ggKbase home page

L3_098_220G1_scaffold_91_2

Organism: L3_098_220G1_public_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 18 / 38 MC: 16
Location: comp(685..5994)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Diguanylate cyclase with TPR repeats n=1 Tax=Clostridium sp. DL-VIII RepID=G7MA39_9CLOT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 45.8
  • Coverage: 1764.0
  • Bit_score: 1625
  • Evalue 0.0
Diguanylate cyclase with TPR repeats {ECO:0000313|EMBL:EHJ01805.1}; TaxID=641107 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium sp. DL-VIII.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 45.8
  • Coverage: 1764.0
  • Bit_score: 1625
  • Evalue 0.0
diguanylate cyclase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 43.9
  • Coverage: 1777.0
  • Bit_score: 1579
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. DL-VIII → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5310
ATGGAATTGAGTGGTAAAAGGGTGGCGTTAATGAAAAGGATTAATGGTAGTTATATTATCCAAAAAGAAGTTGACAATGAAGAATTTTTTACTGGATATTTGGTAAAAGATGAAAAAAGTAAGAAAAAATCTATATTATATATTTTAAAGAGTGGATTTATTTACGAAAAATCTAGAGAATACTTATTAAGTAAATTTAATACTATTAAGAATTTAAATTTCGACAATATGTTTAAATTAATCAATATTAAAATAATAAAGAATATTGATGGTATAAATTTAGATAAACCTCAATATGGTTTTTTACTTGAAGATTATGATTATAAAAAAAATACTAAGAATTTTATAGAAGGATGCAATTTAAAAGAGAAACTAGATATATTTATGGAAGTTTGCGCTTCAATCAATACCTTAAATATTAAAGGGTATGTTTATGATAAAATAAATATAAATGATATTAAAATAATCGTTGATAAAAATAATAGTATTAAAATAAAGCTAAAAAATATTTTACAAAATGAATTGAAAAAAATGAATCTATATAGTTCACCAATGAATTTAAAGCTATTTCCATATAGTTTATATAATAGGGATGAATTTTCAAATGAATTAAATAATATGAATGAGATTATTAATTTATTTAATGAAATTTTTTCTGAAGAAGATCTTAATTCTGATTTAACTGAAATAAAAGAAATTAAAAAATTTTTTAGATATATAAAGACATTAAATAAAATGTGTACAATAACTGATTTTATTAAATATGTTAATAATAGATTGAAAGCGGAATATACAGTATTTATTGAGAGTGGCATAAATAAACCAAAATTTAATTTAGATATTATTGGACGAGAAGAAGAATTGAATATAATAGAAAAAAAGTTTAATAATATTTTAGAAAATAAAGATAAATATAATATAATATGCTTTAAGGGCGAAAATGGGACAGGAAAAACAAAAATTTTAAATGAAATAGAATATATAATATCCAATAAATATTTAAAACAGATATTATATATAAAGAATCTAGAAGATATAAATCTATCTGTTGAAGAGCTTGAAGCATGTTTTATAAATTTCTTTGATGGTATTTTAGAAAAAATCACGCGAGAAAAATATGAATATTATATAAAAAGATTTATGGAGATTCTGATAAAAAATAAATCTGAAATTGATGATAATGAAAAATTAAAGATTGCTAATAGAATAGTTAAATGTATTAGTGAATATTCAGCCAAAAATCCAATAGTAATATTGATAGATAATTTAGAAGAAAAACATGAAATTATTAAGCTGCTTTTAAAGTATATATTGCTCCTAGATAGAAATACAGAGAATATAATGGTTGTGTTTACAGTTAATAACAGTTATTGTGATGAAGAAGTTTCATTGTTATTAAAGCAGCTTGAAAAATTAGAGAAATATGAAGAGTATACAATAAATTACTTTAACCAATATAATACAACCAAAATGATTAAAAATATTCTTAATTATAGTAAAGAAATAGATAAATTATCTATGGAGATATTCGCCAAAACCTTGGGTAATCCGCAATATATAATTAGCCTTATTGAAGAACTTTACAATAATAATTATATATGCTTTGATTTTAAGTCTGGAGTATGGAAAATAGATAAGGAATTCAAGAGTATAGCTATACCTGAAAAGATAGATAGTAAGGTGAATTTTATGATATCTTCACTAAGAGAAAGTGAAATACATATATTAAAAAAACTATCAATCTTTCTAACACCATTGCCAGAAAGAATAATATTGAAGTATGTAATAACAGGGGAAGAAGGAATAGAATCATATAATAAACTTAAAGAAAAAAACTTTTTAGCAGATAAAATAGGTGATAAGGGTCTATTAGTTGGTTTTACCAATGAGCTACTAAAAAATATATTATATTCCAAAATAGATGAAAAAACAAAATATGTAATGCATAAAAATGCAACTGAGTTTTTAGAAGAAGAAATATATAATGACGATTCATATGTTGAAGAATTCTTATATAATTTAGAAAAAATAGAGGAGTTTAACAAATTGTATTTTTATACAATTAGATGTGCTCAAGTTGAAAAGATATATGGAAATCCATCTAAATCAATACAGTATTATAAGAAAACATTTAAATATTCTGATGATAAAAATAAGTGTAATATAGCAATAAATATTGCTAAATTATATGAATGTATATCAGATCATGAAAATGGTTTAAAGTATTTTAAATTAGCTAATGAATATTCTTTTAAAAGAAGTAAAAAGGATATGCAAATATATACTAATATTGAGATAATAATAATAAAAATGAATAATTTTAACGAATGCAATCAAGATATTATATTATTATTGCAAAATATTAGAAAACAGTTAGATGAAATAAATTATCCTAAAGGAGAAGTGTATTATTATTATGCCCTTATGCTTAAAGCAAGGATAGAAGAAGAATATGAAATGATATTGGAGTATGGCTCAAAAGTTTTAGAAATATTAGATGAATTTAGGATAAAAGATGATGTTCATGGATGGATTTTAAATACTATTGCATTAGAATATAGAAGGATTGGGATATATAAACAAGCAAAAAAACTAATTTTGAATTCTACTAGACTATTTGAAAATAATAAAAATATGAATGGATATATATTTTCTAAAAATATATACACAGAATTATTAAAAGAGGAAGGCAGACCAATTGAAAAAATAATTGACAATCTAATAGAAATAAGCAGATTAAGTAATAGGAATAAACTCTATAAGCGAGAGATATTCAGTTTAATAAATATAGCAATATGTTATTTAAATATAGATAATTATGTTGAAGCGGAGAGATATATAACAAAAACATTAGAAAGACAAAGAGATGAATCAGTAGAATTTTATAGTGATATTATCTATAGTACTTTTTGTCTATTACAAATAAAATTAGGAAATATTAGGCTGGCAGTTAAATACCACACTTTATATCAAATGTTTTTAAATAATACCAAAAATCCAGAAGAAAACATGATCGATAATAGCATTTCATCATATTATTATAATTTAATATTTTATAACTATGATGAAGCGTATGAAATACTTAGAAAAATATATAATAAAATTTCAAATAAAAATGATTATAAAAGTAGATATATAGTATGTAACTATTATCAGATGTTACTGCTTAAATGTGAGAATGAATTAGATGTCAAAAATATATATAATATTTTAAAAAATAAATTAGAATATATAAATAATATAAATAAACAAATTGAAATAAAATTAAAAGCCATAAGATTTATATTAAAACTTGACTATAGAACTCTTGCAAATAAACTATTTAATGAAATTAAGGATTATCCTAATAATTATAATATGGAAGCATACTATATATATCTAGAATTATATTTTAAAGATAATAATTCACATTATAATTATCTAATTAACAAAGGGCTTAGAGTATGCAGCTTGTCCGTTGAAAAAGAAATAAAAAGAGATTTGTATGCAATTATAGGTGAAAAATACAGTGAAATGGAGTGTTATCAATTAGCATTTTATTATTACTATGAATCAATTAGTTTACATGTAGAAACATTGAAAGAACTACCTGTAAAGGAACAATTAATTTATATAAATAAGAGTAATTTTTTTTATGTATATAGATTATTAGTTGAATGCCTCAATGATAAGTTAAAAATAAGGATAAATTTTAAAGATTTTCACAACATAAATAATGAAAATGAATTAAATGATATTTTAAATGAAATTAAGATAACTAGATTATTGAACAATCAGTCTATATATAATCTTACACAGGGATTATATGAAAGACTATATTATAATAATTTAAATAATGCATATGATTTATTTTTCACATTTAACGAAGATATTATAAAAAATTTAGGAAGTATAGTAAAATACATTTCTAAAATAACTCTTTCAAATAAAGCTCTGTTGTTAATAGAAAATGAAAATGGAGAGAATGAGGTTGTATATAGTTATAGGATAAATAATGTTAATACAGTAAAATCATATTTTAATAATAAGATTGAATCTCAAGATAATGTTTTAATTTTATCTGAAAATGATATATATTTCAATAACCTAGAAATTGAATCTATGAAAATTAAAGGGTGCATGTATATAAGAATAAGGAATGAAGAAACATATTTAAATGGAAGTAATAAAATTAATGGAAAATTAATTTTGTTATCGGATAATGCAATTAATAATATTAATGACTCCTCAAAAATATTAGTTGAGAAATTAGTGCCATTCATAAACTTTATGTTGAAAAAATATAATTTAACAATAAGTTCAACACTAGATAAGTTAACTGGAGCATATAATAGAAGATATTTTGAACAAGCATTGACTAGATTGTTGGATAATGAAAAAGCAACAAATAATATTTTTGGAATAATAATGTTTGACATAGATGATTTCAAAGGAGTTAATGATAAATATGGACATCAAACTGGTGATGAAGTTCTTGTTAAAGTGGTAAAAGAAGTAAAGAAGAGCATATATAAAAATAATATAATTGGTAGATATGGTGGAGAGGAATTTTTAATATTAATTCCTAATGCAGATGAAGAAAAAATGATTAATTTAGCTGAGACAATAAGAGAGAATATAGAGAAGGCTAAAATTTTAGGTGAAAAAAGACCAATTACTGTTAGCATAGGTTCAGCTATTGGAGGAAATGAAGTACTAAGTAGTAGGGATATTATAAGTAGAGTTGATAGAGCACTATATAAATCTAAAAATGCTGGGAAAAACAAAGTTACTTTTTGGAGAAAAGAATTTGACGAGAATATTGAAGATGTGGATATTAATGGTGGGATGATTAGCGAAATGTTAAGAAGCCATAATTTAGACCTTGTAATAAGTGATATAGTTAATTTAATGAAATATAACATAACTAAAAAAGAAAGAATTCATCAATTTTCTCTTAAAATTATAAATACTATAAAGTGTGCAACTATTGGAGTATTTTTAATAGAAGATTATAAAATAAATAGTACTTTTGTTACTAGATTAAATGGTGAATTTTCATCTGACTTGGAGAATTTTAATTTAAATTTTGTGGATAAGGTAATAGGTGATGGTAAGAGTATATATAATATTGACTGGAATAACGGAAAAAAATATGAAGGGAATAGTATACCAGAATGGAAATCTGTCTGTTTAACACCTGTAATAAGTAATGGGAAAATTATAGTAGTCTTATATTTATACGATTCCATTAATAATAAAGAATTTGATAATAATGATTGTATTTTATTAAATAGCATAGCTCAATTGAGTATACCTGTATTTTTGTAA
PROTEIN sequence
Length: 1770
MELSGKRVALMKRINGSYIIQKEVDNEEFFTGYLVKDEKSKKKSILYILKSGFIYEKSREYLLSKFNTIKNLNFDNMFKLINIKIIKNIDGINLDKPQYGFLLEDYDYKKNTKNFIEGCNLKEKLDIFMEVCASINTLNIKGYVYDKININDIKIIVDKNNSIKIKLKNILQNELKKMNLYSSPMNLKLFPYSLYNRDEFSNELNNMNEIINLFNEIFSEEDLNSDLTEIKEIKKFFRYIKTLNKMCTITDFIKYVNNRLKAEYTVFIESGINKPKFNLDIIGREEELNIIEKKFNNILENKDKYNIICFKGENGTGKTKILNEIEYIISNKYLKQILYIKNLEDINLSVEELEACFINFFDGILEKITREKYEYYIKRFMEILIKNKSEIDDNEKLKIANRIVKCISEYSAKNPIVILIDNLEEKHEIIKLLLKYILLLDRNTENIMVVFTVNNSYCDEEVSLLLKQLEKLEKYEEYTINYFNQYNTTKMIKNILNYSKEIDKLSMEIFAKTLGNPQYIISLIEELYNNNYICFDFKSGVWKIDKEFKSIAIPEKIDSKVNFMISSLRESEIHILKKLSIFLTPLPERIILKYVITGEEGIESYNKLKEKNFLADKIGDKGLLVGFTNELLKNILYSKIDEKTKYVMHKNATEFLEEEIYNDDSYVEEFLYNLEKIEEFNKLYFYTIRCAQVEKIYGNPSKSIQYYKKTFKYSDDKNKCNIAINIAKLYECISDHENGLKYFKLANEYSFKRSKKDMQIYTNIEIIIIKMNNFNECNQDIILLLQNIRKQLDEINYPKGEVYYYYALMLKARIEEEYEMILEYGSKVLEILDEFRIKDDVHGWILNTIALEYRRIGIYKQAKKLILNSTRLFENNKNMNGYIFSKNIYTELLKEEGRPIEKIIDNLIEISRLSNRNKLYKREIFSLINIAICYLNIDNYVEAERYITKTLERQRDESVEFYSDIIYSTFCLLQIKLGNIRLAVKYHTLYQMFLNNTKNPEENMIDNSISSYYYNLIFYNYDEAYEILRKIYNKISNKNDYKSRYIVCNYYQMLLLKCENELDVKNIYNILKNKLEYINNINKQIEIKLKAIRFILKLDYRTLANKLFNEIKDYPNNYNMEAYYIYLELYFKDNNSHYNYLINKGLRVCSLSVEKEIKRDLYAIIGEKYSEMECYQLAFYYYYESISLHVETLKELPVKEQLIYINKSNFFYVYRLLVECLNDKLKIRINFKDFHNINNENELNDILNEIKITRLLNNQSIYNLTQGLYERLYYNNLNNAYDLFFTFNEDIIKNLGSIVKYISKITLSNKALLLIENENGENEVVYSYRINNVNTVKSYFNNKIESQDNVLILSENDIYFNNLEIESMKIKGCMYIRIRNEETYLNGSNKINGKLILLSDNAINNINDSSKILVEKLVPFINFMLKKYNLTISSTLDKLTGAYNRRYFEQALTRLLDNEKATNNIFGIIMFDIDDFKGVNDKYGHQTGDEVLVKVVKEVKKSIYKNNIIGRYGGEEFLILIPNADEEKMINLAETIRENIEKAKILGEKRPITVSIGSAIGGNEVLSSRDIISRVDRALYKSKNAGKNKVTFWRKEFDENIEDVDINGGMISEMLRSHNLDLVISDIVNLMKYNITKKERIHQFSLKIINTIKCATIGVFLIEDYKINSTFVTRLNGEFSSDLENFNLNFVDKVIGDGKSIYNIDWNNGKKYEGNSIPEWKSVCLTPVISNGKIIVVLYLYDSINNKEFDNNDCILLNSIAQLSIPVFL*