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SCNpilot_cont_500_bf_scaffold_100_201

Organism: SCNpilot_BF_INOC_Flavobacteriia_40_10

near complete RP 52 / 55 MC: 3 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38 MC: 1
Location: comp(221367..223139)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Triosephosphate isomerase {ECO:0000313|EMBL:EDP71643.1}; EC=5.3.1.1 {ECO:0000313|EMBL:EDP71643.1};; TaxID=391603 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales.;" source="Flavobacteriales bacterium ALC-1.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 32.3
  • Coverage: 586.0
  • Bit_score: 247
  • Evalue 6.50e-62
Triosephosphate isomerase n=1 Tax=Flavobacteriales bacterium ALC-1 RepID=A8UHM4_9FLAO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 32.3
  • Coverage: 586.0
  • Bit_score: 247
  • Evalue 4.60e-62
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 29.2
  • Coverage: 572.0
  • Bit_score: 246
  • Evalue 2.50e-62

Lists

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Notes

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Taxonomy

Flavobacteriales bacterium ALC-1 → Flavobacteriales → Flavobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1773
ATGGAAAATAATTTTACACACAATATTAAAAAAAATGTGTTTTTAAGTTTATTCATATTTATAAGCATATTTACAAATTTCAGCATTAATCTTAAGGCACAATGTCCAAATATTGCAAGTTTGTATTTCGGCTCACAATCTAGTATCGATCAATTTATAATTAACCATCCAAATTGTAAGCAAATTGTAGGAGATGTTGAAATCAACGGAGACCAAATCACAAACTTGCAAGGTTTAAGAAACTTAGAAAAAATAGGAGGATCGTTAACAATCAGAAATACTAAAGTAAATAATGTTGATCCATTAAATAGCATTGTATCAATTGGTGCATCAAGACCATTTGGAGGATCAATAGATATTGAATATAATTCTGAGCTGCAAAATTTACAAGGTTTTAGCTCTGTTACTTCACTTTATGGACTAACAATTTCTGGAAACATTTTACTTCAGAATTTATATGGATTACAAAATATTGCAGATTTAAAATGGATAAGAATATTTTCTAATAACTTACTTGAGAACATTGATGATCTTTCAAAGACCGCGAGTCTTCTTGGGTTATATATTCATTCTAATAATTCATTGAAAAATATTGATGGACTTAGTAATGTTACATCAGTTGAACAGGATATCGAGTTTATTGCAAATCCGCTGCTTGCAAATCTAAACGGATTCGAAAATCTTACAAATATTAATGGAAATTTACATTTATATTCAAATGAATCTCTTTCCAATGTTGCAGGATTACACAATTTAACCCAAATAGGAAAGGATTTTCATTTCGTATCAAATAATGCAACACAAGATTTTAATGGACTTAATAATTTGAGCTCAATTGGTGGTTGGCTTTCGATATATGATAACAAATCACTAATAAGTTTAAATGGCTTAAATGCATTAACTTCAATAGGGTCTGCTTTGGAAGTTAGGGATAATTCTATATTACAAAATTTAAATGGTTTAAATAATCTTTCAAATGTTACAGCATACGTTCGTTTTGAAAATAATGAGCTATTAAATGATATAAGCTCACTTAAAAAGTTAACTACAATTGGAACAGGCCTTATTTTCTATAAAAACAACTCTTTGACAAATTTAAATGGACTGGAGGGATTAAATAATATTGGTGGAATATTAAGTGTTTTTGAGAATAATTCTTTAGAAAATGTTGATGGTCTTAAAAATCTCACAAGTATTACTGGCTTTCTAAATTTCAGAAAAAACCCACAACTCCTCAATTTGAATGGCTTGAGTAAACTTACTTCAATTGGTGGGTTTTTAAGAGTTGAAAACAACAGTTCCATCAATGATATTTCCGGACTGAAAAACATTAGTGAAAACACAATTACAGAAGATAACGGAATTGCTTTAACAATTAAAGATAACCCAAATGTTTCTATTTGTAATTTACCCAATTTCTGCAATTATCTCTCTCACCCTACAGATACACATATACGAGAAATTTCAGGTAATTCTGGAGCATGTTTTACTGAGCAAGATGTAAAAGATGCTTGTGCGGCTATGTCAACTACTGAGGTTTCAGACTCGACCATATCTATTGCACCAAATCCTGTAATTGATGAGTTAAATATTTTCTCAAAGAAAGTTATCGAAAGTATAGAGATTTTAAATGAGGCGGGGCAATTAATTAGAGCAGAAAAAGTAAAAAGTAGAATTTACAAATTAGATGTTCATTTACTTTCCCAAGGATTATACGTTGTTCGTGTAAAAACAGAATCTAATATTAAAAATTATAAAATTCTTAAAAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 591
MENNFTHNIKKNVFLSLFIFISIFTNFSINLKAQCPNIASLYFGSQSSIDQFIINHPNCKQIVGDVEINGDQITNLQGLRNLEKIGGSLTIRNTKVNNVDPLNSIVSIGASRPFGGSIDIEYNSELQNLQGFSSVTSLYGLTISGNILLQNLYGLQNIADLKWIRIFSNNLLENIDDLSKTASLLGLYIHSNNSLKNIDGLSNVTSVEQDIEFIANPLLANLNGFENLTNINGNLHLYSNESLSNVAGLHNLTQIGKDFHFVSNNATQDFNGLNNLSSIGGWLSIYDNKSLISLNGLNALTSIGSALEVRDNSILQNLNGLNNLSNVTAYVRFENNELLNDISSLKKLTTIGTGLIFYKNNSLTNLNGLEGLNNIGGILSVFENNSLENVDGLKNLTSITGFLNFRKNPQLLNLNGLSKLTSIGGFLRVENNSSINDISGLKNISENTITEDNGIALTIKDNPNVSICNLPNFCNYLSHPTDTHIREISGNSGACFTEQDVKDACAAMSTTEVSDSTISIAPNPVIDELNIFSKKVIESIEILNEAGQLIRAEKVKSRIYKLDVHLLSQGLYVVRVKTESNIKNYKILKK*