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BD02T64_scaffold_1544_22

Organism: BD02T64_Gammaproteobacteria_43_57_partial

partial RP 25 / 55 MC: 3 BSCG 27 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38 MC: 2
Location: comp(24076..26430)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Outer membrane protein assembly factor BamA n=1 Tax=gamma proteobacterium HdN1 RepID=E1VNL9_9GAMM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 64.5
  • Coverage: 788.0
  • Bit_score: 1035
  • Evalue 0.0
Outer membrane protein assembly factor BamA {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01430, ECO:0000256|SAAS:SAAS00011174}; Flags: Precursor;; TaxID=83406 species="Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria.;" s similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 64.5
  • Coverage: 788.0
  • Bit_score: 1035
  • Evalue 0.0
outer membrane protein, bacterial surface antigen family similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 64.5
  • Coverage: 788.0
  • Bit_score: 1035
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

gamma proteobacterium HdN1 → Gammaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2355
ATGAATAAATTATCTATTGGGTTAATTGCCCTGCTGTTGGTTGTCACTAGCTCTGTTCGAGCAGATTCATTTGTCGTTAAAGACATTCGCATAGAGGGTTTGCAAAGACTTTCGCTGGGAGCTGTTTTTAATGTATTGCCTATTGATGTGGGCGATGAAGTTTCGACCGATGTTTTGGCGCGAACAGCCAGAGTCCTTTTTAAAACCGGAAATTTCCAAGATATCCAGGTAGCTCGAGATGGTGACATACTTGTTATCAGTGTTAGTGAGCGGCCATCTATTGTGGGGATCGAAATAGATGGTAATAAGTCTATTGAGACAGATAATTTGCTTGATGGGTTGTCTCAAGCTGGGCTAAGTGAAGGTAGTGTTTTTCAGCGGGCTACACTTGATCGAATTAAGTTAGAGCTTGAACGACAATACATATCACAAGGACGTTATGCGGCAAGTGTGACCCCAGAGGTGACCCCGTTACCTCGAAATCGAGTTTCCCTCAAAATCACCATTAAAGAAGGGGATGTTGCAACAATCAGTGGTATTGATATTGTTGGTAATCATTTGTTTACAGATGAAGAGCTGATTGACCTGTTTGAATTAAAGGCAACGCATTTTACCTCGTTTTATAAAGGTGATGATAAGTACTCCAAGGAACGGTTATCGGGTGACCTGGAAACCTTGAGGTCATTTTATCTTGATCGTGGTTATGTGAATTTTAATATCGACTCTACCCAGGTTTCGGTAACACCGGATAAAACTGAAGTCTATATCGCGGTTAACGTCAGTGAAGGCAAGCTATTTAAAGTTGACGAAGTGAAACTTTCTGGCGACTTGAAAGTTAAAGAAGAAGATTTGAAACGTCTTTTGTTAGTGGCGAAAGGGCAGACCTTCTCTCGTCAGTTAGTCACTCTGACTAATGAATTGATTACCAAACGATTGGGTAATGAAGGGTATATGTTTGCTAACGTGAACGGTGTTCCAAAGGTGAATAACGAAGATACCACCGTATCCGTCACTTTTTATGTGGATCCAGGCAAACGTGTGTATGTTCGTCGAATCAACTTTTTTGGTAATACTAAAACAAGGGATTCAGTGTTACGTCGTGAAATGCGTCAGATGGAAGGCTCGTGGGCGAATGGTCGACTAATTGAACGCTCCAAATCCCGCTTAGAACGTTTAGGGTTTTTTAAAGGTGTAACGATTGAAACACCGAAAGTCGCTGGTGAAAATGATCAGGTAGACGTTAACTATTCGGTAGAAGAGCAACCTTCTGGGTCGATTGGTGCCAGTTTAGGGTTTCAGGAAAGCAGTGGTTTTGTTTTTGGTGCCAACGTGAGTCAAAGTAACTTTTTAGGAACGGGTAATCGTGTGTCGTTTGCGGTAAATAAAAGTGATACACGAACTAGCTATAATTTTTCTTTTGTTGACCCTTATTACACCATCGATGGTGTGAGTCGGGGATATTCTGTGTATTTCCAAGAAACAGACATTGATGAAGACAATAATTTATCATCGTGGGCAACCGATCGGTTTGGCGGTAGTTTAACCTTTGGTTATCCAATTAGTGAAACGCAACGTTTAAATTTTGGCATTGGTTATGAAAACACTAAAGTTTACGCCAGCGCACGCTCATCTTTAGATGTACATAACTTTATTGGTTATGACTATGTTGAGAAAGATAATGGGGCATATACTCAAAATGAAAGCTTTGACACCGTATCGCTAACCGGTAGTTGGACAAGTAGCACACTTAATCGTGGTGTTTTTGCCACCAGAGGCGCGTCTCAGAGTTTATCTACGGAGATATCCGTTCCTACTAGTGAATTGGAATTCTATAAAATTAAGTACAACGGTCAGATCTACTTCCCTCTAACGCGAACCTGGGTATTGCGTTTTAATACGGATCTAGGGTTTGGCGATGGTTATGGCGATGATACACAGCTACCATTTTACGAGAATTTCTATGCAGGTGGTTTCGGCTCTGTGCGAGGCTATGAAGACCGTACATTAGGCCCTCTTGAGAGACAATCGACTGACGATTTTGGTGATCCTAACCCTTTTGGTGGAAATCTTTTGGTTGAGGGTAGCGTGGAATTGATATTTCCTATACCTTTCGTTAAAGATAAACGTTCCGTTAGAACGTTATTTTACTTAGATGGCGGTAATGTTTTCGATACACATCGTGATGATGAGGATGGGCTGGATATTTCGGTAGATGAATTGCGCTACTCAGTAGGTATCGGGCTTTCATGGATCACAGGTATTGGACCGTTAACCTTTAGTTTTTCTAAAACCATCAATGATAAAGAGATTGATGATACCAAGGCCTTCCAATTTTCATTGGGTAAGCCATTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 785
MNKLSIGLIALLLVVTSSVRADSFVVKDIRIEGLQRLSLGAVFNVLPIDVGDEVSTDVLARTARVLFKTGNFQDIQVARDGDILVISVSERPSIVGIEIDGNKSIETDNLLDGLSQAGLSEGSVFQRATLDRIKLELERQYISQGRYAASVTPEVTPLPRNRVSLKITIKEGDVATISGIDIVGNHLFTDEELIDLFELKATHFTSFYKGDDKYSKERLSGDLETLRSFYLDRGYVNFNIDSTQVSVTPDKTEVYIAVNVSEGKLFKVDEVKLSGDLKVKEEDLKRLLLVAKGQTFSRQLVTLTNELITKRLGNEGYMFANVNGVPKVNNEDTTVSVTFYVDPGKRVYVRRINFFGNTKTRDSVLRREMRQMEGSWANGRLIERSKSRLERLGFFKGVTIETPKVAGENDQVDVNYSVEEQPSGSIGASLGFQESSGFVFGANVSQSNFLGTGNRVSFAVNKSDTRTSYNFSFVDPYYTIDGVSRGYSVYFQETDIDEDNNLSSWATDRFGGSLTFGYPISETQRLNFGIGYENTKVYASARSSLDVHNFIGYDYVEKDNGAYTQNESFDTVSLTGSWTSSTLNRGVFATRGASQSLSTEISVPTSELEFYKIKYNGQIYFPLTRTWVLRFNTDLGFGDGYGDDTQLPFYENFYAGGFGSVRGYEDRTLGPLERQSTDDFGDPNPFGGNLLVEGSVELIFPIPFVKDKRSVRTLFYLDGGNVFDTHRDDEDGLDISVDELRYSVGIGLSWITGIGPLTFSFSKTINDKEIDDTKAFQFSLGKPF*