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NECEvent2014_6_5_scaffold_51_12

Organism: NECEvent2014_6_5_Clostridium_butyricum_28_55

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 MC: 4 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(11070..14273)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:ENZ30552.1}; TaxID=997898 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium butyricum 60E.3.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2010
  • Evalue 0.0
putative multidrug efflux pump, membrane protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 66.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1386
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium butyricum → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3204
ATGAGTATGACAAAAACTTCCGTTAAACGTCCTCTTACAATAATAATGGTATTTTTAGTAGTATTAATGTTTGGTGGAATTGGGTATAGTAAAATGCCTGCTAACTTAATGCCAGATATTGATGTGCCAGTTGCTTTAGTAATGACTCAATGGTCTGGAGCTGGTCCAGAAGATATTGATGATCAAATATCAGAACCTATAGAAAAAAGTCTTTCGTCAATTTCAAATGTAAAGACAACTGTTTCCAAGTCCAGTGAAGGTGTATCGATGGTTGTTGCACAATTTGAATATGGAACTGATGTTGATGAAAAACTTAATGACATAAGAAGCAAAATAGATACAGTAAAAATGACACTTCCTGATGATGTTGACACACCAAGTATTTTAAAAATGGATATGAATGCACAGGCCATTGCACAGATAGTTGTAAGTGGAGAGGGTAGTTCAGATGACATAATGAAATATGCAGAAGATACAGTTCAGGTTAAATTAGAATCTATAGATGGTATAACTTCAGCTGATATTAATGGTGGAGATAAGACACAGATAAATGTCATTGCAGATCCTACTATACTTTCAAGTTACGGTGTATCATTAGATACAATTAAAGGTCTTTTATCTGCAACAAATAAGAGTTATCCTTATGGATCAATAACTCAAGGAGATGACAAAATTGTTATCAGAAGTGTTGATAAAGTTGAAGCTTTAGAAGATATTAAGGCAATTCAAATTCCTATGTCAAATGGTGAAACTGTAAGTCTTGATAAGATATGTACAGTTGAGTATGGGACTGTAGATAAGCAATCAATTTATAGATACAATGGCCAAGAAAGTTTAGTTATGGATGTACAGAAGCAGCAAGATGCAAATACTGTACAGGTTATGAAAAATGTTAATTCAAAAATATCTGAACTTAATAATGAGAATTCACAATTTAATTTAAAAATAGTTAATGATACTAGTGAATATATAAATAGCTCAATAAATGACGTAATGAAGAATCTTATTTTAAGTGCAGTAATTGCCTTCTTTGTTATATTACTTTTCTTAAAGAGCGGAAGGGCTTCATTTGTTGTTGCAGTTTCTATACCAACATCAATAATTGGTGCAATTGCATTACTTTATTTTACAGGTGAAACATTGAACATGGTAACATTAAGTTCACTTGTAATAGCAGTTGGTATGGTTGTTGACAACGCCACAGTTGTTATTGAAAATATATTTAAGTATAGAAAAGATCCTAATTTATCTTTAGAAGAAGCAGCTATTCAAGGTACAAATACGGTTTCAACTGCTGTAATGGCTTCAACATTAACAACAGTAGCTATATTCTTACCAATATTGTTTACTGAAGGATTTACAAAGATAATGTTTGGTTCATTGGCTAAAACACTTATTTTTGCATTAACTTTATCATTAATAGTTGCACTTACTTTAGTACCAAGTATATTTGCAAAACTTAGTGGTGGTAAAAATGGTGCAAAGATGGAGGAAAAACCATCTCCTATATTTGATAAAATAAGTGAGGGTTATAAAAATATTATAGTTTTAGCATTAAAACATAAAGCAGTAGTTATTTTAATAAGTGTAGGTATGTTTATTGGAGCAATAGCTTTAGGTGCAACTGGAGCAATAGGTATGGACTTTATGTCAAGTGGTGATGAAGGTATGGTTAGTATATCTATAAAATTACCAGAAGGCTTAGATTTAGAACCAAGTGATTATTATGTATCTATGGCAGAAGAGAAAGTATCTGATATTCCTGAAATTGAAACCATGATAACTCAAATAGGATCAGGTTCAGCAATGGGGTCAGGTGGTTCTACAGCAAGTATAAGTTTGGATTTAGTATCTTCGAAAGAAAGAAAGAGAACAACAGATGAAATTGAACAAGATGTAGTAGAAAGATTAAAAGTAATACCTGACTGTGAAATCAATGTAAGTCAGACTAGTAGTATGTCTATGGGTGGAAGCGGAGATGCTCAAGTAGATATTAAAGGTCCAGATTTAGATGTATTAGAAGAAATAGTTAATCAAGCAAAAGCTAATGTTGAAAAAGTATCTGGATTTAGAAATATAGAAACTTCTCTTGCGGATTCAAATAAGGAAGCTCAATTTAAGATTGATAAAAGAAAAGCTTCATTATTAGGAATAAATACATCGTCAATAGCATCTACATTACGTACAGCAATTAGTGGATCAGATGCTACAACAGTAACAATTGATGATTATGATTATGATGTAAATTTAAAATTCAAGGATTCAAGCATAAATAGTATAGATGACATTGGACAAATAAAAGTAACATCAGCAAGTGGTCAGCAAGTGCCTTTAAATGCATTTGCAGAAATTAAAATGGCTGATGGATTAAAATCAATTTCAAGAACAGATGGTGACTATTCAGTATCAATTACAGCAAAAGCTGATAATATGGATACAAGTACAGCATCAAGACTGTTGACTCAAGCAGTAAATGAAGTTGATATGCCTAGAGATTATAGTATTGATGTTGGTGGATCAGCTGAAATGATGAATGAATCAATGAGTAGCCTTGTAATGGCAATGGTTATCGCGTTAATTCTTGTTTATATGGTAATGGTAGCTCAATTTGAGTCATTTAGTAAGCCTTTTATAATAATGTTTAGTATACCTTTTGCTTTTGTTGGAGTAGTGATTGCATTAGTAATTTCACGTATTTCATTAAATGTAGTTGGAATGCTGGGAGCTATATTACTGGTAGGTATAGTTGTTAATAATGGTATAGTTTTAATTGACTATATTGGTCAGCTTAGGGAGGCTAAAGTTCAAGGAACACTTGAAGATATAGTTGCAAAGGGATGTGCAGCAAGACTTAGACCAGTATTGATGACAACAATGACTACTGTTGTTGGTATGATACCAAGTGCATTGGCATTTGGTGAAGGTGGAGACATGATGCAACCTCTTGCCGTTGTAATTATTGGTGGTCTTTCAGTATCAACACTTGTAACACTAGTATTAATACCAACAGTATACTTAATATTTGATAAGATTGAAAATTCATTGAGAAGTAAATTTGGACAAATATTTGATAAAATAAAAATTCCTCATATTGGACCTAAAAAGTCTAAAATGGACATAAACATATTATCTAAAGATATTGAGGATAAAAAAGAATCAAAAAATGATGATGCTCATGAAAAAGATTCAGATTTAAAGAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1068
MSMTKTSVKRPLTIIMVFLVVLMFGGIGYSKMPANLMPDIDVPVALVMTQWSGAGPEDIDDQISEPIEKSLSSISNVKTTVSKSSEGVSMVVAQFEYGTDVDEKLNDIRSKIDTVKMTLPDDVDTPSILKMDMNAQAIAQIVVSGEGSSDDIMKYAEDTVQVKLESIDGITSADINGGDKTQINVIADPTILSSYGVSLDTIKGLLSATNKSYPYGSITQGDDKIVIRSVDKVEALEDIKAIQIPMSNGETVSLDKICTVEYGTVDKQSIYRYNGQESLVMDVQKQQDANTVQVMKNVNSKISELNNENSQFNLKIVNDTSEYINSSINDVMKNLILSAVIAFFVILLFLKSGRASFVVAVSIPTSIIGAIALLYFTGETLNMVTLSSLVIAVGMVVDNATVVIENIFKYRKDPNLSLEEAAIQGTNTVSTAVMASTLTTVAIFLPILFTEGFTKIMFGSLAKTLIFALTLSLIVALTLVPSIFAKLSGGKNGAKMEEKPSPIFDKISEGYKNIIVLALKHKAVVILISVGMFIGAIALGATGAIGMDFMSSGDEGMVSISIKLPEGLDLEPSDYYVSMAEEKVSDIPEIETMITQIGSGSAMGSGGSTASISLDLVSSKERKRTTDEIEQDVVERLKVIPDCEINVSQTSSMSMGGSGDAQVDIKGPDLDVLEEIVNQAKANVEKVSGFRNIETSLADSNKEAQFKIDKRKASLLGINTSSIASTLRTAISGSDATTVTIDDYDYDVNLKFKDSSINSIDDIGQIKVTSASGQQVPLNAFAEIKMADGLKSISRTDGDYSVSITAKADNMDTSTASRLLTQAVNEVDMPRDYSIDVGGSAEMMNESMSSLVMAMVIALILVYMVMVAQFESFSKPFIIMFSIPFAFVGVVIALVISRISLNVVGMLGAILLVGIVVNNGIVLIDYIGQLREAKVQGTLEDIVAKGCAARLRPVLMTTMTTVVGMIPSALAFGEGGDMMQPLAVVIIGGLSVSTLVTLVLIPTVYLIFDKIENSLRSKFGQIFDKIKIPHIGPKKSKMDINILSKDIEDKKESKNDDAHEKDSDLKK*