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P19_OD1_9_3

Organism: OD1_JGI_AAA255-P19

partial RP 29 / 55 BSCG 14 / 51 ASCG 0 / 38
Location: comp(3867..8051)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
srpA; platelet-binding glycoprotein Tax=RIFCSPHIGHO2_02_FULL_RIF_OD1_07_47_12_curated UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 33.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 555
  • Evalue 2.60e-154
similarity jgi
DB: COG
  • Identity: 51.61
  • Coverage: null
  • Bit_score: 38
  • Evalue 5.00e-03
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  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 0
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

R_RIF_OD1_07_47_12 → RIF-OD1-7 → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4185
atgtctagtataacaaaaaagattattgctgttattgctggtttgactttggctgcgacaatggcccctggtttagctcagggagatacagcgtctgatcttcaagctcaaattgataccttaatggctcaattgacaactctccaagctcaattgtctgctttagaaggcactactcccactgtgactggttgcactattacttcttttgaccgcaacctgaaactgggaatgactggagatgatgtcaaatgccttcaggttgtccttaattccgactcagctactcaagtggcttcatctggcgtaggttcttctggtaatgaaacttcctactttggtcctttgacccaaggaggagttgttaagttccaagagaaatatgccgctgattgtttagcctcctggggattaacttcaggaactggctttgttggttccaccaccagagctaagctaaacactcttttagttgctgctgagcaagaagaagaggaagaggaagaagaggaagaggaagaagaagaggaggaagaggaagttcctggtgccggtttaactgtttctttggctgctgatactccagcggctgctgtagtttccaatagcacggcttacaactccgtgttaaaggtaagcttggcggctggctcggaaggagaagatgcagaggttactggtttggttattaccaaagcaggtctaactgctaataccaatatcgctggtattgcggtttttgacgctgatggtgttcgccacggtaatttcgttagctctctaagtgctgacaatacggctagtttagtctttactacaaacccaattattgtagctgctggaacaactgcctcagttactgttaaagtaaacactgctgctgcagctgttaccgggacaatgaaatttagcgttgccgcggcagctgatattaccactacctctgaagtttcgggaaccttcccgattgcaggtagtgttttcagcttgaccaccggtgctaatatagctacagttacggttactcttcagactcccggtgcctctacggctgacgtgggagccactggtcacttagccaccaagttccgaattacggaaactggcggtaatgaggatgctaacgttagccaattagttttgtacaacaatggcaatgctaacgacgctgattatggcaatcttatcttgactgatcctagtggcaacactattgccacggctaccgcagctgttgacaagtatgttaccttcactcttgacccggcctacactgttgaaagaggaacttccaaggatttaagcattaagcttgatgttcttggaggaagtagtaataccattgacctcaggttgatggagtcctacgacttagtggccgaaggagccacctctggttatggaattttgactggttcaactttgccaacggcggctgctaccaaccgggtaactattaacgcagggacagtgactgtttccaaatcagttgattcccgaagcggtaaaattgcccaaggaggtaaagatgttgttctggctaagtttgacgttaaggcctttggtgaggactttgagttaagaagcttctactactgtgttcagaatgtgaccactgccttaaccggcactttgacagttcaggattcagccggcactattctttatagtgtggctggaggcagcgccaattataagacaagcgctcctactggtgctacggccggtgattggaccaagattactttatccaattaccaaactattgaagctggcactactgaaaccttatcctttgttggtgacgtttcttctgcagctcttaacaccgacacttaccaggtctacatcactgagctttacggcaagagattatctaccaaggactactacactgcttctgacaccactagttttggttttaatgtcagtgctccggccaacagcttaaccgttgaggcggttgtcctagctttagctataaatgcttcggttcctgcccaaactattgttgggggagccactgaagctaagattggctctttcgtcttgcaggcaactgcagtggaaaacgtcaatattaccagcttggcccttaccttaactggatcgggcgctgccagtgcatttaacggaggcccttacactaacgttcagctaaagaccggtgacacccttttgggttcagctattgctagcccagctactaccgtagctaacacggttagcatggctttagctgtcccagctggtggtcagaaagtgattgatgtttacgctagcgttggcactactaccggaactgatgctaccttgaccaaaatagcgactattgccgctaccggcgctgaatctggagctacggtaacttcaccagctttccagaatgggcaaaccgtggtggtttcttccggcggaagcttaactctggaagttgatacgacaaatactccaattaaggcagttttgcctgctggttctttgtctaacaaaatcttccaatttaaggcttcagctgatggagttgaaactttaaccctggacaagctttacgtcggggttaaggagtacacctatcctgccagtgtgattaccgcttctactggtaacattactaatgttaccttgaagaagtcagatggtacggttttagctggtccggctgacccggttaatggccaggttggctttgctggtttagctttgtccatatctaaaggagtatctgctggtctagtagttgagttggacgtcaattccaccactgctatgactcaaggagctaaggtttttgcctctccggtttatgctgaatataccggaacaggcggagtaaccacccaatacggtggtgtttacacctcctataccgttgctgccccaggtgtctttactgtctataacattggacaatttgccactagcacagcgctagctcctgtacctgttagagttgacgccaatggtgatggtgactttgttgataccgtcaatggttttactgaaaccaccacctactacacctgcgttggtgctggtagcaccttgactttagctactgacaatgcttgtatttctcctgtaaccgcaagcggcggtggaactgttccaggatggattgttccagtaagagccgcggctggtactgttccagctcaggttgcttttgctagcaaccggatgctgctccatgacgttgagccagtcattaccttaaatgctggttcattaagcggaacacaatcaccgcagtctggtcaggatattgccaagtttgacgttaaagcagacggtcagagacctttactggtcaaagccatttcttggagtaccagtggttcttatgacgctgcttcagctcatactggtaccttaaccggcaccgctggcacagtagcctttactgctatccctggatttgaagacacctacactgttactaccgcagcccctggaacttccggtattaaagtgactgttactagtggctctactactttagagacatttgataacaccactgataccacagctggtgttgtagctgcgatgaatggcgtcagtgaatacgttaccgctgttgctggtacgggtggtgcaattggtataggtaaaactgttaccttagccgctgctgccaacaatggtggcatctacgactggaaagttcagattaatgacgttgatcagacaggtacgctctatgcccagtatggcaccacagctgttgataccttctttttggtatcagcttctggcctcagaactaattcaggaaccaatttgacctttgtcttcaccacaccggttgagatttctgctgccggaacggttactttcgaagttaattgtaatacttcagcagttagagctggtactggtacacagaccagaacagctggagttttcattgaaggtaccaaaggtgatggtcaatggttaggtggtcttgctgatcaagtagcagctactacccttggtggtctaagatgggattacattaacttagctgccacgtacggtgctactggaacagtcacggctggtacacttcttgctactaccagcggcggtgtcgctggtcgagccatttgtcttgattctgacaatggtggcgctggagcagacgctgtgatagatatctctgattcctaccgaattaacggcaacactctaagctactaa
PROTEIN sequence
Length: 1395
MSSITKKIIAVIAGLTLAATMAPGLAQGDTASDLQAQIDTLMAQLTTLQAQLSALEGTTPTVTGCTITSFDRNLKLGMTGDDVKCLQVVLNSDSATQVASSGVGSSGNETSYFGPLTQGGVVKFQEKYAADCLASWGLTSGTGFVGSTTRAKLNTLLVAAEQEEEEEEEEEEEEEEEEEEVPGAGLTVSLAADTPAAAVVSNSTAYNSVLKVSLAAGSEGEDAEVTGLVITKAGLTANTNIAGIAVFDADGVRHGNFVSSLSADNTASLVFTTNPIIVAAGTTASVTVKVNTAAAAVTGTMKFSVAAAADITTTSEVSGTFPIAGSVFSLTTGANIATVTVTLQTPGASTADVGATGHLATKFRITETGGNEDANVSQLVLYNNGNANDADYGNLILTDPSGNTIATATAAVDKYVTFTLDPAYTVERGTSKDLSIKLDVLGGSSNTIDLRLMESYDLVAEGATSGYGILTGSTLPTAAATNRVTINAGTVTVSKSVDSRSGKIAQGGKDVVLAKFDVKAFGEDFELRSFYYCVQNVTTALTGTLTVQDSAGTILYSVAGGSANYKTSAPTGATAGDWTKITLSNYQTIEAGTTETLSFVGDVSSAALNTDTYQVYITELYGKRLSTKDYYTASDTTSFGFNVSAPANSLTVEAVVLALAINASVPAQTIVGGATEAKIGSFVLQATAVENVNITSLALTLTGSGAASAFNGGPYTNVQLKTGDTLLGSAIASPATTVANTVSMALAVPAGGQKVIDVYASVGTTTGTDATLTKIATIAATGAESGATVTSPAFQNGQTVVVSSGGSLTLEVDTTNTPIKAVLPAGSLSNKIFQFKASADGVETLTLDKLYVGVKEYTYPASVITASTGNITNVTLKKSDGTVLAGPADPVNGQVGFAGLALSISKGVSAGLVVELDVNSTTAMTQGAKVFASPVYAEYTGTGGVTTQYGGVYTSYTVAAPGVFTVYNIGQFATSTALAPVPVRVDANGDGDFVDTVNGFTETTTYYTCVGAGSTLTLATDNACISPVTASGGGTVPGWIVPVRAAAGTVPAQVAFASNRMLLHDVEPVITLNAGSLSGTQSPQSGQDIAKFDVKADGQRPLLVKAISWSTSGSYDAASAHTGTLTGTAGTVAFTAIPGFEDTYTVTTAAPGTSGIKVTVTSGSTTLETFDNTTDTTAGVVAAMNGVSEYVTAVAGTGGAIGIGKTVTLAAAANNGGIYDWKVQINDVDQTGTLYAQYGTTAVDTFFLVSASGLRTNSGTNLTFVFTTPVEISAAGTVTFEVNCNTSAVRAGTGTQTRTAGVFIEGTKGDGQWLGGLADQVAATTLGGLRWDYINLAATYGATGTVTAGTLLATTSGGVAGRAICLDSDNGGAGADAVIDISDSYRINGNTLSY*