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NECEvent2014_7_2_scaffold_146_20

Organism: NECEvent2014_7_2_Escherichia_coli_51_98_partial

partial RP 21 / 55 MC: 5 BSCG 20 / 51 MC: 2 ASCG 9 / 38 MC: 1
Location: comp(18816..23444)

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
Putative inner membrane protein n=1 Tax=Escherichia coli DEC5A RepID=H4S7Z6_ECOLX similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 79.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2382
  • Evalue 0.0
  • rbh
adhesin similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 79.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2380
  • Evalue 0.0
Putative adhesin {ECO:0000313|EMBL:ADD58810.1}; TaxID=701177 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia.;" source="Escherichia coli O55: similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 79.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2380
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Escherichia coli → Escherichia → Enterobacteriales → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4629
ATGAACAAAATATTTAAAGTTATCTGGAACCCTGCCACAGGGAATTATACTGTTACCAGCGAAACGGCAAAAAGCCGTGGCAAGAAATCTGGGCGCAGTAAGCTGTTAATTTCTGCGCTGGTTGCGGGTGGGTTGTTGTCATCGTTTGGGGCGCTGGCTGATAATTACGACGGTCAGGGCGTTGATTACGGCGATGGCTCAGCTAGTGACGGCTGGGTTGCTATCGGTAAAGGTGCAAAAGCAAATATTTTTTTAAACAACGCTGGTGCCAGTACCGCTTTAGGTTATGACGCTATAGCTGAAGGCCAATATAGCTCTGCCATCGGCTCAAAAACCCATGCTATTGGTGGTGCATCAATGGCCTTTGGGGTTAGTGCAATCTCTGAAGGTGACAGGAGTATCGCGCTGGGTGCATCGTCGTATTCATTCGGCCAATACTCAATGGCCCTTGGTCGTTATTCCAAAGCGCTGGGTAGATTGTCTATAGCTATGGGGGATAGCTCCAAAGCGGATGGAGCAAACGCCATTGCGCTGGGAAATGCCGCTAAGGCGGCTGGTATTATGAGCATCGGTCTCGGTGATAATGCCAATGCGTCACAAGATTATGCTATGGCGCTGGGAGCAGAAAGCGAAGCCGCTGAAAATGCGACCGCTATCGGCAATAAAGCGCATGCAAAAGGAGTGAATAGCATCGCGTTGGGTAATGGCAGCCAGGCTCTGGCAGATAGTGCAATTGCTATTGGCCAGGGCAACAAGGCTAACGGCGCTGATGCTATCGCTCTGGGTAATGGTAGCCAGTCGAGTGGCTTAAACGCTATTGCCTTAGGTAAGGCCAGTGTTGTAACTGGCGATAATAGTCTTGCGCTTGGGAGCAATACCAATGCCAACGGTATTAACTCTGTCGCGCTGGGCGCAGGTTCTATTGCGGATCAAGACGATAGCGTTTCTGTCGGCAGTGACTCATTACAACGCAAGATCGTTAATGTAAAAAATGGCACGATCAAGGCTGATAGCCACGACGCCATTAATGGCTCACAGCTTTATGCCATCAGCGACTCGGTGGCAAAACGGCTTGGCGGGGGTTCATCGGTAAACGTTGACGACGGTACTGTTAAAGCACCAACCTACAATTTAAAAAATGGTAACAAAAATAACGTTGGCGATGCGCTCACTGTACTCGATCAATTCACCCTGCAATGGGATCAAAACAGAGACAAATACAGCGCCGCTCATGGTAGCTCAACTGCCAGCGTAATCACCGATGTGGCGGATGGCGCAGTTTCAGATTCCAGTAAAGACGCGGTTAACGGTTCACAACTGAAAGCCACCAATGATGATGTTGAGACCAATACCACCAATATCGCTACCAATACCGGAAATATTGCAACTAACACTGCAAATATTGCTACCAACACCACCAATATCACTAATTTGACAGATACTGTTGGCGACCTTAAAGATGATGCCCTGCTCTGGAATGGCACTGCATTCAACGCCGCTCATGGTACGGAAACCACCAGCACCATCACCAACGTGAAAGCTGGTACCCTTTCGGATGACAGTACTGACGCGGTTAATGGCTCGCAACTGAAAGACACTAACGATAACGTGGCGACCAACACCACCAATATCGCCAGCAATACGGCTAACATTGCGACCAACACCGCCAATATTAATACTCTCAATACGTCGATCGATACCCTTGAGCAGGATGCAATACTCTGGAACGGAACAGCGTATAGCGCCGCGCACGGTACAGAAACAGCCAGCACTATTACCAACGTTAAAGCAGGTACTTTATCTGAAAATAGTACGGACGCAGTTAACGGTGCGCAGCTGAACGCGACTAACGCGAATGTGGCGACCAACACCACCAATATTGCTACTAACACCGCCAGCATTAATACTCTGAATACATCCATTGACGCTCTGGAACAGGATGCGCTGCTTTGGGATGGCACTGCATTCAGTGCAGCGCATGGTGCAAACAAAGATGCCAGCAAAATCACCAATGTCCTGGCAGGGACTGTATCATCCGCCAGTACTGATGCCATTAATGGCAGCCAGCTTCATGGGTTGAGCAGTTCGATCGCTACCTATCTTGGTGGTGGTGCTACTGTGAGCGATTCTGGCGTATTTAGCGGCCCTACCTATAACATTGATGGTAATGATTACACCAATGTTGGTGCTGCACTTGACGCCATTAACACCTCACTTAGCGACTCACTCGGCGATGCCCTCCTTTGGGATAGCACGACTGGCGCATTTAGTGCCAAACACGGTTCTACCGCCAGCGTAATCACTAACGTCGCAGACGGTGCAGTCTCTGACTCTAGCTCTGATGCTGTGAATGGCTCACAACTGTACGATGTTAGCAACTCTGTTGTCGATGTTCTGGGTGGTGGTGCTGGCGTGAATACGGATGGCAGCATCAGTGCACCAACGTACACCATTGCTAACACTGATTACGATAATGTCGGCGATGCCCTAAACGCGCTTGATACCACTCTTGACGATGCGATGCTGTGGGATGCTACCGCAGGTGAAAATGGTGCCTTCAGTGCCAGCCACGATGGCAGTGCCAGCAAAATAACTAACGTCGCGGCAGGAACAATTTCTGACACCAGCACCGATGCGGTTAATGGGGCTCAACTCCACGGCGTTAGCAGTTCCGTCGCTGAGGCTCTTGGTGGTGGTGCGGCGGTGAATTCTGACGGCAGCATCAGCGCACCGACTTACACCATTGCTGATACCGACTATACCAACGTCGGCGATGCGATGAATGCAATTGACTCAACCCTGGATAACGCCTTGCTTTGGGACGCTGCCGCAGGTGAAAACGGTGCGTTTAACGCTAGCCATGATGGCAAAGCCAGTGTCATCACCAACGTAGCCAATGGTCAGATTAACGAAACCAGCACCGACGCGGTTAACGGTTCCCAGTTAAATGCCACGAATATGTTGATCCAGAATATTGCCGGTGATACCAGCGAAAGCTATATCACAGAGAACGGTGAAGGTATCAACTATGTGCGTACTAACGACAGCGGTTTAGTCTTTGAGGATGCCAGTGCTACAGGTGTGGGCGCTACAGCTGTAGGTTATAACTCCGTCGCATCAGGCGATAGCAGTGTGGCAATTGGACAGAATAGCAGCAGTACTATTGAATCTGGAATTGCTCTGGGCAGCAGTTCTGTGTCTAACCGTGTCATCCTTCAGGGCTCCCGTGATACCAGCGTAACCGAAGATGGCGTAGTCATTGGTTATAACACCAGTGATGGCGAACTGCTTGGCGCATTGTCGATTGGTGATGACGGTAAATATCGTCAAATCATCAACGTCGCCGATGGTTCCGAAGCCCATGACGCCGTTACGGTTCGCCAGTTGCAGAATGCGATTGGTGCTGTAGCAACGACACCGTCCAAATACTTCCATGCTAATTCAACGGAAGAAGATTCACTGGCTGTCGGTGAAGACTCACTGGCAATGGGTGCGAAAACCATTGTTAATGGTGATGCCGGGATCGGTATTGGCCTGAACACTCTGGTGTTAACTGATGCAATCAACGGTATTGCTATCGGTAGCAACGCGAGTGCAAATCATGCAAACAGTATTGCGATGGGTAGTGGTTCCCAGACCACCCGTGGTGCGCAGACTGACTACACCGCCTACAACATGGACGCGCCGCAGAATTCTGTCGGTGAATTCTCTGTCGGCAGCGAAGACGGTCAACGTCAGATCACCAACGTCGCGGCTGGTTCAGCGGATACCGATGCGGTTAACGTAGGTCAGTTGAAAGTCACTGATGAGCGCGTAGCGCAAAATACCCAGAGCATTACTAACCTGAACAATCAGGTCACTAATCTGGATACTCGCGTTACTAATATCGAAAACGGTATTGGCGACATTGTCACCACCGGTAGCACCAAGTACTTCAAGACCAACACCGATGGCGTAGATGCCAACGCCCAGGGTAAAGATAGCGTTGCTATTGGTTCTGGTTCCATTGCTGCCGCTGACAACAGCGTCGCACTGGGTACCGGTTCCGTTGCAGATGAAGAAAATACAATCTCTGTAGGTTCTTCCACTAACCAACGCCGTATTACTAACGTTGCCGCAGGTAAAAATGCTACCGATGCTGTTAACGTTGCGCAGTTGAAGTCTTCTGAGGCGGGCGGCGTGCGTTACGACACCAAAGCTGATGGTTCTATCGACTATAGCAATATCACCCTCGGTGGCGGCAACGGTGGTACGACTCGTATCAGCAACGTCTCCGCTGGCGTCAACAACAACGACGCGGTGAACTACGCGCAGTTGAAGCAAAGCGTGCAGGAAACGAAGCAATACACCGATCAGCGGATGGTTGAGATGGATAACAAACTGTCTAAAACTGAAAGCAAGTTGAGCGGTGGTATCGCTTCTGCAATGGCAATGACCGGTCTGCCGCAGGCTTACACTCCAGGTGCCAGCATGGCTTCTATTGGTGGCGGTACTTACAACGGTGAATCGGCAGTTGCTTTAGGTGTATCGATGGTGAGCGCCAATGGTCGTTGGGTCTACAAATTACAAGGTAGTACCAATAGCCAGGGTGAATACTCCGCCGCACTCGGTGCCGGTATTCAGTGGTAA
PROTEIN sequence
Length: 1543
MNKIFKVIWNPATGNYTVTSETAKSRGKKSGRSKLLISALVAGGLLSSFGALADNYDGQGVDYGDGSASDGWVAIGKGAKANIFLNNAGASTALGYDAIAEGQYSSAIGSKTHAIGGASMAFGVSAISEGDRSIALGASSYSFGQYSMALGRYSKALGRLSIAMGDSSKADGANAIALGNAAKAAGIMSIGLGDNANASQDYAMALGAESEAAENATAIGNKAHAKGVNSIALGNGSQALADSAIAIGQGNKANGADAIALGNGSQSSGLNAIALGKASVVTGDNSLALGSNTNANGINSVALGAGSIADQDDSVSVGSDSLQRKIVNVKNGTIKADSHDAINGSQLYAISDSVAKRLGGGSSVNVDDGTVKAPTYNLKNGNKNNVGDALTVLDQFTLQWDQNRDKYSAAHGSSTASVITDVADGAVSDSSKDAVNGSQLKATNDDVETNTTNIATNTGNIATNTANIATNTTNITNLTDTVGDLKDDALLWNGTAFNAAHGTETTSTITNVKAGTLSDDSTDAVNGSQLKDTNDNVATNTTNIASNTANIATNTANINTLNTSIDTLEQDAILWNGTAYSAAHGTETASTITNVKAGTLSENSTDAVNGAQLNATNANVATNTTNIATNTASINTLNTSIDALEQDALLWDGTAFSAAHGANKDASKITNVLAGTVSSASTDAINGSQLHGLSSSIATYLGGGATVSDSGVFSGPTYNIDGNDYTNVGAALDAINTSLSDSLGDALLWDSTTGAFSAKHGSTASVITNVADGAVSDSSSDAVNGSQLYDVSNSVVDVLGGGAGVNTDGSISAPTYTIANTDYDNVGDALNALDTTLDDAMLWDATAGENGAFSASHDGSASKITNVAAGTISDTSTDAVNGAQLHGVSSSVAEALGGGAAVNSDGSISAPTYTIADTDYTNVGDAMNAIDSTLDNALLWDAAAGENGAFNASHDGKASVITNVANGQINETSTDAVNGSQLNATNMLIQNIAGDTSESYITENGEGINYVRTNDSGLVFEDASATGVGATAVGYNSVASGDSSVAIGQNSSSTIESGIALGSSSVSNRVILQGSRDTSVTEDGVVIGYNTSDGELLGALSIGDDGKYRQIINVADGSEAHDAVTVRQLQNAIGAVATTPSKYFHANSTEEDSLAVGEDSLAMGAKTIVNGDAGIGIGLNTLVLTDAINGIAIGSNASANHANSIAMGSGSQTTRGAQTDYTAYNMDAPQNSVGEFSVGSEDGQRQITNVAAGSADTDAVNVGQLKVTDERVAQNTQSITNLNNQVTNLDTRVTNIENGIGDIVTTGSTKYFKTNTDGVDANAQGKDSVAIGSGSIAAADNSVALGTGSVADEENTISVGSSTNQRRITNVAAGKNATDAVNVAQLKSSEAGGVRYDTKADGSIDYSNITLGGGNGGTTRISNVSAGVNNNDAVNYAQLKQSVQETKQYTDQRMVEMDNKLSKTESKLSGGIASAMAMTGLPQAYTPGASMASIGGGTYNGESAVALGVSMVSANGRWVYKLQGSTNSQGEYSAALGAGIQW*