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scnpilot_solids1_trim150_scaffold_254_13

Organism: solids_Mitochondria_Protozoa_2

partial RP 12 / 55 BSCG 8 / 51 ASCG 0 / 38
Location: 17615..19519

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Cytochrome c oxidase subunit 1 {ECO:0000256|RuleBase:RU000369}; EC=1.9.3.1 {ECO:0000256|RuleBase:RU000369};; TaxID=5763 species="Eukaryota; Heterolobosea; Schizopyrenida; Vahlkampfiidae; Naegleria.;" source="Naegleria fowleri (Brain eating amoeba).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 68.6
  • Coverage: 633.0
  • Bit_score: 915
  • Evalue 3.50e-263
Cox1_2; Cox1_2; K02256 cytochrome c oxidase subunit 1 [EC:1.9.3.1] similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 65.0
  • Coverage: 492.0
  • Bit_score: 708
  • Evalue 2.50e-201
Cytochrome c oxidase subunit 1 n=1 Tax=Naegleria fowleri RepID=M4H5I2_NAEFO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 68.6
  • Coverage: 633.0
  • Bit_score: 915
  • Evalue 2.50e-263
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Naegleria fowleri → Naegleria → Schizopyrenida → Heterolobosea → Eukaryota

Sequences

DNA sequence
Length: 1905
ATGTCTTATTATGATAGAGTATGGAAACGTTGGGTATGGACAACCAACCATAAAAGAATTGGTATTTTATACATCTTTTTTGGTATTTTTAATGGTTTCTTAGCAGTATTATTTTCTATGATTATCAGATTAGAATTAGCATTCCCTGGTGATCAAATTTTATTTGGTGAATATCAATTTTATAATTTAATCACAACAATGCATGGTGTATTAATGCTATTTATTGTTGTTATGCCTATATTATTTGGTGGTTTTGGTAACTACTTTGTGCCATTATTAATTGGTGCTCCAGATATGGCATTCCCAAGATTAAATAATTTTAGTTTTTGGATTTTACCACCTGCTACTTTATTAGCATTCGTTTCTACTTTTGTTGATGGTGGTCCAGGTACTGGTTGGACATTATATCCACCTTTATCTTCTACACAAACACACTCAAATTCTTCTGTAGATTTTTTAATTTTAAGTTTTCACTTAGTTGGTGTTTCTTCCATAGTATCCAGTATTAATTTTATTTGTACTGTGTTATATTTTAAAAGTGAATCTATGTATTTAAAAGATTTACCATTATTTGTTTGGTCTGTGTTTATTACTTCTTTCCTATTAATTTTAGCTATTCCAGTATTAGCTGCTGCTATTACATTATTATTTTTCGATAGAAATTTCAACACTAGTTTCTTCGATCCAGCTGGTGGTGGTGATTTAGTATTATACCAACACTTATTTTGGTTCTTCGGTCATCCAGAAGTATATATTTTAGTAATACCTGGTTTTGGTGTAGTTAGTCATGTTATTTCTACTTTCTCTCAAAAAAGAGTTTTTGGTCATACTTCTATGATTGCTGCTATATTAATCATCGGTATTGTTGGTTTTATTGTTTGGGCTCACCACATGTATACATCTGGTATAGATACTAACACTAAAGCTTATTTTACTTCTGCTACTATGGTAATCGCTATTCCAACTGGTATTAAAATCTTTAACTGGTTAGCTACTATGTGGGGTGGTTCTATTTGGTTTTATACTCCAATGTATTTTGCTGTAGGTTTTGTAGCTTTATTTACAATGGGTGGTTTAACAGGTATTATCTTAGCTAACGCTGGTATTGATGTTTCATTACACGATACTTATTATGTTGTTGCTCACTTCCATTATGTTTTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATTTTCTGTGGTTTCTATTATTGGTTTGGTAAAATGTCAGGTTTCCAATATTCCGAATATTTAGGCCAATGCCACTTTTGGTTAACTTTCATTGGTGCTAATTTAACATTCTTCCCAATGCATTTCTTAGGTGTAGCTGGTATGCCTAGAAGAATTCCAGATTATCCAGATATGTATCAAAAATGGAATACTTTTGCTAGTTTTGGTAGCTTAATTTCATTCTTTAGTTTATTATTTTTCTTTTATGTAATATATGATGCTCTTGTACGTAAAATCCCTTGTGGTAGAAATCCATGGATTTTCTCTACTCATGATGATATGTCATACAGAACATCTAGATTATCATATTATGTAACTAATAACTATATTGCTAAAGATTATAGAACTAACCAACAATTTACTAAAGTAGATCATAAATATTATGAACAATGGTTATTATATAATTATGTATATAATTTAAAATATGTTGTATTATTAAAAAATATTAAAACTTTTAGTTTAGAATGGACATTACCTTCTCCAGTTCCTGCTCATACTTTTGCAGTAGCTCCTAAAATAATTACAGTTTCTAGTAATTATAAAAATTATAGAAAAAATTATTATTTTAGAGATTTAAGTAATCCAAAAAACAAAAGATTTATTTTACCTGCTGGTTCTGGTATGAGCAAAGATTTAGATGTTATGATCGAAATCTTCTTCAGTCCTACACGTAAAAATATATAA
PROTEIN sequence
Length: 635
MSYYDRVWKRWVWTTNHKRIGILYIFFGIFNGFLAVLFSMIIRLELAFPGDQILFGEYQFYNLITTMHGVLMLFIVVMPILFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNFSFWILPPATLLAFVSTFVDGGPGTGWTLYPPLSSTQTHSNSSVDFLILSFHLVGVSSIVSSINFICTVLYFKSESMYLKDLPLFVWSVFITSFLLILAIPVLAAAITLLFFDRNFNTSFFDPAGGGDLVLYQHLFWFFGHPEVYILVIPGFGVVSHVISTFSQKRVFGHTSMIAAILIIGIVGFIVWAHHMYTSGIDTNTKAYFTSATMVIAIPTGIKIFNWLATMWGGSIWFYTPMYFAVGFVALFTMGGLTGIILANAGIDVSLHDTYYVVAHFHYVLSMGAVFGIFCGFYYWFGKMSGFQYSEYLGQCHFWLTFIGANLTFFPMHFLGVAGMPRRIPDYPDMYQKWNTFASFGSLISFFSLLFFFYVIYDALVRKIPCGRNPWIFSTHDDMSYRTSRLSYYVTNNYIAKDYRTNQQFTKVDHKYYEQWLLYNYVYNLKYVVLLKNIKTFSLEWTLPSPVPAHTFAVAPKIITVSSNYKNYRKNYYFRDLSNPKNKRFILPAGSGMSKDLDVMIEIFFSPTRKNI*