ggKbase home page

gwf2_scaffold_1133_25

Organism: PER_GWF2_39_17

near complete RP 50 / 55 MC: 9 BSCG 49 / 51 MC: 1 ASCG 11 / 38
Location: comp(22248..25457)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
mfd; transcription-repair coupling factor (EC:3.6.1.-); K03723 transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:3.6.4.-] Tax=PER_GWF2_39_17 UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2105
  • Evalue 0.0
mfd; transcription-repair coupling factor (EC:3.6.1.-) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 40.7
  • Coverage: 970.0
  • Bit_score: 674
  • Evalue 4.60e-191
Transcription-repair coupling factor n=1 Tax=Anaerolinea thermophila (strain DSM 14523 / JCM 11388 / NBRC 100420 / UNI-1) RepID=E8MXI7_ANATU similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 40.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 674
  • Evalue 6.00e+00
  • rbh

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

PER_GWF2_39_17 → Peregrinibacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3210
ATGAAATTTCCTCATCCTCGAAATCAAAAAGTATTAGAACTTTTTGAGAATAATTGTTATGTGACGTTGTCCGGGTCTGGTAATTTTTCATCCAAGGCTTTTGTTGTTTCAGATATTTTGGAGCAGTTTGATAATCTTAAAAAGTTGGTTTGGGTGGTTAATGATTTTGGACAAAGAGATAGTATTGTTAGTGCTTTGGCGGATTGGAGTGATTTTAGTATTGAAATTATAGATCACGATCAAGGGTATTTGTCGTTAATAAAGTCCTTGGCTAATTTAATGAATCATAAGAAGATTGCTCTGGTTATTACGTGCGAACAATTAATGACAAAAATTCCATCCCAAAAAGATATTTTGGATTCTATTCTGAAGTTAAAAATTAAAGAGGAAATTGACCCTATTCAATTATTTGAAAAATTTATTCAAATGGGTTATTTGGTTTCAGAAGATTCTTATTTGAATCCTGGAACTTATTTAAGGCATGGCGATGTGTTTGATTTTTTTCCTATTAATTTTTCTCACCCTTGTCGGCTGGAGTTGGATTATGAAACTATTTCCGAGATTTATACTTTTGATCAAATTAGTCATCAAAAAATTGAATCTTTTTCTGAGGTTACAATTTTTCCCTTAAAAGAATTGGAAGGTACAGCGGTGATTTTGGATTATTTAAGTAAGGGATCTTTGTTGGTTGAAGATGAACTGGATTTGAATGAAAATTTTTATGCTGAAATTGAAGCCGTGATTCAAGCTAAAAATAATGAAGTGGGATATGTTTTATTTACTTCTTTTTTGGAAGAAGATAGTTATCATGAGCATTTGCACTATTTGTCAGTTTTAAAATATCAAAACCGATTGGATTTTGTGGAAAATATGCGTGAAAAAATGATAAATCATTGGCGTGTTTATCTGTTTACAAAAAACGCGACTGAAATTAAATCTTTATTGGATGATCGAAAATTAATTTATGTGGATTCTCCGCAAAAGGCACAAGCCAAAAAAGGAAATATTGTTATTTTTGACCTAAAGAAGGAAGATCATTTTCCGTATGCTTTTCAAAATCCTCATTTAAAATTTACTGTTATTACAGATCGGGAAATTTTAGGTTTACGAGAAAATGGACATAAGCAAGAAGCGCAGCATGCGGTTTATTTGGATTTTTTAACTGGTTTAAAAAAGGGTGATTATGTAGTGCATTCAGAGCACGGGATCGCACTTTTTAATGGTTTAGATAAAAGGACAATTGATGATGTCACTAGAGAGTATTTGCAGTTATTTTATGCTGAAAATGATAAATTGTTTGTGCCGATTGATCAGGCTGATAAGGTTAGTAAATTTATCGGAATTGGAGATCAAGTGCCGAAATTAACCCGCTTGGGATCATCTGAATGGGCAACGATTACTAATCGCGTCAAAAAAGAAACTCAAGAAATTGCGAAGGAATTGTTGCAGTTATATGCAGAGCGAGAACAAGCAAAAGGAGTTGCCTATAAAAAGGACACCAAGGTGCAGGAATTATTTGAGCAATCTTTTCTGTATGAGGAGACGCCAGGACAAATTAAAGCCATTCGTGATGTTAAGTCTGATATGGAACGACCTAAGCCAATGGACCGCCTTATTTGTGGAGATGTGGGGTTTGGTAAAACAGAAATAGCCATGAGAGCAGCTTTTAAAGCGATTCAAAATGGCCGACAAGTGGCTCTGGTTTCGCCGATTACGATTTTAGCGGATCAACATTATCATTCTTTTAAAAAGAGAATGGATGATTTTAACGTGCGCGTGGCTATGATGAGCAGGTTTAAAACCGCAGGAGAGCAAAAAAAGATCATTAAACAGTTAAAAAATGGGGAAGTGGATATTGTTATTGGGACGCATCGTTTATTTCAACCGGACGTGGAATTTAAAAATTTAGGATTAGTAATTATTGATGAAGAACAACGCTTTGGGGTAAAACAAAAAGAGCACCTTAAGGAATTAAGAAAAGAAGTAGATATTTTAACCCTGACCGCGACTCCAATTCCCCGGACTTTAAATATTAGCTTACATGGCTTAAGAGATATTACGACCATTACTACTCCTCCTCCGGGGCGATTACCAGTTATTACGGAAGTGCGACGTTTTTCTTTTGGTTTAATTCAGGAAGCAATTCAGCGAGAAATTGATCGAGGAGGGCAGGTCTATTTTTTACATAACAGAGTGGAGACAATTGAAGAAATGGCGCAAAGATTACGGACGTTGCTTCCCAAGGTGCGATTTATTGTGGCGCATGGCAAACTGAACAGTTCGGATTTAGAAGGAAGAATTTTAGCTTTTAAAGATAAAAAATTTGATGTCTTAGTGAGTTCAACCATTATTGAAAACGGAATTGATTTACCAAATGCTAATACATTAATTGTGAATAAGGCGGAGAAATTTGGGTTGGCTCAATTATATCAATTAAGGGGCCGTGTGGGGCGGGCTAGGATTCAGGCTTATGCTTATTTTTTATATCATTCGCAGCGATTACCGATTGACGCTAAAAAGCGATTAAGAGCTATTGTGGAGGCTTCTGAATTGGGTGCTGGTTTTCAAATTGCGATGAAGGATTTGGAAATTAGAGGGGCTGGTGATATTTTGGGTGCCAACCAGCATGGGGCAATTAATGTGGTGGGAGTTAGTCATTTTATTCGAATGTTAAATCGGGCAGTTGATGATTTAAAGGAGGGAAGATTGACTAAGATGAGTGAAATTCCACCAGAGGTTTCTATCGAAATTCCTTTGCCGGCGTTTATCCCAGATGATTATATCGTTAGTTCTAAGGATAAAATTGGAGTTTATCAGCGTTTGGCTTCGGCGGATAACTTTGATTATTTGGAAGAATTGGAACAAGATTTGATTGAAGATTACGGACGAATGCCTAAGGAAGTGGCGAACCTATTTCATGTTTTGGCCTTAAAATTGTTAGCCAAAAAAGCAAGGTTGGTGAATGTGAGGGCTGAAAATATTCATGGTAAGGGTGAAAGACAAATCGTTTTAACTGTTTCTAATCAAGTTAAGCCGGAGAATATTTTAAATTTACTAGAATATAATTCAAAATGGTTGGTGAGTGGTAATAAATTGAAGATTTCTTTTGAAGAATTAGGGGTAAGCTGGGTGGATGAATTAAAAATTGCTTTAAAGAAATTGAGCGAGAAAATGAAAAATATGCCAGGAAGGGTTTGCGAAAAGGCTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1070
MKFPHPRNQKVLELFENNCYVTLSGSGNFSSKAFVVSDILEQFDNLKKLVWVVNDFGQRDSIVSALADWSDFSIEIIDHDQGYLSLIKSLANLMNHKKIALVITCEQLMTKIPSQKDILDSILKLKIKEEIDPIQLFEKFIQMGYLVSEDSYLNPGTYLRHGDVFDFFPINFSHPCRLELDYETISEIYTFDQISHQKIESFSEVTIFPLKELEGTAVILDYLSKGSLLVEDELDLNENFYAEIEAVIQAKNNEVGYVLFTSFLEEDSYHEHLHYLSVLKYQNRLDFVENMREKMINHWRVYLFTKNATEIKSLLDDRKLIYVDSPQKAQAKKGNIVIFDLKKEDHFPYAFQNPHLKFTVITDREILGLRENGHKQEAQHAVYLDFLTGLKKGDYVVHSEHGIALFNGLDKRTIDDVTREYLQLFYAENDKLFVPIDQADKVSKFIGIGDQVPKLTRLGSSEWATITNRVKKETQEIAKELLQLYAEREQAKGVAYKKDTKVQELFEQSFLYEETPGQIKAIRDVKSDMERPKPMDRLICGDVGFGKTEIAMRAAFKAIQNGRQVALVSPITILADQHYHSFKKRMDDFNVRVAMMSRFKTAGEQKKIIKQLKNGEVDIVIGTHRLFQPDVEFKNLGLVIIDEEQRFGVKQKEHLKELRKEVDILTLTATPIPRTLNISLHGLRDITTITTPPPGRLPVITEVRRFSFGLIQEAIQREIDRGGQVYFLHNRVETIEEMAQRLRTLLPKVRFIVAHGKLNSSDLEGRILAFKDKKFDVLVSSTIIENGIDLPNANTLIVNKAEKFGLAQLYQLRGRVGRARIQAYAYFLYHSQRLPIDAKKRLRAIVEASELGAGFQIAMKDLEIRGAGDILGANQHGAINVVGVSHFIRMLNRAVDDLKEGRLTKMSEIPPEVSIEIPLPAFIPDDYIVSSKDKIGVYQRLASADNFDYLEELEQDLIEDYGRMPKEVANLFHVLALKLLAKKARLVNVRAENIHGKGERQIVLTVSNQVKPENILNLLEYNSKWLVSGNKLKISFEELGVSWVDELKIALKKLSEKMKNMPGRVCEKA*