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SCNpilot_expt_500_p_scaffold_339_curated_33

Organism: scnpilot_dereplicated_Caedibacter_2

near complete RP 52 / 55 BSCG 51 / 51 ASCG 12 / 38
Location: comp(32459..38491)

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
Outer membrane autotransporter barrel domain protein n=1 Tax=Burkholderia cepacia GG4 RepID=J7JF19_BURCE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 27.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 397
  • Evalue 7.20e-107
Membrane protein {ECO:0000313|EMBL:KHK49205.1}; TaxID=1217052 species="Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Ralstonia.;" source="Ralstonia sp. A12.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 25.7
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 452
  • Evalue 2.60e-123
outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 27.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 397
  • Evalue 2.30e-107

Lists

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Taxonomy

Ralstonia sp. A12 → Ralstonia → Burkholderiales → Betaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 6033
ATGAAGAATCAAATTAAGACGTTATTTAATGAGCCGTTAAAAAAATTCATCATATTTGCAACGCTTGTATTTAAGGCGACCCTTGTGCAAGCCGACCCCATTTTGGTCGCTACTTATGGCAACATTGGTTTTAACTCAAATCAATTTATAAGACCTTTCGGAGTTGTTTCTGATTCTCAATTAGGAAGAGTCTATGTTTCAGATAGAGATGGTGGAAAAGTATTACCTTTTAATAATACAGGACAATCCATAAACCTCCCTAACTCAATAACAAGCCTGAATTCTCCATGTGGAATGGCGATTGGTCCAAATTCAAACTATCTTTGGGTTGCCCATAGAGGCCTAAATCAAGTCCTCATTTATGATCAAGACCACAATCCAGTAACTCCTATTTCTACTGGAGCCGGAACACGACCAATAGGTATTGCTATTAATAATCAAATCAATCCACCGCGCGCATATGTTCTTCAGGAACAAACAGGTACAGTAAACCTGTATGGCGCCTCAACTTTAGCTCCAGTTCCTAATAATCCTATAATTGGTGGCCTTGCACAACCTCAAGGAATCGCCGTACATCAATCTAGTGGAAGTGTTCTTATTGCAGACACCGGCAATAATCAAATTAAAATATATAATGCCACTGGAACAACTCAGGAGTATAATTATAATGCTATTGGTACTTACGTATTAAATCAACCTTCAGCTATCGCTGTGGTAAATTCCCTACAGACTCCTATGTGGGTAACTGATGCGGAAAATGGTGGCCGCTTACTTGCAAAGATTCCTGACTCTCCTGCCAAACAATATAATGTTCCAACCCCAACAGGCGTCTCTATTAACCCAGCCACGGGACAAGTCTATGTTGTTGGCGGCGTAGAGAATTCACTCGGTCCAATTCGAATCTATTTTGATCAGTTTGCTTGGGTTGAATCCGGAAAATCAATTTTACAAACCTTAAGTCTGTCTGGTCTCAATCAAAGCCTTGTTCTCGATTCCGCGTATCCGCAACTTCCAAATCCGATCAATCGCCAGTTACGGGTTTCTAAGTACGATGATCCTTCTACAAATAATGATATTACTGCTGAACTTGTAGGATTTGATTCTAACAATGCAGGACTCTTAAGCATTGCTAACGGTGCAACATTATCATTAGGCAATACTGCTGGAATATCAGGCAACGCTCTTGAGGCCGACAAGCTCGAACTTAAGACTGGCGGAACACTTGAACTGTCGGGAAGCAAGTTTAAAATTGATAGCTGGACCTTTAATGGCGGAACTTTAAAGGTTTATTCAAACGCAACAATCCCAGCAAGTGTTTCTCCAAATCCTAATGTCGTTAAACTTTCGCCACAGGGAGGTATAATTGATGTTGAGAATGGTCAGACTCTAACTGTTCAACGCTCTTTTATAAGTGAGTCTAACAACGATCCCTACACGCTTACTAAAATAGGAGGTGGGGATCTTAAGCTAAATATCTCATCCACTTCAATTGATAAGACCGTTGATGTCCAAGCAGGTTCTTTTACGATTAATAATACATCGCTTACTTTTCAAAGTGGTGCTAGCCTTAAAGTGCACCCAGGAGCTAGATTTGTAACTCTACCTAGCAGCGTTAATGGAGTCTCTAATCTTGTTATATCTTCTGGGGCCGTTGCTGAAAACTCTGGTTTTATAGACAACCAAGGATTCTGGGTTCTTTATGGCACTCTTACTAACAGTGGTACCTTTACTAATTATGATACTGGTTCTATCCCTACTGGAACAGGTAATTTTAAATTTAAGGGGGGCACATTTGATACGTATAGCAATGCAACAGTCAATTGGAATATTTCTCTTGATAATGATAATGGAACAATAATTACACGCGGTAGTAAAATATTTACAATCACACAACCAGTAACAGGAAACGGAAACTTAACGATTTCAGGTCCTGGTACAACCGTATTAAATGGAAGTAACTCTTATATTGGCTCGACATCCCTCACGAGCCAAGCAACAGTTAAATTTAATGCAAATTCTCCTTTTGGTTCAGGGAATGTATCTATACAAGACGGTTCAACTCTTCAATGGGGATCAGCTGTCACTCTGCCTAATAATTTTACATTTTTTGCAACTATACCTACTCTAGATACAAGCACTTACAATGGAGGAATATCAGGAAAACTTTCTGGAGGGATTGGTTTTATTAAAAAAGGATCAGGTTCACTTACGCTTTCAGAAAATAATGATTATGACGATAACACAACAATTGAAGAAGGTACTGTGGTTGCCGCTCATAATAATGCGTTAGGCACAGGTTCTGTAACCATGAAAAATGGCACTGTATTTCAATCTGGCCTGAATGGTTTAATCCTTGCAAATAATTTCATTCTTGATTCAGGCTCTCTTGCTACTTTTGGATCCGTAACAATTAATACTGCGAATAATTCTACCACTTTGTCTGGTACCATCTCACAAAATAATGGTCCCATGAAATTAATTGCACAAGGAGGAAGCACCTTAACTCTGGGGGGCCAAGCTTCTTATTCCGGCGGAACTGATGTCCAAGGCGGCACGACCCTTACAGCAGGAATTGCAAACTTATTTACAAGCGCAAATCATAATTTGTCTCTTCTAGATGCTAACTCTATTTTTGATATGTCAGCAGGCAATCAAACATTGGGCAATATTAACGGCGTTACAAGCACATCTATTCAATTAGGCAATAAGACCCTTACCTTTGGAACGGCAAACGACTCCAGTTTCTCTGGTGTCATCTCCGGCGTTGATGGCAAAATCGTAAAACAAGGCAGTGGAACTTGGTATCCCTTAGGAGAGAACCTTTATACAGGGGGATCAACAATTAAGGAGGGAACTGTCGTTGTTACAAATAACCAGGCTTTAGGTAGAAACGTTGTAACTGGCACAAGCCCTGCTGTGATAATGGAAGATGGAACAACTCTAGAATTAGGATTTGTTAATCTTACTAATCCAATAACGCTTAATACAGGACCGAACAACCAAGGCGTAACCTTTAATTTAGGCTCTTTACCGAATGCTCCTGCAGCAATTTCATCTGTTATTGATGGTGACAATAAGCTTTTGATTAAGGGAAGCAGAAGTCTTAATTTAACTGAGCCTCATCTCTTTAAAGGAGGTCTTGAGCTTTATGACACCTCAAGAATATCATTAATAGGGAATGGCAATCTTGCTAACGGAAGCGATGTTAGTTTAAAGTCTTTTGGAACAATATTTGATATTTCTCTCGCTTCACCAGCAGTTAAATTGGGCGCTCTTAATGGTGTACAAGGAAGCAAAGTTTGGGTTGTTAATAAAACTCTTACTCTTACTAAAAACTCGAATTTTATGGGTGATTTCCTTAACTCTGGGAATGGTTTTGTCATCGTTGATGATAACGCAACTTTAACTCTTGGCGGTACTATTCCAAGAAACCTTCAAATCAATAAAGAAGCTACAGCAGAACTCACCTCAAGTGCATCAATACCTCTTGGAACGAACATTATTCTGGCAGAGAAAGACGCTACTTTTAATGCTGAATATTATGCTCGTCCTGTTATTGATCTTGGTTCATTAAATGGTGTGGCAGACACAACTTTTAAATGGGGTAATCAAGAGCTATCATTCTATAGTCCTTCTGCCTCTACATTTGATGGCGTTCTTGAAGGCGGAGCTAGTTCTTCAATTATGATAAATTCTAATCTTACTTTAGGTGGTCAGAATCTTAATACTCCTTCTTGGTTTATTAACAACACGATACTAAAGATGAAAGCAGGAAGTACTCTTCCTTCAATTAGCTCTCTCACTATAAACGGCAATAATGCTGTTTTTGATATGAGTGAGCAAGATCAAACAGTTACTACTCTTCAAACCAGCTTTCCTTCTCCAAACAGCCGTGTTGAGTTAGGCAATAAGACACTTACTATAAAAATGCCAGACCCAAATCAACCCTCAGCATTCTCAGGAAGAGTTAATGGTAATGGAGGTAAAGTTGTTAAAAAGGGACCTGCTTTCTTTACTTTCAGAGGGGCTAATACTTTTAGTGGTGGCTTATTTGTTGAAGAAGGTGGCGTCAGGATTTCTTCACCTTCCGGCATGGGAACAGGACCTATTACAATTTATGATCAAGCAACTCTCAGCATTGGGACACCTTTAACGTTGAGTGGCAATAATTCAATCAACTTACAAAGTGGGATTGCAACTGTGCAAGCTGACTTTCCAACAATTATCAAGACAAAGATTGTGGGCAATGGCGGTTTTAATAAAACAGGAACAGCTCCTCTCACGTTAACACAAATGAATGATTACGCAGGCGAGACATTTGTTAACCAAGGAACTCTCGTAGTTAATGGATCCATAGGCAATGTCACTGCTGGCTCAGGTACGGTTTTGACGGGTGTTGGTTCTGTCGGCACAGTTGTGAACAATGGCACAGTAACACCCAGTGACCCTGTGAATGTTTTCACCCTTAAAGGAGACTTTCTCCCCTCATCAGCAGGTATCACCAAAATAGCCATCAACCCAAATACCTCTAATAAACTTCAAGTCGATGGAATCGCTCATTTGAACAACAGCATCCTCTCAGTTGATGTCGTCCCTGGTGATACTTATGCTTATGAGAATCATGAACCTTTCCTCGTCTTAGAGTCCGACAACCCTGTCAATGGTCAGTTCGGTGCCATCGAAAGCTCTCATGTCAGATTCGCTTGGACAGCTGATTATCAGAAAGATCCAAAAAAGGTCTTCCTCGATGTTGACTATGTTCCTTTCAAAGATATCGTTAATCCTATCACCGATAATCCTAATATCCGTGAAGTCGTCCAGTACCTTGATACCTTACCTCAACCGGTCGCTGATCCTGACTTAAGGAACATCCTCTCTATGCTTAATGCCACACCGGATGCCCAAGGCATTACCAACTTCTTCTCCGAGATCTCGCCAGATGAGCTCTTATTAACCGAAGAAACAGCAAGCCTTATCAATGAGATCAATGGTTTTAGAAT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PROTEIN sequence
Length: 2011
MKNQIKTLFNEPLKKFIIFATLVFKATLVQADPILVATYGNIGFNSNQFIRPFGVVSDSQLGRVYVSDRDGGKVLPFNNTGQSINLPNSITSLNSPCGMAIGPNSNYLWVAHRGLNQVLIYDQDHNPVTPISTGAGTRPIGIAINNQINPPRAYVLQEQTGTVNLYGASTLAPVPNNPIIGGLAQPQGIAVHQSSGSVLIADTGNNQIKIYNATGTTQEYNYNAIGTYVLNQPSAIAVVNSLQTPMWVTDAENGGRLLAKIPDSPAKQYNVPTPTGVSINPATGQVYVVGGVENSLGPIRIYFDQFAWVESGKSILQTLSLSGLNQSLVLDSAYPQLPNPINRQLRVSKYDDPSTNNDITAELVGFDSNNAGLLSIANGATLSLGNTAGISGNALEADKLELKTGGTLELSGSKFKIDSWTFNGGTLKVYSNATIPASVSPNPNVVKLSPQGGIIDVENGQTLTVQRSFISESNNDPYTLTKIGGGDLKLNISSTSIDKTVDVQAGSFTINNTSLTFQSGASLKVHPGARFVTLPSSVNGVSNLVISSGAVAENSGFIDNQGFWVLYGTLTNSGTFTNYDTGSIPTGTGNFKFKGGTFDTYSNATVNWNISLDNDNGTIITRGSKIFTITQPVTGNGNLTISGPGTTVLNGSNSYIGSTSLTSQATVKFNANSPFGSGNVSIQDGSTLQWGSAVTLPNNFTFFATIPTLDTSTYNGGISGKLSGGIGFIKKGSGSLTLSENNDYDDNTTIEEGTVVAAHNNALGTGSVTMKNGTVFQSGLNGLILANNFILDSGSLATFGSVTINTANNSTTLSGTISQNNGPMKLIAQGGSTLTLGGQASYSGGTDVQGGTTLTAGIANLFTSANHNLSLLDANSIFDMSAGNQTLGNINGVTSTSIQLGNKTLTFGTANDSSFSGVISGVDGKIVKQGSGTWYPLGENLYTGGSTIKEGTVVVTNNQALGRNVVTGTSPAVIMEDGTTLELGFVNLTNPITLNTGPNNQGVTFNLGSLPNAPAAISSVIDGDNKLLIKGSRSLNLTEPHLFKGGLELYDTSRISLIGNGNLANGSDVSLKSFGTIFDISLASPAVKLGALNGVQGSKVWVVNKTLTLTKNSNFMGDFLNSGNGFVIVDDNATLTLGGTIPRNLQINKEATAELTSSASIPLGTNIILAEKDATFNAEYYARPVIDLGSLNGVADTTFKWGNQELSFYSPSASTFDGVLEGGASSSIMINSNLTLGGQNLNTPSWFINNTILKMKAGSTLPSISSLTINGNNAVFDMSEQDQTVTTLQTSFPSPNSRVELGNKTLTIKMPDPNQPSAFSGRVNGNGGKVVKKGPAFFTFRGANTFSGGLFVEEGGVRISSPSGMGTGPITIYDQATLSIGTPLTLSGNNSINLQSGIATVQADFPTIIKTKIVGNGGFNKTGTAPLTLTQMNDYAGETFVNQGTLVVNGSIGNVTAGSGTVLTGVGSVGTVVNNGTVTPSDPVNVFTLKGDFLPSSAGITKIAINPNTSNKLQVDGIAHLNNSILSVDVVPGDTYAYENHEPFLVLESDNPVNGQFGAIESSHVRFAWTADYQKDPKKVFLDVDYVPFKDIVNPITDNPNIREVVQYLDTLPQPVADPDLRNILSMLNATPDAQGITNFFSEISPDELLLTEETASLINEINGFRMHYLRDMMTSPTASASFTTTRTQKATTLINQLKQAFGQIRADDPRIHSPAMAMNIGQQMQDSAIMTGPKGGVWIQGFGNTSRQKATRIDMGYRNKMAGSLIGVDYKLRPDLFVGLSFGYDQSRIKWTDALSKGKIKDYVTSLYSTWFHNQFYINASLTGSYNRYNIRRRMTFGTIDRTARSRHDGYVFAPSLEVGHGFTLFNGIDVVPFVRGDYIHIHEKSYTEKEAGALNLHIRSKTNTALRTEPGLNFYRHFKQEEGIITAKVKLSYVNKHPLKKGKITANLVGQPGTFLASGTNKTQHQVSPGLSLDYKSNSNFFVSAAVDSQIGSKYRAMEFSLKIGTKF*