ggKbase home page

NECEvent2014_6_5_scaffold_227_15

Organism: NECEvent2014_6_5_Clostridium_paraputrificum_30_193

near complete RP 48 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: comp(19817..24775)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
AAA ATPase {ECO:0000313|EMBL:ERK31212.1}; TaxID=1294142 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium intestinale URNW.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 76.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2558
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 47.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1548
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium intestinale → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4959
TTGAATAGTATCGATGAAAAAGGCGTAAATAAAAGTTTCCATGATAATAGTAAAGAAGATATGGAGAATGGAACATATGAAGTTATTAAAAATCGTCTTTTAAAAAAAGGTTCTGATTTAAAAGAGAGGGTTGAAAAGCTTAATAAAGAAAGAAAAAGTGTTTTTGGTTCTATTGAAACAAAAGTTCTTGGTAGTGAAAGAATAATTACTGATAATAATTGTATTCCAAGAGATATGGCTCCAGTAGAAGATTACTTTATTTTTGGATATAACGTTCATATTGGACTTAAATCTAAAGTGGAACTAAGTGATGTTTTTTCAATTTATAAATATGAAAATAGGAGTTTTGTAAAACAATCCTTTGATTTGATTAGTGATAAAGACTTTATTAATGACTTTGATGAACTATATAAATATTATAAAAATACTTTTTTTGCTAAGTTTACTATAACAGAGCCTTATTTCTATATGATTTTTCAAACAGGAAAAGATCCTACAGATATTAAAGTATTTAAGTGGGTAATTGAAGGAAATAAGTTAGTTTATGTTGATAGTAGAAGTGAGCATGAAATTAGATTTAAAAATAAAAGTGAATTTAGATTTATTAAGGCCACTAGAGATGATCAAAGAAGTGGTATTCATCCCCATGTTTCAATATTGGACAAGGTTTTTGTTGAAACATTAGAAGGAGATTTAACTATTAAAATAGAGGATAATACCACAACAGGTAAAGGTATATATTCTGAGCCTGTTGAGTATATGGATCAAACCCTTGATGATGCAGAAATATACTATGCAGATTTAGAGCAAATTATAATTTTGAAAATTAAACCATATAAGGAAGAAGAGTATAGATATTTTATTTTCAATAATAAGTTGAAAAATGTTGTTAGAATAGATTCTATAAAAGATACTTGTATTCTATTACCAGGAAACCATGGGATTATATTTCCAGAGGGATATTATCTTCAAAATGGTGAGTATAAGATTTTTGATGTAGAAGCAGAGAATTCTATTTTTGATAAAAGAGTTTCGTCTACTAATGGAGAGGATTATCAATATATTTTTTATAATACTTATAGCGGGTTGTACTTAATTTATTCATATAATATTATTGAACAGAAAATTGATACACCAATTGTTTGCAGTGGATATTCTCATTTTAATAATGGCGAGATGATTATTTTCAAAAATGAAAGTGAGCCAAGAAAAAATCATATTATACAAATATGGCAAACACCTTATGTTGGAAAGAACTATGTAACTGAAGGCAACAAAGATTCTTTGTTATTTAAGATTGGAAACAAGGATATAGTTAATGCAATGGCTGACTGCAAAGGGGTATGTAAGCTTATCCAAAAGGGTGAAGGATACCAAAGTATATATGTTGATATTGTAAAAGAAAGTGAAAGAATAATAGATTCTTATTTCTGGTTAGATAAAGAAGAGATATTTAATTTAAAAGAGGTACTTATAAATATCAAGGAATCTGCTACTTTTGCCATAGGCGAGTTTGAAAAAGTAACGAGAATAAAAACTTCTACCAAAAAACAGGTTGAAGAAGTTAGCACAAGAGCAGAGGAACTATTGAATAATCTAAAGTATGGTTCCTTTGACTCAATTAATGAATATGTTAAGGCATTAGCAGATATAAGAAACTTAAGGGGAGGGATTTCTTCTCTTAAGGACTTAAGATATGCAGATCTCAATATAGTTAATTCTCTTGATGTAAATGTTAAGGAAAAGTATGAAGAGTTCTCAAAAAAATGTGTTGAATTTTTAGTTGCTCCAGAGGGGTTAAAGCCATATGAAACAAATGTTAATAAGTTAGCTTTGGAAATAAATAAAGTTAATAAATCTAAAGAGGGTAGAGAGCTTGAAAAAAGGATGGACGAAACATCCAGTGAATTAGAGCTTCTTATAGATATAATATCTAACTTCAAAATTGAAGATCCCACTATGACCACACAAATAATAGAGAAAATTTCCTCATTATTTTCTTTAATTAATAATGGTAAAGCTAGGCTAAGCAATAGAGTTGGAGATCTTACTAAAAGTGAAATGACAACTCAGTTTAATGCTCAGTTAAAGTTACTTAGTCAATCAGTTGTAAACTATCTAGATATATCAGATACAGTAGATAAATGTGATGAATATTTAAATAAAATTATGATTATGATTCAAGAACTTGAAGGAAAGTTTGCTGAATTTGATGATTATGTTATTCAATTAAGTGAAAAAAGAGAAGAAGTATATAATGCCTTTGAAAGTAAAAAGCAGACAATTTTAGATAAGTTAAATAAAAGAATACTCTCTTTATTTGGTTCTTCAGAACGTATACTTAATGGAATAAGTAATAGGTTAAAAAGTTTTAATACTGTAGATGAGATTAATGGATATCTGGCTACAGATATAATGGTAGAAAAGGTTAGGGATATTATTTCTAGCTTGAAAGATCTTGGGGATAATGTAAAAGGTGATGAGATTACTTCAAGATTAAAGAAAGTAAAAGAGGAAGCTATCCGACAACTTAAGGATAGACAAGAACTTTATATAAATGGAAAAGATATTATTAAATTAGGGAAACATTATTTCTCTGTTAATAACAAACCTATTGATTTATCTATAGTGCAAAAGGAAGATGGACTAAATTATCATATTACAGGAACTGATTTTTGGGAGAAGGTAGATATTAAAGGAATTGACAAATATAATCATGTATTCTCTCAAAGTGTAGTATCTGAGAATAATGAAGTGTATAAGGGGGAGTACCTAGCTTATTTAGTTTTTGATGCAGCAAAAAGAGGTGAAAATGAGTCTTTAGATAAATTACATTCTATGTCTGAAGGACAACTTATTAAAGTGGTGCAAAAATTTATGGAACCAAGATATCAAGAAGGATACACTAAAGGTGTACATGATATTGATGGGGCAAAAATTTTAAAGGCATTATTAGAGTTGCATTATAAAATAGATTTACTTATATATAGTAGTGAAAGTAGGGCATTAGCAAGGTTATTCTGGAGTTCTTTAGCTAAAAAAGATACAAAGGATTTGTTAAGAAAGAGGTTAAAAGAATTATCAAAAGTTAGTTTGTATTTTAATTCTTCTCCTAATTTAGATAGTTATATTCCATATGTGTCTGAAAAGATTGAAGAAGAAAATAATAAGTTTAATCTATTCCATAAGAGATGTGTAAAAGAAGCATCTGAATACCTATGCTTGGAAATTATGAGAGGAGAAGACTTTGTAGTTAGTAAAGATGGTAAGAGTATATATGATGGATTTATTAACTACCTAAAAGGAAAGGGATTGTTAAGTGAATTTTTAGCATCCATAGAAGAGAGTAAAGTAGATATAGAAGGGCTTTACTATTTCATAAAGGAATGTATTAATGCTTATAAAGAAAGTGTTATAGATGATAATAAAGAACTAAGAGACATTAATGCTACTATATTTGAAAACTTAGATGACTATGAAATAGAAGGATTGCTTAAGGAAGTAATTATTTTATTAATGAATGGTGATAGAAGTTTTGGAAGGGTTATATATGTTGATTCAAAAGTAAATATAGAAGGCCTTATAGGAAGTCATTCTGTAATAGAAAGTGGTAAATATATTCTATCTTATACAAAATTTATGAATAAGTTAAAGTATTTTGGTGAGATTTGTGTTAAAGAGTTTATTGAGTTCCAAGATATAAAGAAGGGTCTTATTAAAAACTTTAAGGATAAAATTCATTTAGATGAATATAAGCCACAAGTACTTACTTCTTTTGTAAGAAATCAATTGATAGATAAGGTGTACTTGCCTTTAATTGGTGATAATCTAGCAAAACAAATTGGTGTTGTTGGAGAGAATAAAAGAACAGATTCAATGGGATTATTATTACTTCTTTCTCCACCTGGATATGGTAAAACAACCTTAATGGAATATATAGCAAGTAGGCTTGGAATTATATTGGTTAAGGTAAATGGACCATCATTAGGTTATGATGTAACTTCATTAGATCCAGATAAAGCTAATAATACAGGATCTAGAGAAGAACTTAAAAAGTTGAATATAGCCTTAAAAATGGGTAACAATGTAATGATATACTTAGATGATATACAACACTGTAATCCTGAGTTTTTACAAAAGTTTATTTCTTTATGTGATGGACAAAGAAAAATTGAAGGTGTATATAATGGAATTGGTGAAACTTATGATTTAAGAGGTAAAAAGGTAGCTGTTGTTATGGCTGGAAATCCTTATACTGAAAGTGGAGAAAAATTTAAGATTCCAGATATGCTTGCTAATAGAGCAGATGTATATAACCTAGGGGATATGCTTATGGAAAATGAAGAAGCATTTAAACTTAGTTATATTGAAAACTGTTTAACTTCAAATCCTATATTATCTAAGCTATCTAATACTAATCAGAAGGATTTATATGGACTTGTTGAAATGGCTAATGGAGTGGAAAGGGAAAATGTAACCCTTGAATATGATTACTCAGTAGATGAACTAAATGAATATATAAGTGTTCTTAATAAGTTAATGAAAGTAAGAGATATAGTAATAAAGGTCAATATGGAGTATATCCATTCAGCAGCTCAAAGCGATGAATATAGAAAAGAGCCACCATTTAAGCTTCAAGGGTCATATAGAAATATGAATAAGATAGCTGAGAAAGTAGTAGCTATAATGAATGATGAGGAATTATTCCAAAGAGTTCTAATTAACTATGAAAATGATGCTCAAACATTAACTTCAGGAGCAGAAGCTAATATGCTTAAATGGAAAGAGTTAGTTGGGTGCATAACTGAAGAAGAAAAGAAAAGATTTGAGGAAATAAAAAATACTTTTATTAAAAATAAGTTAGTTAAAGGTGAAGACAAATTAGGACAAGCAATTCTAGTTTTAAGTAATCTTACAGAAAATATAGAAATGATTAAAGAAATATTAGAAAAAAGATAA
PROTEIN sequence
Length: 1653
LNSIDEKGVNKSFHDNSKEDMENGTYEVIKNRLLKKGSDLKERVEKLNKERKSVFGSIETKVLGSERIITDNNCIPRDMAPVEDYFIFGYNVHIGLKSKVELSDVFSIYKYENRSFVKQSFDLISDKDFINDFDELYKYYKNTFFAKFTITEPYFYMIFQTGKDPTDIKVFKWVIEGNKLVYVDSRSEHEIRFKNKSEFRFIKATRDDQRSGIHPHVSILDKVFVETLEGDLTIKIEDNTTTGKGIYSEPVEYMDQTLDDAEIYYADLEQIIILKIKPYKEEEYRYFIFNNKLKNVVRIDSIKDTCILLPGNHGIIFPEGYYLQNGEYKIFDVEAENSIFDKRVSSTNGEDYQYIFYNTYSGLYLIYSYNIIEQKIDTPIVCSGYSHFNNGEMIIFKNESEPRKNHIIQIWQTPYVGKNYVTEGNKDSLLFKIGNKDIVNAMADCKGVCKLIQKGEGYQSIYVDIVKESERIIDSYFWLDKEEIFNLKEVLINIKESATFAIGEFEKVTRIKTSTKKQVEEVSTRAEELLNNLKYGSFDSINEYVKALADIRNLRGGISSLKDLRYADLNIVNSLDVNVKEKYEEFSKKCVEFLVAPEGLKPYETNVNKLALEINKVNKSKEGRELEKRMDETSSELELLIDIISNFKIEDPTMTTQIIEKISSLFSLINNGKARLSNRVGDLTKSEMTTQFNAQLKLLSQSVVNYLDISDTVDKCDEYLNKIMIMIQELEGKFAEFDDYVIQLSEKREEVYNAFESKKQTILDKLNKRILSLFGSSERILNGISNRLKSFNTVDEINGYLATDIMVEKVRDIISSLKDLGDNVKGDEITSRLKKVKEEAIRQLKDRQELYINGKDIIKLGKHYFSVNNKPIDLSIVQKEDGLNYHITGTDFWEKVDIKGIDKYNHVFSQSVVSENNEVYKGEYLAYLVFDAAKRGENESLDKLHSMSEGQLIKVVQKFMEPRYQEGYTKGVHDIDGAKILKALLELHYKIDLLIYSSESRALARLFWSSLAKKDTKDLLRKRLKELSKVSLYFNSSPNLDSYIPYVSEKIEEENNKFNLFHKRCVKEASEYLCLEIMRGEDFVVSKDGKSIYDGFINYLKGKGLLSEFLASIEESKVDIEGLYYFIKECINAYKESVIDDNKELRDINATIFENLDDYEIEGLLKEVIILLMNGDRSFGRVIYVDSKVNIEGLIGSHSVIESGKYILSYTKFMNKLKYFGEICVKEFIEFQDIKKGLIKNFKDKIHLDEYKPQVLTSFVRNQLIDKVYLPLIGDNLAKQIGVVGENKRTDSMGLLLLLSPPGYGKTTLMEYIASRLGIILVKVNGPSLGYDVTSLDPDKANNTGSREELKKLNIALKMGNNVMIYLDDIQHCNPEFLQKFISLCDGQRKIEGVYNGIGETYDLRGKKVAVVMAGNPYTESGEKFKIPDMLANRADVYNLGDMLMENEEAFKLSYIENCLTSNPILSKLSNTNQKDLYGLVEMANGVERENVTLEYDYSVDELNEYISVLNKLMKVRDIVIKVNMEYIHSAAQSDEYRKEPPFKLQGSYRNMNKIAEKVVAIMNDEELFQRVLINYENDAQTLTSGAEANMLKWKELVGCITEEEKKRFEEIKNTFIKNKLVKGEDKLGQAILVLSNLTENIEMIKEILEKR*