ggKbase home page

scnpilot_solids1_trim150_scaffold_254_16

Organism: solids_Mitochondria_Protozoa_2

partial RP 12 / 55 BSCG 8 / 51 ASCG 0 / 38
Location: 21293..23191

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Ribosomal protein S3 n=1 Tax=Naegleria gruberi RepID=Q9G8Q4_NAEGR similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 29.8
  • Coverage: 470.0
  • Bit_score: 168
  • Evalue 2.90e-38
Ribosomal protein S3 {ECO:0000313|EMBL:AAG17800.1}; TaxID=5762 species="Eukaryota; Heterolobosea; Schizopyrenida; Vahlkampfiidae; Naegleria.;" source="Naegleria gruberi (Amoeba).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 29.8
  • Coverage: 470.0
  • Bit_score: 168
  • Evalue 4.10e-38

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Naegleria gruberi → Naegleria → Schizopyrenida → Heterolobosea → Eukaryota

Sequences

DNA sequence
Length: 1899
ATGAGTCGCATAAGCAATTTAAATACATTAAAAATTGGAATTTTTGGAAATTGGTACTCTTCTTGGTATGATAAAGAATATTATAACTTCTTGTTATTTAAGGATTATAAATTAATCCAATATTTAAATTCGATATTTTATCGTTTAAGATTACCAACTTCACATTTTTATATAAATAGAATAAATCAAAAATATTATTATATTGAGTCTAATATATATATAACTCAAAGCACTTTTAGACGTTTAACTAAGTCAATTCGTACATATAAAGAAATCTTTAGATATATCTCTTTAATAGAATATTTATTTGATGTTGTTTTTTTATTACCTAAAGATTCAGTATCCACTAAAGGTTTAAAGTTAATAAATAGAAACATAAACGATTATAATTATCACTTATACTTTTATCTATTAAATACAGCTAGATTAAATATTAATGCTAGTACATTTTTCAATAGATTTGACTGTATGTATTTTATAAATAATTTAATAACTAGTATTTTTTTAAATAAAAGAAATACTTCTAAGAAAAAAAATAATATTAAGTTAAGTGTCTTTTCTAATTTTTTAAAAGTAAATAGTACTAGCAGAGTAAAATTTATTGATAACCAATCAGAACTAAGTAAAAAAAAATTTAGTAAAAATAGTTTAAGCTATTTTTATCTAAACTCTTTTTATTTAAATACTAGTAACGTTAATTCATATTATTATATATTCAACGTTAATTATTTAAGTATATTACGATTGTTAATGAAATTTCTAAATATATTTATAAATAATTTTATTTTTACATTTTTTAATATTTATATAGTATTATCATTAAGTAAAAACAGTTTTAAATTAAATCAATTAGTATACAATACTGAATCTTTTTTAATAAAAGGTATTAGTTATTTACGTAAAGTTAATATTTTATTTAATTATAGATTATTTGTTAAATCTAATGTTAAACTAAATTATTTGAATAATTTAGATAACAGCAGTTATAGTAGTATATTAGATTCTAAAAAAACTAGAAAAGCTTATGTTTCAAATATTGATTTAGTAAAAATCAATTACAATTCAAATAAATTTAACAAATATTTAAATTTATTATTAAATAATAATAATAATTTATTTGGATTATTATATATTCAAGACTTTGATTCATTTTCTAAAAAAAACCTAAGCAATAGTATTACAATCGAAAATGATCAAGTTGAAGCTATATACTACAAACAGATAAATCATTTCAATAATTTTTTCAAACGTATTTTTGTATATATTTATAAAAAGTTTTTTAATTCATTTCATTCTTCAATAGAATTAACAATCTCTTCGTTTAGTGGATTGCAGTGCTTCTTTTTACCTACTTATTACATAAAAACTTTTCCAGTGTTTGATACTAAATTATTATTAGATTATATATCTTATAACTTAAAAAGAAGACATCATATAACTAAAATATTTAATAAGATAGCATCTATTCAGCGAAAACAAAATTCAGATTCTTCCAAAACATTAATTGGATTATTTAATGAATTTGGTAATATAAATAATAGATTATTAAATCACGATAAATATTTATCATTTTTTAATTTAAATGCGATTTATGAATCATTAAATATTGAAAATATATATAATGATCAGGTGAAAAAAAAGAAAAATCCAATATCCGGTATAAGAATTGAATTTAGTGGTCCACCTAAAAAAGCGGAAAGAACAGCTGTAGTTGCTTATCATGATATTGTACAGGATTATCGATTAACAGGTAAAATGCCAACACACAGCGTTTATGCAGATATACATTATTATCAATCTCATATCAGATTGAGACGATCAACCTTTGGTATTAAAGTATGGTTATTTTATTATACACGTATATTAAATTGTAATAACGTAAATAAAACTATACTATAG
PROTEIN sequence
Length: 633
MSRISNLNTLKIGIFGNWYSSWYDKEYYNFLLFKDYKLIQYLNSIFYRLRLPTSHFYINRINQKYYYIESNIYITQSTFRRLTKSIRTYKEIFRYISLIEYLFDVVFLLPKDSVSTKGLKLINRNINDYNYHLYFYLLNTARLNINASTFFNRFDCMYFINNLITSIFLNKRNTSKKKNNIKLSVFSNFLKVNSTSRVKFIDNQSELSKKKFSKNSLSYFYLNSFYLNTSNVNSYYYIFNVNYLSILRLLMKFLNIFINNFIFTFFNIYIVLSLSKNSFKLNQLVYNTESFLIKGISYLRKVNILFNYRLFVKSNVKLNYLNNLDNSSYSSILDSKKTRKAYVSNIDLVKINYNSNKFNKYLNLLLNNNNNLFGLLYIQDFDSFSKKNLSNSITIENDQVEAIYYKQINHFNNFFKRIFVYIYKKFFNSFHSSIELTISSFSGLQCFFLPTYYIKTFPVFDTKLLLDYISYNLKRRHHITKIFNKIASIQRKQNSDSSKTLIGLFNEFGNINNRLLNHDKYLSFFNLNAIYESLNIENIYNDQVKKKKNPISGIRIEFSGPPKKAERTAVVAYHDIVQDYRLTGKMPTHSVYADIHYYQSHIRLRRSTFGIKVWLFYYTRILNCNNVNKTIL*