ggKbase home page

RTP_09252017_15_scaffold_24_49

Organism: RTP_09252017_15_Sphingobacteria_36_17

near complete RP 50 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 12 / 38
Location: 58384..61122

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
hypothetical protein n=1 Tax=Segetibacter koreensis RepID=UPI0003688C8F similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 63.6
  • Coverage: 889.0
  • Bit_score: 1168
  • Evalue 0.0
surface antigen (D15) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 57.9
  • Coverage: 916.0
  • Bit_score: 1067
  • Evalue 0.0
Tax=RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 68.8
  • Coverage: 912.0
  • Bit_score: 1333
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYD2_FULL_Sphingobacteria_35_12_curated → Sphingobacteria → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2739
ATGCAGAAATTGACCCAGTTTACTATAGGAATTCTATTCTTACTTATCTTATCCACCTCGAGTTTTGCCCAAGATCAAAAAGGGCAGGATTCAGTTAGCCAGATCAATGTTAAGTTGCTGGGGATCTTAAATCAAAAAACACCTACTAAGTACAAGATTCGTGCTATTAAAGTTGTAGGTAACCAATTCTTTGACGAAAACTTATTATTATCCTTATCCACTCTGAACGAGGGGGATGAAGTAGCCTTGCCAGGGGGAGATAATTTTGCCAAAGCCATTCGAAAATTAATGGATCAAAATTATTTCAGTGATGTAAGTGTTTACTTGACCGATGTAAAAGGGACTGAAATTGATGTTGAAATCAATGTGGTGGAAAGACCAAGATTAGCTCGATTTAATTTTACGGGTATTAAAAAATCAGAGACAGAGGAACTTTCTGGCAAAACAGGATTGACGCCTAATAGAGTTGTGACTGATAACATGCGTATCACTGCAATCGAAGGTATTAAAAAATTCTACGCAGAAAAAGGTTTTCAAGACGCGAGTGTTCGTATCAAAGAAACAAAAGATTCAGTTCGTAAAAATCAATTGGTGCTTGATTTTATCGTAACCAAAGGACCCAAAGTTAGAATCAATAATATCAATTTTGGTGGCAACCTAATTGAAGAAACTAAATTAAAGAAAAGTTTAAAGGAGATCCATGAAAAATCTCGCTTAACCTTATTCCCAGTGAATGACAAGCCTGCCATTGTAAAAACCTCGCCCTATACTTTTGAACAATATTTAAAAGAGCGTGGGTACTTAACTTTTTCAAAGACTAGAAAAATATTAAACCCTTACGCAAGAATCGGTTTCTCTTCTTCAAAGTATGATATCAAAAAATACGATGAGAGTAAGGATAATTTATTGAATTACTATAATTCTTTAGGCTTTAGAGATGCAGTGATTGAAAAAGATACCATCTATCATAATGCTGTGGGGCATTTAAATATCGATATGCAAATCAAAGAAGGACGTAAGTATTTCTTTGGTAATATTAGTTGGAGAGGCAATACAAAATATCCTGATTCCATCTTAGCAAGTATTTTGAACATTAAAAAAGGAGATATTTATAATAGGGAAACTTTCTTTAATAAATTGGGTAAAACACCTACAGCTGAAGGGGGAGACATTAGTGGTATTTACCAAGATGATGGTTATTTATTCTTTAGTATCAACCCAATTGAGACTGCCGTATACAATGACACCATCGATTTTGAAGTAAGAATACAAGAAGGTCCTCAAGCAACTATTAAAACTATTCGTATTGCAGGTAATGAGAAGACGAAAGATTTTGTTGTACGTAGAGAAATCAGAACAGTGCCAGGTGATAAATTTAGCCGTACATTATTAATTCGTTCTCAACGTGAGATTTCACAATTAAATTATTTTGACCAAGAGAAAATAAAAATTGATCCTATTCCTAATCCTGAAGATGGAACCGTTGACATCAATTACGGTGTAGAAGAAAAATCAAGTGATCAATTAGAATTAAGTGCTGGATGGGGTGGTTATATTGGATTGACGGGTACTTTAGGTGTGACTTTTAATAATTTTTCTTCAAAAAATATTTTCAACAAGAAGGCCTGGGATCCATTGCCTATGGGTGATGGCCAAAAATTAAGTATCCGTTTTCAAAGTAATGGTAAAGCGTTTAGATCTACTAATTTCTCATTCACTGAGCCATGGTTTGGGGGCATCAAGCGCAATACTTTAACAGTAAGTGTATACAATACAAAATACGGACAAACTTTTGATCAACTAACAGGTTTATATGATCCAAACGCTGCAGATGCCAGGTACATTTCAACCACTGGTGCAACGGTTTCTTTTGGTCGTCAATTGGCTTGGCCAGATGACTTTTTCTCTTTAAGTATGGGATTAAACTATACGCGTTATACTTTAAAGAACTATGCGATTGATCCCTATAACTTGCCAAATTTTGATAATGGTATTGTGAATAATTTAAACTTTAGAATTGCTTTACAAAGAAGTTCGGTAGATCAACCATTGTTTCCAAGGGCGGGTTCTACTTTTTTGTTGAGTGGTCAGTTAACACCTCCTTATTCTTTATTCGATCCTAATTTTGGCACGAAGCAAAATCCATATGAATTGTTAGAATACCACAAATGGCGTTTTAATGGTGAATGGTATGTACCATTGGGTAAGCCAGCAGGAGAAGATCGTAACAAACAATTTGTGTTGAAATTTGCAGCTAAATATGGCTTCTTAGGAAGATACAATCAATCATTAACCGTTTCACCATTTGAAAGATTCCAGGTGGGTGATGCAGGTTTAAGTAATCAGTTTGCATTATTAGGATACGATATCATTGCACAGAGAGGTTATCCTGTATATGAATCCTCTAATCCAAAAATCAATCCTGATCAACAATCTTCAAGACAAAAATTCACTATTTTTAATAAGTATGCGGTTGAAATTAGATATCCTTTAAGCTTGGCAGCAAGCAGTACCATTTATGCATTGGGCTTTTTTGAAGCAGCCAATGGTTGGTACAGTATGAAGGAATATAATCCATTCAAATTGAGAAGATCAGTTGGGGTGGGTATGCGTTTCTTTCTACCGATGTTTGGTTTACTTGGTTTTGACTATGGTGTTGGTCTGGATCGTTTGGATGGTACTAATGCATTGAAAGATGCAGCTAGATTTACCTTTATGTTAGGATTTGAACCAGAATAA
PROTEIN sequence
Length: 913
MQKLTQFTIGILFLLILSTSSFAQDQKGQDSVSQINVKLLGILNQKTPTKYKIRAIKVVGNQFFDENLLLSLSTLNEGDEVALPGGDNFAKAIRKLMDQNYFSDVSVYLTDVKGTEIDVEINVVERPRLARFNFTGIKKSETEELSGKTGLTPNRVVTDNMRITAIEGIKKFYAEKGFQDASVRIKETKDSVRKNQLVLDFIVTKGPKVRINNINFGGNLIEETKLKKSLKEIHEKSRLTLFPVNDKPAIVKTSPYTFEQYLKERGYLTFSKTRKILNPYARIGFSSSKYDIKKYDESKDNLLNYYNSLGFRDAVIEKDTIYHNAVGHLNIDMQIKEGRKYFFGNISWRGNTKYPDSILASILNIKKGDIYNRETFFNKLGKTPTAEGGDISGIYQDDGYLFFSINPIETAVYNDTIDFEVRIQEGPQATIKTIRIAGNEKTKDFVVRREIRTVPGDKFSRTLLIRSQREISQLNYFDQEKIKIDPIPNPEDGTVDINYGVEEKSSDQLELSAGWGGYIGLTGTLGVTFNNFSSKNIFNKKAWDPLPMGDGQKLSIRFQSNGKAFRSTNFSFTEPWFGGIKRNTLTVSVYNTKYGQTFDQLTGLYDPNAADARYISTTGATVSFGRQLAWPDDFFSLSMGLNYTRYTLKNYAIDPYNLPNFDNGIVNNLNFRIALQRSSVDQPLFPRAGSTFLLSGQLTPPYSLFDPNFGTKQNPYELLEYHKWRFNGEWYVPLGKPAGEDRNKQFVLKFAAKYGFLGRYNQSLTVSPFERFQVGDAGLSNQFALLGYDIIAQRGYPVYESSNPKINPDQQSSRQKFTIFNKYAVEIRYPLSLAASSTIYALGFFEAANGWYSMKEYNPFKLRRSVGVGMRFFLPMFGLLGFDYGVGLDRLDGTNALKDAARFTFMLGFEPE*