTCAGTGTAAATAAAATTCTGCCAGCAGGCTTTATTCCAAGTGAAGATCAAGGGCAGATATATGCCATCATTCAAACAAGTCCTGGTACAACACTTGAACGTACTAATGAAATTTCTAGAAAATTGCAATTAATTGCTAGTAAAATTGAAGGGGTAGCTTCTGTTACTTCATTGGCTGGTTATGAAATCTTGACCGAGGGCCGAGGCTCAAATGCTGGCACTTGTTTAATCAATTTAAAAGACTGGTCTGAAAGAAAGCAATCTGTTAAAGAAGTAATTGAAGAATTAGAAAAAGAATCAAAAGACTTGCCTGCCAATATTGAATATTTTGAACCACCTGCTGTTCCAGGTTATGGAACATCCGATGGTTTTTCTCTTCGATTGCTCGATAAAGGAAGCGATGTAGATTATCAGGAATTTGATCGAGTGAATGCTGAGTTTTTATCGGCACTTAAAAAACGAAAAGAATTAGCAGGCCTATTTTCCTTTTATTCTGCCAAGTATCCTCAGTATGAAATTTCTGTTGACAATGCTTTGGCTATGCAAAAAGGCGTCTCATTGGGTAATGCAATGGAGAATTTAAATGTGATGATTGGAAGTACTTATGAGCAAGGCTTTATTCGATTTAATAATTATTATAAAGTATATACACAGGCTGGTCCTCAGTTCCGAAAACAGCCATCAGATATCCTAAATATGTTTGTTAAAAATGATCGTGGTGAAATGGTGCCTTATTCTGCTTTCATGACGATTAAGAAAACACAGGGGCCTAATGAAATAGCAAGGTACAATTTGTATATTTCTTCATTGATTAATGGTACTCCGGCGAAAGGCTATTCATCAGGAGACGCCATTGATGCCATTAAGGAAGTAGCTGCGCAAACATTACCTCGTGGTTATGATATTGCTTGGGAAGGTTTATCATATGATGAAGCTAAAAGAGGTAATGAAGCTTTATACCTGTTTTTAATTGTTATATTTTTTGTTTATTTAATTCTTGCATCTCAATATGAAAGTTTCTTATTGCCTTTTGCAGTATTGTTGTCATTGCCGCCAGGTATTTTTGGCTCATTTTTTTTATTAAAATTAATGGGGCTATCCAATGATATTTATGCACAAGTAGGTTTAATCATGTTGGTGGGATTATTGGGGAAAAATGCTGTATTAATTGTGGAGTTTGCCGTACAGAAACACAATAGGGGTGCAACAGTTTTAAATGCTGCAATAGAAGGTGCAAAAGCCCGATTCAGGCCAATTCTTATGACTTCATTCGCCTTTATTGCAGGTTTGATTCCGCTAGTAATTGCAACAGGACCTGGTGCTGTTGGTAACCATACTATAGGTTCTTCGGCATTAGGAGGAATGTTGTTTGGAACTTTGTTTGGCGTGATTGTAGTACCTGGTTTGTATTTCATATTTGGAACGCTACAGGAAGGCAGGTACTTAATCCGAGACGAAGATCAAAATCCTTTGAGTGAAGATTTAGTAGAAAGTAACTCTCCTGTGACTAGCAAAATCAAAAAAATATTTTTACGATTTACAAACAAAAACGACAATGAAACCAATAACTAA
PROTEIN sequence
Length: 1078
MFNKFIKRPVLAIALSVVIVFMGLLAIKTSPVAQFPEIAPPRVNIFIEFPGSNADVLVKSTLTILERAINGVQGMQYMISDATSASEATIEVIFEPGTDPTLAAVRVKSRVDQVMTNLPPLVQREGVIISPLQPSMLMYLNLFSKENDVDEKYLFNYANTYILPELQRINGMGFAQAIGSRAFAIRVWLDPERMRAYNISAEEVLKSIDEQSVLARPGRVGLSSGKTAQSQEYVFTYKGWYNKPEQYQDIIIKANSKGEILKLKDIAEVEVGSEFVDIYSNKDGHPSASLVLKQNPGSNANTVIAEVKAKLAELKKDFPPGIDYEINYDVSKFVDASIEKVLHTLIEAFILVAIVVFVFLGDWRSTFIPILAVPVSLIGAFALMKFFGLSINLITLFALVLAIGVVVDDAIVVVEAVHVKMEEENLSPFAAVKKVIREISGAIIAITLVMTSVFVPVAFMTGPVGVLYRQFSLTMASAIVISGFVALTLTPVLCAILLKNTHGKPKPKTPINQFINWFNKTFERITGKYTKFLSLIVNRKLITYGILLVFAFGIFSVNKILPAGFIPSEDQGQIYAIIQTSPGTTLERTNEISRKLQLIASKIEGVASVTSLAGYEILTEGRGSNAGTCLINLKDWSERKQSVKEVIEELEKESKDLPANIEYFEPPAVPGYGTSDGFSLRLLDKGSDVDYQEFDRVNAEFLSALKKRKELAGLFSFYSAKYPQYEISVDNALAMQKGVSLGNAMENLNVMIGSTYEQGFIRFNNYYKVYTQAGPQFRKQPSDILNMFVKNDRGEMVPYSAFMTIKKTQGPNEIARYNLYISSLINGTPAKGYSSGDAIDAIKEVAAQTLPRGYDIAWEGLSYDEAKRGNEALYLFLIVIFFVYLILASQYESFLLPFAVLLSLPPGIFGSFFLLKLMGLSNDIYAQVGLIMLVGLLGKNAVLIVEFAVQKHNRGATVLNAAIEGAKARFRPILMTSFAFIAGLIPLVIATGPGAVGNHTIGSSALGGMLFGTLFGVIVVPGLYFIFGTLQEGRYLIRDEDQNPLSEDLVESNSPVTSKIKKIFLRFTNKNDNETNN*