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rifcsphigho2_01_scaffold_2479_28

Organism: RIFCSPHIGHO2_01_FULL_Archaea_Pacearchaeota_29_23

partial RP 25 / 55 MC: 3 BSCG 17 / 51 ASCG 23 / 38 MC: 3
Location: 22991..24715

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Probable translation initiation factor IF-2 n=1 Tax=Methanothermus fervidus (strain ATCC 43054 / DSM 2088 / JCM 10308 / V24 S) RepID=E3GY66_METFV similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 42.5
  • Coverage: 593.0
  • Bit_score: 455
  • Evalue 8.30e-125
translation initiation factor IF-2; K03243 translation initiation factor 5B Tax=CG_Pacearch_05 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 86.8
  • Coverage: 574.0
  • Bit_score: 1003
  • Evalue 1.50e-289
translation initiation factor eaif-5b similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 42.5
  • Coverage: 593.0
  • Bit_score: 455
  • Evalue 2.30e-125

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

CG_Pacearch_05 → Pacearchaeota → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 1725
ATGAAAATCAGACAACCAATCATAACTGTTGCAGGTCATGTTGATCATGGAAAAACAAGTATTTTAGATGCTCTTAGACGTAGTAGTATTGCAGAAAAAGAAGCAGGGAATATTACTCAAAAAATAAGTTTTACAGATTTTCCAGCTCAAAGTCTTAAAATGAAGTGCCCATTAATTGAAAAGTATGGGATTAAATTAGAAATCCCTGGTTTTTTATTTATTGATACTCCTGGACATGCAGCATTTAATAATTTGAGAAAAAGAGGAGGTAGTTTAGCTGATTTAGCTATTCTGGTTATTGATATAAATGAAGGTATTAAACCTCAGACAGCAGAAGTTATACAGATATTAAAAGCAAATAAAACTCCATTTATAGTTGCTCTTAATAAAGTTGATAAGGTTCAGGGTTGGCATAAAGTAAAAGAAGAGTTTAAAGATAATTACCAAGCGCAGCCACCACATGTTAGACAAGTATTTGACAAAAAATATTACACATTGGTAGGGGCATTACATGATTTTGGACTTAATGCAGAACTTTATCACAAAATAACTGACTTCTCTAAAAATTTAGTTGTTGTTCCATGTAGTGCAAAAACAGGAGAGGGAATTTCTGAAATACTAATGATGATATGTGGTTTATCCCAGAAATTTCTTAGAGAGCAATTAAAGCTTGGAGAAATTGCAAAAGGAGTTGTGCTTGAGATAAAAAAAGAAAAGACAATAAATTACATAGAAGCAATATTATATGATGGACATTTATTAACTGGACATGATATTGCAATTGCTAAATTTGATGGGTATTATACTTCTAAAATTAAATCTATCCAAGTAATTGAACCTTTATCATTTAAATTTAGAAATTGTGATAATGTAATAGCTGCAGCAGGGATAAGAATACAGCTTGCAGATAAATTAGATATTTTGCCTGGAATGCCCTTTATGTCCTACACTAATGAAAAAGAAGTTAAAGATTATTTTAAAAAAGATGTTGGAGAATCAATTAAGACTGATAAACAGGGAATAATTATAAAAGCTGATTCTTTGGGCAGTTTAGAAGCTTTAATGGTTCTTTTAAAACAGGCAAATGTTTCTGTTGTCAGGGTAGGAATAGGAAATATAAACAAATCTGATGTTCTTGTTGCTAAAGCTAATTTAGATATTAATCCTATTGACTCAGTTATACTTGGTTTTAATGTTGAAATTGATGATGATGTTATAGTTAAAGATAAAATCAAAGTAATTACAGATAAGGTTGTTTATAAATTAATAGAAAACTTACAGTTATTTAGAGAGGAAAAATCTAAGGAAATAGAAAAAGAGAGGTTAATGTCTATGTTCAAAGTTTGTAAAATTGAGATTTTACACAATTATGTTTTTAGAAATACAAGTCCTGCTATTTTTGGAGTAAGAGTGGTAGCTGGTAGATTAGTTAATGGTCAGGAATTTATTGATGATAATAATGAAAAAATTGGAAGGATAAAAAATATTCAGTCTGATAATAAGAGTGTTGAAGAAGCAACAGAAGGCATGGAAGTTGCTATATCTATACCAGGTGTTAATTTTGAGAGAAGGTTAAAAGACAAAAAGTATCTTTATTCTGATATTTCCTCTAAGCAATTTAAAAGTTTTAAAGATAATAAAGATTTATTATCAAATTCTGAACTTAATGCTTTGCAAGAGATAAAAATTATTAAACAAAAAAATGATTATGTCTGGGGAGGATAA
PROTEIN sequence
Length: 575
MKIRQPIITVAGHVDHGKTSILDALRRSSIAEKEAGNITQKISFTDFPAQSLKMKCPLIEKYGIKLEIPGFLFIDTPGHAAFNNLRKRGGSLADLAILVIDINEGIKPQTAEVIQILKANKTPFIVALNKVDKVQGWHKVKEEFKDNYQAQPPHVRQVFDKKYYTLVGALHDFGLNAELYHKITDFSKNLVVVPCSAKTGEGISEILMMICGLSQKFLREQLKLGEIAKGVVLEIKKEKTINYIEAILYDGHLLTGHDIAIAKFDGYYTSKIKSIQVIEPLSFKFRNCDNVIAAAGIRIQLADKLDILPGMPFMSYTNEKEVKDYFKKDVGESIKTDKQGIIIKADSLGSLEALMVLLKQANVSVVRVGIGNINKSDVLVAKANLDINPIDSVILGFNVEIDDDVIVKDKIKVITDKVVYKLIENLQLFREEKSKEIEKERLMSMFKVCKIEILHNYVFRNTSPAIFGVRVVAGRLVNGQEFIDDNNEKIGRIKNIQSDNKSVEEATEGMEVAISIPGVNFERRLKDKKYLYSDISSKQFKSFKDNKDLLSNSELNALQEIKIIKQKNDYVWGG*