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RTP_09252017_15_scaffold_24_2

Organism: RTP_09252017_15_Sphingobacteria_36_17

near complete RP 50 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 12 / 38
Location: 4996..8655

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Conserved repeat domain protein n=1 Tax=Pedobacter heparinus (strain ATCC 13125 / DSM 2366 / NCIB 9290) RepID=C6Y085_PEDHD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 28.0
  • Coverage: 1170.0
  • Bit_score: 290
  • Evalue 5.70e-75
Conserved repeat domain protein {ECO:0000313|EMBL:ACU04797.1}; TaxID=485917 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Sphingobacteriaceae; Pedobacter.;" source="Pedobacter heparinus (strain ATCC 13125 / DSM 2366 / NCIB 9290).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 28.0
  • Coverage: 1170.0
  • Bit_score: 290
  • Evalue 8.00e-75
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.6
  • Coverage: 1230.0
  • Bit_score: 276
  • Evalue 1.90e-71

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Pedobacter heparinus → Pedobacter → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3660
TTGAATGGTAACACGATCCAAGCGGGTGCGACTGGACAATTAACGTATACATCTACAACAGGAGCTGGACCGTTCACATTAGTATATAATGCTGGAGCGGGTGATGTAACTGTAAATAATGTAACAAGTGGCCTACCATTTAATGTAAATGCAGGAACACCAACAAGCACGACTACATATACATTAGTAAGTGTAATGGATCAAGTAACTAATAGTTCAAGAACTACAAGCTTTACAACATCAACAGCAACTATTACGGTATTTGCTAAACCAACAGCAACGTTGAGTGGTACACCAAGTATTTGTGATAAGTCAACTGCTACATTGAATGTTGCTTTAACAGGCAATGCTACAGCATCAATCACAGTGACGTTAAATGACGGAACAGTGAAGACATTTGCTGCAGGCACATCAAGTGGTACTTTCAGTGTAACACCAGCTACGAACACAACGTATACAATAGCGAGTGTGACAGATGCTTATGGAATTGGTACTTCAACAGGAAGTGCTACTGTAACAATCTACGCACCAGCAACAATTACAGTACAACCAGTAACTTCAGTAACGATCAATGAAGGAACAACAACTACATTGAGCGTAACTGTAACAGGTGAACCAACTGTTAGATACCAATGGTATAAAAATGGCGGTGTGTTAGGCGGATCTAATAGTTCTGCTTACACTACTACTAGTGAGACAACAGCAACAGGTATCTACTATGTAACTGTAAGTACAACATGTAATGTGGTAAGCTCTGAATCTATTGTAGTCAATGTGATTCCAAGACCACAAGGTCGTTTGAGAGGCGGTACTATACAAGCAGGTGCAACTGGTCAATTAACATATATTTCTAGTAATGCAACTGGACCGTTCACGATCGTGTACAATCCAGGAAGCGTAACAGTAACGAACGTAATTAGTGGTATACCATTTAATGTAAATACTGGAACACCAACAGGTACAACAACCTACACGTTAGTAAGTGTGATGGACGAAGTAACAACTAGCTCAAGAACGACAGGCTTCGCTACATCAACAGCAACGATCACCGTATTTGCTAAGCCAACAGCGGAGTTGAGTGGAAGTCAAACGATCTGTGAGGGAACTACAGCGACGTTGAGTTTAACATTAGGAGGAAATCTTACAGCATCAACGACAGTGACATTGAGTGATGGAACAGTGAAGACCTTTAATGCTGGAGCTACAAGTGGAACGATAGTGGTATCGCCAGCTAGTTTAGGTGGTGGATCTACAACATATACGATAGCGAGTGTGAGCGATTTATATGGTACTGGTAATGTTACTGGAACCGTGACTGTCTCTATATTTGCACCAGCTACGATCACTGTACAACCAGTATCAGCTGCTGTAATATGTGCTGGGTCATCTACAACATTAGATGTAACAGCAACAGGTGCAGGTATCACGTACCAATGGTATAATAAGAAAAATGGCATTATCGCTGGTGAAACAAATAGAACTATAACTGTAACTACTGCAGGCGATTACTATGTAATTGTAACAGGAACATGTAATGCAGTAACAAGTGCACAAACTTCAGTAACAGTCAATCAATTACCACAAGGTACATTGTCTGCAAACACAATATGTGTAGGTGGAACTGGTCAATTAACATATAGATCAAGTGTTGCAGGAACTGGACCATACACTATTGTTTACTCTGATGGAACTACAAGCTACACAGTTAGTAGAGTGGTAAGTGCTGTTCCATTTGATGTATCAGTGAACCCAACTGCAACAACTACTTACAGAATAATTAGTGTAACTGATGCAAGTGGATGTATTAGATCTGTAGACTTTACAACAGTAAGCGCTGTGATAACAGTCAATAACTTACCAGCTATCACTAGCCAGCCAGTAAGTGTAACCAATAGTGCAGGTACTTCAACTACATTTGAAGTTGCTGCAACTGGAACTGCGTTAACATACCAATGGCAATTAAGTGTGGATGGTGGCACTAGCTTCGTAGACTTATTAAACAATGTTTACTATGCAGGAGCTACTAGCAACAAGTTAACTGTGTCTAACATTGCATTAAGAATGAATGGAATCAGATATAGAGTTAAAGTATCTGGAACATGTAATCCTTTTGTAATGAGTGATGCCGCATTATTAACAGTTATTAATCCTTTAGCATCATTTAGTGTAAACACAAGTGAGCAATGTATCGCTGGAAATAGCTTTGTATTCACAAATACAAGTGCTACCAATGCAGGTATCTTAAGCTACAGCTGGACATTTGGTGATAGTGTTGGAAAGGCAACTACAAAAGCGCCATCATATACCTATACGAAAGCTGGACGCTACACCGTTAAATTGGTGGTAGTAACCAATACAGGTGATAGCGATAGTACTACTGCAGTAGTAGTAGTATACCCTAAACCAGTACCTGCGTTTGCGGTGAATAAAAATGCACAATGTTTATCTGGAAATAGCTTTGTATTCACTAATGAAACATCTATTGATAAATCACCATTAATCTTTGATTACAAGTGGAACTTTGGTGATAGCACTCAATCATCAGATATTAATCCAATCAAAACTTATAAAGCTAGCGGAGACTTCGTTGTTACTTTAAAAGTTACAAGCTTCTATGGTTGTGTGGACAGTGTTAAACAAACAATCACTGTTAACCCAATGCCAACAGTAGCAGTAAGCGCTCCTAAAGGCACTATAATTTGTGATGGATTAACATTAGACTTAACAGCAACAGGTGGAGTAAGCTACTTATGGTATAAAGATGGTGTATTAATCAATGGAGCAACTGCAGCAACCTATGCTTCAACAACTCCTGGTAACTATAGTGTGAAAGCTGTTAACTCATTTGGTTGCGTATCATTGAGTGAGGCTAAGATAACGACTACAATGTTAACTAAGCCTAAGGCAGAATTTAGCTTCAATACTTTCTGTACTCAAGTACCTGTAACATTCACAAACTTATCTACAACAAGCAATGCAGGTGCAGTGACTTATGCTTGGAGAGATAATCTTGGAAATACAAGTGCAGCTACATCACCAGTATTTACTTACAATAGTGTTGGATCTGTAAGTATGAAGTTAGTAGTAACATCTACTTATTGTCCAAACTTAAAAGATAGTATCACTAAAGTATTAGCTATTGAAAGTCCTATACCTGGTAAGCGTTTACCATTAGTAGATGGAGTAAATGGGGATGAAACTAAACTTCAAGCAAGAGTATTCGCAAATAGCAAATACACTTGGAGTCCAGCAACAGGATTATCTGATATTACAATTAGTAATCCAATCACCAAACTATCTGCTGAACAACAGTATACGATCTCAATGTTAGCTCCTTCAGGATGTACAACAGTGGATACATTGTTAGTGAGAATATTCAAAGACTTCACAGTATTTATTCCAAATGTATTCTCACCAAATGGAGATGGACAGAACGATAAGCTTTATGCAAATCTCGTTGGTGTTAAAGAATTCAAAATATATAGAATCTTTAATAGAGCTGGACAAAAAGTATTTGAAACCACAAATCCTGCAGAAGGATGGGATGGAACTGTGAATGGTGTTCCACAAGCTTTAGATACTTACGTATGGATGGTTGAAGCAGTAAGTAAATACGGCGCACCAATTAGAGAAAACGGCTTAGTAACACTACTTAGATAA
PROTEIN sequence
Length: 1220
LNGNTIQAGATGQLTYTSTTGAGPFTLVYNAGAGDVTVNNVTSGLPFNVNAGTPTSTTTYTLVSVMDQVTNSSRTTSFTTSTATITVFAKPTATLSGTPSICDKSTATLNVALTGNATASITVTLNDGTVKTFAAGTSSGTFSVTPATNTTYTIASVTDAYGIGTSTGSATVTIYAPATITVQPVTSVTINEGTTTTLSVTVTGEPTVRYQWYKNGGVLGGSNSSAYTTTSETTATGIYYVTVSTTCNVVSSESIVVNVIPRPQGRLRGGTIQAGATGQLTYISSNATGPFTIVYNPGSVTVTNVISGIPFNVNTGTPTGTTTYTLVSVMDEVTTSSRTTGFATSTATITVFAKPTAELSGSQTICEGTTATLSLTLGGNLTASTTVTLSDGTVKTFNAGATSGTIVVSPASLGGGSTTYTIASVSDLYGTGNVTGTVTVSIFAPATITVQPVSAAVICAGSSTTLDVTATGAGITYQWYNKKNGIIAGETNRTITVTTAGDYYVIVTGTCNAVTSAQTSVTVNQLPQGTLSANTICVGGTGQLTYRSSVAGTGPYTIVYSDGTTSYTVSRVVSAVPFDVSVNPTATTTYRIISVTDASGCIRSVDFTTVSAVITVNNLPAITSQPVSVTNSAGTSTTFEVAATGTALTYQWQLSVDGGTSFVDLLNNVYYAGATSNKLTVSNIALRMNGIRYRVKVSGTCNPFVMSDAALLTVINPLASFSVNTSEQCIAGNSFVFTNTSATNAGILSYSWTFGDSVGKATTKAPSYTYTKAGRYTVKLVVVTNTGDSDSTTAVVVVYPKPVPAFAVNKNAQCLSGNSFVFTNETSIDKSPLIFDYKWNFGDSTQSSDINPIKTYKASGDFVVTLKVTSFYGCVDSVKQTITVNPMPTVAVSAPKGTIICDGLTLDLTATGGVSYLWYKDGVLINGATAATYASTTPGNYSVKAVNSFGCVSLSEAKITTTMLTKPKAEFSFNTFCTQVPVTFTNLSTTSNAGAVTYAWRDNLGNTSAATSPVFTYNSVGSVSMKLVVTSTYCPNLKDSITKVLAIESPIPGKRLPLVDGVNGDETKLQARVFANSKYTWSPATGLSDITISNPITKLSAEQQYTISMLAPSGCTTVDTLLVRIFKDFTVFIPNVFSPNGDGQNDKLYANLVGVKEFKIYRIFNRAGQKVFETTNPAEGWDGTVNGVPQALDTYVWMVEAVSKYGAPIRENGLVTLLR*