ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

RIFOXYC2_FULL_Bacteroidetes_40_12_rifoxyc2_full_scaffold_104_2

Organism: Bacteroidetes bacterium RIFOXYC2_FULL_40_12

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 ASCG 14 / 38
Location: comp(694..6585)

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
large extracellular alpha-helical protein Tax=GWE2_Bacteroidetes_40_63_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 3962
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug id=2159587 bin=GWE2_Bacteroidetes_40_63 species=Mariniradius saccharolyticus genus=Mariniradius taxon_order=Cytophagales taxon_class=Cytophagia phylum=Bacteroidetes tax=GWE2_Bacteroidetes_40_63 organism_group=Bacteroidetes organism_desc=Good similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 3962
  • Evalue 0.0
outer membrane protein with CnaB and TonB plug receptor domains similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1055
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

GWE2_Bacteroidetes_40_63_curated → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5892
ATGAAACTTTCACTTACCACTATTTTTATTTGTCTTTCAATCATACTTTTTAGCCAGGACTTAACAAAATCAAGAGCTTCAAGTTATTATACTTATATTTTTAAAATATCGAATAAAGAGGCAAAAAAAATTTATAATAATGCATTATGGAAATTTGAAAGATCTTATTTTCACACTTTAATCGATTCTTTTCCAACAGATAGCATTTATAAAAAAACCTTACCTCAAGGTCATTATTTAAAACTTGCTTCAAAAAATCATAATTTAATCATCGATATTGCCACAATCCAATACTTCGATGTACTCATAAAAAATAATAGTCGAGATTTAAATATTCAGGTAGTTGATACACTTGGTAATGCTATTCCTAATGCTGAAGTTAAAGTTAATAACATAGCACTTCGATTCGATAAAAAAAGTCAATGTTACAGAAATACAAAATCAAATAAAAAAGGACTATTAAGTGTTTCTTATAAAGGGATGGTGGTATATAATGATTTAGCAAGAAGCAACAATAATTCTTTACCACGCCGCGCTTTAAGTCAAATAGTTTATGGAAAACCTGTCCGGTATTTATGGTTACCGGTATACTATATCATTAATCTTCCAATTGATGGAGTGAAGTCTATAATTAATCACTATCCACAGAATACTATTTACCGAACGCGAAATTATTTTGTAAACTGTTTTAACCGAATTGCTTGTCGATTCGATGATTACTATTGCGATGAAGTTTCACCACCGATAAAAACAAATTGGGGATATATGATTTTTAATAAACCAAAATACTTACCCAATGACACGGTAAAATTTAAAGCCTATGTTTTAAATCGGAGAGGCTATCCAATAAATAAACCTGTTGAAGTAATCCTTTTTAATTACAACAAAAAAAATAGTCGGATGAAATTAGGTTCTATTTATCCTGATTCACCCGGTAACTATGTTTTTGAATTTAAATTATCCGACTCTTTAAATTTATCGCTCGACAGAAGTTATTCTATATACTTGGAGGACAAAAACTACAACACTATGTTTGAGGGTGGATTTAAATATGAAGATTACGAGCTTTCAGGGACTAAACTAAGTACCCGCCTGGAGTTTGAAAATCATTATATTCAGGATTCCAATATACTTTATATTTCAGCAACCAACGAAAACAATTTACCTTTATTAGGGGCAAAAGCCAAATTAGTTATTACAACCACTAACATTCAAAGGGTTTTTGCAAATTCTTTATACATAAAAGACACCTTGTTGGAGAAAACTATTGATTTAGAACCAAGTGGAGAAACTAAATTTCAAATCCCTGATTCAGTTTTTCCGAATGCCAATTTCTATTATCAAATCAAAACGGAGTTACAAACTGCTGAAAATGATAACAAAACCGAATATAGGAACGCTAAATATTTTTTTTATGAAATCAGAATAGAAGGCAATCTGAAGGACGACTACATTAGTTTTATTTATCTCAAAAATGGAATAAATCTACAATCAAATGGGTATTTAACAGGAATTGATAGGTTTGGAAATATTATTGAATCAAAAGCAGTCCATATACCATACATTGAGAAAGTTAATCCATATTATGCCAAATATACGGTACGGGTGGGTTCCGATTTCCTTGAATTTGACTTAAAAAAACATATGGCAAATCTGGAATGCTTTTCAGAAAGAAACAAAGACTCGGTTAGAATTATAATTAAAAATCCACGGACTATTCCTTTTAATTACAATATTTACAGGGGAAATTCTGAAATTAAAAGAGGATTAACAACAAGTTTGTCTTATTGTGAAAAAAGTAAAAACAAAAAAACCTATCATCTCTCGCTACAGTATTTATGGGGTGGAGTAATAACTGAAAATAATTATGATATCCCAATTCCTAGTGAAGAATTTAAAATTTCGGTGGAACAACCTTCCATTATTTTTCTAGGGAAAAAGACTCCGATTAAAATTAAAGTTGTTAAATCAAATGGAAAACCAGCCGTTAATGTGAACTTAACAGCTTTCTCTCTTACTGATAAATTCTCATATTCTCTACCAGAAATCGAAACAATAAAACCAAAAATTAAAGGACGGAAACTCATTAATAATTTCAAACTTAATGAAAATCATGCAACCCAATATCTTTGGAAAATGAATTATGATTTTTGGCAGGAAATTTCACATTTCGACTCCATTCCATACTATCAGTTCATTTTCCCAAGAAAAAATGTGTTTACAACGCAATTAGAAAATCCGGAACACTCTACCCAGTTTGCTCCTTTTTATTTCGAAAATGGCGAACCTTATCAAATACATATCATTTATGTTGATAATAGACCGGTTTATTTCAGTTGGGCAAGTCAAAACCGACCCTATTCATTCAAAATCAGCAGCGGAAAACACACTATCCAACTGAGAACCTATAATAAACTTATAACCCTAAAAGATTTTAAATTTGAAATGGGAAAGAAAACTATTCTTAGCTTAAGTGATTCTTGTTCAGATGCCCGTGTAGTGATAAAACCAATGCTTAAAAGACTAGAATATAATGAGAAAGTCCTAGCAACAAAATATACTGCTTCTTACAGGGACTATTTTTCAAATCCCAATGCTTATTTAAACCAAATGGGAGAAGTATTTCCTTTATATCAATCAAAGGGCATGTTAGGTCCAATCTTCGGGAATTATGTAACATTTCATTTACTTGACCAATATGAACTTCGGTTTGAACATGAACCCAATTTTGAATATGATTTTAATAAGGATATTTTAAAAATGCGCTGTACCCAAATGGAAAAAAGAATTCCGGAATACTTAAACCCTACCGGAAAAGTATCATTAACGGATAATCTTTTAACCGAAGAAAAAATAATTACTCAATGGAACCAATTCAAAAAAATACACAAATTTGATAATGTAAAGTATTACGTACCTAATGTTACCCAAAAAGGAAACGGAGTACTCCTGATAAATGATTCTATTCGGTTTTTGTTAGACCAAAATCATCGCAATAACTTACATACCATTATTCAAAGCAAAAATGGCAATGGATTTTATCGGGTTTATCAGGATATTCCAAAACAAATAAACGATTTAAAACCAGGTAATTATCAACTAATTTTATTGCATCTGGATGGTGCGTATTATAAGACCGATTCATTGAGTATACTAGGAAACGGAAAAAATTTTTATCAATTCAACCAATTAGTTTGTGGAAACGAAATTAAGGATAGTAAGTATTTTGAATCACTTATTTGGGATCTTTCCTATTCAAAAACATCAAATGAAAACTCTTCAATTATATCGCGTTCTGGTAACAGTGAGTTTTATGATATTTATACAGGGTCAGGTATGGAAATATCGGGTATTGTTTCATTGAAATCCGAAAATGAACCTTTACCCGGGGTTTCAATAAATATTAAAGGAACAGCTATTGGAACCATTACCGATCAGAATGGTTTTTATAAAATAAAAGTACCTTATGGGGCAACGTTGGTCTTTTCATTTATAGGTTGTGTTCCATTTGAAACCAAAGTCGATTATAACGATGTTATTGATGTTAAATTAGAAGAGGATTTATTAGAGCTTGATGAAGTTATTGTAATTGGTTATGGAATTCAAAGAAAATCTGAAATGACAGGTTCAAGAACTGTGGTTTCAAATAATATAGCAAACCTTCTGCAAGGAACAGTTGCCGGTGCTCAAATTACTGGAAATTCAGGAGCAACAAATTTTATTACCATTCGGGGAATTTCATCGCTTCCATCAAGTGATAAACCTTTGGTTGTAATTGACGGAATTCCCTTCTGGGGTGATTTATCAACTTTGAATCCAAATGATTTTCAGGAATTTAAAATTTTGAAAGATGCAAGTGCAACAGCAATTTACGGAGCTAAAGCAACCAATGGAGTTATTTTAATTCAAACCAAAGCTGGTTCTGTAAAAAACCAGAGCCTCGCCGAGGCGCTTCAGGTTTTTGAACTTCCTAATAATATAAATAGTATTCGTAAAAACTTTTCAGATTACGGGTATTGGCAACCAAAATTGTATACTGATAAAAAGGGCGAAGCTTCGTTTTCGGTCACTTTTCCTGATGATGTGACTCGTTGGAACACATTCGTTATAGCAATGGATGGGAATGATAGATTGGGAATCAATCAGGGTAGTATTCAATCTTTTAAACCTTTATTGGCTGAAATTAAAACTCCACGATTTTTAGTTGAAAGAGATTCAGCCATTGCTATTGGGAAAATATCAAATTATACAGTTGATAGCATTGATTTAAAAACTGAATTTAAAGTGAACGACAGCTTACTTGAGAAATCAATTGTCAAGGTTGGAAAAGCTATTGTTGATTCTATTTTAATTGTTGGTACAGGAAATGATTCTATTTGCATTTCATATTCTCTCGAAACGGGTGAATTAAATTATATTGATGGGGAAAAACGCTACCTGCCAATGGTTAAAAGTGGGGTTGAATTAGCCATAGGAGAATTTTATCAACTGAATAATGATACTACATTTACACTTGAAAACAATAACCGTGAAGCTACTATCCATCTTACAGCAACCAGCGACCAATTAGATTTATTGAAATCGGATATTGCAAGCTTAATTGATTACAAACATGAATGTAACGAGCAGCTTGCTTCAAAATTGAAAGCATTACTGGCTGAAGAAATTATATGCAAATTTATTGGAGATGATTTTAAAAAAACTCACCTGATAAAAAAATTAATCCGGTTACTTACCAAAAATCAAAATGATTATGGGGGTTGGGGTTGGTGGGGAAAATCGGAAACAAGTCTCTGGGTAACCAAACATGTTTTAGAGGCATTAAATAAAGCAACTGAAAATAATTATTCTGTTACCTTCAATAAAGATCTATTAGCAAAAGAATTAACTTGGGAATTGAGCAAATCGAGAGATAATAAGACTAACCTGGATATTTTATTACTTTTAAAAAATCTTAATGTTGTTTATGATTACCAATCATTTTTAGATAGTGTATATTTCAATCCTGATAAAAATTTCAATGCATATGTAAAAATGCAACTACTTAAACAGTTTCAGCGTATTCCAATTTCTCTTGATTCCATTTTACAGTATAAACAGGTTACAATGCTTGGTAATTATTACTTTTCAAGCCCAAATTTTTCTATGTATGATTTTGTAAATGGGAACTCGCAAACCTCACTGTTAATCTACAAATTGCTCAAAAATGACAGCAGTAATCATTCTGAATTATTAAATAAAATGAGAAATTATTTTTTTGAGAATAAAAGAGTATATACTTACAATACTTATGAGTCAGCTAATTTAATTGAAACCATTTTGCCTGACCTGTTAACTAAAGGTGATAAAATTGCAGAAGCATCATTGTTGATTGATGGTGATTTTAAGAAACAGATAAATACTTTTCCCTTCGATACAACTTTAACAAGACTCAATAAAATTCAAGTGACTAAAACAGGTTCATTTCCTGTATACTTTACATCATATAGTAGATATTGGGATATAAATCCAAAATGCAAAGAATCGGATTTCAAAATTGAAAGTCATTTTTCCAATAATAAACTTACTTTGGAAGCAGGAAAAAAAGAATATTTTGTTGTAGAACTTGATGTAAAAAAAGATGCAAAATATCTTATGATTGAAATCCCAATTCCCGCAGGCTGTTCATATAATTCAAAAAACATAAATTTTCGAAATGAATCGCATCGTGAATATTTCAAAGATAAAGTATTAATATATTGTGGATCACTAAAGGCTGGTCACTATAGTTTTTCAATAGACTTGTTACCTCGTTTTTCAGGAAAATATACTTTAAATCCTGCAAAAGTAGAACTCATGTATTTTCCAACTTTTAATGCCAACAACGAACTAAAAAGAGTAATTATAAATTAG
PROTEIN sequence
Length: 1964
MKLSLTTIFICLSIILFSQDLTKSRASSYYTYIFKISNKEAKKIYNNALWKFERSYFHTLIDSFPTDSIYKKTLPQGHYLKLASKNHNLIIDIATIQYFDVLIKNNSRDLNIQVVDTLGNAIPNAEVKVNNIALRFDKKSQCYRNTKSNKKGLLSVSYKGMVVYNDLARSNNNSLPRRALSQIVYGKPVRYLWLPVYYIINLPIDGVKSIINHYPQNTIYRTRNYFVNCFNRIACRFDDYYCDEVSPPIKTNWGYMIFNKPKYLPNDTVKFKAYVLNRRGYPINKPVEVILFNYNKKNSRMKLGSIYPDSPGNYVFEFKLSDSLNLSLDRSYSIYLEDKNYNTMFEGGFKYEDYELSGTKLSTRLEFENHYIQDSNILYISATNENNLPLLGAKAKLVITTTNIQRVFANSLYIKDTLLEKTIDLEPSGETKFQIPDSVFPNANFYYQIKTELQTAENDNKTEYRNAKYFFYEIRIEGNLKDDYISFIYLKNGINLQSNGYLTGIDRFGNIIESKAVHIPYIEKVNPYYAKYTVRVGSDFLEFDLKKHMANLECFSERNKDSVRIIIKNPRTIPFNYNIYRGNSEIKRGLTTSLSYCEKSKNKKTYHLSLQYLWGGVITENNYDIPIPSEEFKISVEQPSIIFLGKKTPIKIKVVKSNGKPAVNVNLTAFSLTDKFSYSLPEIETIKPKIKGRKLINNFKLNENHATQYLWKMNYDFWQEISHFDSIPYYQFIFPRKNVFTTQLENPEHSTQFAPFYFENGEPYQIHIIYVDNRPVYFSWASQNRPYSFKISSGKHTIQLRTYNKLITLKDFKFEMGKKTILSLSDSCSDARVVIKPMLKRLEYNEKVLATKYTASYRDYFSNPNAYLNQMGEVFPLYQSKGMLGPIFGNYVTFHLLDQYELRFEHEPNFEYDFNKDILKMRCTQMEKRIPEYLNPTGKVSLTDNLLTEEKIITQWNQFKKIHKFDNVKYYVPNVTQKGNGVLLINDSIRFLLDQNHRNNLHTIIQSKNGNGFYRVYQDIPKQINDLKPGNYQLILLHLDGAYYKTDSLSILGNGKNFYQFNQLVCGNEIKDSKYFESLIWDLSYSKTSNENSSIISRSGNSEFYDIYTGSGMEISGIVSLKSENEPLPGVSINIKGTAIGTITDQNGFYKIKVPYGATLVFSFIGCVPFETKVDYNDVIDVKLEEDLLELDEVIVIGYGIQRKSEMTGSRTVVSNNIANLLQGTVAGAQITGNSGATNFITIRGISSLPSSDKPLVVIDGIPFWGDLSTLNPNDFQEFKILKDASATAIYGAKATNGVILIQTKAGSVKNQSLAEALQVFELPNNINSIRKNFSDYGYWQPKLYTDKKGEASFSVTFPDDVTRWNTFVIAMDGNDRLGINQGSIQSFKPLLAEIKTPRFLVERDSAIAIGKISNYTVDSIDLKTEFKVNDSLLEKSIVKVGKAIVDSILIVGTGNDSICISYSLETGELNYIDGEKRYLPMVKSGVELAIGEFYQLNNDTTFTLENNNREATIHLTATSDQLDLLKSDIASLIDYKHECNEQLASKLKALLAEEIICKFIGDDFKKTHLIKKLIRLLTKNQNDYGGWGWWGKSETSLWVTKHVLEALNKATENNYSVTFNKDLLAKELTWELSKSRDNKTNLDILLLLKNLNVVYDYQSFLDSVYFNPDKNFNAYVKMQLLKQFQRIPISLDSILQYKQVTMLGNYYFSSPNFSMYDFVNGNSQTSLLIYKLLKNDSSNHSELLNKMRNYFFENKRVYTYNTYESANLIETILPDLLTKGDKIAEASLLIDGDFKKQINTFPFDTTLTRLNKIQVTKTGSFPVYFTSYSRYWDINPKCKESDFKIESHFSNNKLTLEAGKKEYFVVELDVKKDAKYLMIEIPIPAGCSYNSKNINFRNESHREYFKDKVLIYCGSLKAGHYSFSIDLLPRFSGKYTLNPAKVELMYFPTFNANNELKRVIIN*