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L3_060_052G1_scaffold_423_27

Organism: dasL3_060_052G1_concoct_1_fa

near complete RP 34 / 55 BSCG 51 / 51 ASCG 14 / 38 MC: 3
Location: comp(25211..34063)

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
Ribosome-binding protein 1 n=1 Tax=Columba livia RepID=R7VVQ2_COLLI similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 23.4
  • Coverage: 1049.0
  • Bit_score: 189
  • Evalue 3.30e-44
Ribosome-binding protein 1 {ECO:0000313|EMBL:EMC82863.1}; TaxID=8932 species="Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Archelosauria; Archosauria; Dinosauria; Saurischia; Theropoda; Coelurosauria; Aves; Neognathae; Columbiformes; Columbidae; Columba.;" source="Columba livia (Rock dove).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 23.4
  • Coverage: 1049.0
  • Bit_score: 189
  • Evalue 4.70e-44
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 27.2
  • Coverage: 239.0
  • Bit_score: 72
  • Evalue 2.20e-09

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Columba livia → Columba → Columbiformes → Aves → Chordata → Metazoa

Sequences

DNA sequence
Length: 8853
ATGGTGAAAAATTTGTCTGAAAATAAAAATAAAAAACTAGAAATATTTGATAGTGAAATAGATGATAGAAACTTTTCAGGCGAACTCAAAGAAGGTAGCTCTTTTCATACATCTGAATCCTTATACAATGAATTAATTAATCATAAAAAGAAAAGAGAAAAGAAGAAAAAAAAGCTATATAGAGGAAAAAGAAAACGTAAAAACAGATTAAAAGACAGAGTAGAAACTGTTGAAAAACCTAATATAGCAAAAGATGTAAAAACTTCTAAGATTTCTTATGATTTTAACCGAGAGGAAAGAATAAAGAAAAAAGCTTTTGAAGAGTTTGAAAAAACAAGAAAACAACAAGTTAAAAACACAATAACTAAATTAAAAAGAGAAGCTAGAGAAGGAACAGGGCTAAAATCTAATAATGTTTTTGCCAATTCAAAGTTGTTAAACAACTCTTCTCTTAAAAACGATAGTAATATTTTAAATAAAAATAAGCTTAATGTTAATGAAGAAAACGTTGGAAATAGCTTTAACAATTTTAATGTTGAACAAGAAAAAAGAAGAATAAAAGAAGATAAAAAACGTGAAGAAAGACTAATAAAAGAACAAGAGAAGCTGTTTAATAAAAATCTATTGGAAAAACAAAGTCCTATAGGTACAAGTTATGGGGAAACTAGTTTTTTTTCAAAAGATAATAATAAACAAAATAACTTTTTAAATAATAAAGCAAATGATAAAAATCAAAAAAACACACTTAGCTTTTCTAGGTTTATTAAAGATCAAGCCATAGCAAAAGAAACTATTAATAACAGACTTAGAGATAGGGTTAACGATGAAAAAAATCATAAAAAAAGCTTTAATATAGAAAACAAATACTCAAAACCTAACCCTACGAAAAAACATAATAAAAACAGTGAATATGGCAAAAGTTCTGGTATAAAAGAAGGTAAAGATTTTCACACAATGAACTCTACTTTTGAGAAGGCTAGAAGTAGAGTTAACGAATATCAAACTAATGCTAAGGAAAAATCTGATGAAATTTTTAAAAGAAAAGGCAACTTAACAAAAGATAAAAAGAATTTATCCAATAGGGGAGTTCAAAACAATAGAAACAGAAAATTTGAAACAAGGTCAAATAAAAACCAGAACACCTCTAATTCATCTTTTGTTTTAATAAACAAAGACACAAATAAAATAAATGATTCTATTAATAAACTAAAAAAAGACTCTGGGAATAATGATTTATTAAAAAACATTAAATCAAAAACAAATAGTGGTTTAACATACGATAAAATCATTTTAAGTAAAAATTCTGAAAAATTATCTAATTTTTCCCCTGAGATAAAAGGGGATATTAAAACCTTTAACAAAGATAGAGTAGAATTCTCTGAAAAAATTAAGAATTTTCAAGATTCGACTAGTAAAGACAAGATTTTCCAAAATAAAACCATCAAAGACGAGCCTATAAAAAAAGAATTCAAAAAACAAGGCAAAATTTCTAAAACAAAAGCAGAAGAACGTGTTAGAAGAAACAACGCTATAAATAAATTTAAAGAAAAAACATTTAAAGAAAAGTCAGGTATAAAAGAAGGTAGAGATTTTCATACAATGGAGTCTACCTTCAACAAGACTTCTTCAAGACTAGATAGGCAAGGAAACATATTTATAGACTCTGAAAGAGATTCTTTAAAAAAATCTAGAACAGACAGACAAACATCTGGAATTGAAAGCAAACTCGCTTATATAGAAAACAGAGATAGAATAAAAAAAGTAAACTCTAAAAAAGTATTAAATAATTCTTCAGATTATAAAAATTCTTTTAATAGTAGTTTTGATTATAAGAACAAAAATAATAACATTAAAAGAAAAACTGAAAAAAATTTAGCTCATAAAAAGCTAATTGAAAGAAAGGTCAAAAGACAAGCTTATTTGAAAAACAAGGAAGATTTAAATAAGCTATATAATAGAAGAAATAATCTATCTAACAAGGGTAAAATTAATCCAATTGACGAGATTTCAAGACAAGATTTAATAAACCACAGGAAAGAACTAAAGAGAAGAAATAAAAATGCTTTTAAGAGAGTTAGTGTAGGAATAATTCTTAATGAAGCTAAAAAATTTGATATTGAAAAAGTTAAAAAGGCAAAGGAAGTCATAAAAAGCAATTCTTATGCCAATTTGGATAATTGGAAAGTAGATCCAAAAAAAGTAAATTCTAAAGTAATAAAAAGAACAAAAGAGAATTTAGATAAAAATACTCACAAGTTTGCTTCTTCAGCTTTAGAAAAAACTATGAAGAAAAAACCTAGTAAAAAAGATAAAAATTCTTTTTATAGAAACAAGGGTTATTTATATACTACAAAGGTTTCTAATAAACAAAAACTTGGAACAAAAGAGATTCGAAAAAAACGTCTGATGAGACAAATGAAATTAAATGCTCTTAATAAAACCAAGAACATGAAACTAATTGCAATGGAGGCCGCAAGACGAGGAAACATAACACCAGCCCAAGCTCGTTATGCACTTCTTCAATCTGGTAGTATTAAAACTTTAATCAAAAAAATTGACGAGACTTCAATTCTTTCTTCTAAACTAAGAAAAGAAAAGAAAGAAATTCTTATTCATAAAAACAAAAAAGATAACTACCACAGATATACAAAAAATCTAGGCAAAGTTAATCTTAAAAGTGAAAAAGATGTCAGAAGGTTTTATGGAAAAATAAAAAATGAGCAAAGAAAATACTTCAATACAGCTTTTCATGCAGATAATAAGAATAGGATAAAAACTATTGAAAGAAGAAAGAATCTTAGAAAAAGAATAAACAGACAAATTGCATATTCTAAAGGTCTTGACAGAAAAAAACATAAAGAAAGATTGAGCAATCTATCAAGTCAAAAAAGAAAAAGGATAGTTAAATCAATTAATAAAAATAAATCTTTTGAAAACATAAATAAAAGAATTAAAAGAAAACCTAGAATAGACAAAAACACTTTTGAGAAATCTAAAAAAACCCTTAATAATCATGGTAAATCAAAATATAAAAAGAAGAATAGACAGCGTAAGAGAACATTCTATAAAAATAGAAAAAATTTTAACGAATTAAAAAGAAAATTTGGCTACCAAAAAAGACAAACTTTAAAATCCTATAAAGAAGTTAACAAGGACATCATTTTATTTAATAAGTTCTTAAAAAGGGAATTTAATAAAAAGAAGATTAAAGTTAAATCTAAAACTATTAAGCGTTTAAAAAGAATTAAAAAATATAGAAAAAATTATGCTAAAAAATTCGGTCGCAACCTAAGATATGGTCTTGGAATGATGGCTTATGATTATTCTTCTGGAATGATACTTGGAAGAACAACTGAAGACGAAGGATATTTTAAGGCTTTGGCTCAGTTATATGGAAGGCAATATATTTCAAGGCTACTTTTAAGGGATGGAAAAACCAAGAGAAAAAATAGAATAAAAAAAGCGAAAGAAGTTTCAAGAAAAGCAGGCAGAATTCTAAAAGTTGGGTCTGTCGAAGCTTGGAATTACTTTACAAATAATAGTGATAATCCTTTCTATAGATATTTACAAAAACAAAAGCTAAAGCAAGAAGCAAGAAAAAAGGCAAAAAGATTAAAAATATATCTAAAGAAAAACAAAAAAGATATATTTCAAAAGTTTAAATATAGGTCTAGAAGGTTTGGCTATTTAGCGTTAAGAACGCAACAATCTATTTTAAGGGTAAATGATGACGAAGCATCTATCGCCACATCTAAAATATTTGACACCATGTATTCTGGTGGAAAGCTTGGAGTTTATACTGGTAAAAAAGCATACAAAGTTGGAAAATCTACTAAAAAGAACACAAAAAGAGCTTACAAGTTTGTAAGAAAAAACATATCTAATGTTAAAAGATTTGCAAGAAGTTCCTATCAAGCTTTGAGACACACTATAAGACTAATAGTTATAGGTATTCAAGCTGTGCTTTCTTTCTTAGCAACAATACCAGGAATTATAATGATGGTAGTATTGGTATTGGTATTGGCAGTAATGATATTGCTAAGCTTCATAAACTCATTAAAATTAAACGAAACTTACGACTATGGAACAATAACATACAATCGTATAACTAAATTAGACTATGATGCCAACATGGGAGAATCTCAAAGATATAGAGATGCTAACATTGATGCTTTAAACAAGCTTCAAGCTATAAGGGATGGAGCATGGTCTTCAGATGAAGATTTGACAGTAATTGTTCCTAGAAGAAAAAAAATGCCGATTCCTGAACCATATAACCCTACAAGTGACGGCTTATTTGTAAGAACAGATGCAAATAGATTAGTTCAGTTTTTAGAAACTGTATATCAAGATGATACTATTGAGCAGATAACAGACTACGCACTTGAAACAAATGAGATTGATGCAGGTAAGGAATATGAAAGTAATTTCGGCCTTGAAAAGATTCCACCTACAGAATCAGAATATAATAGACAACAAAAAAATCTTGAAAAGATTAGTATTAAATCGGCAAAAGATCAAGTGGATAATTCTACTCTTATTAGAAAAAAATCTGACGGAACTTATACTAACACTAAAGAGCTTTCACAGGATGCAGTAGATGCAGGTGTAAAAGAAGACCCAATTGATATGATGTTAGATATTTTCCAAAGATTACATCCACCTAACTCTTATACTATTGATGATGCAAATAAGGATTCTTTAATAACTAAAGAGATATCTAAGGATGGGGAAATCAAAAAGGTTAAAATTTACTATGCAGATAGAAAAGATTATCCTTTCGATTATTTCTACGGATATGAGTTTGCAGAATCAAAAACTGGTGGAGATAATAACCAAGAAAATACAAGTGAAGATATTGCAGTAGATAACAACACAGCAAAAAAACTGGAGCTTCCTAAGGATGGAGAAGAAGGACTTGGTGTACCTAGTGCAGGAGAAGAACACACAGGTAGAGAAATGTTATTTAGACTTCAAGGTTCTGATACTAGATTTAGGAC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PROTEIN sequence
Length: 2951
MVKNLSENKNKKLEIFDSEIDDRNFSGELKEGSSFHTSESLYNELINHKKKREKKKKKLYRGKRKRKNRLKDRVETVEKPNIAKDVKTSKISYDFNREERIKKKAFEEFEKTRKQQVKNTITKLKREAREGTGLKSNNVFANSKLLNNSSLKNDSNILNKNKLNVNEENVGNSFNNFNVEQEKRRIKEDKKREERLIKEQEKLFNKNLLEKQSPIGTSYGETSFFSKDNNKQNNFLNNKANDKNQKNTLSFSRFIKDQAIAKETINNRLRDRVNDEKNHKKSFNIENKYSKPNPTKKHNKNSEYGKSSGIKEGKDFHTMNSTFEKARSRVNEYQTNAKEKSDEIFKRKGNLTKDKKNLSNRGVQNNRNRKFETRSNKNQNTSNSSFVLINKDTNKINDSINKLKKDSGNNDLLKNIKSKTNSGLTYDKIILSKNSEKLSNFSPEIKGDIKTFNKDRVEFSEKIKNFQDSTSKDKIFQNKTIKDEPIKKEFKKQGKISKTKAEERVRRNNAINKFKEKTFKEKSGIKEGRDFHTMESTFNKTSSRLDRQGNIFIDSERDSLKKSRTDRQTSGIESKLAYIENRDRIKKVNSKKVLNNSSDYKNSFNSSFDYKNKNNNIKRKTEKNLAHKKLIERKVKRQAYLKNKEDLNKLYNRRNNLSNKGKINPIDEISRQDLINHRKELKRRNKNAFKRVSVGIILNEAKKFDIEKVKKAKEVIKSNSYANLDNWKVDPKKVNSKVIKRTKENLDKNTHKFASSALEKTMKKKPSKKDKNSFYRNKGYLYTTKVSNKQKLGTKEIRKKRLMRQMKLNALNKTKNMKLIAMEAARRGNITPAQARYALLQSGSIKTLIKKIDETSILSSKLRKEKKEILIHKNKKDNYHRYTKNLGKVNLKSEKDVRRFYGKIKNEQRKYFNTAFHADNKNRIKTIERRKNLRKRINRQIAYSKGLDRKKHKERLSNLSSQKRKRIVKSINKNKSFENINKRIKRKPRIDKNTFEKSKKTLNNHGKSKYKKKNRQRKRTFYKNRKNFNELKRKFGYQKRQTLKSYKEVNKDIILFNKFLKREFNKKKIKVKSKTIKRLKRIKKYRKNYAKKFGRNLRYGLGMMAYDYSSGMILGRTTEDEGYFKALAQLYGRQYISRLLLRDGKTKRKNRIKKAKEVSRKAGRILKVGSVEAWNYFTNNSDNPFYRYLQKQKLKQEARKKAKRLKIYLKKNKKDIFQKFKYRSRRFGYLALRTQQSILRVNDDEASIATSKIFDTMYSGGKLGVYTGKKAYKVGKSTKKNTKRAYKFVRKNISNVKRFARSSYQALRHTIRLIVIGIQAVLSFLATIPGIIMMVVLVLVLAVMILLSFINSLKLNETYDYGTITYNRITKLDYDANMGESQRYRDANIDALNKLQAIRDGAWSSDEDLTVIVPRRKKMPIPEPYNPTSDGLFVRTDANRLVQFLETVYQDDTIEQITDYALETNEIDAGKEYESNFGLEKIPPTESEYNRQQKNLEKISIKSAKDQVDNSTLIRKKSDGTYTNTKELSQDAVDAGVKEDPIDMMLDIFQRLHPPNSYTIDDANKDSLITKEISKDGEIKKVKIYYADRKDYPFDYFYGYEFAESKTGGDNNQENTSEDIAVDNNTAKKLELPKDGEEGLGVPSAGEEHTGREMLFRLQGSDTRFRTMDANQSTITGRLTNPFSSKEVADDPLNPGKQLDLTDPIYSVSWLIRHQDGYRHVDYDKEDEKNKDKQNRSSLFDTNTNADKTENNDTEDNTDNSTDNKAESTTDKKDETPTVSTVIPNPTNPYDFPTTYVRRRFGFETDKIYKPASDNVSDVSGFETKNLNLNYNESQNYLKKNGLTDFGEYYDKKTGLVMNSVVDVVTMPGQKVYSPMEGKLVVAGNGFLGITAPTLEDERVGGGYVLIANPDRYGAEGASSTALADLTNEKFYSTSGKLKGFKHGSILLIGGFDAESIEKLRIRAFDGENNWVDHYDELGTLKKVLKDEDPEEKARNEGSHKSDVINSEPGEISHPVLGDMYQGLGPRGLGWGRPSDIAGDLIEKRGKWTVTAYSDDPAENGLGPGGVSTTATDKTKLPEVYKGVKDKDNLLRIGDVAVPRKNGKPIIPYGTYLWIDGYGFARATDTGGAMKGDWSTANPENRVLDILMHNRDCNKWGRKVVEVIQFKGNPFENKNFDITGAGFTGDTGREELDEEIQETDTLDKKVQKLSKKVQKLTKKISGLKEKLAENSGDTSIQDKITKLEKELAEKQEKLDKLFADHEEEAKKALENMDVKEEDLQSVLYLQLYYVYPHLDLLASIGNINVPVFKQTIGKLADALSDKFNTAYTYINPAMYMETGVLDYPDNKVQSYMLETGYGSYQTDINVDDYFLDASNNVNESDHLTQCSNDDGWTLPVSTNTFDGLKVVSSYGKRNKDYISEASSQEVQAFLNQARSYLGKYTYSQLDCSGYARAVLRDMGIDFPRISASKFLNKDQPWWDKVVAYKDVRESGGDPLEGIKPGDIIVMIKGVNGYATNLSITGHIAINVGMDKENGVNRGNNVMYHSTIGRTGNGPTQGVISDTYKNATGWIRFFDAGPVENNAEIDPNNWEYSPTLEFTSSTVNRPLVGSMSKASVISTGTTQEGHAYVVTKQADESGNDKYLVYEGLDPATLRVEKGDVLKPGTELGISAGSVVKVYSPKDPATQLVTDSQELDKFNNVLEVIHPDIAKKLHSKFTEGAKKAEEKEEKNKIEYKTDGEVFSKEAVCEIPDTYTGTVTTDIVMMEGYPWMSQMASIPNEYHNVKIHGKSKTYLQNGCGGWANAMGLTKALGRPIHVPELEGGFLKNDLVMEAGLMSRFINNNYGSEVTARASSSSNFRNSQNEIIEALNSGGYAVIHSRPPDRTWTRRPSGEHRSGGHYVVLIGYDPENHPDKPFRVHDSANNNPSNTGWFTWEQVKAGAVGGSNMIVKKK*