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SCNpilot_expt_500_p_scaffold_350_curated_21

Organism: scnpilot_dereplicated_Chlamydia_1

near complete RP 50 / 55 BSCG 47 / 51 MC: 1 ASCG 12 / 38 MC: 2
Location: 22290..25460

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Parachlamydia acanthamoebae str. Hall's coccus RepID=D1RBN0_9CHLA similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 52.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1091
  • Evalue 0.0
Nickel and cobalt resistance protein CnrA {ECO:0000313|EMBL:CDZ80719.1}; TaxID=1444712 species="Bacteria; Chlamydiae; Chlamydiales; Chlamydiaceae; Chlamydia/Chlamydophila group; Chlamydia.;" source="Chlamydia sp. 'Rubis'.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 97.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2002
  • Evalue 0.0
nccA; nickel-cobalt-cadmium resistance protein NccA; K15726 cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 52.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1091
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Chlamydia sp. 'Rubis' → Chlamydia → Chlamydiales → Chlamydiia → Chlamydiae → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3171
ATGATAGAAAAAGTCATTCGTTGGTCTGTTTATAATCGCTTTGTTGTAATCTTTTTTTCCCTTATTAGTGTGTTTGTGGGCCTATATTTTCTCATTCACCTTCCAATTGACGCTGTGCCAGATATTACAAATAATCAGGTACAGATTAATTCTTACATTTCAGGGCTTTCCCCGACAGAAATAGAAACACAAATTACAGTTCCAATTGAAAATGCCTTAAAAGGAATGATTGGCTTAGAAAATACACGCTCAATTTCAAAAAATGAGTTTTCTCAAATTACTGCTATATTTACTGATAATACTGATATTTATTTTGCGAGACAACAGATCCAAGAAAGGCTCAACGAAATTAAACATTATTTGCCTCATGACGCGGAATTTTTTTTAGGTCCTATTGCAACAGGACTTGGAGAAATTGCGATGTGGATGGTGGATTTAAAAAAGACTGAAAATAATTCAATCTTATCGAATGCAGAAAACCATCGATTTGACCCTCCTTTTTTAAACGGTGACTTAGAAAAACTAACCTACTTAAGAACGGTACAAGACTGGATTATTAAACCTCAGTTAAAAAACCTTCCCAACGTCGCCGATATTGATACAATTGGTGGTTATGAAAAGCAAATTCACATCACCCCAAGCCTTGATAAACTCATTAGTCATAATATTTCTTTTCAGGACATTTTAGATTCTATTGCAAATAATCATGTCAATATCGGAGCTGGATTTATAGAAACTAAAGGAGAAAATTTAATTGTTCTTTCAAACCAAAAAGCCCAAGGAATAGATGAGATTGGTGACATTTTAATACGTAATCAAACCTTTGCTCTACCTTTAAAAGAATTGGCTACAGTATCGCTTGGTAAAGAAAGAAGAACAGGCACTGCTACCAAAGATGGGCATGAAGTAGTCATAGGAACTGCTATGATGAGAATTGGAGCTAATAGCCGTGAAGTTTCTAACAGTGTAGAAAAAAAATTAGCTGAGATAAAAGAAACTCTTCCTCAAGATGTAGAAGTACAATTGATCCTCAATCGCGCTAACTTAGTCAACGCTACTTTAGAAACTGTTTTTTACAATTTACTAGAGGGAGCTCTTCTTGTTGTAATTGTGCTTTTTGCCATGCTTGGAAGTTTCAAAATTGCCTGTATCGTTGCCTGCGTCATTCCCCTTTCATTTTTATTAACAGGGATTGGCATGCATTACTTTCACATAAGCGGCAATTTAATGAGTTTGGGTGCTATCGATTTTGGTTTAATTGTGGATGGATCAATCATTATTGCTGAAAATTTTTCCAGAAGAATTGCATTAAGGGCTAAAAAGGAAATAAGTCAACTTGTCAATCATGATCGATTTGAAGAATTAATCGCATCAGCTAATGAAATGATTAAACCAACTCTTTATGGACAAGCGATATTAATCATTGTTTACTTGCCCCTTCTTACCTTAAAAGGAATTGAGGGTAAAATGTTTATCCCAATGGCGGCTACTGCATCTTTTGCCCTCATTGGGGCTTTAGTCTTATCGGTCACTTTTGTACCTGCCATGCTAAGCTTAATCGCTGTAACTGGTAAAGAAAAAACAAGCTCCCTACTTCTTAAAATTCAAAACATTTACAGCAACGTCCTTCAAAAAATCTTTCCTCATTCTATTTTTATTATAACTTTAGCAAGCTTAATTATTGTATTCGCCACTTCGTTATTCTTTCATTTAGGTCAAGAATTTATACCACAGCTTGATGAACAAGATATTGCATTACATGCTATTCGCATACCTGGAACCTCTCTTACCCAATCTACAAAAATGCAAACAAAAGTTGAGACTGCCTTGTTACAAATACCTGAAGTTTCCCATGTATTTTCAAAAACTGGAACGGCTGAAATGGCTACAGATCCAATGCCTCCTAATGTTTCCGATACTTTTGTTATGTTAAAACCAAAGGCTAAATGGCCAAATCCTCTAAAACTTAAAGGCAACTTGATTAAAGAAATGGAGCATCTCTTAAATGAGGTTCCTGGCAATAATTATGAATTTACACAACCAATTGAAATGAGATTTAACGAATTGATTTCAGGTGTTAAAAGCGATGTTGCTATTAAAATCTTTGGACATGATTTTGACACTCTGGACAATTTAGCGCATAAAATCGCCTCTTTAATGAGAAAAATCCCAGGAGCTGCTGATGTAAAAACCTCACAAATTGAAGGTTTACCTTTAATTAAAGCTGAATTATTAAAAGATAAAGTTAAGCAATACTCCTTAGACCCTTTACCTATTTTACAAGTTTTAAAAATAGCGATTGGTGGGCAAACTGCTGGACAGCTTATAGAAAATGATCAACCCATCGATGTTATCGTAAATTTGCCTGAAAATTTAAGAGATAACCCTTCCCAATGGTCTTCTATACCAATCATTCAAAAAGGGCATGTTATTCCATTAAGTGAGTTAATCCAAAATCAAAAAAAAATTGGGGTAAACGAGATCAATCGAGAAAATGGAAAACGATTTGCTATTGTCGAAAGCAATGTTCGGGGAAATGACCTAGGAAGTTATATTGATACATCGCAAAAAGCAATCAAGTCTCATGTAAATCTGCCAACTGGTTATTGGATCGAATGGGGTGGGGAATATGAAAATTTAGTAAAAGCTAGAAAACACATGCTAATCGTAATCCCACTATGTTTGATCTTAATTTTTATCCTCCTTTATAGCGCTTTTTTATCATTAAAAAAAGTTTTTATAATTTTAACTGGCATTCCGTTTGCCTTGTTAGGTGGCATTATAGCTTTGTGGCTGCGAGACATCCCCTTTTCGATATCTGCAGCGGTTGGTTTTATTGCCTTATCTGGTATAGCTGTATTAAATGGTTTGGTGATGGTTAATTGTATCCAGCAATATTTAGCTAAAGAAGCTAATTTAGCGCGCGCTGTTATATATGGCTCAGTGGAACGATTAAGACCTGTATTAATGACTGCTTTAGTTGCCTCCCTTGGCTTTACACCAATGGCCTTTGCAAACGGTGTTGGCTCTGAAATACAAATTCCTTTGGCAACAGTTGTCATTGGAGGCATTATCAGTTCCACTTTACTAACTCTTGTGATTGTCCCACTTTTATGCAAAGAAATTTTACAAGAAAAAAAGACCCCTTCTACAATACCCTCTTTTTTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1057
MIEKVIRWSVYNRFVVIFFSLISVFVGLYFLIHLPIDAVPDITNNQVQINSYISGLSPTEIETQITVPIENALKGMIGLENTRSISKNEFSQITAIFTDNTDIYFARQQIQERLNEIKHYLPHDAEFFLGPIATGLGEIAMWMVDLKKTENNSILSNAENHRFDPPFLNGDLEKLTYLRTVQDWIIKPQLKNLPNVADIDTIGGYEKQIHITPSLDKLISHNISFQDILDSIANNHVNIGAGFIETKGENLIVLSNQKAQGIDEIGDILIRNQTFALPLKELATVSLGKERRTGTATKDGHEVVIGTAMMRIGANSREVSNSVEKKLAEIKETLPQDVEVQLILNRANLVNATLETVFYNLLEGALLVVIVLFAMLGSFKIACIVACVIPLSFLLTGIGMHYFHISGNLMSLGAIDFGLIVDGSIIIAENFSRRIALRAKKEISQLVNHDRFEELIASANEMIKPTLYGQAILIIVYLPLLTLKGIEGKMFIPMAATASFALIGALVLSVTFVPAMLSLIAVTGKEKTSSLLLKIQNIYSNVLQKIFPHSIFIITLASLIIVFATSLFFHLGQEFIPQLDEQDIALHAIRIPGTSLTQSTKMQTKVETALLQIPEVSHVFSKTGTAEMATDPMPPNVSDTFVMLKPKAKWPNPLKLKGNLIKEMEHLLNEVPGNNYEFTQPIEMRFNELISGVKSDVAIKIFGHDFDTLDNLAHKIASLMRKIPGAADVKTSQIEGLPLIKAELLKDKVKQYSLDPLPILQVLKIAIGGQTAGQLIENDQPIDVIVNLPENLRDNPSQWSSIPIIQKGHVIPLSELIQNQKKIGVNEINRENGKRFAIVESNVRGNDLGSYIDTSQKAIKSHVNLPTGYWIEWGGEYENLVKARKHMLIVIPLCLILIFILLYSAFLSLKKVFIILTGIPFALLGGIIALWLRDIPFSISAAVGFIALSGIAVLNGLVMVNCIQQYLAKEANLARAVIYGSVERLRPVLMTALVASLGFTPMAFANGVGSEIQIPLATVVIGGIISSTLLTLVIVPLLCKEILQEKKTPSTIPSFF*