ggKbase home page

rifcsphigho2_01_scaffold_2479_6

Organism: RIFCSPHIGHO2_01_FULL_Archaea_Pacearchaeota_29_23

partial RP 25 / 55 MC: 3 BSCG 17 / 51 ASCG 23 / 38 MC: 3
Location: 5151..8921

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA gyrase subunit A (EC:5.99.1.3); K02469 DNA gyrase subunit A [EC:5.99.1.3] Tax=RIFOXYB1_FULL_RIF_OD1_06_37_44_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 51.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1264
  • Evalue 0.0
DNA gyrase subunit A n=1 Tax=candidate division ZIXI bacterium RBG-1 RepID=T0LE70_9BACT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 47.2
  • Coverage: 735.0
  • Bit_score: 668
  • Evalue 1.80e-188
gyrA; DNA gyrase subunit A similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 47.3
  • Coverage: 732.0
  • Bit_score: 673
  • Evalue 1.60e-190

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYB1_FULL_RIF_OD1_06_37_44_curated → RIF-OD1-6 → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3771
ATGAAGAAAAAAACAGATGAAAATGAAGAAGATGAACTAGATGAATCTTCTGAAGAAGATGATAATGATGAGTCTAATGGTAATTCTGAATCTGAAAATGAAAAAGACTTTGATGAAGATATAGAGACTCTTTCTAGAGAAGAAATTAATCTTAAGGATTTAGGAGAAGATAGAACTGTTAATACTGAGATATCTGGTGAAATGCAGAAAGCATATATTGATTATGCTATGTCAGTTATTGTATCTAGAGCTTTACCTGCTGTTGAAGATGGTTTAAAGCCTGTTCATAGAAGAATTCTTTATGCAATGGACCAAATGGGCTTGGATAAAGGTCCAACAAAAAAATCAGCAAGTATTGTCGGAGATGTTATGGGAAAATATCACCCTCATGGAGATGTTGCTATTTATGATTCTTTAGTTAGAATGGCTCAAGACTTTTCTTTAAGATATCCTTTAATTCATGGTCAGGGAAATTTTGGTTGTTTTACTGCTGATACTAAAGTTAAATTAGTAGATGGAAGGGATTTATCATTTGCTGATTTGATTGAAGAACACCAAAAAGGAAAACGTAATTTTACCCTTTCAGTGAATGAAGATGGAAATGTAATAATTACAGAGATAAAGAACCCAAGATTAACACAAAAAAATGTAGAAATAATGAAAGTCACTTTGGATAATGGGGAAGAGATAAAATGTACTTTGAATCATAAATTTATGTTAAGAGATGGAAGTTATAAAGAAGCACAATATTTACAATCTGGTAATTCTTTGATGCCTGTTTACTTTAAATTATCTACTAAAGATGATGGCCAGAAAGTTATTGGTTATAGTATGGTTTTCCAGCCTAAATCAAACGAATGGAGTTTCTTCCATTACCTTTCTGATAAATGGAATTTAGAAAATGGAATATATTCTGTTTCTGCTGGGAGAGTAAGACATCATATAGACTTTAATAAATTAAATAATAATCCAGATAATATAAGAAGAATGCATTGGAAAGATCATTGGTTATTACATTCTTCTTTAACTTCATTTAAACATAAAAATGACCAAGAATATGTAAAAAAATTAGAAGAAGGAAGAAAAGTATTTTGGGAGAATAATCAAAATAGAATTAATTATTCAACTAGAATGCGTAGTAGAAATATTGAAAATTGGAAAGATCAAACTTATAGGGCTGAAATGAGTTTAACTTTAAGTGAAGTTAATAAAAAATATTTGGCTGAACATCCTGAAAGAATCGAAGAAATCCGTAGAACTGCATCATTGACTATGAAAAAAATGTGGCTTAGTCCAGATTATAAAAACTTATTTAATGAGAAAATTACTGCATCTAACAAGAGAAGAGAAACTAATTTAACAGGAAAAAAGAATTTTTTAAATATATGTGATTATCTGAAAAAAAATAATTTATTTATAAACAAGGAAAATTTTGAAAAAGCAAGAATTGAAGTATTTGGTGGAAAAAACTTTACAAGCTGGGAACATGGTTTAACTAAATATTATAATAAAAATAATAATTTACTTCTGGCTGAGCTGAATGGTAATCATAAAGTTGTTAAGACTGAATTTTTAAGAGAATTTCAGGATGTTTATGATTTAACTATAGATAAAACACATAATTTTTCTTTATCTTCTGGAGTATTTGTTCATAATTCAATGGATGGTGATAGGGCTGCTGCTCAGAGATATACAGAAGCTAAATTAGATAAAATATCTTTGGAATTGTTGCAAGATTTAGATAAAGAAACAGTTCCATTTGTAAATACTTATGATAATTCTAGAAAAGAACCAATAGTTCTTCCTGGAAAAGTTCCTAACTTGCTTATTAATGGTTCTTCAGGAATTGCGGTTGGAATGGCAACAAATATTCCCCCCCATAACCTAGTAGAAGTTTGTGATGCTATAACTGTTTTGATTGATAAACCAAACACTGAAATTAAAGATTTGCTTGAGATAATTAAAGGTCCTGATTTTCCAACTGGAGGAGTAATGGTTGCTGAAAATTTATTGGAAATGTATTCTACTGGAAAAGGGGCAGTGACATTAAGGGGAAATGTTAAAACAGAGTCTGCAAAAAATAAAGAAGTAGTTGTTATTAATGAAATTCCTTATCAGGTTAATAAATCTGAATTAGTAAAACAAATTGCAGAGCTTGCAAGAGATAAAAAATTAACAGATGTAAGTGATATTAGAGATGAGTCTGCTAAAGGTAAAGTAAGAATTGTGATAGAACTAAGAAAAGGTGTTGATTCTAAATTTACTATAAACAGACTTTACAAAAGTACTAATTTGCAGACTAGATTTAATTCTACTTTTGTTGCTTTAGATAATGGTATTCCAAAAACAATGAATTTAAAACATATTTTAGAAGCTTACATTTTACATAGAAGAAAGATGGTCAGAAAAAGATCAGAATTTGATTTTAGGAAGGCTGAAGCAAGATTACACATTGTTGAAGGATTATTAATTGCCCAAAAACAGATTGATAAAATTATTGAATCAATTAAAAAAAGTAAAGGTACTCAAGAAGCTTCTGAGAATTTACAGCATAAATTTTCTTTGTCTAAGAAACAGGCTGAAGCAATTCTTGAAATAACTCTGAAACAATTAACAGCTTTGGAAAGAGAAAAACTTGAGAATGAGGAAAAGTTTTTGAAACAACTAATAAAAGAATTAAAGTTAATTCTTGATGATGAAAAAGAAATACTTAAGATAATTAAAAAAGAATTAAATGAGTTAAAGAAAAATTATGGGGATGAGAGAAGAACTAGAGTTATTAAGGTTATTAAAGAAATTGAAGAAAAAGATCTAGTTTTAAAACAAGATGTTGTAATTACAATAACTGAAAAAGGATACATAAAAAGAATGCCTTTCAAATCTTATAATGAACAAAAACGTGGTGGTAAAGGTGTTATTGGAACTGATCTTTCAACAGATGATTTTGTTAAACAGTTGTTAACTTGTTCAACTCACGACTATTTGTTATTGTTTACAAGGCGTGGAAGATTAATGTGGTTGAAGGCGCATAAAGTTCCTGAAACTCAGAGGTATGGTAAAGGTCAGGCAATTGTTAATTTACTTAATATTAAGGACGATGAAATATCAAGTGTTATGCCTGTAAAAGATTTCAAGGATTATTTGTTTATGGTTACTAAAAAAGGAATGGTTAAGAAAATAAACTTAAGCATGTTTGCAAAGCCTAGAAATGTTGGAGTGAGAATAATTAATTTACCTGCTGATAATTCTGATTCTGTTGTAGATGTTAAAAGGATTATGGACAAACAACAGGTTATGTTAATGAGTGCAGATGGACAGGCAATTAGATTTAACTCTGATGAAGTTAGAAATATGGGTAGAGCAAGTTATGGGGTTGCTGGAATAAAATTAGATAAAGGAGATGAGGTTGTTTCAATGGAAATAGTTCCTATGGAAAAAACTAAGAGTAATATTTTAACAATTACTGAAAAAGGTTATGGTAAAAGATCTGAGATTGATGATTATAGACTTACAGGAAGAGCTGGAAAAGGAGTTATTAATCTTAAAGTTTCTGAAAAAACTGGAAAGGTTATAAGAACTATTGAACTTGATGAGAAAGATACTATTGTTGTTACAACAAAAAAAGGAATGGCAATAAGGACTAAAGCTAAAGCTATTAGGGTTATGGGAAGAGCTGCTCAGGGTGTTAGAATTATTAACCTGAAACAAGGGGATAGAGTTGGTGATGTTGCTAAGCTAGTTGAAGCTCCTGAAGAGATTTTCACCGAGTGA
PROTEIN sequence
Length: 1257
MKKKTDENEEDELDESSEEDDNDESNGNSESENEKDFDEDIETLSREEINLKDLGEDRTVNTEISGEMQKAYIDYAMSVIVSRALPAVEDGLKPVHRRILYAMDQMGLDKGPTKKSASIVGDVMGKYHPHGDVAIYDSLVRMAQDFSLRYPLIHGQGNFGCFTADTKVKLVDGRDLSFADLIEEHQKGKRNFTLSVNEDGNVIITEIKNPRLTQKNVEIMKVTLDNGEEIKCTLNHKFMLRDGSYKEAQYLQSGNSLMPVYFKLSTKDDGQKVIGYSMVFQPKSNEWSFFHYLSDKWNLENGIYSVSAGRVRHHIDFNKLNNNPDNIRRMHWKDHWLLHSSLTSFKHKNDQEYVKKLEEGRKVFWENNQNRINYSTRMRSRNIENWKDQTYRAEMSLTLSEVNKKYLAEHPERIEEIRRTASLTMKKMWLSPDYKNLFNEKITASNKRRETNLTGKKNFLNICDYLKKNNLFINKENFEKARIEVFGGKNFTSWEHGLTKYYNKNNNLLLAELNGNHKVVKTEFLREFQDVYDLTIDKTHNFSLSSGVFVHNSMDGDRAAAQRYTEAKLDKISLELLQDLDKETVPFVNTYDNSRKEPIVLPGKVPNLLINGSSGIAVGMATNIPPHNLVEVCDAITVLIDKPNTEIKDLLEIIKGPDFPTGGVMVAENLLEMYSTGKGAVTLRGNVKTESAKNKEVVVINEIPYQVNKSELVKQIAELARDKKLTDVSDIRDESAKGKVRIVIELRKGVDSKFTINRLYKSTNLQTRFNSTFVALDNGIPKTMNLKHILEAYILHRRKMVRKRSEFDFRKAEARLHIVEGLLIAQKQIDKIIESIKKSKGTQEASENLQHKFSLSKKQAEAILEITLKQLTALEREKLENEEKFLKQLIKELKLILDDEKEILKIIKKELNELKKNYGDERRTRVIKVIKEIEEKDLVLKQDVVITITEKGYIKRMPFKSYNEQKRGGKGVIGTDLSTDDFVKQLLTCSTHDYLLLFTRRGRLMWLKAHKVPETQRYGKGQAIVNLLNIKDDEISSVMPVKDFKDYLFMVTKKGMVKKINLSMFAKPRNVGVRIINLPADNSDSVVDVKRIMDKQQVMLMSADGQAIRFNSDEVRNMGRASYGVAGIKLDKGDEVVSMEIVPMEKTKSNILTITEKGYGKRSEIDDYRLTGRAGKGVINLKVSEKTGKVIRTIELDEKDTIVVTTKKGMAIRTKAKAIRVMGRAAQGVRIINLKQGDRVGDVAKLVEAPEEIFTE*