ggKbase home page

NECEvent2014_4_7_scaffold_444_11

Organism: NECEvent2014_4_7_Clostridium_7_2_43FAA-rel_28_17_lowerCov

near complete RP 48 / 55 MC: 6 BSCG 46 / 51 MC: 5 ASCG 15 / 38 MC: 2
Location: comp(11052..12857)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Histidine kinase {ECO:0000256|SAAS:SAAS00251121}; EC=2.7.13.3 {ECO:0000256|SAAS:SAAS00251121};; TaxID=457396 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" so similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 75.1
  • Coverage: 591.0
  • Bit_score: 904
  • Evalue 9.90e-260
Uncharacterized protein n=1 Tax=Clostridium sp. 7_2_43FAA RepID=V9H1N9_9CLOT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 75.3
  • Coverage: 591.0
  • Bit_score: 905
  • Evalue 3.20e-260
two-component sensor kinase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 46.8
  • Coverage: 613.0
  • Bit_score: 534
  • Evalue 4.20e-149

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. 7_2_43FAA → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1806
TTGAGAGAGAAAATTAAGCGTTATATAACTGGTGTATGGGGATTTGAACTTTTAATTCTTGCTATATCAATAGTATTACTGATTACAGGTTATTATCAAGCTTTTAATAATTCATCAGATAATTTAAATACATTTGATGCTTTATTTAATAAAGATAAATATATGCAATCAATGATATATTATGAAAGTAGAGATATTTCAAAGTATATATATACTAATTCTAAGGATTTAGAAGATATAAGTGCAATAAAATATGAAAATGAAAATTTAACAGGTGATCCTTATTATAATGATAATATTTTTTATGTATTAATTAATAAAGAAACAGGAGAGTTTACAACAAATGATGTAAACTTATTTAATTCTGTAAAGCAAGAGGATAATAACGTTCCGTTGCTTGAAGACACTGTAAATGCATATTTAAAGGAATGGGGTCTAGCTTCTGTTAGATTAGATAATAAAGAAAAGTATAATTACTATATAATGAGTATGCCAGACAAAGCAAATTTAAAGTATATTGATAAATACATTGAAATATATTATAGCAACCCTGATTCATATACTTATATTATAAAGGCAGAAGCCTTAACAGGTAAAATTATGATAGTAGCTACTATTCTTACAATTATTTTATTAATAAAGGTGCTATTTAATCTGATTTTTAATAGGAATAATATTCATTTAGAGATAAAGGTATTAAAAAGATTAATTTTTGTATTAAAGTATGGATATAGATATAGAACTACAAGAAATAAGATATTATTATCCTTTGGAATAGCTATTGGCGTAATCCTAGTTTATTTATACTTAGTTGCTGGTATAAGGAATCAAAATTTACTTGTAACATTTTTAACTAAGTACCCATTTAAGGGAACATTAATATTAGTGTTGATTCCCTTAGTATGTGTTCTATATTCATTAAAAAAGAGCTTAGATATTACCATTATTAATGATGGCTTAAAAAAGATTAATTCTGGAGACTTAGAATACACCCTTGGTAATGTGGGGGAAAGAGAAGTTAGAGAATTAGTTGAAAACATAGATAAAATAAAAGAGGGTTATAAAATAGCCTTAAATGAACAAGTTAAAAATGAAAAACTAAAAACAGAATTAATATCAAATGTCTCTCATGATTTAAAAACACCATTAACATCAATAATTAACTATGTAAATATATTAAATGAGTCCAATATAACAGAAGAGGAAAGAAAAGATTATTTAAAGATATTAGATAGAAGCTCAAGAAGATTAAAGAGTCTAATTGAAGATTTATTTGAAGCTTCAAAATTAAATAGTGGAAAGATGAAAATAGAAAAACAACCTATAGATATAGTTTCATTAGTATATCAAGGAATTGGGGAATATTCGAATCTTTATGAAGAAAAAAATATAGAGTTTAAAGTTAATTCAAATGAAGAAGAGATTATATTAGACTTAGATGGTAAGTTAATGTCTAGAGTATTTGAGAATTTAATAGTTAATGCTTTAAAGTATTCTTTAAGCGACACTAGAGTGTATATAGATATTATTTCTAAAGAGAATTCTGTTGATATTTCATTTAAAAATATTTCTAATTACGAATTAGATTTTAATACTGAAGATATTTTTGAAAGATTTACAAGAGCAGATAAGTCTAGAAATTCTTCTGTAGAGGGGTCAGGCATGGGCCTTGCAATAACAAAGAGTATAGTAGAACTTCATAATGGAATTATAAAGATTGAAGTAGAAGGAGATATGTTTAAAATATATTTAACTATACCTAAGTCATCCTATGATATAATGGAAGAAATTAAGATTAGTAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 602
LREKIKRYITGVWGFELLILAISIVLLITGYYQAFNNSSDNLNTFDALFNKDKYMQSMIYYESRDISKYIYTNSKDLEDISAIKYENENLTGDPYYNDNIFYVLINKETGEFTTNDVNLFNSVKQEDNNVPLLEDTVNAYLKEWGLASVRLDNKEKYNYYIMSMPDKANLKYIDKYIEIYYSNPDSYTYIIKAEALTGKIMIVATILTIILLIKVLFNLIFNRNNIHLEIKVLKRLIFVLKYGYRYRTTRNKILLSFGIAIGVILVYLYLVAGIRNQNLLVTFLTKYPFKGTLILVLIPLVCVLYSLKKSLDITIINDGLKKINSGDLEYTLGNVGEREVRELVENIDKIKEGYKIALNEQVKNEKLKTELISNVSHDLKTPLTSIINYVNILNESNITEEERKDYLKILDRSSRRLKSLIEDLFEASKLNSGKMKIEKQPIDIVSLVYQGIGEYSNLYEEKNIEFKVNSNEEEIILDLDGKLMSRVFENLIVNALKYSLSDTRVYIDIISKENSVDISFKNISNYELDFNTEDIFERFTRADKSRNSSVEGSGMGLAITKSIVELHNGIIKIEVEGDMFKIYLTIPKSSYDIMEEIKISN*