ggKbase home page

OR1_SR1_2_23

Organism: SR1_OR1

partial RP 41 / 55 MC: 1 BSCG 22 / 51 ASCG 0 / 38
Location: comp(30977..35812)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
similarity jgi
DB: COG
  • Identity: 14.5
  • Coverage: null
  • Bit_score: 41
  • Evalue 6.00e-04
similarity jgi
DB: jgi
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 0
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Sequences

DNA sequence
Length: 4836
atgagtaatccagaaactaaaaatattcagacggctgataagattaaagaaggtctgtatggtacagatattgttgatgatcaggctgttgctgaactcaataaatttgtcttggaggagaaagatggtgataaggcaattactaagaagatgcttaaggaaaatttttctaaatatgagcctaaaattaatgaaattcttaatggtaagaatcaggtttctttaattaagaaagcgtttgagagtgcgaaaactcaagatgaaaagtcagaattggctgtaatttttcaacaaaagcatctttctgctaagtatgatgttgctttaaatgagattagaaaatctttgtctgatgtgcagaagaagttagatcaagaacagtctcctcagattaaggaaaaacttagagggcttcgtactgaattagaaaatttgcaagatagtttacagaaagagcttaacgatcttactacagaggtggcggatcagatttctaatttgtctagaattatagaagcatatgatgtagtagatcagaatgaacttactgtaaagggaagtgaaacaaaaaatgacaaaaaaagagtacataaaatagctagagaaactagaaaagtgtttaaggagctttcgtctcaggagcttgaatcaaaggcgaagcatgttgaaatttctcttaaacttcaacccaaagagactcaaattatgaggcattttgctggtatagttagtgatgttattagagattctggaaagtctgtgactacagattgaacccttattgaaaaatttgtacttgattttatccataattattcacttaatgatttttctgacgaagatattgttaaaaaattcgcagataatggtttgacgattaagaaagaaagttggcttgataggagagctgggcagaggtgagtagtatacttgagagaggttgcagatttttataatgctagccacgatattaagaatgctgatgcttataactcaggggcaaatttgagaaagtattttgatttaattaggcaaactggttcgtttcaatcagctttggatacctttaatccagaagtggaaaaggccctagatttacgtaaattgcctagaaatgagagattttctaaattaaaagaaagtaaaaatgtgactaaggatgatattgataaggtgatggatctttgtctagattttaacctagatggtatgatcgtttatggcgatactggtatcaagggaggaaatcagattaaggaaatgtttagtaaatttgttactccagaagagagaaagcaggcttttgaaaatattttaaatgctgtttctaaggctaataagtctcaattgcaagaaaaaaagctgactgtagatgatgttattcaggattttgaaacttttactgcagttcagaattttcttaagaatcctccgatggatatgaattatatccttaagtatggagagaatgcttttgatgagtataagaaagcaatgacgacagatcttcctttaactttggaggaaagaaatatgagggatcaagtggttgaagaaggtgctagagagattatcaaagaagtgtgagataaagtaactgaaattgaggctaaatctgcaaaggctaaggcagaaggaagggataaagatgcggaaaattaccagaaggctgctgaaaagcttaaaaaacttagagatatggatgctaagcctcttagagaaggacttagagaggtgttggaaggacaggcagctgcaattaggcagtctggacttggtgctggagtagatattccgcttactaggattttgaagggactttcatttaattttggagctagatacagcgaagatggatctatcaatgcaggagtgaatcttgcatggaatggtagtgtagatctttctgcaaatggtagatttaagggatttgctggagtttctgctggaactaatcttttatcaatcccaattttgggatgaagtgctggacttggatatacctttgaaaattctaagcaagataaatcgcttgatgatagaagtgaaaagacctttacatttggtgttggaggtttaattgctccaggcataattggatggaatattaatcttggagtagatagagatcttgatgctggtagattgcagatgcaggaaaagattaaatcaagtattggtaatcttgttctcgattttatgagctcttctgatgaaaaaaatcctgaaaaaaagtttacttgagaaaagtataaatttgatgagaagattcttaaggagaaattagaggctagatatccgaaaactaagaaagaaactcttgatgctgctattaaaaaccttggtcagatcttgcaatattatgactgagttgaaatgaatgaggctaatgtttctttgattgctgaggaaattgcaaacgcatattctcaggcttggtcaaatatgcaggcgctcaaacttgctgataagggatggtatatttctggagctgggctttcagttagctttttccaaggagtgatcccagtagttggaattttgaagtttgcaaaacatagatttcatggatcttctgatacaaaggaatcgactcagaattttgttgctatgagagagacatgaaagtgaaatagagagcttgtggatgagagcttgagtaataatttgatcgcccttgagcagcaacttggagttgaaaaaggaacacttttgcttgtagctgaccaagatggggctgctgtcgaagaatgaaaagatgctgattatattcagatttctttggatatgctgcttgcaaaatcaaatattgctttgaatccagcgattaagcagaatgtaaaaattgataaagaaaaaaggacgattgtcgttcataaaaatactcttttgagagcttccagtggatatttgtctgattcaaaagctatgaccttggatatcggtgctcataggacagataagtcagcgcaaattattacaaaggattcagtgaatgattttttgaataatcaagtgaatgaatggaatcttaacccagaagctaagattgctccagaaaagttgccaaaattggctgctagtttggatgaacagaagttttctagagcatttaaagaattgaaggcacaagttgccaaagctggttatgaatttccttcggaatatgcaaatttgactatagaaaaaaacacaactgaagatgggaagacggtttatgccttgtttaataatggttctttggtgacaggcgatgatttgaatgcagtgattatccctgaggggaaacatcttgtgattgatacaacgagtggtgatgtagagtttaagtttgaagatattcaaactggtaaggaaaattttaaagtaaaatttgaggggcttcctaaatctgctcctatatctgctgatgttttgaatgtagatccggatatacaggggcttattgatggggtctatacaaacttgagtcttttgaagtcaaacgcgattagaaatgtagctcataaagctacaggtagagcttctttaactaatggatatgttgcttggagaaaggctttgtctgatttttgttgtgaattaccgaaagagtgagattatacgaagatagatctcgcggcagataagatgattgcattgttgttagatatggatggatatattcagcattcagacggtgcgaataaagctggaatttttagagacatattgggaggaagttgaggtttgtatgcattaaaggagaaaacagattatgctagtaaggtaaaattgcagcagttacttctagcattagatggtatgtttagtagaacacaaaatgtaagaggaacaaatgaaaataataaatatcaactacaatatggtgctgaatctaataagaatacatttaaccagattactacagatatttcgacaaagattgtggctaaaatgaagaaattgaatgctaaaaaaactggtcaatttgattgttatgaggactatgcaaatttatttaagtcaatgaatgaaggaactcaaaatattgaatctcaagtatcatctgtagtaaaggaaggggttattgcttataactatggaaatcctgcagatatgatgagacctattatcaatccacatattattgagtgaacagaaaataagaataagcttcctattcctgagacggtaaaattacatgttttacaacagcttttccaggaagattcaattcttgttgtgaatattcttcagagtctgaaggaaaggacttgaagcacacagactttggaggagatcagagagactgtttatgctcagctttgaagtcttttgaagtgagaagctattgacatttgatgaaaaaaggttactatgtgagctagtttctctactgggtattttgctcagtgtgtgaaccatatggtaatgattggagatcttcattttaatgttgaaggaactccaggtaatcctgatggagggaagaatagatttgaggctgagattactggatcagctcaagtagtagcaagtatggagagcgatattcagaataataatactacgagaagattcgcagtagctgctgaggtaatgaaagtggatactcgtaagccaggggaaactattattactaatgatgtaaaaacagatcctcatgagtgaagtgatcaatgaactacagacgttccgcagccaaatgatcctaatacctgagttaatgatggaagtggaaatgtaacacctccggcacctgcagatccaatagattctcctaatccagatattaatataaaagaaacaggacctgctcctgttgttcctagggatgaacaacaagatttttaa
PROTEIN sequence
Length: 1612
MSNPETKNIQTADKIKEGLYGTDIVDDQAVAELNKFVLEEKDGDKAITKKMLKENFSKYEPKINEILNGKNQVSLIKKAFESAKTQDEKSELAVIFQQKHLSAKYDVALNEIRKSLSDVQKKLDQEQSPQIKEKLRGLRTELENLQDSLQKELNDLTTEVADQISNLSRIIEAYDVVDQNELTVKGSETKNDKKRVHKIARETRKVFKELSSQELESKAKHVEISLKLQPKETQIMRHFAGIVSDVIRDSGKSVTTD*TLIEKFVLDFIHNYSLNDFSDEDIVKKFADNGLTIKKESWLDRRAGQR*VVYLREVADFYNASHDIKNADAYNSGANLRKYFDLIRQTGSFQSALDTFNPEVEKALDLRKLPRNERFSKLKESKNVTKDDIDKVMDLCLDFNLDGMIVYGDTGIKGGNQIKEMFSKFVTPEERKQAFENILNAVSKANKSQLQEKKLTVDDVIQDFETFTAVQNFLKNPPMDMNYILKYGENAFDEYKKAMTTDLPLTLEERNMRDQVVEEGAREIIKEV*DKVTEIEAKSAKAKAEGRDKDAENYQKAAEKLKKLRDMDAKPLREGLREVLEGQAAAIRQSGLGAGVDIPLTRILKGLSFNFGARYSEDGSINAGVNLAWNGSVDLSANGRFKGFAGVSAGTNLLSIPILG*SAGLGYTFENSKQDKSLDDRSEKTFTFGVGGLIAPGIIGWNINLGVDRDLDAGRLQMQEKIKSSIGNLVLDFMSSSDEKNPEKKFT*EKYKFDEKILKEKLEARYPKTKKETLDAAIKNLGQILQYYD*VEMNEANVSLIAEEIANAYSQAWSNMQALKLADKGWYISGAGLSVSFFQGVIPVVGILKFAKHRFHGSSDTKESTQNFVAMRET*K*NRELVDESLSNNLIALEQQLGVEKGTLLLVADQDGAAVEE*KDADYIQISLDMLLAKSNIALNPAIKQNVKIDKEKRTIVVHKNTLLRASSGYLSDSKAMTLDIGAHRTDKSAQIITKDSVNDFLNNQVNEWNLNPEAKIAPEKLPKLAASLDEQKFSRAFKELKAQVAKAGYEFPSEYANLTIEKNTTEDGKTVYALFNNGSLVTGDDLNAVIIPEGKHLVIDTTSGDVEFKFEDIQTGKENFKVKFEGLPKSAPISADVLNVDPDIQGLIDGVYTNLSLLKSNAIRNVAHKATGRASLTNGYVAWRKALSDFCCELPKE*DYTKIDLAADKMIALLLDMDGYIQHSDGANKAGIFRDILGGS*GLYALKEKTDYASKVKLQQLLLALDGMFSRTQNVRGTNENNKYQLQYGAESNKNTFNQITTDISTKIVAKMKKLNAKKTGQFDCYEDYANLFKSMNEGTQNIESQVSSVVKEGVIAYNYGNPADMMRPIINPHIIE*TENKNKLPIPETVKLHVLQQLFQEDSILVVNILQSLKERT*STQTLEEIRETVYAQL*SLLK*EAIDI**KKVTM*ASFSTGYFAQCVNHMVMIGDLHFNVEGTPGNPDGGKNRFEAEITGSAQVVASMESDIQNNNTTRRFAVAAEVMKVDTRKPGETIITNDVKTDPHE*SDQ*TTDVPQPNDPNT*VNDGSGNVTPPAPADPIDSPNPDINIKETGPAPVVPRDEQQDF*