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NECEvent2014_5_3_scaffold_181_5

Organism: NECEvent2014_5_3_Clostridium_paraputrificum_30_27

near complete RP 50 / 55 MC: 2 BSCG 51 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 2
Location: comp(3529..8547)

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
LPXTG-domain-containing protein cell wall anchor domain n=1 Tax=Clostridium perfringens WAL-14572 RepID=H1CPU1_CLOPF similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 38.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 861
  • Evalue 1.10e-246
  • rbh
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:CDM69259.1}; TaxID=1216932 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium bornimense.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 50.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1573
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 50.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1573
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Clostridium bornimense → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5019
ATGAGGGGGAAAAACAAGAAGTTCTTATCATTGCTTACGGCTATTGCGTTAGGAACTACTATGATTCTCGGTAATGGAGTTAAGATTAGTGCTAAAGAAGATTTAGCATCAAAACTTAAATCTGAGTTATTAAAACAGATGAGAGAATCACAAGGAGAACTTTCAGAGCATAGCAAAGGCCAAAGTGAATTTGGAAAAGACTTTGATGAGAATGGCAATAAGCTAGACGAAAATGAGGAGATTAGAGTTATAGTTCAGTTAAAAGATTCGCCTGCTATTATTTCAGAATCTAATGGTTATGATTCTAATGTAAAAACTAAGGAAAACACAGTTAAAGGTGCCCAACAAAGTGTTATAAAGAAGGTAGAAGCAATAACAGGAACAAAGGTGAAAAGAAGCTTTGGATATTTAGTTAATGGTTTCTCAATAAGTACTACAAGGAAAAATGTAGATAAAATTAAATCTATATCAGAAGTTAAGTCTGTAACTGAGGTTAGAAGATATTATCCAACCATGGCATATGCAGATGAGATAACAGGAGCTACTGGTGTATGGAATGAATTAGGTTATAAGGGTGAAGGAATGGTAGTGTCCATAATTGATAGTGGTATTGATTATAGGCATAAGGATTTAAAGGTTACAAATAATGATGTTAAGTTAACACAAAGTAATATGAATACTGCTATTGAACAACTTGATTACGGTAAGTACTTTACCAATAAGATTCCATATGGATATAACTATGCAGACGGAAATAATGACATTATTGATGTTGGAGCTGCAGGAGAACATGGTATGCATGTAGCTGGAATTGTGGGAGCTAACGGATCCTCAGATGAAGTAGAAGGATTAATGGGTGTTAAGGGGGTTGCCCCAGAGGCACAACTTCTAGCAATGAAGGTATTTTCTAATAATCCTGAAATAAAAGGAGCATATGATGATGATATAATTGCTGCTATTGAAGACTCTGTTAAATTAGGAGCAGATGTAATTAACATGAGCTTAGGATCAGATGCAGGTTTTAGTGATCCTGATGATCCACAAGAAGTAGCCATAAAGAATGCTACAGATAAGGGTGTTTTATGTGTAATATCAGCTGGTAATGCACAAGTATCTACAAGTTCAAGCTCATGGGAACAACCTCATAACTTATTTGGAACTATTGATACAGGTTTAATAGGTTCTCCATCAACAGCTTCTGATGCTTTATCAGTTGCATCCATGGAAAATACATCAGCAATAGGGCCAGCATTAACTTATACAACAATTGGCAATGCTACTGGAAAAGTTCAATATTCAAAGGTAAGTGGATGCAAGTATGATTCATTATCTAATAACCATGAATTAGTTTATTGTGGTATAGGTAGCGAAAGTGATTGTACAAACTCAGATGGTAAAATAGCTTTAATTATTAGGGGAGATATAAGTTTTTCAGAAAAATATAACAATGCTATAAATGCAGGTGCTTCGGCAGTTATTATATATAACCATGCAGATGGTGGAAATGAAACTATCTCTATGGCAGTTGATAATGTTGTGGCTGATAAACCTATATTTAGTGTAGGATATTCAGATGGTGAAAAGTTAAAATCTCTAATAACATCAGGGGATAGTACAATAAAGTTTGAGCAAGGTGGAGCGTTATCAAGCGAAAATATAGATAAGGGTGATATGTCTCAATTTACTTCATGGGGCCCAACATCAAGCCTAGAATTTAAGCCTGAAATAACTGCACCAGGTGGAGATATTTATTCTCTTGCAAATAATAATAGTTATCAAAGTATGAGTGGTACATCTATGGCAGCACCACATACTTCAGGTGCTCAAGCATTAATTATTCAGGGCGTTAAAGCTAATGGACTAAATTTATCAGGAAGAGATTTAGTTACATTTGCAAAGAATACTGCAATGAATACATCAGTTCCTATGACTGACAAGTATGGAAATGGAACAATTCCTTATTCTCCAAGAAGACAAGGAGCTGGGCTTTTACAAATAAGAAATGCAATAAATAATAAGGTAATAGTTACTAATTCTAATAGACAAGCATCTGTAGCGTTAAAGGAAATTGGAAATAATACAAGCTTTACCTTAAATTTAAAGAATTATGGAAATGAAGAGATAACTTATTCTATTCCAGAAGTTAAGGTATATAGTGAGGTAACTGATGAAGTTGGATATATTCATGAAGTTGAACTTGAAGGTGCTTCAATAACTTTTGATAAGTCATCAGTAACAGTACCAGCGAATGGAACTGCTACAGTAATTTGCAATTTAAATCTTTCATCAGTTGTTACAGCACAAAAGTTTGTTGAAGGATTTGTAAAATTTGTAGGTAATGAAAATGTACCTTCTTTAGTAATGCCATTTATGGGCTTCTATGGAGATTGGTCTGCTGAAAAAATAGTAGATGATCCTGAATACACTGATGGATCAACTTCTAGTATTACTGCAGAAACAGCTTTAATTGGAGTTTCCGGTGAAAATTTATCTTATATTGGAGCAGTTAGCAATGGACAATATACAGTATTTGATAAGAGTAAGATGGCCTTCTCTCCTAATAATGATGGTACTTTAGATGAAGTAATGCCATATTTATATATGCTTAGAAATTCTAAAGAACTTAAGATTCAAGTTTTAGATCAAAATGGAGATATTTTATCTGAAATATATAAAGAAAATAATGTTAGGAAGAATCTTCTTGAAGAATATATTAATGGAACTAGTGGTCCTAAGCTAGTTAGTGAAGGAGCTTGGGATGGAGCATTATATAATATGAATACTGGTAGATATGAAAATGTTGAAGACGGTAATTATTATATTAGAGTAGTTAATAAAGTTGATTTACCAAATGCAACACCTCAAAATTTAGATATGCCAATTATGGTAGATACAGTTGCTCCAGAAATAGATATTCTTGGAGTTGAGAGTATTGCAAGTGATAATAATAGTGTTAACTATGTTTTAAAATGGAAGTCTAATGATGAAGCTTCAGGATTAAGTGATATTTTCGTAGTTATAATTGGAGATAAAATGCTTGTATTATCTGAAGATAATATAAGTAAAGATTCTAATGGTAACTACTATGCTATAATTCCTTTTGCACTTGAAACTACTAATGATGTAGTAGTTGCTACAATGGATAATGCAGGTAACTTTGGATTAGATGAAGAGGTTATTTCAAATGTTACAAATGCAGATGTTAAATTTACTAATATATCTAATGGCATGATTATTTCAGCAGATATGTTAGCTGATGGTAAGTATATTGTAAATGGTTTAGCTAATGATTCAGTGGGAGTTTTAAAGATAAATGGTGAAGATGTAGAAATAGAAAATAATAGATTTAATTACCCATTATCAGTAGCTGAGGGAGTTAATGAAGTAAGTCTGTATGCAGAGGATAGGGACGGAAATACTATAGTTAGAACAAGTATACTAGTATTATTAGATACTATTGCACCAGCTCTCTCTGTTACACCGGACATAGGAACTGTATCACCTTACTATACAACTACAGAAGATTCTATAAATCTTCAGGTATCAGTTTCTGAAATAAATGAGTTTACTGGAAATTATGTTGGGGCATACCTAGGAGTTAATAGTGAAGATTTACAACCTATATCCTTAGATGCAAATGGAAAAGGAAGCGTGGAAGTGAATCTTACAGATGGATTAAATGGTATATCTATAATAGCAGCAGATGCAGCTGGAAATATATCTTATAAAGATATGGTTATTTCTAGGTATAGTGAAGATAATAACTTATCAGTTGAATTCTATAATTTAGAAGCGCTTAATTTTATTTCAGCTCAATTAACAGAAAATGATTTTTATACAATTGAAGGTAAGTTAAGCAATAAACCTGGAGTCTTTAAGATTTCTGGAGAAGATGTAACTGTAAAGGATGACTTAACATTTGAATTTAAGCAAAAACTAGAACAAGGCACAAATAGGATTAATGTTTATTTGGAAGATAAGGACGGAAAAGTTATTGTTAATAAGAACTATAAAGTTCTTTATGATTCAAAAGCACCATCAGTATCATTTGATTTAAATGTTAGAGATGATAATAAAGTTTACACTAACAATGAAAATTTCACTTTAAAAGGAAATGTTACAGATAGTCTACATGGATATTCCCTATATATAAATGGTGAAGCAGTATTAACTTTAGATCAAATGTTTGTAGAGGGAGAAGATAAATTACAAAGAGAGTTCTCTAAGGATATAAGATTACAACAAGGTGTTAATAATGTGTTAGTAGAAGTTGTTGATATGATGGGAAATAGTGTTGCTCAATATATTCCTGTTATATTAGATAAGGAAGCTCCAGTAAAGCCTTCTATAAACTTAAGCACTACAGAATTAACTAATAAACCTGTTAATGTAACAATTAGCTCTAATGAAACTCAAATTGATAAGATTGAATACAGTTTTGATGGAGAAAATTATACTGAATATAACGGACAATTCTCAGTAGGTATATCTTCTAAGGTATATGCAAGAGTAACTGATTACGCAGGTAATGTAAGTGAAGTTGCATTAGCTGAGGTTAAGATAGATACTGAAGCTCCACAAGTAAACATTACAAATATAGGTGAAGGACAAGAATTCACAGAATCAGTAACACCTAATGTTGTTTGTAATGATGAAGAAGCTACAATTACTCTTTTATTAAATGGAAATTCATATTATGGAGAGGAAATTACAGCTGAAGGAGAATATATTTTAGAGGCTTATGTTACAGATAAGGCTGGAAATAAATCTTTAGTTGTTACAAGACACTTTAAGATTGTTTCAGATTCTGCTGTAATAACCCCACCTAGTGGAGGAGATACAGATAATCCAAGTAAGCCTGGAGATTCAACAGAACCTGGTGATACAAATAATACTCAAGGAATACCGTCAAAAACTGGAGACAGTAATTCAATGACAGTAGTAATAGTACTTGTTGCTTTAATGCTATGCTCTGGAGCAGCAGTAGTTGTTATTAGAAAGAAAAAGAAAGTAGAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1673
MRGKNKKFLSLLTAIALGTTMILGNGVKISAKEDLASKLKSELLKQMRESQGELSEHSKGQSEFGKDFDENGNKLDENEEIRVIVQLKDSPAIISESNGYDSNVKTKENTVKGAQQSVIKKVEAITGTKVKRSFGYLVNGFSISTTRKNVDKIKSISEVKSVTEVRRYYPTMAYADEITGATGVWNELGYKGEGMVVSIIDSGIDYRHKDLKVTNNDVKLTQSNMNTAIEQLDYGKYFTNKIPYGYNYADGNNDIIDVGAAGEHGMHVAGIVGANGSSDEVEGLMGVKGVAPEAQLLAMKVFSNNPEIKGAYDDDIIAAIEDSVKLGADVINMSLGSDAGFSDPDDPQEVAIKNATDKGVLCVISAGNAQVSTSSSSWEQPHNLFGTIDTGLIGSPSTASDALSVASMENTSAIGPALTYTTIGNATGKVQYSKVSGCKYDSLSNNHELVYCGIGSESDCTNSDGKIALIIRGDISFSEKYNNAINAGASAVIIYNHADGGNETISMAVDNVVADKPIFSVGYSDGEKLKSLITSGDSTIKFEQGGALSSENIDKGDMSQFTSWGPTSSLEFKPEITAPGGDIYSLANNNSYQSMSGTSMAAPHTSGAQALIIQGVKANGLNLSGRDLVTFAKNTAMNTSVPMTDKYGNGTIPYSPRRQGAGLLQIRNAINNKVIVTNSNRQASVALKEIGNNTSFTLNLKNYGNEEITYSIPEVKVYSEVTDEVGYIHEVELEGASITFDKSSVTVPANGTATVICNLNLSSVVTAQKFVEGFVKFVGNENVPSLVMPFMGFYGDWSAEKIVDDPEYTDGSTSSITAETALIGVSGENLSYIGAVSNGQYTVFDKSKMAFSPNNDGTLDEVMPYLYMLRNSKELKIQVLDQNGDILSEIYKENNVRKNLLEEYINGTSGPKLVSEGAWDGALYNMNTGRYENVEDGNYYIRVVNKVDLPNATPQNLDMPIMVDTVAPEIDILGVESIASDNNSVNYVLKWKSNDEASGLSDIFVVIIGDKMLVLSEDNISKDSNGNYYAIIPFALETTNDVVVATMDNAGNFGLDEEVISNVTNADVKFTNISNGMIISADMLADGKYIVNGLANDSVGVLKINGEDVEIENNRFNYPLSVAEGVNEVSLYAEDRDGNTIVRTSILVLLDTIAPALSVTPDIGTVSPYYTTTEDSINLQVSVSEINEFTGNYVGAYLGVNSEDLQPISLDANGKGSVEVNLTDGLNGISIIAADAAGNISYKDMVISRYSEDNNLSVEFYNLEALNFISAQLTENDFYTIEGKLSNKPGVFKISGEDVTVKDDLTFEFKQKLEQGTNRINVYLEDKDGKVIVNKNYKVLYDSKAPSVSFDLNVRDDNKVYTNNENFTLKGNVTDSLHGYSLYINGEAVLTLDQMFVEGEDKLQREFSKDIRLQQGVNNVLVEVVDMMGNSVAQYIPVILDKEAPVKPSINLSTTELTNKPVNVTISSNETQIDKIEYSFDGENYTEYNGQFSVGISSKVYARVTDYAGNVSEVALAEVKIDTEAPQVNITNIGEGQEFTESVTPNVVCNDEEATITLLLNGNSYYGEEITAEGEYILEAYVTDKAGNKSLVVTRHFKIVSDSAVITPPSGGDTDNPSKPGDSTEPGDTNNTQGIPSKTGDSNSMTVVIVLVALMLCSGAAVVVIRKKKKVE*