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NECEvent2014_2_3_scaffold_98_22

Organism: NECEvent2014_2_3_Peptoclostridium_difficile_28_21

near complete RP 49 / 55 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38 MC: 2
Location: comp(18960..21122)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
ABC-type transport system, permease n=5 Tax=Clostridium difficile RepID=Q181M6_CLOD6 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 720.0
  • Bit_score: 1393
  • Evalue 0.0
  • rbh
ABC-type transport system, permease similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 720.0
  • Bit_score: 1392
  • Evalue 0.0
ABC-type transport system, permease {ECO:0000313|EMBL:CAJ70531.1}; TaxID=272563 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Peptostreptococcaceae; Peptoclostridium.;" source="Peptoclostr similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 720.0
  • Bit_score: 1392
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Peptoclostridium difficile → Peptoclostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2163
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PROTEIN sequence
Length: 721
LKKIIYVLFTIELLIVSLLGLNIVKDNEINNILYNDTTSISVMFKDYKKLNKNYSKWIKDIADENNVAISKYVFNNNEKLSIYTTDTSLNNNIKLKSGKFPNTNSNEFISNINTNNSNQVGKFSTMSKDISILIRDFGKISEVGESGILYISTQNEDTINKILRELNVDRSIFVARLHDRYVNSNLYLNPSIIRDLILIILCFLATIIHYSISVSREASILRLNGYSKLDIIARVIKNILRIMILSSVTALLIYIIYILKLNIGVRACLYFAMFSIICILINILISILIVGFNSRSSKYVISLNGKKSYGFVNIMHFTLKIVFVSFLILSINNCILNYNMLQTQLGNLSEWDKAKNVYNLTLKDTGEQSLGKEEVIKNAKIKGFYKNLVEEKDAFLIDSTNFEKLEDGSYMYEINSKGKNPEVSQYGKNIKINKNYLKVNPIYSNGKEIFNLIDYDDKTINLLVPKKLQVHENEIKKEFRELFYFEKIEVENMYNKELNRELNKTKKSDLNVNIIYVDNNQSYFTYNSLVMDDNRNLIDDPIAIVDIDNIDDSFYLSYISRCVYFNSKKLDALADISSIIEAQGVEAHIQSLHAVYNEYGLEINKLEKYLNSEIFTIIIIAISNLMITYNIVASYYERNKYKLYIKKIFGYSTTARSMLLIVSLILTNIIPIGIISTRVDLSNNIILFGLLILVIEVIVSIVLDKIISNSSFNKIIKGEH*