ggKbase home page

SCNpilot_bf_inoc_scaffold_194_curated_108

Organism: scnpilot_dereplicated_Bacteroidales_1

near complete RP 52 / 55 MC: 4 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38
Location: comp(119054..122149)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Cation/multidrug efflux pump id=3343227 bin=GWF2_Bacteroidetes_42_66 species=Echinicola vietnamensis genus=Echinicola taxon_order=Cytophagales taxon_class=Cytophagia phylum=Bacteroidetes tax=GWF2_Bacteroidetes_42_66 organism_group=Bacteroidetes organism_desc=a73 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 47.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 925
  • Evalue 6.60e-266
cation/multidrug efflux pump similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 44.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 901
  • Evalue 2.50e-259
Tax=GWE2_Bacteroidetes_42_39_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 47.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 925
  • Evalue 9.30e-266

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

GWE2_Bacteroidetes_42_39_curated → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3096
ATGAATATATCAGATATATCAATTAAACGACCAACAATCCCACTGGTTCTACTTATAATAACATTATTGGTAGGTTTATTTTTAGGCACAAGGCTAAAGTACGAATTAATTCCCGACATTAGTGCCCCGGTAGTTGTAGTAACTACTATATATCCGGGGGCCGGAGCAAGCGATATCGAAAAATCGGTAACCATTCCGCTTGAAGATGCACTGGCACAAGTTGAAGGAATAGACGAAATTATTTCAGCTTCAATGGAAGGTGTTTCAACTGTAAGGCTTATGATGAGTATGGATATTGACCCAAAGGATGCCTTACAAGATGTAAAAGCAAAACTCGACAAAATCCGTCGTACACTGCCAAAGGACATTTATGAGCCATCGGTGTCTGCAATTGATTTAGGAGAGCTGCCAATTATTACTATTGGTGCAACATCGGGTATGTCGAACACCGATTTCTTTGACCTTATCGATAAAACAATACAGCCAACTTTATCGCAAATTAAAGGAGTAACAAATGTGAATATCGTTGGCGGTATGCAAAAGGAAATTAAGGTAAACATCGACAAAAACAAGCTAGATGCTTTTAACCTTACAATGTTACAAGTAGTGCAATTAGTTGGTGCTTCAAATATCGAATTCCCAGCCGGGAAAATTGAAGATGAGCAAACTCAAATGAAGGTGCGATTATCCGGAAAATACCAATCTGTTGACCAATTAAGAAAAACCGTAGTTGGGTATTCAAATACCGGCAATGCTATTTACCTCGAAGAAATTGCCGATGTATATGAAGGAATTTCAGACATTAAAACAATTGCAAAAATTAATGGTGCCGAAGCCATTGGTATCGAAGTTTCGAAACAAAAAGCAGCCAATGCTGTAGATGTAAGCCGTCTTGTTCAGGAAAAACTGGAACAACTAAAAGTAGATTATGCCGATTCCGAATTGGATTTTACAATTGCCAACGACAATTCAGTATTTACACTTAATGCAGCAAATGCTGTTGGTAAAGACCTAATGATGGCAATTATCCTTGTGTCACTCATTATGCTGTTGTTCTTAAAAAGCTACCGAAATACCCTTTTTGTTTTGGTTACTATTCCAACATCATTAATAGGGACATTTATTGTAATGTATTTGCTCGATTTTTCGCTCGATCTTATTAGTTTAACCTCGCTTTCGTTGGTTGTTGGTACTGTGGTCGACGATGCTATTGTTATAATCGAGAACATCCACCGCCATATGGAAATGGGCAAAAACAGGTTTGATGCCACAAAAGACAGCATGAAAGAAATAGGTCTTACACTTGTTTCAACTACTGCGGTTTTATCAGCTGTATTTATTCCAATATCAATGGTTACAGGAATCACAGGTCAAATTTTGCACGAGTATGCAATTGTTATTGTGGCATCTATGCTTTTTAGTTTGCTATTTACATTTACCCTTGTGCCTTTATTAACCTCGAGATATGCAAAAATTGAAACACCAAAGAAAAATGCCGTAAGCAAAGTACTCGATGGTTTTGAAAAACTATTGGAAAAATTTGCAGTTTCTATTACCAACATGCTAAAATGGGTGTTACGGCACAAAATAATTACTACTCTGTCGGTAATTGCATTGTTTGTAGTTAGCGTTTGGCTTATACCAGCAGGTTTTATTGGCACTGCGTTTATGGAATCGGGCGACCGTGGTAATGTTATTCTTAGAATTGAATTGCCAAAATCGGCACAAATTCACGAGAATTTAAAAGTTACGTCACAAGTCGAGGAACTTATCCTTGCGCAACCAGAAGTCGAAAATTTATATACTACTATTGGTAAACGAACAGGAAACGTTATTGCAACCGATAACAGTACACCTTATTTCACCGAGTTTAACGTAATTTTTGTTCCTTTAGAAGAGCGCGAAATGAGTTCGCAAAATATTGCTCGAACATTACGCGCCAAAATCGAGGAAACCGTGCCCGGTATTAAAGTTAGTGCTGCCAATGTTAACATTATGGGCAACGAAGACATTCCTATAAAATTCTATGTAAAAGGCAATAATATTGATAGTATTTATAAAGCTTCCGAAATGTTTTGCGATATGCTTCGCTCAATTGAAGGAACAACAGAAGTAGAAAATTCACTAAATTTTGGGAATCCTGAATACCAGGTATTTTTCGACAGGGAAAAGCTTGCATATTATGGACTTACAATAGGGGAAGTTTCAAAAGATATTCAACTTGCATTTGCAGGAAATACCGATAATAAATACCGGATTGGAGATAACGAATATGATATCAACATTCGTCTCGATGAATTTAACAGAAAAGACAAATCCGATTTGGAATCCTTAAAATTTAAAACACATAAAGGCATTGTTACTTTATCGCAATTTGCTTCTGTTGAGCAAGGTAGGGGTCCAAGTGTTTTAGAAAGATATAATCGTGGTTCGTCGGCAACTATTACTTGTCAGTTGGTGGGTGTTTCGCAAGGTACAGCAACCGAACAATTCGAAAGTTTAGTAAAACAGGCCAAACTGCCCGAAGGCACAAGTCACGAGTATTCTAAAATGTCGAAAATGATGAGTGAATCGTTTGCGTCGCTCGCAATTGCATTTATTGCCGCAATTCTTTTTATGTACCTAATTATGGTATTGCTATATAATAACTGGTTGCATCCTTTCGTGGTTTTGTTTACCATTCCTTTAGCAATTATTGGGGCACTATTTGCACTTGCGCTTGCAAACGAAAACCTTAGTTTGTTTACTATTTTAGGCATTATAATGCTTGCCGGATTGGTAGCCAAAAATGCCATTCTGGTAATCGATTTTGCCAATGAATTAATACGAGAAGGAAAAGCATTGATAGATGCCATCCTCGAAGCTGTACTTTTACGATTCAGAGCTATTCTTATGACCAATATCTCAATGATTATCGGGCTTATTCCTCTTGCAGTTTCAGCCAGTGCCGGATCTGAATGGAAAAACGGAATCGGTTGGGTATTAATTGGAGGTTTGACAGTTTCTATGTTCTTGTCAATGATTATTGTACCTATGATTTATTATATATTTGAGAAATTGAAAATAAAAATAATGGGACAAGCTAAAGGTATGTAA
PROTEIN sequence
Length: 1032
MNISDISIKRPTIPLVLLIITLLVGLFLGTRLKYELIPDISAPVVVVTTIYPGAGASDIEKSVTIPLEDALAQVEGIDEIISASMEGVSTVRLMMSMDIDPKDALQDVKAKLDKIRRTLPKDIYEPSVSAIDLGELPIITIGATSGMSNTDFFDLIDKTIQPTLSQIKGVTNVNIVGGMQKEIKVNIDKNKLDAFNLTMLQVVQLVGASNIEFPAGKIEDEQTQMKVRLSGKYQSVDQLRKTVVGYSNTGNAIYLEEIADVYEGISDIKTIAKINGAEAIGIEVSKQKAANAVDVSRLVQEKLEQLKVDYADSELDFTIANDNSVFTLNAANAVGKDLMMAIILVSLIMLLFLKSYRNTLFVLVTIPTSLIGTFIVMYLLDFSLDLISLTSLSLVVGTVVDDAIVIIENIHRHMEMGKNRFDATKDSMKEIGLTLVSTTAVLSAVFIPISMVTGITGQILHEYAIVIVASMLFSLLFTFTLVPLLTSRYAKIETPKKNAVSKVLDGFEKLLEKFAVSITNMLKWVLRHKIITTLSVIALFVVSVWLIPAGFIGTAFMESGDRGNVILRIELPKSAQIHENLKVTSQVEELILAQPEVENLYTTIGKRTGNVIATDNSTPYFTEFNVIFVPLEEREMSSQNIARTLRAKIEETVPGIKVSAANVNIMGNEDIPIKFYVKGNNIDSIYKASEMFCDMLRSIEGTTEVENSLNFGNPEYQVFFDREKLAYYGLTIGEVSKDIQLAFAGNTDNKYRIGDNEYDINIRLDEFNRKDKSDLESLKFKTHKGIVTLSQFASVEQGRGPSVLERYNRGSSATITCQLVGVSQGTATEQFESLVKQAKLPEGTSHEYSKMSKMMSESFASLAIAFIAAILFMYLIMVLLYNNWLHPFVVLFTIPLAIIGALFALALANENLSLFTILGIIMLAGLVAKNAILVIDFANELIREGKALIDAILEAVLLRFRAILMTNISMIIGLIPLAVSASAGSEWKNGIGWVLIGGLTVSMFLSMIIVPMIYYIFEKLKIKIMGQAKGM*