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SCN18_25_8_15_R2_B_scaffold_1651_5

Organism: SCN18_25_8_15_R2_B_SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10_40_9

near complete RP 52 / 55 MC: 1 BSCG 50 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38
Location: comp(2472..8078)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
RHS repeat-associated core domain protein n=1 Tax=Haliscomenobacter hydrossis (strain ATCC 27775 / DSM 1100 / LMG 10767 / O) RepID=F4KRN7_HALH1 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 34.4
  • Coverage: 1216.0
  • Bit_score: 702
  • Evalue 9.70e-199
RHS repeat-associated core domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 34.4
  • Coverage: 1216.0
  • Bit_score: 702
  • Evalue 2.70e-199
RHS repeat-associated core domain protein {ECO:0000313|EMBL:AEE49026.1}; TaxID=760192 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Saprospiraceae; Haliscomenobacter.;" source="Haliscomenobacter hydrossis (strain ATCC 27775 / DSM 1100 / LMG 10767; / O).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 34.4
  • Coverage: 1216.0
  • Bit_score: 702
  • Evalue 1.40e-198

Lists

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Notes

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Taxonomy

SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10 → SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10 → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5607
ATGAAAAAACACGGTTGTATTTTTCTTGTGCTGCTCCTGGTGTTTGCAGATAGTAAATCTCAGAATATAAATACAACGAATAAAAGCGGTCCATTAGGTACAAGTATTAATACGCTAACAGGTAATTTCTTTTTAAAGCGTACGGATATGTATAATCCCGGTCGGTTAATAGATATGGATATCACATTTAATTATAATAGTTTCAGAACGAACCTGAAGCGATCTTATGGATCAGGATGGAGCTTTGAATATGACATATATTATAAAACAGATACAATACCCGGAAGAAAAATAATTGTATGGGGTAGTGGCAGGAATGACAAATATGATTCTGTAAGCACTACTGCATTCCACACGCCAAAGGGATTTTACAGTGCACTTACAGCGCCTGAAGCGGGTAAGCTGCTTTTAACCGACACAGACGGATGGAAATATTATTTTGATAACCCCACGCACCGAAGGGTTACTAAAATTGAAGAGCCAAATGGTAATGCGCTTACTTTTAATTATGTTGATACCCTGCTGCAATCAATGATAAACACCACGGGGCAAACCATAAGCTTTCAGTATAATGCCCAGGGGTTATTAACAAAGGTGACGGATGAAACAGCTTCACCCACTATTGCTTATACCTATAGTTATAATGCCGCCGGAAACCTTATAACGGTAACAGACCCGCTGGGTGGCACATACCGGTATACGTACCTGGTAAACGGCCCTATGAAAACAATGTCAGATAAAAACAACAATACCGTAAACATAGTCTATTACCCCAATTTCAGCACAAGGGAAATTATTGGTTGTAACAAAAGGATCAGCGCCACTTACGACCAGTTAAACAGAAAGACGATTATTACTGATTATATGGATGAGGGCGAAACTAACCAGGTTACAACTTATGTGTATGAAAAAAGCGGTGACCTGTACTGGTTAAAGTCAATTAAGGGAAATTGCTGTGGTTTTGATAAACAATATGAATACGATGAGAATGGCAATGTATTGCGGGAAACAGATGCTAATGGAAACGCGTGGAACTATACTTATGATGATTATGGCAATAAATTAACGGAAACAAATCCTTCGGGTAAATCAGCGGTATATACTTATACCGCCAATCATAAATATATTGCGGGCTACAGGGATTTTAACGGTAACACTACCAGTTACGAATATGACAACAAAGGGAATGTAATAAAAATCATTGAACCCGATAATAATGTATACACAGCTACATATAATACAAATGGTGAGATAATTTCAACAACCGATGCGAAAGGCAATACATTTACCTGTACTTACAATACTTTTGGTCAACCGGTAGAGATAAATGGCCCGGAAGATTATCATAAAGAAATGCAATTTGACAGCAGGGGAAATCCTGTTACGCTTACTGATGCAAATGGAAATTCCACATTTCTGGAATTTGACGTCTTAAACAGGTTGAAAAAAAGTACCGATGCCCAGGGTAAATTAAACAGGTTTGAATATGACGCCGCCGGAAATTTAGTAAAATTTACAAATGCAAGAAGCCAGCTTTATGAGATGAAGTATGATGCAGCTAACCGCATGGTTAAAATTATCAATCCTGTTTCTAATGCCATAGGTATTTTTTATGACCCTATGGATAATGTTAAGACTATAACCGACCCTCTTAATAATGTTATTGCTCGTGACTATGATAGTAAAAACCGGCTTAGTTCTAATACAGATCCTCTTGGAAATAAAGGTAACATTAGCTATGATGCCAATGGTAATATGGTGGCTATTTCTTTATCAAACGGCAGAATGGTACATGCCACGTATGATGTGAACAACAAAGTAACTAAAATTCAGGACGACGAAAGTGTACTTTATGGATATACATACGATGATAATGGAAACATTACCAGCATTACAGATGCAACAGGATCTGCAATTAATCTTAAGTACGATAAGCTGAACAGGGTTACCAGGGTAACCAATGCATTAGGTAATAGCAGGCAATATACTTATGATAAGAATAATAATATTATTCTTGTAACAGACGAGAATAATCAAAGCTATCATTTAACATACGATGGGTTAGACCGGATTGTCAGTTATACAGACCCCATTGGCGCTACTATTCATTTAGGCTACGATAAGCAGGGCAATGTTACTTCTATTACCGACCAGAAAGGAAATATTACCCAATATGGTTATGATGCACTGAACAGAAGAACAAGCATGAAATTTGCCGATGGAACCAGTAATTTTTATACGTATGATGATGCCGGTAACCTGACTGTTTTACAACATACCGATGGCACTCAAACCACGTTTACCTATAACCAGCTTAACCAGGTAATACAAAAAGTTGTACCGGGCGGAGAGGTTTTTAATTATACTTATGATGCGCTGGGCAGGATATTAACCGCTACGAACAATAGCGGAATGGTTACTTTAACATATGATGCACTAGGAAGAGTATTAAGCGAATCTTTCAATAACAAAACCGTGGCTTATGCCTATAACGATGCAGGCAGAACAAAAACCATTATCTACCCTGATAACACATCGGTGATAAGGGAATATGATACAAGGAACAGGCTCGTAAAAATTTTGAAAGACAGCGTACTGGTGGCATTATACGATTATAACAATACAAATCAGTTGATCAGCCAAACAATGGGCAATGGATTAACTTCTACTTACCAGTATGATTTTGCAAACCGCCTTAGCAAGATCACTACCGGTGCAAATATCCAGGAAACAACATTTGGATATGATAAATTAGGCAATAAATTATCTGTAAACCGTATAAATTATCCCGCATGGTCTGAACAAATGACCTACGATGCCAATGCAAGGCTTACCAACTTTAACCGGGGCAGTTCTTTACAAAATAATTATACCTACGATAACCTGGGCAACAGGGTAAGCGCCAATATCAATGGCGTAAATAATACTTATATTATAAATAATTTAAACCAGCTTACTTCCGTAAATGGCACGCCGTTGCAATATGATGAACGGGGCAACCTGGTTTTTGATGGCGTATATCATAAATTTTATAATGGAGCGGGGCAGTTAATAAAAGATTCTTCGGGCATAAACAATGTACACACTTATACATACGATGCTTTTGGAAGAAGGGTTACAAAAACCATAGCAGGGGTTTCTTATAAATATACTTATAGCGGTTTAACAGCAGTAGAGGAAAGAGATGCGGCAGACCAAATACTGAACCAAACCGTATTTGCGGATTTCCTGAATCCTGTGCTTAATAAAAAGAACAACGCAAGTTTTTATTATCATAGAAATGAGTTGGGCTCAACAGAAGCGGTGACCGATGCGGGTGGGCAGCTTGCAGAGCGGTACTTATACGATGCTTACGGAAAGCCATCCATTTTTAACAGCAGTAATCAGCCTGTTGCCGGCTCTGTTACAGGTAACCGGTTTGGATTGACGGGGCAGGAATACGATAGCGCCACAGCAAGCTATCGCTTTTTTTACCGTACATATTCTCCGGATTTAGGAATTTTTAACCAAAGGGATTTAATAGAATATGAGGATGGCATGGGTATGTACCAGTATGTAGGAAATAATCCCGCGAATGGTCTTGACATACTTGGTCTGAAGGATTGTTATAAAGAGAAAAATAATACTGACAAGAAAGTTGTTGAATATTTTGTTCTTACAGGAAGTGTGGCTGTGGGTACGCCGAAATTCATTCTTGTGAAGGTATTAAAAACGATTTCAGAAGAAGTTGGGGATAAAGCCGGGCTTGTTGCTTTGCCTTTCAATGTGATAGACAATGTAACCAGGTCTGTGGACTTCGTAAGTGAATTTTCGGACAGGTCAACCATGACGAATATAGAAAAGGGCGGAGAAGTGGGGCTTAGTTTAATAGGAACAGGTGCTACCGTTGGAGCTGCTGTAGTAGGAAGCGGTGCTGCAGTGGTAGGAGGTGTAACAGTTGGCACTATAGCAGTTGGCGCTTTAGTGGTTAAAGGTGTTGATGCCGGAACAGAATATGCTTTGAACAAATATTATGACCATAAAGCAAAGAATATTGAAGAAGACGCCTATGAATATGCGAAAGAACGAGGTATGGGTGAAAAATGGTTAGAGGCAAGAAGGAGGATGATTGAACGGCAAAGACGATATCGTGAAAAAAATCCTTGCGATGATGGAGACCAGGAATTTCCTGATCCTTATGATCCGAAAAACGCTTCTATGTCTCTCCTCTGGTCTCTTGACCCCAACGAAATCATCGGACCCAAAGGAATAGAAGAACCTAAATGGGTAAGCGTTAACGACCGGATGCCTTATACCATCTATTGCGAAAATCACGAAACAGCTACTGCACCTGCAAGGTTTATTCGCATTACTACCCCGGTTCAGCCTAAGCAGGATCCCAATACCCTGGAGCTTGGCAGCTTTGGCTTTAACAACCAGGAATTTGAAATTCCGGCAGGCAACAGCGCTTACTATACCCGTTTGGATTGCAGGGATTCTCTTGGTATATATGTAGATGTGATTGCAGGATATGATGTAGCCAAAAATGAAATTTTCTGGGAGTTTAAAGCTATTGACCCGGTTACGCTGCTTTCGTCAGAAGATCCTGCCAAAGGCGTATTATTATTAAGAGATAGTGTTGAAACAAAATACGGGCATGGCTTTGTGAACTTCAGCATGAAACCTGTATCTACAGCCAATACACTTGATCTTATAGATGCCGATGCTGAAATTGTTTTTGATGAGAATGAAATGATACCAACCAATATTCACACCAATACAATTGATGCCATAGCGCCAACAAGCACTTTCGCAAGCTCAACTGTAACCAACCACAATGTAACATTCACCTGGAGCGGCACAGATGATACTGGTGGTGTTGGTGTGGATTATTACACATTGTATGTTTCGATGGATGGCATTAATTATTCCATATTTGCTCCGGAGATAAGAAGAACTGATACAACATTTACCCTGGCAGAAGGAGGGCAGTACTGCTTTTTTGTGCTGGCAACCGATAG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PROTEIN sequence
Length: 1869
MKKHGCIFLVLLLVFADSKSQNINTTNKSGPLGTSINTLTGNFFLKRTDMYNPGRLIDMDITFNYNSFRTNLKRSYGSGWSFEYDIYYKTDTIPGRKIIVWGSGRNDKYDSVSTTAFHTPKGFYSALTAPEAGKLLLTDTDGWKYYFDNPTHRRVTKIEEPNGNALTFNYVDTLLQSMINTTGQTISFQYNAQGLLTKVTDETASPTIAYTYSYNAAGNLITVTDPLGGTYRYTYLVNGPMKTMSDKNNNTVNIVYYPNFSTREIIGCNKRISATYDQLNRKTIITDYMDEGETNQVTTYVYEKSGDLYWLKSIKGNCCGFDKQYEYDENGNVLRETDANGNAWNYTYDDYGNKLTETNPSGKSAVYTYTANHKYIAGYRDFNGNTTSYEYDNKGNVIKIIEPDNNVYTATYNTNGEIISTTDAKGNTFTCTYNTFGQPVEINGPEDYHKEMQFDSRGNPVTLTDANGNSTFLEFDVLNRLKKSTDAQGKLNRFEYDAAGNLVKFTNARSQLYEMKYDAANRMVKIINPVSNAIGIFYDPMDNVKTITDPLNNVIARDYDSKNRLSSNTDPLGNKGNISYDANGNMVAISLSNGRMVHATYDVNNKVTKIQDDESVLYGYTYDDNGNITSITDATGSAINLKYDKLNRVTRVTNALGNSRQYTYDKNNNIILVTDENNQSYHLTYDGLDRIVSYTDPIGATIHLGYDKQGNVTSITDQKGNITQYGYDALNRRTSMKFADGTSNFYTYDDAGNLTVLQHTDGTQTTFTYNQLNQVIQKVVPGGEVFNYTYDALGRILTATNNSGMVTLTYDALGRVLSESFNNKTVAYAYNDAGRTKTIIYPDNTSVIREYDTRNRLVKILKDSVLVALYDYNNTNQLISQTMGNGLTSTYQYDFANRLSKITTGANIQETTFGYDKLGNKLSVNRINYPAWSEQMTYDANARLTNFNRGSSLQNNYTYDNLGNRVSANINGVNNTYIINNLNQLTSVNGTPLQYDERGNLVFDGVYHKFYNGAGQLIKDSSGINNVHTYTYDAFGRRVTKTIAGVSYKYTYSGLTAVEERDAADQILNQTVFADFLNPVLNKKNNASFYYHRNELGSTEAVTDAGGQLAERYLYDAYGKPSIFNSSNQPVAGSVTGNRFGLTGQEYDSATASYRFFYRTYSPDLGIFNQRDLIEYEDGMGMYQYVGNNPANGLDILGLKDCYKEKNNTDKKVVEYFVLTGSVAVGTPKFILVKVLKTISEEVGDKAGLVALPFNVIDNVTRSVDFVSEFSDRSTMTNIEKGGEVGLSLIGTGATVGAAVVGSGAAVVGGVTVGTIAVGALVVKGVDAGTEYALNKYYDHKAKNIEEDAYEYAKERGMGEKWLEARRRMIERQRRYREKNPCDDGDQEFPDPYDPKNASMSLLWSLDPNEIIGPKGIEEPKWVSVNDRMPYTIYCENHETATAPARFIRITTPVQPKQDPNTLELGSFGFNNQEFEIPAGNSAYYTRLDCRDSLGIYVDVIAGYDVAKNEIFWEFKAIDPVTLLSSEDPAKGVLLLRDSVETKYGHGFVNFSMKPVSTANTLDLIDADAEIVFDENEMIPTNIHTNTIDAIAPTSTFASSTVTNHNVTFTWSGTDDTGGVGVDYYTLYVSMDGINYSIFAPEIRRTDTTFTLAEGGQYCFFVLATDRVGNAEQMRQNVVQCVNIQSTALPVTWLHFNAINQKTDNILTWATAAEANAKEFIIERSFDGVHFESIGKVSAKGNSISETTYNYTDKHIDKLNSNTFFYRLKEVDVDGQYTYSNTILIRYSSPGVTARSVVYPNPARNMVNVLLGDKALVGTEAFLFDMSGKMLKKIRIEANLEQVDLSAYTHGVYLLKLSNGEILRIIKQ*