ggKbase home page

L3_122_000M1_scaffold_513_4

Organism: L3_122_000M1_public_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 20 / 38 MC: 18
Location: 4816..8220

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein n=1 Tax=Parabacteroides merdae CL03T12C32 RepID=K6A1L4_9PORP similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.7
  • Coverage: 1134.0
  • Bit_score: 2296
  • Evalue 0.0
SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein {ECO:0000313|EMBL:EKN17435.1}; TaxID=999420 species="Bacteria; Bacteroidetes; Bacteroidia; Bacteroidales; Porphyromonadaceae; Parabacteroides.;" source="Parabacteroides merdae CL03T12C32.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.7
  • Coverage: 1134.0
  • Bit_score: 2296
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 64.9
  • Coverage: 1138.0
  • Bit_score: 1551
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Parabacteroides merdae → Parabacteroides → Bacteroidales → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3405
ATGAAAAAAAGTAATGAACGGGCACTTTGTGTCCCATTATTAAAAAAAACTAAGCGTATCATGAAACTCACGACCTTATTTTCTTTAGGAGTCGCTTGCTGTATATCTGCTTCAACTTACGCGCAGGGTTATAAATTATCCATGAATAAGCAGAATAGCAGTATCATTGAGATTTTGAAAGACATTGAAAAAAATAGTGAATTTACATTCTTTTTCAATGACAACAAAGTGAATGTAAATAAAAAGGCGAGCATCAACGTAAAAGATGCGACTTTGGATGAAGCGCTGGCTCAAGTACTGAAAAATACCGGTTACGATTATCAAATTATAGATCGACAAGTATTGATAAAGACAGCTTCGTCCTCTGTTTCTTCCGTGCCCAGTGTACAACAGAATCAAAAAGCGATTACCGGTATTATTAAAGATGTAAACGGTGAACCAATTATTGGTGCAAACGTTGTTGAAAAAGGTACGACAAACGGTACCGTTACCGATATCGAAGGGAGGTTCTCCCTTAATGTTGCACCTGGTGCAACATTAGTAGTTTCTTATATAGGATATACTACAAGCGAAATAGTTGTTGGCAATAAAACAGATTTGGCGATCAGTTTGAAAGAAGATTCTGAAATGTTGGATGAAGTGGTTGTTGTCGGTTATGGAACCATGAAGAAAAAAGATTTGACAGGTGCTGTTGCTGCTGTTAAAGGTGATGATTTGGCTGCCCGCAAAACGACTCAATTATCTACAGCCTTACAAGGTGCTGCTTCTGGTGTCACAGTAACACGTGATAATAGTGCTCCTGGAGCAACTGCTAGTATACAAATTCGAGGTGTGACGACTATCGGTGAGACAAGCCCTTTAGTGATTGTAGATGGAATTCCAGGGGATATTAATCAAGTGAATCCAGAAGATGTAGAGAGTATGTCCGTTTTGAAAGATGCGGCATCTGCTTCAATTTATGGTTCACGTGCTGCAGCTGGTGTGATTGTAATCACGACAAAACGTGCAAAACAGGATGATTTATCCCTAAACTATAATTTCGAATATGGTTGGGAAATGCCGACTAAATTACCAGAATATGTTGGTGCTCAGCGATATTTGGAAATGATAAATGAAACGCGTTTTAATGATAATAATTCAGGTGGTTGGTATCAGGCTTATTCTGAAGACCAAGTGAATAATTGGGTGAAAAATAATGCAACAAATCCAGATGCTTATCCTATAGTGGATTGGCAGGATGCAATTTTGAAAAGTTCTGCTCCACGTCAGACTCATTCGATTAATATTGCAGGAGGTAGCAAAGTTGTGAAAACGAAAGCTTCTTTCCGATATGACAAGACAGATGGTCTTTATGAAAATAGAGGATATGAGCGTTATATGATTCGTATCAATAATGACTTTAAAATAAATAAATGGCTTGAAGCTCATTTGGATGTAAATTATAAACGTTCAAAATCGGAAGAACCGCATACGAATCCGATGCAATTGAATTTTCGTGCAACAGCTCCAATTTATGCAGTTCGTTGGAGTAATGGATTGTGGGGAGATGTAAAAGATGGAGAAAATCCATTGGCAATGATAACAGATGGTGGGTTAAAAACTTCATGGTATAATCGTTTAGGGGGTAAGGCGGCTATTGATATAACTCCGATTGAAGGATTGAAAATATCAGGAGTTATAGCACCGACATATAATTTTAATAAGGTGAAAAGTTTTGTAAAACAAGTACCTTATACCTATGCCAATGATCCTACTACAGTGAAAGGTTATATGGCTGGTTATAGAACGACAAAATTGACTGAAAATAGAAATGATGATTATGATGTGACTACACAATTTTTTGCAAATTACAATAAATCGTTTGGTCGCCATGATCTTTCAGCAATGATTGGTTATGAAGATTATTATGCTTTTTGGGAAAATTTGAGTGCATCTCGTGATCAGTATGAATTGACAAATTTCCCCTATTTAGATTTGGGACCTGAAAATTTGAGAGATAATGGTGGTAATGCAGAAGAGTACGCTTATCGTTCTTTCTTTGGACGAATCACTTATAGTTATGCCAATCGTTATTTATTGCAGGTAAATTTCCGTCGTGATGGCTCTTCTCGTTTTGCTCCGGATAGTAGATGGGCAAATTTCCCTTCTTTTTCTGCTGGTTGGGTTATGAGTGAAGAGAAGTTTATGCAAAATTTAAATTGGAATTGGTTGTCATATTTGAAATTAAGAGGTTCTTGGGGTACATTAGGTAATGAACGTATTACACGAATTGATGATAATAATAAACAAAATTATTATCCATATCAGTCAGCTTTAAACTTTGGTTCTGGTCTATTTTACAATGGAAACTCAGTGAGTTCTTTACTGACTGCTGCTCAGCAATATTATGCGGTTCGTAATATTTCTTGGGAAACAACAGAGACTTGGGACATTGGTTTGGATGCAAATTTCTTGGATAGCCGTTTGCATTTTAATTTCGATTTCTATAAAAAGAAAACGAAAGACATTTTGTTGGCTTTGGAAATTCCTAAATTTATAGGATATGATAATCCGTTTGTGAATACTGGGAATATGGAAACTACAGGGTATGATATTGAATTGGGATGGCGAGACCAAGTGGGAGATTTTAATTATTCTGTTTCTGCCAACCTTTCTGACTTCGTTTCAAAGATGGGTGATTTAGGAGGTACGGAATTTTTAGGTGAAAAAGTGAAAATGAAAGGTAGTGAGTTCAATGAGTGGTATGGCTATTTGAGTGATGGACTCTTTTTGACTCAAGAAGATGTTGATAATTCGCCTAAATTGAATAATAATGTAAAAGTTGGTGATATCAAGTATAAAGATATTTCTGGTCCGGATGGTGTACCTGATGGTAAAATTTCTTCGGAATATGACCGTGTCTGTTTAGGAGGATCATTACCCCGTTATACATTTGGTGTCAACTTTGCTGCATCATATAAAGGCTTTGATTTGGCTATGATGTTCCAAGGTGTGGGAAGTCAAAATGTTCGTATTAATAGTAATATGATAGAAGGATTGAGAAATAACTGGTGTGGCTTCCCTTCTATTTTGGAAGGTAATTATTGGAGTGTGAACAATACTGATGCTGAAAATGCGAAAGCAATATATCCTCGTTTGACCCGTAATAATATTGATTCTAATATGGCGATGTCTGATTTCTGGATGTTTAATGGGAGATATTTAAGAATGAAAAACTTAACATTAGGATACACACTTCCTTCTGTATTGACAAAGAAAATAAGTATGGAATCTGTTAGGTTCTATGTATCTGGTAACGATTTATTCTGTTTAAGCAAGTATCCGCATGGATGGGATCCGGAAGTCAGTACTACTGGTTATCCTATTACCACATCGGTGTTGTTAGGGGTATCGGTTAACTTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1135
MKKSNERALCVPLLKKTKRIMKLTTLFSLGVACCISASTYAQGYKLSMNKQNSSIIEILKDIEKNSEFTFFFNDNKVNVNKKASINVKDATLDEALAQVLKNTGYDYQIIDRQVLIKTASSSVSSVPSVQQNQKAITGIIKDVNGEPIIGANVVEKGTTNGTVTDIEGRFSLNVAPGATLVVSYIGYTTSEIVVGNKTDLAISLKEDSEMLDEVVVVGYGTMKKKDLTGAVAAVKGDDLAARKTTQLSTALQGAASGVTVTRDNSAPGATASIQIRGVTTIGETSPLVIVDGIPGDINQVNPEDVESMSVLKDAASASIYGSRAAAGVIVITTKRAKQDDLSLNYNFEYGWEMPTKLPEYVGAQRYLEMINETRFNDNNSGGWYQAYSEDQVNNWVKNNATNPDAYPIVDWQDAILKSSAPRQTHSINIAGGSKVVKTKASFRYDKTDGLYENRGYERYMIRINNDFKINKWLEAHLDVNYKRSKSEEPHTNPMQLNFRATAPIYAVRWSNGLWGDVKDGENPLAMITDGGLKTSWYNRLGGKAAIDITPIEGLKISGVIAPTYNFNKVKSFVKQVPYTYANDPTTVKGYMAGYRTTKLTENRNDDYDVTTQFFANYNKSFGRHDLSAMIGYEDYYAFWENLSASRDQYELTNFPYLDLGPENLRDNGGNAEEYAYRSFFGRITYSYANRYLLQVNFRRDGSSRFAPDSRWANFPSFSAGWVMSEEKFMQNLNWNWLSYLKLRGSWGTLGNERITRIDDNNKQNYYPYQSALNFGSGLFYNGNSVSSLLTAAQQYYAVRNISWETTETWDIGLDANFLDSRLHFNFDFYKKKTKDILLALEIPKFIGYDNPFVNTGNMETTGYDIELGWRDQVGDFNYSVSANLSDFVSKMGDLGGTEFLGEKVKMKGSEFNEWYGYLSDGLFLTQEDVDNSPKLNNNVKVGDIKYKDISGPDGVPDGKISSEYDRVCLGGSLPRYTFGVNFAASYKGFDLAMMFQGVGSQNVRINSNMIEGLRNNWCGFPSILEGNYWSVNNTDAENAKAIYPRLTRNNIDSNMAMSDFWMFNGRYLRMKNLTLGYTLPSVLTKKISMESVRFYVSGNDLFCLSKYPHGWDPEVSTTGYPITTSVLLGVSVNF*