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SCNpilot_expt_1000_bf_scaffold_49_curated_84

Organism: scnpilot_dereplicated_Bacteroidetes_7

near complete RP 53 / 55 MC: 2 BSCG 51 / 51 ASCG 14 / 38
Location: comp(92099..98080)

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
PKD domain containing protein n=1 Tax=Chitinophaga pinensis (strain ATCC 43595 / DSM 2588 / NCIB 11800 / UQM 2034) RepID=C7P9Z7_CHIPD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 31.8
  • Coverage: 679.0
  • Bit_score: 284
  • Evalue 1.10e-72
PKD domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 31.8
  • Coverage: 679.0
  • Bit_score: 284
  • Evalue 3.60e-73
PKD domain containing protein {ECO:0000313|EMBL:ACU59234.1}; Flags: Precursor;; TaxID=485918 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Chitinophagaceae; Chitinophaga.;" source="Chitinophaga pinensis (strain ATCC 43595 / DSM 2588 / NCIB 11800 / UQM; 2034).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 31.8
  • Coverage: 679.0
  • Bit_score: 284
  • Evalue 1.60e-72

Lists

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Notes

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Taxonomy

Chitinophaga pinensis → Chitinophaga → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5982
ATGAAACACTTCAACAATTTACTACGGTCTCTGGCACCGGTGCTGCTCTTCCTGGTAGCGGCTTCGCCTGTCCGGGCCCTTAACTTCAGCGGTACGTACACCATACCGTCTGCCACGTTCCCCGATCTGCAGACTGCCTGCACGCAGTTGACGCTAGGTACGGTTACCGGCCCTACAGTGTTCAATATCACTGCGGGTACTTATACAGGTTCTACAGCACAGGGTATTCTCGGTGGTTCTTCAGGTATCGCCGGTCTCAGCTCTACCAATACGGTTACCTTTCAGCCTGCAAGCGGCGCGGGTACCGTCACTCTTAGTCCTGCAAGCTCAGGTAGTTCCGATAACTATGTGTTCAGGTTAGTTAACGTAAGCTATATTACTATCAAGGATCTTACCTTGTCCAACACTGGTAGTAGTTATGGTACTGATATAGAACTGCGCGGTAACTGTAGCAACAATACCATTTCAGGCTGTACGCTTGATGGTAATTCAGGTACATCTACAAGCACTAATAAGGCCCGCATTTATGCAAGCCAGGGTAGTTCTTCCGATGGCCTGACAGGTTCTAACAACGTGTTTTCCGGTAACACCATCAATGGTGGTTCTTATGCTTTTTATATGCAGGGTTCCAATTCGGCTCCTTCTTATCCAAGGCCATACAACTGGAAGTTATCCAATAATACTATCGCATCGCCGTATTACACCTTTGTCTATGCATATTATATGGATAGCTTACAGGTAATAAATAATGCAGTGACTGTAGGCTCTGTTGGTTCTTTCTATGGCTTCAATTTATATTATTGCGATAAGTCAATGACAATTACGGGCAATAGTATTAATATTTCAAGCACCACCAGCACGTTTTATGGGCTGAATTTATATACATGTAATGGTGCTACCAATAAAAAATCAACAATTGCTAATAATACTATTAACAACCCTTCCTGCGGCAGCACTACTTATCCTATAAACATTCAGTATGATAATTATGATTCTGTCGCTAATAATACCTTCAGCTGTACAGGTAACAGCATTTCCATGTACAATCAATATTTATACAATAATGATTGTATCTTAAAGGGTAATACTTTCAACATGAGCGTTACATCAGGTACTTTGGAACCGATGTATACCTATTCTAACTATGCCAGCGCAAGATGTACTATCGATGGTAATACCTGGAACTGTAGCACCACATCGGGCAGTATGTACAATTATGCCATGTATTTTGTATCCAACTGGAGGTTTATTAATAATAATATTATTGAGAATTCAACCAGCGGCGGTACTATCTACAACTACATGCCGTATTATTCTGCAAACTGTTTGATAGACCACAATAACATCAAGGCTACCAGCGATGGTAGTATGAACTATCAATATGTGTATGGTCTGTATGCTTATCAGAGCAGCAGCGCAAATAGCAATGATACTTTCAGTAATAATAAGATTTATGCAAGTGGTTCTTACTACAACATGGGCTTTTATTATGGCTTCGGTAAGAATACGCTGATCTATAATAATAGCATTTGTACCGGCAATGATAACGCTCAGTACAACTATACCTTCTATCCTTCGTATTATTATGGAGGAAAGTACCAGATATATAATAACAGTATCCTGAATAATGTAAATAATACAAGTAACTATAACTATACAACGTATAGCTATACTTATTCTTTTTATGGTGGTACTGCAGAGTGGACTAATAATATCATTGCTAAGGTGAGTAGCAGCGGCCCTGCTATATTGGCTTTGGGTGAAGACAACACAGTTGCCGGTGTGCTTAACAAGATGGATTATAACAATATTTATACTCCTAGTACCAGCTACTTCTATTATAACCCATATTATGGTACTAATACATATACAACATTTGCAGCGTATAAGGCAGGTACCGGTCAAAATCTTAATGGCCTCTCTTATCAGCCGGCATTCACTAATCCATCAATAGGTGATCTTACTCCCGACCCAAGCAGTTCCAATTGTTGGTCTATGAACGGTCGTGCTAAGCATATCACTACAAATACAAAAGACATAGTGGGTAATGCCCGCCCGGTAGTTACCGGCGCCGGCGTTCCTGATCTGGGTGCTTATGAATTTACACCAAACGCCGGTGTCGTACCTCCGCTTTGCCAGGTAACCCCAACTGTACCTGCCGCCGGTGGTACACAGACTTATACATTTGGTGATTTGCCGGTTGCTTCCATTACATGGGATCCTGCAGCTTCAGTTCCTGCAACGGCTCCTACTTGCCAGCAATGGTCAGGTGCTAAGCCGCCCAGCATTAGTTCTGTAAATAATACATTTATGTATTTTTATACAGATATCCTTTCCAGCTCTACCGCTAGCTATACTGCTAATATAAATTACCTGGAACCTTGGTTGGGTACAATAGCAAACGAAAACGTATTGCACCTTGCCAAAAAAGATGGCAGCAATCCTTGGGTAGTTTATCCTTTTGGCCCTAGTGGTGCTAATACTACGCTGAATTATTTATACTCTCCAACTACAGGCCCTCTCAACTCGTTTGGTTCTTATACAGGTCTCGATCTGCAAAACAATGCAGGTGCTACGGATATTGCCAGCCCTGCCGGAAGCTTCTGCGCCGGTACTTATAACGTAGTGGTAAGGATCAAAAACCTGGGTAGTAATACTATCAATAATGTGAAGATCGATTGGAAACTTGATGGTTTCACTCAATCCGGAATCAGCTATAGTACACCTATTAGTTATAATACAGGTGTTGCAGGTAGTAACGAGGCCCTTATTTCATTGGGCAACATCACGTTTGGCGCTACTCCGCGTACCATCAAGGTATGGACTTCAAACCCTAATGGTGTAGCTGATACATACAATCCGGACGATACACTTAATGTTGTGATGCGTGCCTCACTAAACGGTGTTTATACTGTAGGTGGTACTACACCGGATTTTGCTACGCCGAAAGATGCGGTGGATGCGCTTAACGCGGTAGGTGTTTGTGGTGCGGTAACGTTCAACATCCGCCCCGGTACTTATAATAATGGTTCTAACTCTTTACAGATCAACAAAGTTGTCGGTGGCGGACCTTCAGCCCGCGTTACCTTCCAGGCAGAAAATGGCGTGGCAAGCAGCGTTACGATTACAAACGCGCCTGCTTCATCTGCTAACAACGGTGTATTCAGGTTAAATGGTGCTAACTATGTTACCATCAAAAACCTGACTATTAATGGCTCTAATACAAATAGCAACTATATTGGTGATTGTATCTGGGGTACCGACGCTTCTTACGATTCCATCCTGGGATGTAAAATGCTCTGCCCTTCTACTACATCTGGTAGTGGTCAGTCTAACATTGATTTTTATAGTCCCGGCAACAGTGCATATAATGTCATTCAGGGTAATACACTTAGTGGCGGTGGTATGGCAAACATTGCTATCTATGGTAGCGGCAGTACAAATACCGGCTGGGTCATAGATAATAACATTATTAGTGACAATACGTTTACATCCTATTTTACATTATATATTTGGTATGTTGATCGTATTACATTCACTAACAACAAAATCTCCGGTGGTTCCTTTGCTGGTGGTGGGTATGGTTATGGCAGTTACTTATGGTATTGGACTAATGGTCCTACTGTGAGCAATAATATCTGGTCTGGCCCTGGAATGGCCAATCCATACGCTTATATGTATCTTTACTATTTCCAGGGTAGTTCGCCTACTGCGGCTAATCCTAAGAGGGCTACTTTCTCCAATAATATAATTGTGGGTGGTAAGCCCGGCGGTAACAGCTATACGGGTATATACGCGTATGGTATGCAGGAAGCAAGTTTTTACAATAATACTATCGTAGATAACTGCGATGCCAGCGGCAGCTCCGGTTACAATTTATATATCTACGCTACCGGCCCTCGTGATAGTATCTATAACAACGTGTTCTGGAATACCCTATCTGCCGGCAGAACGGTTGGACAATTCTATTTGTATTCAGGCAACGGGCACTATATGGACTATAATAACTTTTACACCAATTCAAGTAATCTGATTTACTTCCAGGGGTCAAGTTATTCCAGCTTCGATGCTTATCGTGCTGCTTCCGTGTCTTCTTACGGCTATGATAAGAACTCCATTTCTTACCATCCTGGATTGGACTCTCTTACAGGTCAGCCTGTGTTAACCAATCCAAATGTTTGGTCACTCAATGGCCGTGGTATTCAAATGGCGAACAATACAAAAGATATGAATGGTAACCCAAGGCCTACAACATTGGCGACTGGTGTGCCTGATATCGGTGCCGTGGAGTTCGATCCTACTTCTACTCCGCCTGCAGCCGTAGGAACTCCTGCTATCCCTGCTCCTGGTGTTACACAAACATATAAGTTTGGTGGTAATCCGGTTGCTGTGATCAAATGGAATCCGCAGCTGGCACTTACAGCGCAGTTAAGGGTTAGGCAATACAGCGGCCGTATACCGCCATCTAACTTTGCAGCGCTTACCGGTGGTAAACAAATGTACTTCTATACAGATATCTCTCCTGTTGGTACCGGTACTACTTACGATTTCAATGTCGAAAATCTGTACTACTACCACACATGGTTGGGTACTACCAACGCGGCTTCTTCTACTGCTAACGAGCTGAATATGAAGTTGGCAGAAAAAGTTGTAGGGTTCCCAAGCTGGATATCTTTCAACTCAGCGAACAGTATCACTACTACTCCTATCTCTGCAATGGATGGTGGTTATATTTACAGCCCAGGTATGACTAGCTTCGGCGCAATGACAGGTATCGATGATGGCCTCAATTTCACTGCGCTGGTTAAAGTAACAGGTTCTACCGTTCTTTGTTCTGGTAATACTGTTACCCTAAATGCAGATCCTACTTCCGGTGGTTCAGGTACATATACTTACCAATGGAAACGCAACGGTATAGATATTCCTGGTGCTACTTCTTCTACTTATGCGCCTAGTACTGGTGGTGATTATAGTGTTACTATTACCGGTGTTGGTTCACA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PROTEIN sequence
Length: 1994
MKHFNNLLRSLAPVLLFLVAASPVRALNFSGTYTIPSATFPDLQTACTQLTLGTVTGPTVFNITAGTYTGSTAQGILGGSSGIAGLSSTNTVTFQPASGAGTVTLSPASSGSSDNYVFRLVNVSYITIKDLTLSNTGSSYGTDIELRGNCSNNTISGCTLDGNSGTSTSTNKARIYASQGSSSDGLTGSNNVFSGNTINGGSYAFYMQGSNSAPSYPRPYNWKLSNNTIASPYYTFVYAYYMDSLQVINNAVTVGSVGSFYGFNLYYCDKSMTITGNSINISSTTSTFYGLNLYTCNGATNKKSTIANNTINNPSCGSTTYPINIQYDNYDSVANNTFSCTGNSISMYNQYLYNNDCILKGNTFNMSVTSGTLEPMYTYSNYASARCTIDGNTWNCSTTSGSMYNYAMYFVSNWRFINNNIIENSTSGGTIYNYMPYYSANCLIDHNNIKATSDGSMNYQYVYGLYAYQSSSANSNDTFSNNKIYASGSYYNMGFYYGFGKNTLIYNNSICTGNDNAQYNYTFYPSYYYGGKYQIYNNSILNNVNNTSNYNYTTYSYTYSFYGGTAEWTNNIIAKVSSSGPAILALGEDNTVAGVLNKMDYNNIYTPSTSYFYYNPYYGTNTYTTFAAYKAGTGQNLNGLSYQPAFTNPSIGDLTPDPSSSNCWSMNGRAKHITTNTKDIVGNARPVVTGAGVPDLGAYEFTPNAGVVPPLCQVTPTVPAAGGTQTYTFGDLPVASITWDPAASVPATAPTCQQWSGAKPPSISSVNNTFMYFYTDILSSSTASYTANINYLEPWLGTIANENVLHLAKKDGSNPWVVYPFGPSGANTTLNYLYSPTTGPLNSFGSYTGLDLQNNAGATDIASPAGSFCAGTYNVVVRIKNLGSNTINNVKIDWKLDGFTQSGISYSTPISYNTGVAGSNEALISLGNITFGATPRTIKVWTSNPNGVADTYNPDDTLNVVMRASLNGVYTVGGTTPDFATPKDAVDALNAVGVCGAVTFNIRPGTYNNGSNSLQINKVVGGGPSARVTFQAENGVASSVTITNAPASSANNGVFRLNGANYVTIKNLTINGSNTNSNYIGDCIWGTDASYDSILGCKMLCPSTTSGSGQSNIDFYSPGNSAYNVIQGNTLSGGGMANIAIYGSGSTNTGWVIDNNIISDNTFTSYFTLYIWYVDRITFTNNKISGGSFAGGGYGYGSYLWYWTNGPTVSNNIWSGPGMANPYAYMYLYYFQGSSPTAANPKRATFSNNIIVGGKPGGNSYTGIYAYGMQEASFYNNTIVDNCDASGSSGYNLYIYATGPRDSIYNNVFWNTLSAGRTVGQFYLYSGNGHYMDYNNFYTNSSNLIYFQGSSYSSFDAYRAASVSSYGYDKNSISYHPGLDSLTGQPVLTNPNVWSLNGRGIQMANNTKDMNGNPRPTTLATGVPDIGAVEFDPTSTPPAAVGTPAIPAPGVTQTYKFGGNPVAVIKWNPQLALTAQLRVRQYSGRIPPSNFAALTGGKQMYFYTDISPVGTGTTYDFNVENLYYYHTWLGTTNAASSTANELNMKLAEKVVGFPSWISFNSANSITTTPISAMDGGYIYSPGMTSFGAMTGIDDGLNFTALVKVTGSTVLCSGNTVTLNADPTSGGSGTYTYQWKRNGIDIPGATSSTYAPSTGGDYSVTITGVGSQQSTSIPVTVTIVAPPMALITANGALTFCTGNNLQLAASGGGTAYQWQLNGSDIPGATDPTYKVSGAGTYTVKVSNIGCTTQSTATVVNAGPINVNLGADIATCEIKNKPIILDAGYPGAKYLWSTGDTTQTISIPGGKGTYSVTVDAGPNCKGSDQVEVNLYPLPSVQGISSQHYGNKYSLTAAGAANVDSYVWIFDDTIQVAGPTVTRTIDGSLNVKLVICNQCGCDTVNMVDWATNVSNVSSEGLDITVYPNPAKEKVNISITGGYMKDITVMNSVGEIVYRADLSGQVKTADVNVSGLASGRYIIRANTNNGIISKPFNVQQQ*