ggKbase home page

L3_072_000G1_scaffold_501_3

Organism: L3_072_000G1_public_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 20 / 38 MC: 16
Location: 1224..4400

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein n=1 Tax=Clostridium sp. Maddingley MBC34-26 RepID=K6U9C3_9CLOT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 52.4
  • Coverage: 1066.0
  • Bit_score: 1111
  • Evalue 0.0
Diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein {ECO:0000313|EMBL:EKQ53309.1}; TaxID=1196322 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium sp. Maddingley MBC34-26.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 52.4
  • Coverage: 1066.0
  • Bit_score: 1111
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 42.6
  • Coverage: 1077.0
  • Bit_score: 857
  • Evalue 2.90e-246

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. Maddingley MBC34-26 → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3177
ATGGAAAGTATATCAAAGAATTTATTATCTATTTTGGTTACTGCAATTAATGAAAAAGATAATAAGGTTATTTTAATTAAAGATACTAAAAATTTATCATTAGGAGATATAAATAAAACCTTAATAAATCTAGGAAAAAAATGTTTTTATAGAGTTTTAGAAAAACATAATAATGGAGAATTAGAACCGTATTTTCCGTTTTTAACTTTCATAGAGGAAGAAATTAATATAGCAAATATTGAAGTAGAAAAATTTTTAGAAGATATTAATATTTATCCGCTGCATAAATCATTATTTTTAAGTTATTTAAAATGTGGAAAAGCTGAAAGAGATGAAGAATTAATATTTTTTGATTATGAGTATGAAAAAAATAAAATTTATGAATCATTGATGAATATTATAAATAAATTTGGAGACAATGTATTTATTTTATTAGAAAACATAAATTATATGTCACTCTCAACTCTCAATTGGCTAAAATATATAGTGATGAATAATGAAGAATATAATTTTAAAATTATATTAACTTTTTCAGATGACAAGTATTTTGATTGTGATTATCAAGATGAATTTGAAAATCTAATTGATTCTATAGAAGCAAAGCATTCATTATTACGACTTAGTATTAAAGAAAAAAGCAACGGAGATAATAAAAAGCCTAAAAAAGTAGAAAAAGATCTAATTATTCATGGTGAGAATTTGTATAACTTTTTTGCAATAGATGAAGCTTTAATATGCTTTTGTAGAAAATATAAGAGTATGATTGATTCAAATGATATTTATGAATTAAAACGAGTACTACTAAGATTGGGTGATATATATTTAATAAAAAAAGATTATGGAAATAGTTATAAGTATTATGATTTGTTACTAAATTTTGCAATTGATGTAAACGATAAACGATTAAAAACATTGGCACTTCAAAAATTGTCTATGTTAAATATAGTACGCTTAAAGTTTAATGAGGCAGAAACCCTTGCGAAAAATAGTTATAAATTAGCTGTTGAAATTAATAATGATTATTTTAAACTAAAATCTTATGAACTATTATTCTGGATTAATGAAAAAGGAAAGTATAGGACAACCATAGAAGAACTAAATTTTGATGAAGAATTTATTAAATTGGCAAGAAAATATAACCAAAGAAATATACTTGCATATTTTTTGACACATAATTTTAATCTTATATCTTTTGTTGGACCTAAAGATCAAAGAGAAGACTATTATATGGAAGGGCTTGAATTAGCAGAAAAATTAAAGAATATAAATTGTATTTTATCAGCTGATTTAAAAACTGCACTAGTATATGCAGTTAATGGAGATCATGATATTAGCCAGGAATACTACAAGAAAGTAGAAAAAATACTTATTGATATGCATGACAATTTTAGATTGGCACAGACATATAATGGAATGGGTTATTATTGCTTAATTGAAGGCGATTATATAAAGGCAAATGATTACTATAATAAATCATTAAGTTATTTAAGACTTGAATGGAATTTTGATGAAATCTGCATGGCTTTAATAAATAAAAGTCTTACTTCACTATTTGTATGCGATTATGAGACAGCAAACAAACAATTAGAGATACTTCTAAATGTAATTAAGACATTAAAGCTAGGAAGATTAAGACTTACTACTGTTAGTAGAATATATGGAATAGCAGCATTAAATCATTGCTATTTAGGAAATCTATATAAAAGTTATTCGTTTTTATCTAAAATTCAAACTGTAGATATTAGTAATAGATTTTATGAAGATGATGAAGAATATTTTCTTAAGAATTTTACTGAAGCTCTATTAGCCAAAAAGCGAGGAGATTTAGACGAAGCTCTAAAACTATTTAGAAAATCATATAAGAATTTAATAAAAGCTAAAGGTTCATTAAAATGTATGTATCCTAAGTTTATGTATGAATATTTTAGAATATTGGAAATATCTGAAGAAAATAATAATGCAGACTCTGTAAGGAAAGAAGCAATAAAATATTGTAAAGAACATAATATAAATTACTATATAAATCTAATTGATGGAGTTACAGTAAACAATAATTATACTTTTGAGAGTGATTTAAAAGACTTAAGTTGGATTATTGAAGCAGCTAAACAAGAAGCTACAATTAATTCTCTTAATGATAAAGTTGAAGAAATACATTTCATAAATAGCTTTCAAGAAATTTTAACATCAATAGATGATAAGAATACCATTATAAATAATTCAATGACTCTGATAGAAAATAAATTTTCTATTGACTATTCATTATTGATTTTTTATGAAGGAGAAACCACAGAAATACTTTATACGACTGATAGAGAAATTTTAAGTGATAATTATATAAAAGAATTAAATGCTATAATAACTGAATATACGTCACCATTTGTAACAAGCGATGATATTGACTTAAGTAATTGGATTGAGAGAACTATAAATGAAAAGGTTCGTTCATTAATTTATGTGCCTATTATAAAAGATGAGAATTTAAAATTAATATTTATATGTGCAACTAAGTTTGGAGATGATCCTATAAGAAATAATATAATATTAGATAGTTCTAATTTAGGAATAATAAATATATCTATAAAAGAATTTAATGAAACACTTCAAAAAATAAAATGGCAGGAAAAATTAATGGAAAGTGCATTAAAAGATGCACTTACTGGTCTAAATAATAGGTGTTATTTCTTTGATAAATTATCTACACTTGTGAAAAATAATGGTAAGAAAAATATAAATGCTTGTTTATTATATATTGATTTGGATAATTTTAAATATTATAATGATACATTTGGACACTCTATAGGTGATTATATTTTGAGTTTTTTTGCTAATTCATTAAGTTCTATATGTGAAGAATTAAAGAGTGTAGATGTTATTAGATATGGTGGAGATGAATTTATAGTATTACTGGAACAAGCAGAATTTGGAGATGGAGAAGTGTTAGCAGAAAAGTTATATGAAGAAATAAAACGATGTAGAGGATACGAGGATAATATAAAAGCACTTTTAAATAAAAATATAAATATTCCAAAAGAAAAATTATTATCATGTTCAATGGGAATATCCTACAGAAAATTAAATTCTTCTACAAATTATAATAAATTAATTGAAGAAGCTGATAAATGTTTGTACAAAGCTAAAAATTCTGGTAAAGGCAGGTATATAGTTTTTAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1059
MESISKNLLSILVTAINEKDNKVILIKDTKNLSLGDINKTLINLGKKCFYRVLEKHNNGELEPYFPFLTFIEEEINIANIEVEKFLEDINIYPLHKSLFLSYLKCGKAERDEELIFFDYEYEKNKIYESLMNIINKFGDNVFILLENINYMSLSTLNWLKYIVMNNEEYNFKIILTFSDDKYFDCDYQDEFENLIDSIEAKHSLLRLSIKEKSNGDNKKPKKVEKDLIIHGENLYNFFAIDEALICFCRKYKSMIDSNDIYELKRVLLRLGDIYLIKKDYGNSYKYYDLLLNFAIDVNDKRLKTLALQKLSMLNIVRLKFNEAETLAKNSYKLAVEINNDYFKLKSYELLFWINEKGKYRTTIEELNFDEEFIKLARKYNQRNILAYFLTHNFNLISFVGPKDQREDYYMEGLELAEKLKNINCILSADLKTALVYAVNGDHDISQEYYKKVEKILIDMHDNFRLAQTYNGMGYYCLIEGDYIKANDYYNKSLSYLRLEWNFDEICMALINKSLTSLFVCDYETANKQLEILLNVIKTLKLGRLRLTTVSRIYGIAALNHCYLGNLYKSYSFLSKIQTVDISNRFYEDDEEYFLKNFTEALLAKKRGDLDEALKLFRKSYKNLIKAKGSLKCMYPKFMYEYFRILEISEENNNADSVRKEAIKYCKEHNINYYINLIDGVTVNNNYTFESDLKDLSWIIEAAKQEATINSLNDKVEEIHFINSFQEILTSIDDKNTIINNSMTLIENKFSIDYSLLIFYEGETTEILYTTDREILSDNYIKELNAIITEYTSPFVTSDDIDLSNWIERTINEKVRSLIYVPIIKDENLKLIFICATKFGDDPIRNNIILDSSNLGIINISIKEFNETLQKIKWQEKLMESALKDALTGLNNRCYFFDKLSTLVKNNGKKNINACLLYIDLDNFKYYNDTFGHSIGDYILSFFANSLSSICEELKSVDVIRYGGDEFIVLLEQAEFGDGEVLAEKLYEEIKRCRGYEDNIKALLNKNINIPKEKLLSCSMGISYRKLNSSTNYNKLIEEADKCLYKAKNSGKGRYIVFK*