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RTP_09252017_15_scaffold_24_1

Organism: RTP_09252017_15_Sphingobacteria_36_17

near complete RP 50 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 12 / 38
Location: 2..4963

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
PREDICTED: uncharacterized protein LOC102033029 n=1 Tax=Geospiza fortis RepID=UPI000395554D similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 29.5
  • Coverage: 1777.0
  • Bit_score: 423
  • Evalue 5.90e-115
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:EFA84423.1}; TaxID=13642 species="Eukaryota; Amoebozoa; Mycetozoa; Dictyosteliida; Polysphondylium.;" source="Polysphondylium pallidum (Cellular slime mold).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 27.2
  • Coverage: 1802.0
  • Bit_score: 397
  • Evalue 4.80e-107
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.1
  • Coverage: 1856.0
  • Bit_score: 368
  • Evalue 6.40e-99

Lists

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Notes

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Taxonomy

Polysphondylium pallidum → Polysphondylium → Dictyosteliida → Eukaryota

Sequences

DNA sequence
Length: 4962
ATCTCAGCGATGCCAACTGAGAATTGGTCATTTACATTAACAAGTACAGTTACTGCAGGTACGATTACAACAGTAACAGGTACGGGTACAATGTCATGGACGGCTACGTTTACATTATCAAATACATCAACAGCAACCGCTACAACACATATTATTGGTATAGGGACAATGTCTTCTACTTTAGATATAGTTAATGCATTTAATAATCCAAAAGGAGGAACGATAACTACTACAGTTAAAATATATAGTTTACCAAGAGCAGAGATAAATGCACCGTTACCTAGCCAGTATATTTATACAACATACAATGCAGGTGTTTACGAAGCTCCGATAACGATAACAGGTACGATTACTTCAGTTAGTGGCGAATCATGGTCATTACAAATAAAGAATAATGGATCAACGATTACAACAGTAACTGGTAATGCAGGAACTGCATCATGGACAGCGACGTTTACATTAACAAGTACGACTTCGACACAGACGATTAACAATATTAGTTTAGGAACATTGACTTCTACAGTAGGCATATTAGGAGCAACACAAAACGGAAATGCAACAACAGGTACTACCACTACTACGATCTATGTAAATGGATTACCTAAAGCAAACATTTCAACATTATCAAATACCATTACTGCATATGAAGGTCAAAATATAACGATAACGGGTACATTAACATTAATACCTGGTGAATCTTGGAAAATTACTTTATTAGATCAAACTACTGGTAATACAATTACACCAACTTCTTCTGTTTTATTTGGCACTGCTGTTACATCAAATGTAACATGGACAGCCACCTTTACTTTAACAAGTTCAACCACAGCAACCCAAACCGCTCATAATATAGTTATAGGTACTGTATCTACCACTTTAGGAATTAACAATCAAATTAATGATGGAACAGTTACTAATACTGTAATTGTACTTAACGATTTACCACAAGCAACTATTTCAACTTTATCAAATACAATTGCTGTTTATGAAGGTCAAAATATTACGATAACTGGTACTATCACTACAATACCTGGAGAGGCTTGGTCAATTACTTTAAGAAGTGATAAAGTTGGAACTATTACTACAATTACAGGACCAGCAGGTGGTGGTAATATTTCTTGGACATCTACATTTAATTTAACAAGTACGACTTCTACACAAACAATACATAATATTAGTATTAATACACTGTCTTCTACTTTAACAGTATTAAATGGTGTAAATAATGTAACGCCTACTCCAACAATTGCAGTAGGTGTTAATGCAATTCCAAAAATTGATATTTCACCACTTCAAGCAAATCAATACAGTGCGGTTGGTGCGGTGAGTAATGTTACTATAACAGGTACTATAACAGGTATACAAGGGGAGACTTATGCTATTCAATTAATTGATCAAGCAGCAGGTGTTACAAGAACTTTAACTACTGTTAGTAGTACAATTACAGTTTCAAATACAAATACTTGGTCTTATAGCGCCACTTTAACAAGTACGGCAGATGCAACAACTACATCACACACCATTAGCATTGGAACGATTACTACAACATTTAGGGGTAGTTCAATTCCTGTAACTGCAACAAATACAACTAATCCTAATGCTACAGTTACCAATACAACGATTAATATTAATGGTGCACCATTAGCAACATTATCAGCAGCAACATTAACTATATGTAGTAATGATGACGGGTCTTGGCCTTTAACAATATCAGGAACAATTTCAACCGCAACACCAACTGCATATACAATTGTTTTACGTAATAGCAGAACTTTTGCGGCTACAACAATAACTGGAACTACAACTACTGGAATAGGAGGAACGTTTGAAAATTGGACTGTAACAATTACTACAAGCAGTAACTATTCAGGATCTATTACCGAGACCTACACAATATCTTCGGTTATCACCAATAATCCTGTATTTGGAAATTCTGGCACAATCACAGGTGCAATTTCAAGTACAATTGTTACAATCAATCAGGTTCCGCATCCAGTTTTATTAGGACCAGGTTCATTAACGACTGCTGCTGCAGGTCAACTTTATTCTGCAGTTTTCTTAACTGTTTCTGGAACTACCACAACTGAACCAAATGATCCTTATTTCTGGGGAACGGCATCCAACACAATTTATGTTGATGCAAATGGCCATGAATATAATTTCCCTTACGGAAGTTGGTTGGCTGTTGGAGGTGGGGTAACTCAAAGAGGAATTGGTGGTATTGGAACTGGTTCAGATTATACTACAATTTTAGATTGGGCACCTACAAATACAATAACTCAAACCACCCTTTCCTACTTAGCTATAAATACTTTTGGATGTAATTATATGGTTACTAAAACCATTACTGTATATCCTGCACCTACAGCTAGTTTGACTAATGGAGATATCATTTGTGCGGGTGGTGAAGCAAATATCGAAGTAAGTTTAACAGGAACAGGATCAACAACAATTACTTTAAATGATGGTACTACTAAAACTTTTGATTTAGGTACATCTACCTCTACTATAACAAGATTAACTGGAACAATCACAGTTAAGCCAAATACAACTACAGCTTATTCGATCGCTAAGATTGAAGATGAATACGGAGTAGGAACAGTGAGTGGAACAGTTACAGTTACTGTAAAAGTTCCAGCTACTATTACATCTCAACCTGCTTCAGTAACAATCAACGAGGGTGCTGTTGCAACATTAACTGCAACGGTTTCTGGTTCTTCTCCTTATACATATCAATGGTATAAAAATGGCGTTGCAACGATAAGTGAAACTACCTCATCAAATACTACAACATTAACAACTACAACTGCTGGAACATTTTATGTTACTGCAACAGCTAGTGGTACATGTACTCCTGCTGCAGCTTCAAGTAATGCTTCAGTGGTAGTAAACCCAAGACCACAAGGAAGCTTGAGTGGAAATATTATTCAAACAGGTGCTACAGGTCAGTTAACGTTTAATTCAAGTGTTGGAACTGGACCATTCGCCATTGTCTATAATATTGGCTCAACTAATGTTACAGTTTCACCAGTAACAAGTGGTGCAGCATTTAATGTATTAAATGGTACGCCTACAAGCACAACCTCATACACATTAATCAGTGTAACTGATATTGCAACTAATAGTTCAAGAACAGCTAGCTTCACAACAGCTACTGGCACAATTACAGTGTTTGCAAAACCAACGGCGACGTTAACTGGAAGTACAACTTTATGTGAGGGTGGAACAACTTCCTTGAATTTGGCTTTAACAGGTAATAATACAGTATCTATCACTGTTACATTGAACGAGGGAACTTATAAAACATTTGCTCCTGGAACTACAAGTGGAACAATAGATGTAACACCATCAGGTGCTGCAGGAACTACTGCTACTTATACTATAGCAAGAGTTAACGATCAATATGGTGATGGAACATTTAGTGGTACAGTAACACTAACAATTTTACCAAAAGTATTCATTACTGCACAACCTTTATCAGTTAATATAAATGAAGGAGAATCAGCTACATTAACTGTAACTGCAAGCAATGTCTCTGTATATCAGTGGTATAGAAATAGTAATATTGCGACAGGCGCATCTAATAATGCTTCATATATTACTACGAATGATTTATCAGCAGCTGGAACATATTATGTAACTGTTTCTAACACATGCAGCAGAGATATTTCAAGTATTGTAGCTGTAACAGTAAACCCAAGACCAGTGGGTACGTTTACTGGTAATACGATCCAAGCGGGTGGAACAGGACAATTAACATATGTTTCAACAAAAGGAACTTCTCCATATACTATTAACTATTCAGTAGTAGGTGGACCTTCAGGTTCAGTAACTGCCGTAAGTGGAACTCCATTTAATATTGGAACAATCACTCAAACAGGATCAGTTTCAGTAACTGTTACAAGCATTACTGATGCATTAGGTGCAGTTATGAATACACCAGTTACTTCTACGATTACAGTGTTTGCAAAACCAACGGCCACGTTGAGTGGAGATCAAACGATCTGTGAGGGAACGACGACGAATTTGAATTTAGCATTAGGAGGAAATCTTACAGCATCTATAACAGTGACGTTGAGTGATGGAACAGTGAAGACATTTGCTGCGGGCACTACAAGTGGAACGATAGCGGTGACACCAGCTAGTTTAGGTGGTGGATCTACAACATATACGATAGCGAGTGTGAGTGATACATATGGTACAGGTACAGTAAGTGGATCAGCGACGGTAGCGATTTATGCGCCGGCTACGATCACAGTACAACCTGTATCAACAGTAACGATTATAGAAGGAACGACAACTACATTAAGTGTAACAGGAACGGGTCAACCATCATTAGGATTGAGTGGTAACACGATCCAAGCGGGTGCGACTGGACAGTTAACGTATACATCTACAACAGGAGCTGGACCGTTCACATTGGTATACAATGCTGGATCAGGTAATGTAACGGTAAGTAATGTAACAAGTGCAGTAGGATTTAATGTAACAACAGGAACACCAACGAGCACGACTACGTATACCTTAGTAAGCGTAACGGATCAAGTAACTACAAGTTCAAGAACTACAGGCTTCACGACAATGACAGGCACGATTACAGTGTTTGCAAAACCAACGGCATTATTAAGTGTTGGTACTCCAAACATCTGTGATAAAGGGACAGCTACGTTGAACTTAACAACGACTGGTAATGGAACAATTACAGTGACATTGAATGATGGAACAGTAGTAAGTACAGCATCAGGCACAACAACAATCAGTGTAACACCATCTACGAATACAACGTATACGATAGCGAGTGTGAGCGATACATATGGTACGGGTACAGTAAGTGGATCAGCGACGGTAGCGATTTATGCGCCGGCTACGATCACAGTACAACCTGTATCAACAGTAACGATTATAGAAGGAACGACAACTACATTAAGTGTAACAGGAACGGGTCAACCATCATTAGGATAA
PROTEIN sequence
Length: 1654
ISAMPTENWSFTLTSTVTAGTITTVTGTGTMSWTATFTLSNTSTATATTHIIGIGTMSSTLDIVNAFNNPKGGTITTTVKIYSLPRAEINAPLPSQYIYTTYNAGVYEAPITITGTITSVSGESWSLQIKNNGSTITTVTGNAGTASWTATFTLTSTTSTQTINNISLGTLTSTVGILGATQNGNATTGTTTTTIYVNGLPKANISTLSNTITAYEGQNITITGTLTLIPGESWKITLLDQTTGNTITPTSSVLFGTAVTSNVTWTATFTLTSSTTATQTAHNIVIGTVSTTLGINNQINDGTVTNTVIVLNDLPQATISTLSNTIAVYEGQNITITGTITTIPGEAWSITLRSDKVGTITTITGPAGGGNISWTSTFNLTSTTSTQTIHNISINTLSSTLTVLNGVNNVTPTPTIAVGVNAIPKIDISPLQANQYSAVGAVSNVTITGTITGIQGETYAIQLIDQAAGVTRTLTTVSSTITVSNTNTWSYSATLTSTADATTTSHTISIGTITTTFRGSSIPVTATNTTNPNATVTNTTININGAPLATLSAATLTICSNDDGSWPLTISGTISTATPTAYTIVLRNSRTFAATTITGTTTTGIGGTFENWTVTITTSSNYSGSITETYTISSVITNNPVFGNSGTITGAISSTIVTINQVPHPVLLGPGSLTTAAAGQLYSAVFLTVSGTTTTEPNDPYFWGTASNTIYVDANGHEYNFPYGSWLAVGGGVTQRGIGGIGTGSDYTTILDWAPTNTITQTTLSYLAINTFGCNYMVTKTITVYPAPTASLTNGDIICAGGEANIEVSLTGTGSTTITLNDGTTKTFDLGTSTSTITRLTGTITVKPNTTTAYSIAKIEDEYGVGTVSGTVTVTVKVPATITSQPASVTINEGAVATLTATVSGSSPYTYQWYKNGVATISETTSSNTTTLTTTTAGTFYVTATASGTCTPAAASSNASVVVNPRPQGSLSGNIIQTGATGQLTFNSSVGTGPFAIVYNIGSTNVTVSPVTSGAAFNVLNGTPTSTTSYTLISVTDIATNSSRTASFTTATGTITVFAKPTATLTGSTTLCEGGTTSLNLALTGNNTVSITVTLNEGTYKTFAPGTTSGTIDVTPSGAAGTTATYTIARVNDQYGDGTFSGTVTLTILPKVFITAQPLSVNINEGESATLTVTASNVSVYQWYRNSNIATGASNNASYITTNDLSAAGTYYVTVSNTCSRDISSIVAVTVNPRPVGTFTGNTIQAGGTGQLTYVSTKGTSPYTINYSVVGGPSGSVTAVSGTPFNIGTITQTGSVSVTVTSITDALGAVMNTPVTSTITVFAKPTATLSGDQTICEGTTTNLNLALGGNLTASITVTLSDGTVKTFAAGTTSGTIAVTPASLGGGSTTYTIASVSDTYGTGTVSGSATVAIYAPATITVQPVSTVTIIEGTTTTLSVTGTGQPSLGLSGNTIQAGATGQLTYTSTTGAGPFTLVYNAGSGNVTVSNVTSAVGFNVTTGTPTSTTTYTLVSVTDQVTTSSRTTGFTTMTGTITVFAKPTALLSVGTPNICDKGTATLNLTTTGNGTITVTLNDGTVVSTASGTTTISVTPSTNTTYTIASVSDTYGTGTVSGSATVAIYAPATITVQPVSTVTIIEGTTTTLSVTGTGQPSLG*