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gwf2_scaffold_1292_3

Organism: x-PER_GWF2_33_10

near complete RP 52 / 55 MC: 11 BSCG 48 / 51 MC: 1 ASCG 10 / 38
Location: comp(963..2861)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Parallel beta-helix repeat Tax=RIFOXYA2_FULL_Peregrinibacteria_33_21_curated UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 632.0
  • Bit_score: 1278
  • Evalue 0.0
seg (db=Seg db_id=seg from=300 to=315) iprscan interpro
DB: Seg
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 0
  • Evalue 0.0
Pectin lyase-like (db=superfamily db_id=SSF51126 from=424 to=631 evalue=4.7e-14 interpro_id=IPR011050 interpro_description=Pectin lyase fold/virulence factor) iprscan interpro
DB: superfamily
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 0
  • Evalue 4.00e+00

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYA2_FULL_Peregrinibacteria_33_21_curated → Peregrinibacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1899
ATGTTTAATTTTAAATTTTTGTTTAAATTATCTTTTGGCTTGACTTCGTTTCTATTGATCTTAAGCACCAGTTATGCCACCACTACTACAGAATATGATTGCAGTCAAAATATTTGTTTATATATAAACCAAACTGTTCCTCAATCTTTTGTGGAAGGTACTGATGATCAACGTGATGTTGTTAATGATACTTTTTCAGACGGGAGCCAAGCTCATCCATTTATCACAATACAGTCAGCTTTGGACTATATTAGTGTTTATCCAAACGCGCAAAATTATTTTTTTGTACTATTTGTAACTGGTAATTGCAGTCCAGCTGAAAATTTAAATTTTGATAGATGGCATTGTTCGTTTGCGGTTGATTCTAATACGCCAAAAACAGTTATCGCCGCCTGGCCGGAACAGACAGAAATGCCTCAAATGGAACTGAAAGAAACTTTATCTACCGTAACTTTAAATAATGCTAGCGACCTAACCATTGATGGCTTGGAATTTACTTGGACAGATACAGAAATAGATTCAACTTATGCTAATTTTAATATTTTTGGCACTACTCATAATGTTAAAATTATTAATAATATTTTTGATTTTTACGTCCCTCAATATGGCACAATTTTATTATTTAATAACACTAGCGAAGATTCAGATAATAAAGAGATAGTGATAGAAGGCAATACTTTTACTGGAAGATTCGGCAATGCTATATCATTAATTAATGGCGCAACAGTCGGTGCGATTCGAAATAATAATTTTATTAATCCTTATAGTTATCTTTTTGATCAGGATTTATATGCTTATGGCATTTCAATTACTGAAAATTCTCAAGTTAAAGGTGATATAGCCGGTAATACTTTTACCATGATGGCCAAAGCTATTTATGGCAATTCTGCCAGCCTTAATGGATCTATTGCTAATAACAATATTGATGCCATTATCAGCGGAATTGAGTTTGAGATGCCTGTTAATTATCCAAACGATTTTATCTTAAATCAAATTTTTGGCGATATTTCTGGCAATCAAATAACTATTGCTTCCAATCAATCAGCTCAGAATATAAATGATATGGGATATGGCATGAATATTCAATACACCGATCTTAAAGAAAAAGATATCAAAAATAACAGCATTTATAATCAAGCTAACCGCCCTTACAGTGTTTATCTTAATTATACTAATCCCAAAAATATTACTAACAATAAAATTGAAATTCCGGCTGATAATCATGACATTTGTATAGGGCTTCTCGTGTCTCAATTGTTTACTAAGCCCTCTAGCACTGTAACTATTGCTAATAATGACTCTATTAATTCTTATTATGGCATTTCATTATTCTCCATTAATGCGCCGGTTGAATTTTATAATAATGTACTGACTACAAATAATACCGCGGTGGTTATTAATCAGGTGGGCAAAATTAATTTCAAGAATAATTCCATTTACAATCCAAAAACAGATTATACCGTTACAAAATCAGCAGTATTAATAGAAAATTCACCTAACACTTATATCTATAATTCGATTATTGATAGTGATTTGGCGGCAATTGAAATATATGATTTACCTGATGCAAGTTATGGGGCCACCAAATTGATTTCTGATAATAATCTTTTTTATAATAGAAATAAAAATATACAGTTTATTATCCAGGGCGTATATAATACTTTAGCACAGTGGCAGGGTTTGGGTTATGACAAAACATCTTTCGTGGTAAATCCTTTGTATGTCAATACTGTTAAAGAATCGTTTGATTTACACTTGAGAGCACTTTCTCTTGCCATTGATAAAGGCAATAATAATTTGGCACCTCCCACCAGCACTGATAAAGATGGGAATCCAAGGATTGTAACAGGCAGAAATAAGGGTAATATAGATATTGGGGCTTATGAGTACCAGAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 633
MFNFKFLFKLSFGLTSFLLILSTSYATTTTEYDCSQNICLYINQTVPQSFVEGTDDQRDVVNDTFSDGSQAHPFITIQSALDYISVYPNAQNYFFVLFVTGNCSPAENLNFDRWHCSFAVDSNTPKTVIAAWPEQTEMPQMELKETLSTVTLNNASDLTIDGLEFTWTDTEIDSTYANFNIFGTTHNVKIINNIFDFYVPQYGTILLFNNTSEDSDNKEIVIEGNTFTGRFGNAISLINGATVGAIRNNNFINPYSYLFDQDLYAYGISITENSQVKGDIAGNTFTMMAKAIYGNSASLNGSIANNNIDAIISGIEFEMPVNYPNDFILNQIFGDISGNQITIASNQSAQNINDMGYGMNIQYTDLKEKDIKNNSIYNQANRPYSVYLNYTNPKNITNNKIEIPADNHDICIGLLVSQLFTKPSSTVTIANNDSINSYYGISLFSINAPVEFYNNVLTTNNTAVVINQVGKINFKNNSIYNPKTDYTVTKSAVLIENSPNTYIYNSIIDSDLAAIEIYDLPDASYGATKLISDNNLFYNRNKNIQFIIQGVYNTLAQWQGLGYDKTSFVVNPLYVNTVKESFDLHLRALSLAIDKGNNNLAPPTSTDKDGNPRIVTGRNKGNIDIGAYEYQK*