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L3_083_088G1_scaffold_197_28

Organism: L3_083_088G1_public_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 15 / 38 MC: 15
Location: comp(31414..34548)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
RND transporter, HAE1/HME family, permease protein n=102 Tax=Clostridium difficile RepID=G6BCR4_CLODI similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 1044.0
  • Bit_score: 1974
  • Evalue 0.0
Putative multidrug efflux pump {ECO:0000313|EMBL:CAJ69292.1}; TaxID=272563 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Peptostreptococcaceae; Peptoclostridium.;" source="Peptoclostridium difficile (strain 630) (Clostridium difficile).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 1044.0
  • Bit_score: 1975
  • Evalue 0.0
multidrug efflux pump similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 1044.0
  • Bit_score: 1975
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Peptoclostridium difficile → Peptoclostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3135
ATGAATTTAACACAGACTTCCGTTAAACGTCCTCTCACAATCATAATGGTCTTTTTAGTATTAATAGTTTTTGGTGGTATTGGATATAAAAAAATGTCAATAAATCTAATGCCTGATATAGAAATACCAGTTGTAATGGTCATGACTACTTGGACAGGTGCTGGTCCTCAAGACGTTGATGAACAAGTTAGTCAAAAAGTTGATGAAAGTTTATCTGCCGTTTCAAATGTAAAATCTACTATATCAAGTTCACAAGAAAGTGTTTCTATGGTAGTTGCTCAGTTTGAATTTGGAACTAATTTGGATGAAATAATGAATGATGTTAGGTCTAAAGTTGATGCATTACAGACCAGCCTCCCAGATGATGCAGCTAAACCAACAGTTTTAAAGCTGGATATGAATGCACAGGCTATAGGTCAACTTGTCATATCTGGAGGAAATGAAAATAGTTCACAAGCCTTAAGAAAATACGCTGAAGATGTAATTCAGCCTAAAATAGAATCCATAGATGGTGTTACTTCAGCAGACCTTAAAGGTGGAAAAAAAGCACAGGTTAATGTAATAGCTGACCCAGCTGTTCTTTCAAATTATGGAGTTAGTTTATCCACTATAAAAGGTGTCTTATCCTCTAGTAATAAAACATTCCCTTATGGTTCAATTACTCAAGGTGAGGATAAAATAGTTTTAAGAGCGATTGATAAATTAGAATCCCTAGATGATATAAAACAGATTCAAATTCCTGTAAAAGGAGGAAATACAGTTAGATTAGATAATCTTTGTAGTGTAGATTATGGATATGCAGACAAAGATAGTATTTATAGATACAATGGAAAAGACAGTTTGGTAATAGATATTTCTAAACAACAAGATGCCAACACTGTAAAAGTTATGCAGAGTGCATACAAATACGTAGATGAATTGAATAAGGAAAATCCTCAATTTAAAATTAAAATTGCTAATGATACAAGTTCATACATAAGTGAATCAATAAACAGTGTAATGAGCAACTTGCTTATAAGTGCTGTTATCGCATTTATTGTAATATTTGCTTTCCTAAAAAGTGTAAGAGCTTCACTAGTTGTTGCAGTTGCAATACCAATTTCTATAATAGGTGCTATAGCAATTCTCTACTTTACTGGTGAAAGTTTAAATCTTATTACTGCAAGTTCATTGGTAATTTCAGTTGGTATGGTTGTTGATAATGCTACAGTTGTAATTGAAAATATATTTAAATATAGGAAAAGTGGCAGATTGAGTCTTGATGATTGTGCTATTGAGGGAACAAGAACTGTAACAAATGCAATACTTGCATCAACATTGACCACGATAGCAATATTCTTACCTATCATGTTTACAGAAGGTATAGCTAAAATAACTTTTGGGGCATTAGGTAAAACACTAATAGCTTCACTAGCATTCTCCTTTATAGGTGCAATTACACTCGTTCCTAGTGTATTTGCAAAATTAAGCAGAGGAAAAAATAGTCAAAAGATGCAAGAAAAAGATAGTCCTATATTTGATAAGGTAAGTGAAGCATATAAAAAATTATTAAGTGTATGTTTGAGACATCAACGCTTAGTTGTAATATCAAGTTTACTTATTTTTGTAGCTTCCTTATTTGGAATGGGATTTATAGGTATGGACTTTATGCCTGCAGCAGACAAGGGTGAATTATCTATTTCTATAGAACTTCCAAAAGGTCTTAGCCTAGAATCCAATGATTATTATGTATCTATGACTGAGAAAAAAGTCTCAGATATTCCAGAAATTAAAACTTTAATAACAACTTTGACATCAGATTCAAATAATAGTAAAGCAAGTATAGCAATTGAATTAGAATCTCAAAAAAATAGAAAAAGAACTACTGATGAAATAGAAAAAGAGATAATTGATAGAGTGGCTACTGTACCAGATTGTAAAATAAATGTAAGTCAAAACAGTAGTGTTATGGGTGGAGCTGGAGGAGCAGACTTCACATTAGAAATGAAAGGTCCTGATTTAGATGTATTAAAAATACTGGGAAAAGAAGCTGAAAAAGAATTTAGCTCTATAAAAGGATTTAGAAATGTTGAAACTTCTCTTACAGATACAACACAAGAAGCTCAATTTACTATAGATAAACATAAGGCTCAAGAATATGGTGTAAATACTGCTGAAATTGCAGGCATGTTACGTACAGCAATAAATGGTGACTCTGTAACCACTGCTACTATTGATGATTACAAAGTGGATGTAAACCTAAAATTTAAAGCAGATACTATTGATAGCTTAGAAGATATAAAGCAACTAAAAGTAAACTCTGCAACTGGAAAAGAAGTTCCTCTTGGTGCTTTTTCAGATATAAAAATGGCAGATGGTCTACAATCTATATCTAGGACTGATGGAGATTTTTCTGTAAATATAACTGCTACACTTGACAATTTAGATGCTGGTACTGCTACAAAACTAGCACTAGAAAAAACGAATAAAATGGTAATTCCTAAAGATTACTCTATAGGTGTTGGTGGTGAAACAGAAATGATGAATGAATCTATGGCAAGTCTTGGATTTTCAATGGTCATAGCTATAGCATTAGTTTATATGGTAATGGTAGCTCAGTTTGAATCATTTAGTAAACCATTTATAATCATGTTCTGTGTTCCATTTGCATTCGTTGGAGTTGTGCTTTCGCTTCTAGTTAGTGGTCAAAGTTTAAGTACTGTCGGTATGCTAGGTATAATCTTACTTATCGGTATTGTTGTTAATAATGGTATAGTTCTTATTGACTACATAGAGCAACTTAGAAAAACAAATCGTAACAATGATTTAATTGGTTTGGTTTCAATTGGTTGTGCAGCAAGATTAAGACCAGTCTTAATGACTACAGCAACAACAATTTTAGGTATGTTGCCAACAGCACTATCTCTTGGTGAAGGTGGAGAAACTATGCAACCACTAGCCATAGTTATAATGGGTGGTCTAACTGTATCTACACTTATAACTTTGGTGCTTATACCTACTATATACTTAATATTTGATAAATGGGAAAATAAGTTTTCAGACAAAATGCCTAAAATATTTGGTAAGATAACAGATAAAATAGGAAGTATAAAACGTAAAATAATAAAGAAACCAAAATTGAAAGCTAAAGTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1045
MNLTQTSVKRPLTIIMVFLVLIVFGGIGYKKMSINLMPDIEIPVVMVMTTWTGAGPQDVDEQVSQKVDESLSAVSNVKSTISSSQESVSMVVAQFEFGTNLDEIMNDVRSKVDALQTSLPDDAAKPTVLKLDMNAQAIGQLVISGGNENSSQALRKYAEDVIQPKIESIDGVTSADLKGGKKAQVNVIADPAVLSNYGVSLSTIKGVLSSSNKTFPYGSITQGEDKIVLRAIDKLESLDDIKQIQIPVKGGNTVRLDNLCSVDYGYADKDSIYRYNGKDSLVIDISKQQDANTVKVMQSAYKYVDELNKENPQFKIKIANDTSSYISESINSVMSNLLISAVIAFIVIFAFLKSVRASLVVAVAIPISIIGAIAILYFTGESLNLITASSLVISVGMVVDNATVVIENIFKYRKSGRLSLDDCAIEGTRTVTNAILASTLTTIAIFLPIMFTEGIAKITFGALGKTLIASLAFSFIGAITLVPSVFAKLSRGKNSQKMQEKDSPIFDKVSEAYKKLLSVCLRHQRLVVISSLLIFVASLFGMGFIGMDFMPAADKGELSISIELPKGLSLESNDYYVSMTEKKVSDIPEIKTLITTLTSDSNNSKASIAIELESQKNRKRTTDEIEKEIIDRVATVPDCKINVSQNSSVMGGAGGADFTLEMKGPDLDVLKILGKEAEKEFSSIKGFRNVETSLTDTTQEAQFTIDKHKAQEYGVNTAEIAGMLRTAINGDSVTTATIDDYKVDVNLKFKADTIDSLEDIKQLKVNSATGKEVPLGAFSDIKMADGLQSISRTDGDFSVNITATLDNLDAGTATKLALEKTNKMVIPKDYSIGVGGETEMMNESMASLGFSMVIAIALVYMVMVAQFESFSKPFIIMFCVPFAFVGVVLSLLVSGQSLSTVGMLGIILLIGIVVNNGIVLIDYIEQLRKTNRNNDLIGLVSIGCAARLRPVLMTTATTILGMLPTALSLGEGGETMQPLAIVIMGGLTVSTLITLVLIPTIYLIFDKWENKFSDKMPKIFGKITDKIGSIKRKIIKKPKLKAKV*